NOTAT. Eksempler på mikrobiologi. 1. Testcase

Transkript

1 NOTAT Til Leverandører og IT-personell Fra Annebeth Askevold, KITH Dato Tema Eksempelmeldinger på mikrobiologisvar Eksempler på mikrobiologi Notatet inneholder noen eksempler på mikrobiologisvar, og hvordan disse eksemplene representeres i XML-meldingen. Eksemplene forutsetter versjon 1.1 av svarmeldingen (svar-v11.xsd). 1. Testcase For at mottager skal kunne avgjøre hvilke data som hører til resistensbestemmelse på en enkel måte er det lagt inn type tekstsvar med kodeverdi LR for alt som skal i svardelen. Resistensbestemmelser ligger sortert under den enkelte bakterie, men type tekstsvar har kodeverdi RSB (Resistensbestemmelse). Dette er gjort for at mottager skal kunne sortere ut resistensbestemmelsene for å kunne presentere disse i en tabell. Spørsmål fra KITH: Tieto Enator bruker betegelsen Stamme A, B, C etc. Steria benytter Identifikasjon 1, 2, 3 etc. Bør dette navngis individuelt eller kan man enes om en felles betegnelse? I eksemplene er det benyttet Identifikasjon, og de har fått nummer eller bokstav etter seg når de er fulgt videre med resistensbestemmelse. Mulig at dette bør løses på en annen måte. Når vi har fått svar/synspunkter fra dere vil vi ta dette opp med primærlegeleverandørene også. Spørsmål fra KITH: Vi har vi kalt undersøkelsen funn når det ikke gjøres dyrkning videre - dette kan endres hvis ønskelig. Spørsmål fra KITH: Vi er usikre på plasseringen av kommentarer om S=Sensitiv, I=, R=... Vi har foreløpig plassert den på første forekomst av resistensbestemmelse. Vi må ha en gjennomgang sammen med primærlegeleverandørene i forhold til hvordan svarene skal tolkes Case 1 Besvarelse av bakt. Us, enkel resistenspakke Tjeneste Mikrobiologi Pasient Roland Gndersen Fødselsnummer:

2 Adresse: Åssiden Drammen Rekvirent Navn legesenter: Kattskinnet legesenter Organisasjonsnr: Navn fastlege: August September HPR-nr: HER-id: E-postadresse: Tjenesteyter: Haukeland Universitetssykehus Org. nr: Lokal prøveid: #1-MBIO-Urin tatt dato: mottatt dato: Type materiale: Urin Status: Endelig Kommentar til hele svarrapporten: Alle undersøkelser på denne prøven er nå besvart Undersøkelse Svar Kommentar Svardato Urin dyrkning Vekst Vekst av mer enn en bakterie indikerer mulig forurensning Identifikasjon #A Stamme A: Enterococcus Faecalis Mengde > / ml Ampicillin S Doxycyclin S Nitrofurantoin S Identifikasjon Alfahemolytiske streptokokker Mengde > / ml Kommentar: Alle undersøkelsene spesifiseres i henhold til lokale kodeverk såfremt det ikke fines nasjonale kodeverk som undersøkelsen kan oppgis under (f.eks. NPU-kode, Snomed-kode, Norakokode). Lokale kodeverk oppgis med Uspesifisert laboratoriekodeverk med oid= Lokale koder oppgis i attributtet OT (se eksempelmelding) 2

3 3

4 Case 2 - Besvarelse av bakt. Us med mange funn, enkel resistens og lokasjon Tjeneste Mikrobiologi Pasient Roland Gndersen Fødselsnummer: Adresse: Åssiden Drammen Rekvirent Navn legesenter: Kattskinnet legesenter Organisasjonsnr: Navn fastlege: August September HPR-nr: HER-id: E-postadresse: katskin@noline.no Tjenesteyter: Haukeland Universitetssykehus Org. nr: Avdelingsnr Lokal prøveid: #2-MBIO-sekret tatt dato: Type materiale: Sårsekret Anatomiisk lokasjon: Legg Status: Endelig Kommentar til hele svarrapporten: Alle undersøkelser på denne prøven er nå besvart Undersøkelse Svar Kommentar Svardato Aerob dyrkning Vekst Identifikasjon Streptococcus Milleri Abscessogen Rikelig vekst mikrobe Identifikasjon #A: Stamme A: ASTAPHYLOCOCCUS Rikelig vekst AUREUS, BETALAKTAMASEPRODUSERENDE Clindamycin S Erytromycin S Fucidin S Kloksacillin/Diklo S Penicillin G R Identifikasjon BETAHEMOLYTISKE STREPTOKOKKER Gr. B Rikelig vekst

5 Identifikasjon Pseudomonas Aeruginosa Rikelig vekst Case 3 Bakt. Us, fæcesprøve med flere us. Tjeneste Mikrobiologi Pasient Gry Telokk Fødselsnummer: Adresse: Lungegaardsbakken Bergen Rekvirent Navn legesenter: Kattskinnet legesenter Organisasjonsnr: Navn fastlege: Rita Lin HPR-nr: HER-id: E-postadresse: katskin@noline.no Tjenesteyter: Lokal prøveid: #3-MBIO-Fæces tatt dato: mottatt dato: Type materiale: Fæces Status: Endelig Kommentar til hele svarrapporten: Disse us svares siden: Treponema EIAIg Undersøkelse Svar Kommentar Svardato Ansvarlig Salmonella dyrkning Negativ May Blomst Shigella dyrkning Negativ May Blomst Camplybakter dyrkning Negativ May Blomst Yersina durkning Negativ Rikelig vekst av PROTEUS SPECIES, Uttrykk for forstyrret tarmflora May Blomst 5

6 CL. Difficile Toxin A/B ELISA Positiv Funnet må vurderes opp mot klinikken. Asymptom.bærertilstand av toxin A/B prod.stammer forekommer Inge Lab I dette eksempelet er det oppgitt navn på medisinsk ansvarlig for analyseresultatet. Det er mulig å oppgi mer detaljerte opplysninger for medisinsk ansvarlig hvis dette er ønskelig (stillingsbetegnelse, HPR-nr. etc) Case 4- Serologi us. uten parallell Tjeneste Mikrobiologi Pasient Roland Gndersen Fødselsnummer: Adresse: Åssiden Drammen Rekvirent Avdeling/Post: Ortopedisk operasjonsavdeling Id: Tjenesteyter: Lokal prøveid: #4-MBIO-Serum tatt dato: mottatt dato: Type materiale: Serum Kommentar: Kopi, n er innsendt av ort.- sengepost A2, Status: Endelig Kommentar til hele svarrapporten: Disse us svares siden: Treponema EIAIg Undersøkelse Svar Kommentar Svardato Utførende Hepatitt B S - antigen Negativ May Blomst Hepatitt Bcore antistoff Negativ May Blomst total Hepatitt B S - antistoff Negativ May Blomst Hepatitt C - antistoff Negativ May Blomst 6

7 Cytomegalovirus IgM - ELISA Cytomegalovirus IgG - ELISA Negativ Positiv Tidligere gjennomgått infeksjon Inge Lab Inge Lab I dette eksempelet er det oppgitt navn på medisinsk ansvarlig for analyseresultatet. Det er mulig å oppgi mer detaljerte opplysninger for medisinsk ansvarlig hvis dette er ønskelig (stillingsbetegnelse, HPR-nr. etc) Case 5 Bakt us, enkel besvarelse urindyrkning Tjeneste Mikrobiologi Pasient Gry Telokk Fødselsnummer: Adresse: Lungegaardsbakken Bergen Rekvirent Avdeling: Kirurgisk sengepost A4 Avdelingsnr (lokal): Tjenesteyter: Lokal prøveid: #3-MBIO-Urin tatt dato: mottatt dato: Type materiale: Urin Status: Endelig Kommentar til hele svarrapporten: Alle undersøkelser på denne prøven er nå besvart Undersøkelse Svar Kommentar Svardato Ansvarlig Urin dyrkning Ingen vekst May Blomst 7

8 1.5. Case 6 - Besvarelse av bakt. Us, Urinprøve, 2 mikrober, kommentarer på prøve, til rekvirent, og på prøvemateriale Tjeneste Mikrobiologi Pasient Test Test Fødselsnummer: test Adresse: Gimleveien Bergen Rekvirent Navn legesenter: Kir. avd. Post 1V Organisasjonsnr: Navn lege: Asbjørn Digranes HPR-nr: HER-id: E-postadresse: Kopi til Navn Legesenter: Legesenteret i Loddefjord Organisasjonsnr Navn Lege: Gaute Christensen HPS-nr: Tjenesteyter: Haukeland Universitetssykehus Org. nr: Avdeling: Avd. for mikrobiologi og immunologi Seksjon: Bakteriologisk Seksjon Rekvisisjonsnummer: Lokal prøveid: tatt dato/kl: , 11:30 mottatt dato: Type materiale: Urin Status: Endelig kommentar til rekvirenten: Til vanlig bakt.us. av urin bruk borsyreglass/dyppekultur. Undersøkelse Svar Kommentar Dato/MVAL Dyrkning: Aerobt: Vekst /OKOM Identifikasjon #1 Escherichia coli /OKOM Mengde > / ml /OKOM Ampicillin S /OKOM Mecillinam S /OKOM 8

9 Trimetoprim S /OKOM Trimetoprim sulfa R /OKOM Nitrofurantoin S /OKOM Identifikasjon #2 Klebsiella pneumoniae /OKOM Mengde > / ml /OKOM Ampicillin R /OKOM Mecillinam R /OKOM Trimetoprim S /OKOM Trimetoprim sulfa S /OKOM Nitrofurantoin S /OKOM Kommentar til prøven Alle I tillegg oppvekst av andre mikrober i mindre mengde. Disse oppfattes som forurensing. Dette er kommentar som gjelder hele prøven /OKOM Kommentar: Analysen Mengde er akkreditert. Dato/MVAL er dato for når analysen er medisinsk validert, samt opplysninger om personen som har medisinsk validert analysen. 2. Eksempelmeldinger testcase 2.1. Filnavn på eksempelmeldinger #1-MBIO-Bakt-us-enkel resistenspakke.xml #2-MBIO-Bakt-us-mangeFunn-enkelResistens-Lokasjon.xml #3-MBIO-Bakt-us-fæsesprøve-flere-us.xml #4-MBIO-serologi-us-uten-parallell.xml #5-MBIO-Bakt-us-enkelBesvarelse-urindyrkning.xml #6-MBIO-Bakt-us-urin-toMikrober-dobbelResistens-kommentarer-klinsikeOppl.xml 9