En nasjonal plattform for persontilpasset kreftbehandling Norsk Kreftgenomikkonsortium Leder Ola Myklebost OUS Radiumhospitalet
Dagens tema Introduksjon av konsortiet Presentasjon av den nasjonale modellen Behovet for samarbeid og standardisering Konsortiets forskningsprosjekter Eksempel på molekylær målretting mot nye mutasjoner Etablering av klinikktilpasset teknologi
KreftGenomikKonsortiet Stiftet av onkologer og forskere ved universitetssykehus i alle helse-regioner Oppfølgning av nasjonal prioritet på Individuell kreftbehandling basert på genprofilen av egen svulst Har fått 75 Mill kr i forskningsbevilgninger fra Forskningsrådet
NCGC partnere Universitetene i Tromsø, Trondheim, Bergen og Oslo Kre$registeret ELSA- komponent: ü Bioteknologinemnda ü UiO Senter for medisinsk ebkk ü UiO helseledelse og helseøkonomi Innovasjon, industrisamarbeid: ü Oslo Cancer Cluster ü Biotek og farmasøybsk industri Pasientrepresentant: Kre$foreningen
The Lancet Genomic medicine and the NHS: it is possible The advisory group noted that the UK must act quickly to avoid being le$ behind in this field a point illustrated by the recent launch of the Norwegian Cancer Genomics ConsorBum, a nabonal collaborabon for genome- based diagnosbcs in cancer treatment.
Persontilpasning er ikke nytt Det nye er høykapasitetesanalyse av arvestoffet Økende tilbud av biologisk definerte målrettede medisiner Påvisning av alle mutasjoner
Ok, så jeg kan få pasientens genprofil, hva nå?
Molekylærpatologisk klassifisering Standard behandling Mutasjonsmønster A? Mutasjonsmønster C Helt ny behandling? Mutasjonsmønster B????? Respons??
Genomdiagnostikk Genomanalyse av kreft har helt spesielle utfordringer Krever høykompetent tverrfaglig team Onkologi Patologi (+imaging for biopsering og responsmåling) Kreftbiologi Genomteknologi Bioinformatikk Avanserte kjernefasiliteter Forskningsbaserte Standardisert teknologi og analyse Med klinikktilpasset tilbud
Genombasert persontilpassing av kreftbehandling Må bygge kompetanse og teknologi i det norske helsevesenet Bygger faglig nettverk basert på regionale sentre Felles metodikk og tolkning Samlede resultater fra pasienter i alle helseregioner for kost/nytte-analyser Lik tilgang til ny diagnostikk og behandling for pasienter i alle regioner ü Både under utprøving og når det blir klinisk praksis
NCGCs forskning Pasientstudier PrognosBske og predikbve markører Markører for målrewet behandling ProspekBv, populasjonsbasert analyse Prekliniske studier Validering av nye terapimål BioinformaBske metoder Tolkningsredskap for onkologer og patologer EBkkstudier Helseøkonomi
NCGCs produksjonslinje Myeloma Bioinformatikk Gensekvens Lymphoma OUS/UiO Leukemia Colon Melanoma Nasjonal Sikker lagring og mutasjonsdatabase analyse UiB Prostate NTNU Kreftregisteret Sarcoma Klinisk informasjon Akkumulerte nasjonale data [ UiT ] Breast
Ulike metoder ulike svar Fullgenomsekvensering av svulster Hvor mange team finner samme mutasjoner i felles datasew? Antall mutasjoner påvist Team Sanger Centre, Cambridge UK Bare ew 10 11 12 13 Alle 14
Felles infrastruktur Felles plattform for sensitive genomdata Teknisk isolert nett Sekvensering i alle regioner Utveksling av data og analyser mellom regioner Krypteringsløsninger Spredning av teknologi og deling av kunnskap
Felles prosedyrer Samtykker, kryptering, personvern Pasientinformasjon Tilbakemelding Til behandlende lege? Til pasienten?
De første pasientstudiene Sekvenserer alle gener Fullt eksom, 1-2% av genomet, 60 Mbp Normalprøve (blod) 30x, svulst 300x sekvensering Ca 150 Gbyte data for hver pasient Starter med 100 par med normal/svulst fra: PopulaBonsbasert, prospekbv innsamling Malignt melanom Kolorektalkreft Lymfom Multippelt myelom Sarkom Brystkreft Prostatakreft Leukemi
Tolkningen er kompleks Genet må være aktivt Hvilken strukturell effekt har ubeskrevne mutasjoner? Vil den kunne rammes av medisinen i en annen celletype? Aktiviteten kan modifiseres av andre mutasjoner eller mekanismer
Mekanismen må være flaskehals Lungekre$ Tarmkre$ Mutert EGFR ErloBnib Mutert NRAS Mutert MET
Kinaser er sentrale enzymer i celleregulering Outside the cell Inside the cell Gene abvity Phenotypes Cell nucleus
Kinaser er sentrale enzymer i celleregulering De fleste nye kreftterapier rettes mot kinaser
DDR2-kinasen i lungekreft Peter S. Hammerman, MarBn L. Sos, Alex H. Ramos, et al. Cancer Discovery 2011;1:78-89.
DDR2-mutasjoner i cellelinjer fra lungekreft Dasatinib Dasatinib Dasatinibresponder Ser768Arg Kollagenbinding His136Asn Thr226Ala Helland, Brustugun, Hovig, Myklebost, Meza- Zepeda Peter S. Hammerman, Martin L. Sos, Alex H. Ramos, et al. Cancer Discovery 2011;1:78-89. Ser675Phe Lønning, NCGC - Melanom
UK Stratified Medicine Initiative Lung DDR2
The purpose of this study is to identify if patients with malignancy harboring a Discoidin Domain Receptor 2 (DDR2) mutation or an inactivating B-RAF mutation will respond to Dasatinib. Inclusion Criteria: NSCLC with DDR2 mutation
Rask analyse 20 50 gener the action-ome Kan sekvensere dypt Allerede kostnadseffektivt? Genombasert diagnostikk inn i rutinen?
Teamwork
Invitasjon NCGC bygger opp kompetanse og infrastruktur for nye prosjekter Alle nasjonale kreftgrupper er invitert til å foreslå prosjekter Klinisk analyseplattform settes opp for utprøvende bruk
cancergenomics.no Norsk versjon: kreftgenomikk.no
Oppsummering Vi har etablert kompetanse, Hvis de+e ikke hjelper, teknologi og infrastruktur for så kom <lbake, så skal dypsekvensering og du få noe annet. identifikasjon av mutasjoner i svulster Kan jeg ikke få noe annet med engang? Vi er i gang med forskningsprosjekter på betydningen av mutasjoner som biomarkører og nye mål for kreftbehandling Vi etablerer metoder for klinisk bruk Vi er åpne for flere prosjekter
Bør begrepet kunnskapsbasert medisin revideres? Gjennomsnitt for store grupper? Biologisk innsikt? Hvordan få kunnskap uten å prøve?
Hvordan få kunnskap uten å prøve?