Direkte identifikasjon av mikrober fra positive blodkulturer ved hjelp av MALDI-TOF
|
|
- Arild Bø
- 7 år siden
- Visninger:
Transkript
1 Direkte identifikasjon av mikrober fra positive blodkulturer ved hjelp av MALDI-TOF Aleksandra Jakovljev Kjersti Haugum Siri Beate Nergård Valle Kåre Bergh
2 MALDI-TOF MS (Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation Time-of-Flight Mass Spectrometry) «Ongoing revolution in bacteriology,» (Seng et al., 2009, CID). Introduksjon av MALDI TOF MS på mikrobiologiske laboratorier siden 1990-tallet i Europa. Hurtig identifikasjon direkte fra koloni.
3 Work flow and delay for matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight (MALDI- TOF) mass spectrometry identification of bacteria in this study. Piseth Seng et al. Clin Infect Dis. 2009;49:
4 MALDI-TOF: Bakgrunnsinformasjon Id baseres på deteksjon av ratio av molekylmassen til bakterielle proteiner, i hovedsak ribosomale, i forhold til time-of-flight av ioniserte ioner gjennom vakuum rør (m/z ratio). Resultatet presenteres som massespekter, spesifikk for hver species. Sammenlignes med spektra i referansedatabaser. Identifikasjon skjer ved beste treff i en database. Score >2,0 for species og score >1,7 for genus identifikasjon.
5 Diagnostikk av bakteriemi og dens kliniske betydning Bakteriemi og sepsis: ledende årsak til mortalitet blant inneliggende pasienter. Hurtig identifikasjon av mikroorganismer adekvat antibiotika behandling. I Norge: påvist 4,26 bakteriemiepisoder per 1000 innleggelser i perioden fra ; 8,71 per 1000 i (Haug et al., Clin. Infect. Dis., 1994).
6 Tradisjonell rutinediagnostikk av bakteriemi Etter prøvetaking på avdelingen: sett av aerobe/anaerobe blodkulturflasker sendes snarest til laboratoriet og inkuberes i BD BACTEC blodkultursystem Identifikasjon utføres først etter subkultivering og oppvekst på faste medier Tidsintervall fra positiv blodkultur til id: timer
7 Nyere metoder for hurtig id av mikroorganismer direkte fra positiv blodkultur PCR (polymerase chain reaction). FISH (fluorescence-in-situ-hybridization). Microarray
8 Metoder for direkte id av mikrober fra positive blodkulturer vha. MALDI-TOF Sepsityper Kit (Bruker Daltonics, Bremen, Germany) Ulike in-house metoder, publisert siden 2010 Sepsityper vs. tidligere beskrevet in-house metoder: ingen signifikante forskjeller i antall identifiserte mikrober (Martiny D et al, 2012; Chen JH et al, 2013; Meex C et al, 2012)
9 Målet ved utvikling av in-house metode på vårt mikrobiologiske laboratorium Hurtig og pålitelig diagnostikk. Robust og reproduserbar metode for rutinearbeid på laboratoriet. Helst ikke en arbeidsom og tidkrevende in-house prosedyre.
10 Utprøvingsperiode Sepsityper Kit og ulike in-house metoder utprøvd som pilotprosjekt i bacheloroppgave (februar-april 2014). Ikke vist signifikant forskjell av kommersiell metode sammenlignet med in-house-metoder. Konklusjon: videre testing nødvendig!
11 Utvikling av dagens in-house-metode Prosjektperiode: mai-september Utført på Avd. for Medisinsk mikrobiologi, St. Olavs Hospital. Basert på tidligere beskrevet in-house metode av Martiny et al. (Eur. J. Clin. Microbiol. Inf. Dis., 2012).
12 Materialer og metoder 152 positive blodkulturer inkludert i studien. Mikroskopi av Grampreparat fra alle positive blodkulturer. For monomikrobielle blodkulturer: kun en flaske (vanligvis første) ble videre testet for direkte identifikasjon vha. MALDI-TOF.
13 Materialer og metoder Rutineidentifikasjon av kolonier fra positive blodkulturflasker ble utført etter standard prosedyrer: hurtigtester standard biokjemiske- og agglutinasjonstester MALDI-TOF API Direkte påvisning med MALDI-TOF. Resultater fra direkte påvisning med MALDI-TOF og id med rutinemetoder fra kolonier ble sammenlignet.
14 1 ml blodkultur 200 µl saponin La stå 10 min. 2 min, rpm Supernatant kastes 1 ml sterilt H 2 O 2 min, rpm Supernatant kastes Bunnfall overføres 1 µl maursyre Matrix HCCA Avlesning Maldi-Tof
15 Fordeler med vår in-house metode vs. tidligere beskrevne metoder Robust metode som produserer pålitelige resultater. Bruker 1 ml av blodkulturflaska og hele prosedyren utføres i samme sentrifugerør. Forenklet ekstraksjonsprosess: kun bruk av maursyre. Hurtig metode: tar ca. 25 minutter.
16 Resultater fra prosjektet (mai-sept. 2014) Testet :152 blodkulturer 149 monomikrobielle: Gram positive bakterier: 82 (55%) Gram negative bakterier: 67 (45%) 3 polymikrobielle blodkulturer Generelt: direkte id av Gram negative bakterier var mer vellykket enn Gram positive
17 Resultater Score >1,7 122/149 (81,9 %) Score kategorisering Score > 2,0: 75/149 (50,3 %) Score > 1,7: 47/149 (31,5 %)
18 Resultater for Gram positive bakterier Korrekt id: 61/82 (74.4%) med score >1.7 Bakterie Score >1,7 (%) Score > 2,0 Staphylococcus aureus 17/17 (100%) 15 STKN 14 /21 (67%) 6 Β-hemolytiske streptokokker 9/9 (100%) 4 Viridans streptokokker 2/5 (40%) 0 Pneumokokker 1/6 (16.7%) 0 Enterococcus faecalis 11/12 (91.7%) 8 Andre enterokokker 4/4 (100%) 1
19 Resultater for Gram+ forts. Vellykket id: Aerococcus urinae (>2.0) Clostridium hathewayi (>1.7) Micrococcus luteus (>1.7) Ingen id (score < 1.7) : Propionibacterium Listeria monocytogenes Lactobacillus spp.
20 Resultater for Gram negative bakterier Korrekt Id: 61/67 (91%) med score >1.7 Bakterie Score >1,7 (%) Score > 2,0 Escherichia coli 35/35 (100%) 28 Andre Enterobacteriaceae 17/18 (94.4%) 8 Bacteroides fragilis 3/3 (100%) 2 Capnocytophaga sputigena 1/1 (100%) 0 Pseudomonas aeruginosa 3/4 (75%) 2 Acinetobacter spp. 1/3 (33.3%) 0 Haemophilus influenzae 1/1 (100%) 0
21 Resultater for Gram- forts. Ingen id: Moraxella nonliquefaciens Francisella tularensis
22 Samsvar mellom resultater fra direkte og endelig identifikasjon Samsvar genus 100 % Samsvar species 97,9 %
23 Uoverensstemmelser mellom resultater fra direkte og endelig identifikasjon Kun mindre uoverensstemmelser med score kategorisering >1,7: 1) en Streptococcus anginosus identifisert direkte som S. constellatus 2) en S. mitis identifisert som S. pneumoniae 3) en Salmonella typhimurium identifisert som Salmonella spp. Kjent problematikk med S. mitis- og S. pneumoniae-identifikasjon. Salmonella id kun mulig til genusnivå vha. MALDI-TOF.
24 Resultater avlest etter reduserte cutoffverdier Reduserte verdier for både genus (>1.5) og species (>1.7) kategorisering. Korrekt direkte id. oppnådd: 133/149 (89.3%) av positive blodkulturer. Samsvar med endelig id: 99.3% for genus og 96.6% for species. Korrekt identifiserte Gram positive: 70/82 (85.4%). Korrekt identifiserte Gram negative: 63/67 (94%).
25 Uoverensstemmelser ved reduserte cutoff-verdier Genus misidentifikasjon: en Citrobacter freundii feilidentifisert som Lactobacillus helveticus (score: 1,513) etterfulgt med tre id av C. freundii med score 1,474 1,453 1,420. Mindre uoverensstemmelser: en S. dysgalactiae identifisert som S. pyogenes (score 1,628) en Lactobacillus rhamnosus identifisert som L. sharpeae (score 1,568)
26 Spesifikke problemer ved direkte id Dårlig id av pneumokokker (scoreverdier rundt 1,1-1,2): celle lysering? Beskrevet tidligere av Prod hom et al (J. Clin. Microbiol., 2010). Pneumokokkid: Relativt pålitelig og hurtig id med direkte agglutinasjonstest (Slidex Pneumo-Kit, BioMeriéux)
27 Spesifikke problemer ved direkte id forts Blodkulturer med difteroide staver og Gram+ kokker som blir positive etter 3-4 dagers inkubasjon, representerer vanligvis forurensing. Ofte ikke høy nok konsentrasjon av bakterier i blodkulturflasken (<10⁵ CFU/ml) og bør ikke testes direkte.
28 Polymikrobielle blodkulturer Suspekt polymikrobiell blodkultur ved Gramfarging Forsiktighet i tolkningen av direkte id-resultater Resultater fra studien: 3/152 (2%) polymikrobielle blodkult. Enterococcus faecalis + Staphylococcus epidermidis i 4/4 flasker (kun S. epidermidis id) E. coli + Streptococcus mitis i 6/6 flasker, Streptococcus oralis i 2/6 flasker (kun E. coli id) Staphylococcus hominis + Staphylococcus epidermidis i 1/6 flasker (kun S. epidermidis id)
29 Implementering av in-house metoden på laboratoriet Blitt en del av rutinearbeidet. Testing utføres to ganger daglig. Oppdatering av MALDI-TOF-databasen med ca nye stammer. Fordeler og ulemper av metoden beskrevet i prosjektet også merket i rutinearbeidet.
30 Konklusjon Robust in-house metode som gir hurtig og pålitelige identifikasjon. Enkel å implementere. God hjelp til leger på klinikker i tilfeller der identifiserte mikrober har kjent innebygd resistens.
31 Takk for oppmerksomheten!
Identifikasjon av mykobakterier vha MALDI-TOF MS. Aina Myhre Tuberkuloselaboratoriet, Rikshospitalet
Identifikasjon av mykobakterier vha MALDI-TOF MS Aina Myhre Tuberkuloselaboratoriet, Rikshospitalet Nåværende identifikasjonsrutiner Direkte i (NALC-behandlet) prøvemateriale: Mikroskopi (auramin) PCR
DetaljerAutomasjon. Erfaringer med nytt utstyr på bakteriologisk enhet. Jaswinder Sandhu (Bioingeniør, Mikrobiologisk avd.)
Automasjon Erfaringer med nytt utstyr på bakteriologisk enhet Jaswinder Sandhu (Bioingeniør, Mikrobiologisk avd.) Mikrobiologisk avdeling (SiV) Årsverk 47,8 (2012) Avdelingssjef 1 Avdelingsoverlege 1 Seksjonsleder
DetaljerFilmArray i praksis Spesialbioingeniør Hanna Ilag, Bakteriologisk enhet Lege i spesialisering Hanne Brekke, Bakteriologisk enhet
FilmArray i praksis Spesialbioingeniør Hanna Ilag, Bakteriologisk enhet Lege i spesialisering Hanne Brekke, Bakteriologisk enhet 1 2 FilmArrayer en kvalitativ hurtigtest basert på multipleks real-time
DetaljerDE ULIKE TEKNIKKENE VI HAR IMPLEMENTERT
MALDI-TOF kvalitetsmessig og logistisk effektivisering av bakteriologisk lab. Erfaringer fra Haukeland universitetssjukehus DE ULIKE TEKNIKKENE VI HAR IMPLEMENTERT Direkte metode med/uten syre Etanol-Maursyre
DetaljerForslag til opplegg for kontroll av blodkultur og ID-systemer
Forslag til opplegg for kontroll av blodkultur og ID-systemer Fredrik Müller Mikrobiologisk institutt Rikshospitalet Bestilling: Å presentere et lavterskel opplegg for bruk av kvalitetskontroller knyttet
DetaljerResistensbestemmelse av anaerobe bakterier. Truls Leegaard AFA-kurs 2015
Resistensbestemmelse av anaerobe bakterier Truls Leegaard AFA-kurs 2015 Anaerober - utfordring Langsomtvoksende Identifikasjon Krever spesielle vekstvilkår Opprettholdes anaerobe forhold? Hvilke funn skal
DetaljerPåvisning av resistensmekanismer ved hjelp av MALDI-TOF massespektrometri
Påvisning av resistensmekanismer ved hjelp av MALDI-TOF massespektrometri André Ingebretsen Avd. for smittevern og Avd. for mikrobiologi Oslo Universitetssykehus NordicAST workshop 2012, Gøteborg MALDI-TOF
DetaljerHurtigdiagnostikk ved luftveisinfeksjoner
Hurtigdiagnostikk ved luftveisinfeksjoner Fredrik Müller Mikrobiologisk institutt Rikshospitalet Hva er hurtigdiagnostikk? Valgt definisjon: Tid fra prøven når laboratoriet til svar rapporteres: < 1 time
DetaljerPasientnær analysering innen medisinsk mikrobiologi
Pasientnær analysering innen medisinsk mikrobiologi Marie Elisabeth Vad Fagbioingeniør/ Medlem av RUFMIK Seksjon for Utvikling Avdeling for Mikrobiologi Ullevål,OUS Hva mener vi med pasientnær analysering(pna)?
DetaljerRESISTENSRAPPORT Sørlandet sykehus HF 2016 TABELLER
RESISTENSRAPPORT Sørlandet sykehus HF 2016 TABELLER Avdeling for medisinsk mikrobiologi November 2017 Redaksjon: Ståle Tofteland, overlege PhD (leder) Unn Houge, overlege Hilde Strand, bioingeniør, kvalitetskoordinator,
DetaljerUrinveisinfeksjoner i almenpraksis. Olav B. Natås Avd. for medisinsk mikrobiologi 11. September 2013
Urinveisinfeksjoner i almenpraksis Olav B. Natås Avd. for medisinsk mikrobiologi 11. September 2013 Urinveisinfeksjoner, UVI Ukompliserte UVI Sporadiske, nedre UVI hos friske, ikke gravide kvinner 15-55
Detaljer2 BIO HØST GENERELL IMMUNOLOGI OG MEDISINSK MIKROBIOLOGI HBIO2003
2 BIO HØST GENERELL IMMUNOLOGI OG MEDISINSK MIKROBIOLOGI HBIO2003 Delemne: MIKROBIOLOGI LABORATORIEKURS I MIKROBIOLOGI MÅL: Holdninger Studentene skal ta ansvar for å: - gi beskjed når vedkommende ikke
DetaljerKvalitetskontroll av resistensbestemmelse. Olav B. Natås Stavanger 2013
Kvalitetskontroll av resistensbestemmelse Olav B. Natås Stavanger 2013 Viktige kontrollstasjoner 1. Resistensmedium 2. Inokulum 3. Antibiotikadepoter 4. Avlesning Resistensmedium Tillages etter produsentens
DetaljerAntibiotikaresistens - forekomst, konsekvenser og utfordringer. Regionsmøte Helse Vest, mai 2019 Petter Elstrøm Folkehelseinstituttet
Antibiotikaresistens - forekomst, konsekvenser og utfordringer Regionsmøte Helse Vest, mai 2019 Petter Elstrøm Folkehelseinstituttet Disposisjon Forbruk av antibiotika Forekomst av resistente bakterier
DetaljerAsymptomatisk bakteriuri hos gravide
Asymptomatisk bakteriuri hos gravide Mikrobiologiske aspekter Truls Leegaard Mikrobiologisk institutt Rikshospitalet Retningslinjene for svangerskapsomsorgen fra 2005 Presentert av Helsedirektoratet i
DetaljerVRE-utbrudd ved St.Olavs Hospital Vancomycinresistente enterokokker. Smittevern St. Olavs Hospital HF
VRE-utbrudd ved St.Olavs Hospital Vancomycinresistente enterokokker Marthe Lind Kroknes Spesialbioingeniør Andreas Radtke Smittevernlege Smittevern St. Olavs Hospital HF Enterokokker Enterokokker er i
DetaljerNOTAT. Eksempler på mikrobiologi. 1. Testcase
NOTAT Til Leverandører og IT-personell Fra Annebeth Askevold, KITH Dato 15.09.2004 Tema Eksempelmeldinger på mikrobiologisvar Eksempler på mikrobiologi Notatet inneholder noen eksempler på mikrobiologisvar,
DetaljerBruk av DNA-sekvensering i mikrobiologisk diagnostikk. Øyvind Kommedal Haukeland Universitetssykehus
Bruk av DNA-sekvensering i mikrobiologisk diagnostikk Øyvind Kommedal Haukeland Universitetssykehus Hvordan sekvensering revolusjonerte mikrobiologien Bakterienes morfologi Fenotypisk identifikasjon Fylogentisk
DetaljerHenning Onarheim overlege, Kirurgisk serviceklinikk, Haukeland universitetssjukehus professor II, Klinisk institutt 1, Universitetet i Bergen og
INFEKSJONSUTBRUDD BLANT BRANNSKADEDE: KLINISK BAKGRUNN OG MIKROBIOLOGISKE UTFORDRINGER Henning Onarheim overlege, Kirurgisk serviceklinikk, Haukeland universitetssjukehus professor II, Klinisk institutt
DetaljerDiagnostikk av Shigella etter innføring av Maldi-Tof MS i laboratoriet. Heidi Nerbø Aasen Tomren, avd for medisinsk mikrobiologi, seksjon Molde
Diagnostikk av Shigella etter innføring av Maldi-Tof MS i laboratoriet Heidi Nerbø Aasen Tomren, avd for medisinsk mikrobiologi, seksjon Molde Shigella kan ikke på nåværende tidspunkt skilles fra E.coli
DetaljerKlinisk emnekurs i laboratoriemedisin Karianne Wiger Gammelsrud, kst overlege, førsteamanuensis Avd. for mikrobiologi, OUS, Ullevål
Resistensproblemer og bruk av screeningprøver ved mistanke om resistente bakterier Klinisk emnekurs i laboratoriemedisin Karianne Wiger Gammelsrud, kst overlege, førsteamanuensis Avd. for mikrobiologi,
DetaljerBACTEC Peds Plus/F Culture Vials Vekstmedium framstilt av soyabønne-kasein med resiner
BACTEC Peds Plus/F Culture Vials Vekstmedium framstilt av soyabønne-kasein med resiner PP091JAA 2008/01 Norsk *Amerikansk patentnr. 4 632 902 BRUKSOMRÅDE BACTEC Peds Plus/F Culture Vials (blodkulturflasker)
DetaljerResistensrapport for Sykehuset Innlandet 2016
Resistensrapport for Sykehuset Innlandet Rapportmalen er utarbeidet av Seksjon for mikrobiologi og smittevern, Akershus universitetssykehus, brukt med tillatelse fra seksjonsoverlege Silje Bakken Jørgensen.
DetaljerMBT Sepsityper IVD Kit
1834338 Bruksanvisning MBT Sepsityper IVD Kit Sett for identifisering av mikroorganismer fra positive blodkulturer ved hjelp av IVD MALDI Biotyper-systemet CARE- produkter er utformet for å støtte kunder
DetaljerResistensutvikling og overvåking i Norge
Resistensutvikling og overvåking i Norge Gunnar Skov Simonsen Bioingeniørdagen 29.3.217 Hva er resistens? Kliniker: Antibiotika virker ikke! Manglende effekt ut fra klinikk og erfaring Mikrobiolog: Endring
DetaljerInfiserte hemiproteser
Infiserte hemiproteser Marianne Westberg St Olav 09.05.19 Seksjonsoverlege PhD Seksjon for protesekiriurgi Ortopedisk avdeling Ullevål Oslo universitetssykehus Infeksjon etter hofteprotese? Totalprotese
DetaljerÅRSRAPPORT for 2011. fra. Nasjonalt referanselaboratorium for Francisella tularensis
ÅRSRAPPORT for 2011 fra Nasjonalt referanselaboratorium for Francisella tularensis Avdeling for medisinsk mikrobiologi, St. Olavs Hospital Besøksadresse: Erling Skjalgsons gate 1 Postadresse: St. Olavs
DetaljerMALDI TOF MS i klinisk mikrobiologi Status 2018
MALDI TOF MS i klinisk mikrobiologi Status 2018 André Ingebretsen Avdeling for mikrobiologi og Avdeling for smittevern Oslo universitetssykehus Identifisering/Klassifisering 1 Tidsforløp klassisk klinisk
DetaljerESBL. Anna Senske Lege Avdeling for smittevern 19. 20 og 27. april 2016
ESBL Anna Senske Lege Avdeling for smittevern 19. 20 og 27. april 2016 April 2016 Inndeling Hva er ESBL? Forekomsten av ESBL ESBL-spredning ESBL-bærerskap Betydning av ESBL på sykehuset Terapi og sanering
DetaljerAntibiotikaresistens og resistensmekanismer
Antibiotikaresistens og resistensmekanismer RELIS Fagseminar 290118 Overlege Hege Enger Avd. for medisinsk mikrobiologi St Olavs hospital Disposisjon Introduksjon Hva er antibiotikaresistens? Eksempler
DetaljerÅRSRAPPORT 2013. Nasjonalt referanselaboratorium for Francisella tularensis
Erling Skjalgsons gate 1 Postadresse: St. Olavs Hospital, ÅRSRAPPORT 2013 Nasjonalt referanselaboratorium for Francisella tularensis Bakgrunnsinformasjon Helse Midt-Norge RHF ved ble tildelt nasjonal referansefunksjon
DetaljerResistensrapport for Sykehuset Innlandet 2017
Resistensrapport for Sykehuset Innlandet Rapportmalen er utarbeidet av Seksjon for mikrobiologi og smittevern, Akershus universitetssykehus, brukt med tillatelse fra seksjonsoverlege Silje Bakken Jørgensen.
DetaljerSensorveiledning. IRBIO30018 Medisinsk mikrobiologi (MLE3)
Sensorveiledning IRBIO30018 Medisinsk mikrobiologi (MLE3) Skriftlig, digital eksamen (Inspera Assessment), 3 timer Oppgave 1 a. Gi tre eksempler på klassifisering/inndeling av bakteriene når vi ser dem
DetaljerNyttig mikrobiologi med en praktisk vri
Nyttig mikrobiologi med en praktisk vri Undervisning for legene på Diakonhjemmet 26.05.16 Karianne Wiger Gammelsrud, overlege, førsteamanuensis Avd. for mikrobiologi, OUS, Ullevål Disposisjon Grunnprinsipper
DetaljerOppgave: MED3300-2_MIKROBIOLOGI_H18_ORD
Side 14 av 30 Oppgave: MED3300-2_MIKROBIOLOGI_H18_ORD Del 1: Du tar imot en 36 år gammel kvinne i akuttmottaket som legges inn grunnet akutt innsettende feber, frostanfall og redusert almentilstand. Hun
DetaljerIntravenøs antibiotikabruk i sykehjem. Erna Harboe Overlege infeksjonsavdelingen SUS
Intravenøs antibiotikabruk i sykehjem Erna Harboe Overlege infeksjonsavdelingen SUS Spørsmål og svar Ny utvikling vedrørende antibiotika? Egentlig ikke prinsippet om smalt spekter gjelder fremdeles. Hva
Detaljer(12) Translation of european patent specification
(12) Translation of european patent specification (11) NO/EP 2563916 B1 (19) NO NORWAY (51) Int Cl. C12N 9/36 (2006.01) C12N 9/52 (2006.01) Norwegian Industrial Property Office (21) Translation Published
DetaljerOrganisering og praktisk bruk ved OUS
Pasientnære analyser innen mikrobiologiorganisering og praktisk bruk Marie Elisabeth Vad Spesialbioingeniør Mikrobiologisk avdeling, OUS Mette Sannes Enhetsleder Infeksjonsmedisinsk laboratorium, OUS Organisering
DetaljerN-Sm M1610 Medisinsk mikrobiolog, bakteriologi Blodkultur Bakterier, sopp Blodprodukter, Bakterier, sopp dialysefilter og bein til beinbank Enterokokk
N-Sm M1610 Medisinsk mikrobiolog, bakteriologi Dokumentansvarlig: Margaret Frøseth Li Dokumentnummer: SJ7404 Godkjent av: Ingrid Elisabeth Simonsen Gyldig for: Bakteriologisk enhet NLSH; Molekylærbiologisk
DetaljerResistensrapport for Sykehuset Innlandet 2018
Resistensrapport for Sykehuset Innlandet Rapportmalen er utarbeidet av Seksjon for mikrobiologi og smittevern, Akershus universitetssykehus, brukt med tillatelse fra seksjonsoverlege Silje Bakken Jørgensen.
DetaljerPCR-analyser i rutinediagnostikken Pål A. Jenum
PCR-analyser i rutinediagnostikken Pål A. Jenum september 2015 1 Utvikling Antall genmolekylære analyser pr år (unntatt klamydia og gonokokker: Ca 32.000 i 2015) 120000 Stipulert for hele året 100000 80000
DetaljerUrinveisinfeksjoner og antibiotikabehandling. Jon Sundal 11.09.2013
Urinveisinfeksjoner og antibiotikabehandling Jon Sundal 11.09.2013 1 Definisjoner Urinveisinfeksjon (UVI): Mikrobiell infeksjon, eventuelt med invasjon i vev langs urinveiene. Infeksjonen kan gi symptomer
DetaljerVankomycinresistente enterokokker VRE Epidemiologi/utbruddet på Haukeland Universitetssjukehus
Vankomycinresistente enterokokker VRE Epidemiologi/utbruddet på Haukeland Universitetssjukehus Kristin Stenhaug Kilhus LIS, Mikrobiologisk avdeling Haukeland Universitetssykehus 2 Enterokokker Gram positive
DetaljerNA-S5m M1610 Medisinsk mikrobiolog, bakteriologi Dokumentansvarlig: Margaret Frøseth Li Dokumentnummer: SJ7404 Godkjent av: Oddny Kristin Remlo Versjo
Dokumentansvarlig: Margaret Frøseth Li Dokumentnummer: SJ7404 Godkjent av: Oddny Kristin Remlo Gyldig for: Bakteriologisk enhet NLSH; Molekylærbiologisk enhet NLSH METODEOVERSIKT bcess/fistel ctinomyces
DetaljerKvalitetskontroll av resistensbestemmelse. Iren Høyland Löhr Avd. for medisinsk mikrobiologi, Stavanger Universitetssjukehus AFA-kurs, november 2015
Kvalitetskontroll av resistensbestemmelse Iren Høyland Löhr Avd. for medisinsk mikrobiologi, Stavanger Universitetssjukehus AFA-kurs, november 2015 Disposisjon EUCASTs lappediffusjonsmetode Resistensbestemmelse
DetaljerKPU STHF. Sakspresentasjon 27.05.2014
KPU STHF Sakspresentasjon 27.05.2014 Saksliste 35/2014 Godkjenning av referat og saksliste 36/2014 Saker meldt til Helsetilsynets utrykningsgruppe (3-3a) 37/2014 Pasientskader målt ved GTT (Global Trigger
DetaljerHogskoleni østfold EKSAMENSOPPGAVE
Hogskoleni østfold A deling for ingeniorfag EKSAMENSOPPGAVE Emne: IRBI030012 Medisinske laboratorieemner 3 Faglærer: Eva Madsen Emneansvarlig: Annette Veberg Dahl Dato: 30. mars 2016 Antall oppgavesider:
DetaljerGonoré. Diagnostikk terapi resistens. Overlege / professor Kåre Bergh. Avd for med.mikrobiologi / NTNU. Høstkonferansen 2015
Gonoré Diagnostikk terapi resistens Høstkonferansen 2015 Overlege / professor Kåre Bergh Avd for med.mikrobiologi / NTNU 1 Gonoré meldt MSIS i 2014 etter bostedsfylke (rate per 100 000 innb.) FHI: Smittevernboka
DetaljerGenerelt om mikrober og infeksjoner. Dr. Angela Kümmel
Generelt om mikrober og infeksjoner Dr. Angela Kümmel Bakterie former/typer 1 = Mikrokokker 5 = Sarciner 2 = Diplokokker 6 = Staver 3 = Streptokokker 7 = Spiriller 4 = Staphylokokker 8 = Vibrioner 1000
DetaljerHurtigtester innen mikrobiologi. Fredrik Müller Avdeling for mikrobiologi, Oslo universitetssykehus HF
Hurtigtester innen mikrobiologi Fredrik Müller Avdeling for mikrobiologi, Oslo universitetssykehus HF Hva mener vi med mikrobiologiske «Hurtigtester»? Ingen entydig definisjon Kanskje kan en hensiktsmessig
DetaljerREFERAT FRA MØTE I FAGRÅDET FOR NORM 1. NOVEMBER 2018
REFERAT FRA MØTE I FAGRÅDET FOR NORM 1. NOVEMBER 2018 Til stede: Forfall: Dag Harald Skutlaberg (HUS), Thea Bergheim (OUS, NITO), Aasmund Fostervold (SUS, NFMM), Heidi Cecilie Villmones (SIV), Didrik Vestrheim
DetaljerAFA-kurs 2013 6. November OUS-Rikshospitalet
ESBL A & ESBL M-C AFA-kurs 2013 6. November OUS-Rikshospitalet Ørjan Samuelsen, Forsker Kompetansetjeneste for påvisning av antibiotikaresistens (K-res) Avd. for mikrobiologi og smittevern Universitetssykehuset
DetaljerBetalaktamasepåvisning
Betalaktamasepåvisning Påvisning av betalaktamase hos Staphylococcus spp., Enterococcus faecalis, Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis, Neisseria gonorrhoeae og Neisseria meningitidis Truls Leegaard,
DetaljerInfeksjon og hofteproteser
Infeksjon og hofteproteser Marianne Westberg Seksjonsoverlege PhD Seksjon for protesekirurgi Ortopedisk avdeling, OUS 09. mars 2016 Hvorfor hofteprotese? Lårhalsbrudd Hofteleddsartrose Hvorfor hofteprotese?
DetaljerKlassiske metoder for resistensbestemmelse
Fenotypiske metoder for påvisning av bakteriers følsomhet for antimikrobielle midler Martin Steinbakk, Avdeling for bakteriologi og infeksjonsimmunologi, Fhi Klassiske metoder for resistensbestemmelse
DetaljerSMYKKEFRITT. Er det evidens for tiltaket? Diakonhjemmet Smitteverndagene Mette Fagernes Folkehelseinstituttet
SMYKKEFRITT Er det evidens for tiltaket? Diakonhjemmet Smitteverndagene 2018 Mette Fagernes Folkehelseinstituttet Disposisjon o Nosokomiale mikrober o Livet på hendene o Smykkefritt - er det evidens for
DetaljerNORM / NORM VET 2016 Antibiotikabruk og resistens i Norge. Gunnar Skov Simonsen NORM UNN HF
NORM / NORM VET 216 Antibiotikabruk og resistens i Norge Gunnar Skov Simonsen NORM UNN HF 2 Antibiotikaforbruketi Norge 216 Antibiotikaresistens i Norge 216 Mennesker og dyr Artikler om aktuelle tema Tonnes
DetaljerKjemi i slambehandling i settefiskindustrien løsninger og utfordringer
Kjemi i slambehandling i settefiskindustrien løsninger og utfordringer Desinfeksjon, hygienisering, stabilisering, avvanning og resirkulering av fosfor Ada Brinchmann, Kemira Chemicals AS, 14.5.13 Kemira
DetaljerOppgave: MED1100-3_OPPGAVE4_H17_ORD
Side 34 av 41 Oppgave: MED1100-3_OPPGAVE4_H17_ORD Del 1: Oppgaver i mikrobiologi Spørsmål 1: En 2 år gammel pike blir innlagt med mistanke om hjernehinnebetennelse. Spinalvæsken blir tappet. Bildet viser
DetaljerEksperter på revisjon
C Eksperter på revisjon AL P O Ekspertise. Forpliktelse. Ansvar. Spisskompetanse på artroplastikk. Effektiv kombinasjon av teknisk ekspertise, tenke progressivt og tenke utenfor boksen dette er prinsippene
DetaljerCF-mikrober og resistens. Karianne Wiger Gammelsrud LIS: Mikrobiologisk avd, OUS, Rikshospitalet
CF-mikrober og resistens Karianne Wiger Gammelsrud LIS: Mikrobiologisk avd, OUS, Rikshospitalet Min bakgrunn 6 mnd v/ barneavd Ullevål Mange år som stipendiat ð ð ð ð Fulgte 37 barn med CF med gjentatte
DetaljerMikrobiologisk prøvetakning hva og hvordan
Mikrobiologisk prøvetakning hva og hvordan Karianne Wiger Gammelsrud Overlege, PhD Avd. for mikrobiologi, Oslo Universitetssykehus Smitteverndagen Diakonhjemmet 25.09.18 Disposisjon Brukerhåndbok Rekvisisjonen
DetaljerAkkrediteringsomfang for TEST 046
Kopiere link Akkrediteringsomfang for TEST 046 http://www.akkreditert.no/no/akkrediterte-organisasj X MjøsLab iks Ringveien 11 2815 GJØVIK Telefon: E-post: Tlf. 61 13 62 20/61 13 62 21 Faks. 61 13 62 29
DetaljerKonsekvenser av infeksjoner med antibiotikaresistente bakterier
Klinisk betydning av antibiotikaresistens Kurs TØ-28224, 19. november 2014 Per Espen Akselsen Nasjonal kompetansetjeneste for antibiotikabruk i spesialisthelsetjenesten FoU-avd, Haukeland Universitetssykehus
DetaljerMeldingspliktige resistente bakterier og C. difficile
Rapport kvartal 4/2013 Meldingspliktige resistente bakterier og C. difficile Folkehelseinstituttet publiserer kvartalsvise rapporter om forekomst av infeksjon og bæreskap forårsaket av utvalgte resistente
DetaljerESBL hvem skal isoleres? Smitteverndagen Diakonhjemmet Silje B. Jørgensen smittevernoverlege
ESBL hvem skal isoleres? Smitteverndagen Diakonhjemmet 25.09.18 Silje B. Jørgensen smittevernoverlege www.cartoonstock.com Disposisjon Problemet med multiresistente mikrober Hvilke tiltak gjør vi? Utfordringer
DetaljerBrukerundersøkelsen 2015
Brukerundersøkelsen 15 Brukerundersøkelsen 15 Gjennomført mai/juni 15 NORM-ansvarlig lege og bioingeniør v/ 22 medisinsk mikrobiologiske laboratorier i Norge ble invitert til å delta spørsmål i Questback-format
DetaljerMikrobiologi: Meningitt IIAB
Mikrobiologi: Meningitt IIAB Forfatter Navn Institutt Undervisningsenhet E-post Telefon Kåre Bergh IKOM Mikrobiologi Kare.bergh@ntnu.no 95223850 Jan Egil Afset IKOM Mikrobiologi jan.afset@ntnu.no 99267367
DetaljerInnhald. Blodkultur Når, kvifor og korleis? Blodkultur. Indikasjon. Prøvetaking. Taking av blodkultur utanfor sjukehus
Innhald Blodkultur Når, kvifor og korleis? NITO preanalyse, Bergen, 10.05.17 Reidar Hjetland Mikrobiologisk avdeling, Helse Førde Innleiing Eksisterande rutinar Diskusjon omkring ulike forhold Definisjonar
DetaljerÅRSMELDING FOR NORM 2005
Avdeling for mikrobiologi og smittevern NORM Norsk overvåkingssystem for antibiotikaresistens hos mikrober ÅRSMELDING FOR NORM 2005 OVERVÅKING AV ANTIBIOTIKARESISTENS Norsk overvåkingssystem for antibiotikaresistens
DetaljerBakteriekontroll av trombocytter fallgruver Mirjana Grujic Arsenovic
Bakteriekontroll av trombocytter fallgruver Mirjana Grujic Arsenovic Jeg vil prate om: Septiske transfusjonsreaksjoner Forbyggende tiltak Status i Norge Hvordan gjør man det ved UNN (og hvorfor) Kliniske
DetaljerVisjonene bakteriologi / genteknologi
NFMM Fagmøte 29.01.09 Medisinsk mikrobiologi - et fag nær undergangen? Visjonene bakteriologi / genteknologi Kåre Bergh NTNU / DMF ; St.Olavs Hospital, AMM For de med anlegg for å se mørkt på perspektivene:
DetaljerResistensepidemiologi nasjonalt og internasjonalt. Gunnar Skov Simonsen
Resistensepidemiologi nasjonalt og internasjonalt Gunnar Skov Simonsen 2 Overvåking av antibiotikaresistens Antall enkelttilfeller eller andel av isolater med en gitt egenskap Antall enkelttilfeller kan
DetaljerImport av antibiotikaresistente bakterier Hvilke antibiotika kan vi utstyre reisende med? Ragnhild Raastad Reiseklinikken
Import av antibiotikaresistente bakterier Hvilke antibiotika kan vi utstyre reisende med? Ragnhild Raastad Reiseklinikken Hva er antibiotikaresistens? Antibiotikaresistens: Endring av bakterier slik de
DetaljerBrytningspunkttabeller for tolkning av MIC-verdier og sonediametre Norsk versjon 2.1, 2011-01-25
Brytningspunkttabeller for tolkning av MIC-verdier og sonediametre Norsk versjon 2.1, 2011-01-25 Basert på EUCAST version 1.3, 2011-01-05 Skandinavisk version, RAF-M, 2010-08-30 Innhold Side Ansvarlig
DetaljerMeldingspliktige resistente bakterier og C. difficile
Rapport kvartal 2/2013 Meldingspliktige resistente bakterier og C. difficile Folkehelseinstituttet vil fremover publisere kvartalsvise rapporter om forekomst av infeksjon og bæreskap forårsaket av utvalgte
DetaljerResistensbestemmelse av bakterier Metodebeskrivelse
Resistensbestemmelse av bakterier Metodebeskrivelse Foto: Christian Lidstedt 1 Innholdsfortegnelse 1 Innledning 3 2 Lappediffusjon 4 2.1 Medier 4 2.2 Tillaging av inokulum 5 2.3 Inokulering av skåler 5
DetaljerAntibiotikaresistens. Peter Meyer Avd. for Blod- og kreftsykdommer Stavanger Universitetssykehus
Antibiotikaresistens Peter Meyer Avd. for Blod- og kreftsykdommer Stavanger Universitetssykehus Antibiotikaresistens Europeisk antibiotikadag 18.11.2014 100 mio. europeere er bærere av resistente bakterier
DetaljerRisikovurdering knyttet til konsum av rå melk og kolostrum
Risikovurdering knyttet til konsum av rå melk og kolostrum Vitenskapskomiteen for mattrygghet Faggruppe for hygiene og smittestoffer Februar 2007 1 Innholdsfortegnelse I. Bakgrunn... 3 II. Oppdrag... 4
DetaljerAminoglykosid dosering hos nyfødte. Claus Klingenberg Barnavdelingen UNN og UiT
Aminoglykosid dosering hos nyfødte Claus Klingenberg Barnavdelingen UNN og UiT Disposisjon Bakgrunn om aminoglykosider Resistens Virkningsmekanismer Toksisitet Netilmicin studie (2004) Gentamicin audit
DetaljerPreanalytiske forhold ved urinprøver kan forårsake unødvendig antibiotikabehandling hos eldre
Preanalytiske forhold ved urinprøver kan forårsake unødvendig antibiotikabehandling hos eldre Kari van den Berg Bioingeniør/laboratoriekonsulent Noklus Rekvirering av prøven Preanalytisk fase Forberedelse
DetaljerNORM / NORM VET 2018 Antibiotikabruk og resistens i Norge. Gunnar Skov Simonsen NORM UNN HF
NORM / NORM VET 218 Antibiotikabruk og resistens i Norge Gunnar Skov Simonsen NORM UNN HF 1 Antibiotikaforbruket i Norge 218 Antibiotikaresistens i Norge 218 Mennesker og dyr Artikler om aktuelle tema
DetaljerEr det farlig med antibiotikaresistens i maten?
Er det farlig med antibiotikaresistens i maten? Frokostseminar: Bakterier og antibiotikaresistens 6. Mars 2015 Trine L Abée-Lund Antibiotikaresistens og mat Norges miljø- og biovitenskapelige universitet
DetaljerCefalexin er inkludert i utvidet resistensbestemmelse for urinveisisolater (enterobakterier)
Spørsmål og svar Hvorfor er ikke cefalotin/cefalexin med i noen av panelene? I følge felleskatalogen er Keflex og Keflin et ok middel til urinveisinf, luftveisinf. og inf. i hud og bløtvev. Felleskatalogne
DetaljerForutsetninger for tolkning av funn. Opplysninger: Hva slags sår? Kirurgi? Hva slags? Anatomisk lokalisasjon av såret? Grunnsykdom?
Tolkning av funn Forutsetninger for tolkning av funn Opplysninger: Hva slags sår? Kirurgi? Hva slags? Anatomisk lokalisasjon av såret? Grunnsykdom? Forutsetning for tolkning av funn Er såret rengjort før
DetaljerDen neste bølgen? Multiresistente Gramnegative staver Industriseminar 11. november 2008
Den neste bølgen? Multiresistente Gramnegative staver Industriseminar 11. november 2008 Arnfinn Sundsfjord K-Res, Universitetssykehuset i Nord-Norge, Universitetet i Tromsø 1 Agenda Forekomst Betalaktamaser
DetaljerPest eller kolera? ANTIBIOTIKABRUK OG RESISTENSFORHOLD VED FINNMARKSSYKEHUSET OG I PRIMÆRHELSETJENESTEN I FINNMARK 2013-2015
Pest eller kolera? Forsideillustrasjon v. Tore Lier ANTIBIOTIKABRUK OG RESISTENSFORHOLD VED FINNMARKSSYKEHUSET OG I PRIMÆRHELSETJENESTEN I FINNMARK 2013-2015 ANNE METTE ASFELDT og GUNNAR SKOV SIMONSEN
DetaljerMeronem 500 mg Hvert hetteglass innholder meropenem trihydrat tilsvarende 500 mg vannfritt meropenem.
1. LEGEMIDLETS NAVN Meronem 500 mg pulver til infusjons- og injeksjonsvæske, oppløsning Meronem 1 g pulver til infusjons- og injeksjonsvæske, oppløsning 2. KVALITATIV OG KVANTITATIV SAMMENSETNING Meronem
DetaljerUtbrudd og utbruddsmelding i sykehjem. Fylkeskonferanse i Buskerud, april 2015 Emily MacDonald Rådgiver, Folkehelseinstituttet
Utbrudd og utbruddsmelding i sykehjem Fylkeskonferanse i Buskerud, april 2015 Emily MacDonald Rådgiver, Folkehelseinstituttet Oversikt Hva er et utbrudd Utbruddshåndtering i helseinstitusjoner Utbruddsetterforskning:
DetaljerOffisielle retningslinjer for riktig bruk av antibakterielle midler bør også følges.
1. LEGEMIDLETS NAVN Cefotaxim Villerton pulver til injeksjonsvæske, oppløsning. 2. KVALITATIV OG KVANTITATIV SAMMENSETNING Cefotaksimnatrium tilsvarende cefotaksim 0,5 g Cefotaksimnatrium tilsvarende cefotaksim
DetaljerLost in Translation ESBL fra sykehus til kommune
Lost in Translation ESBL fra sykehus til kommune Smittevernoverlege Bjørg T. Dysthe Bærum kommune NSH Hamar 15.10.14 ESBL egenskap Extended-spectrum beta-lactamases Enzym som bryter beta-lactamring i penicillin
DetaljerTotal bakterieovervåking i løpet av minutter. - Hva indikerer bakterier og hvordan (hvorfor) bør vi måle på dette?
Aktuelle VA Utfordringer Total bakterieovervåking i løpet av minutter. - Hva indikerer bakterier og hvordan (hvorfor) bør vi måle på dette? Eirik Ansnes HOUM AS Morten Miller Mycometer A/S Aktuelle VA
DetaljerBasal mikrobiologi og mikrobiologisk prøvetaking
1 Basal mikrobiologi og mikrobiologisk prøvetaking Overlege Gry Klouman Bekken OUS 2 Disposisjon Definisjon og inndeling av mikrober Forekomst og nytte Bakterier Normalflora vs. Sykdomsfremkallende bakterier
DetaljerMikrobiologiske prøver i allmennpraksis: Forbedringspotensiale? Nils Grude Mikrobiologisk avd. SiV, Tønsberg
Mikrobiologiske prøver i allmennpraksis: Forbedringspotensiale? Nils Grude Mikrobiologisk avd. SiV, Tønsberg Veileder: Eget kapittel + hurtigguide for mikrobiologiske undersøkelser Andre labundersøkelser:
DetaljerMikrobiologisk prøvetaking i. akuttmottaket
Mikrobiologisk prøvetaking i Laktoseskål (G-) akuttmottaket Frank O. Pettersen Overlege, Phd Infeksjonsavdelingen, OUS Sjokoladeskål Blodskål Rekvisisjonen FOPettersen/OUS/2016 2 Rekvisisjonen Legehenvisning
DetaljerREFERAT FRA MØTE I FAGRÅDET FOR NORM 20. OKTOBER 2016
REFERAT FRA MØTE I FAGRÅDET FOR NORM 20. OKTOBER 2016 Til stede: Forfall: Dag Harald Skutlaberg (HUS), Thea Bergheim (OUS, NITO), Aasmund Fostervold (SUS, NFMM), Knut Eirik Eliassen (ASP, NFA), Heidi Cecilie
DetaljerURINVEISINFEKSJON Sølvi Antonsen Oktober 06 Urinveisinfeksjoner 10-15% 15% prevalens i medisinske avdelinger 1/3 av alle nosokomiale infeksjoner I Norge: - > 100 000 konsultasjoner årlig - > 20 000 sykehusinnleggelser
Detaljer