Vegard Eldholm. Molekylær TB epidemiologi
|
|
- Oscar Olsen
- 6 år siden
- Visninger:
Transkript
1 Vegard Eldholm Molekylær TB epidemiologi
2 Molekylærepidemiologiske metoder Sannsynliggjøre eller avkrefte transmisjonslinker mellom TB pasienter. Avdekke krysskontaminasjon i laboratoriet Skille reinfeksjon fra reaktivering
3 Molekylærepidemiologiske metoder Metoder varier mht utstyrsbehov, hurtighet ++ Ulike genetiske markører evolverer ulikt, derfor ulik nøyaktighet Molekylærepidemiologi sammen med «klassisk» epidemiologi svært viktig for å identifisere og bryte pågående smittekjeder
4 Metoder: historikk ~ : RFLP Tidkrevende Krever mye DNA av god kvalitet For «gruppering», tolkning, deling må man transformere data analog digital. Stort rom for feil
5 Metoder: historikk ~1995-i dag: Spoligotyping + - Stabile mønstre Stabile mønstre Raskt & enkelt (PCR) Dårlig oppløsning Databaser «homoplasier»
6 MIRU-VNTR (fra 2005) Rutinemetode på FHI + store deler av Europa + verden Rask (PCR) OK oppløsning + - Deling & Database Krever kapillær elektroforese (HT) Homoplasier Ikke god nok oppløsning til å konkludere ang utbrudd/transmisjon
7 Like MIRU profiler kan være (og er/var) et seleksjonkriterium for igangsetting av epidemiologiske undersøkelser. Dessuten: data velegnet for deling og felles europeisk overvåkning MIRU data for MDR-stammer rapporteres til TESSy (The European Surveillance System)
8 Neste-generasjon sekvensering (NGS) Alle Mtb stammer sekvenseres ved FHI, men foreløpig ikke i «real-time» Rutine-workflow under etablering Verdifullt for utbruddsovervåkning: slektskap mellom stammer kartlegges detaljert ved å identifisere forskjeller i enkeltnukleotider (SNPer) Mtb: 4.4 millioner bp Får også detaljert info om resistensmutasjoner
9 M. tuberculosis kan deles inn i 7 «lineages» Disse er i større eller mindre grad assosiert med spesifikke geografiske områder Pepperell et al - unpublished Bentley S et al Plos negl trop dis 2012
10 Relevant også for tolkning av MIRU data. I Norge er TB byrden størst blant ikke-etniske nordmenn. I Afghanistan er f.eks L2 utbredt, på Afrikas horn L1 og L3 etc Typiske cut-off for å si at to stammer er «genomisk linka»: 3-12 SNPer (stort spenn altså vi vil aldri få en fasit) MIRU presterer ulikt for ulike lineages. For identiske MIRU typer (D. Wyllie presentation «TB is changing»): median SNP-forskjeller L4 19 L1 220 Identiske MIRU profiler er absolutt ingen garanti for direkte smitte eller at to personer er nære hverandre i en smittekjede
11 NGS har åpenbare fordeler for overvåkning Mye mer detaljert bilde, resistensmutasjoner kan påvises direkte, svært bra utgangspunkt for kontakt-sporing Kan spare ressurser ved å ikke igangsette unødvendig smitte-sporing
12 MIRU WGS Bjorn-Mortensen et al 2016 Sci Rep
13 NGS på FHI (TB): noen funn Plassere utbrudd i større kontekst, studere spredning i tid og rom, påvise resistens etc. Eldholm et al 2016 PNAS Studere TB transmisjon og resistensutvikling etc som funksjon av vertens HIV status Eldholm et al 2016 elife
14 NGS på FHI (TB): noen funn NGS avdekker MIRU-homoplasier
15 Studie av stort MIRU-cluster, i hovedsak assosiert med pasienter fra Afrikas horn (stamme: L3) MIRU-homoplasier + Stor genetisk variasjon i MIRU cluster Gjennomsnittelig parvis SNPdistanse: 57 SNPs
16 NGS i rutinen Under etablering. Brukes bare til identifikasjon av resistens ved mistanke. Per i dag bruker vi SeqSphere for NGS-basert overvåkning. (wgmlst). Kontinuerlig oppdatert intern database. Detaljert oversikt over slektskap som oppdateres fortløpende med nye isolater.
17 SeqSphere (NGS): MIRU-klynge kan være så mangt Utbrudd Oslo: Utbrudd (?) nord på:
18 NGS på mellomlang sikt Vil kunne gjøres hurtig Vil overta for MIRU Vil overta for fenotypisk DST (?) (Direkte fra sputum/vev/væske?) Uansett bør vi lagre kulturer. Plutselig dukker det opp nye spm/metoder
19 Takk til: Janne Oseberg Rønning, Anne Torunn Mengshoel og alle på TB labben på FHI + diverse samarbeidspartnere
Helgenomsekvensering for epidemiologisk overvåking av TB Nasjonalt referanselaboratorium for mykobakterier Avdeling for tuberkulose, blod og seksuell
Helgenomsekvensering for epidemiologisk overvåking av TB Nasjonalt referanselaboratorium for mykobakterier Avdeling for tuberkulose, blod og seksuell smitte Anne Torunn Mengshoel Overlege Bidrag fra Vegard
DetaljerTuberkulose, bruk av nye metoder i smitteoppsporing. Trude Margrete Arnesen, FHI Smitteverndagene
Tuberkulose, bruk av nye metoder i smitteoppsporing Trude Margrete Arnesen, FHI Smitteverndagene 2019 1405-14.30 Kort om tuberkulose, smitteoppsporing, molekylærepidemiologiske metoder -hva er nytt? Kort
DetaljerProblembakterier karakterisering og genotyping. André Ingebretsen Avdeling for smittevern og Avdeling for mikrobiologi Oslo universitetssykehus
Problembakterier karakterisering og genotyping André Ingebretsen Avdeling for smittevern og Avdeling for mikrobiologi Oslo universitetssykehus Mikroorganismer finnes i alle miljøer? Estimat av biodiversitet
DetaljerAkvatisk smitteovervåkning med miljø-dna
Akvatisk smitteovervåkning med miljø-dna edna sporing av Gyrodactylus salaris edna overvåkning av Aphanomyces astaci - krepsepest Trude Vrålstad Forskningsgruppe Fiskehelse Haakon Hansen Trude Vrålstad
DetaljerMultinasjonalt utbrudd av Salmonella Enteritidisi Europa. Lin Thorstensen Brandal Avd. for smitte fra mat, vann og dyr Nasjonalt folkehelseinstitutt
Multinasjonalt utbrudd av Salmonella Enteritidisi Europa Lin Thorstensen Brandal Avd. for smitte fra mat, vann og dyr Nasjonalt folkehelseinstitutt Nasjonal referansefunksjon for næringsmiddelbårne bakterier
DetaljerHva kan vi bruke WGS til?
Hva kan vi bruke WGS til? (innen klinisk bakteriologi / forskning) Ola Brynildsrud Bioinformatiker/forsker Folkehelseinstituttet En forelesning på Bioingeniørdagen, 11. april 2018 «In five years time,
DetaljerScreening for TB og LTBI - endring i anbefaling fra 1. mars
Screening for TB og LTBI - endring i anbefaling fra 1. mars Tuberkulosedagen 24 mars 2017 Trude M. Arnesen, Overlege dr med Avdeling for tuberkulose, blod- og seksuell smitte Tema Hvorfor screene for TB?
DetaljerTuberkulose - diagnostiske og epidemiologiske laboratoriemetoder
Tuberkulose - diagnostiske og epidemiologiske laboratoriemetoder Turid Mannsåker Nasjonalt referanselaboratorium for mykobakterier Smitteverndivisjonen, FHI Dagens tuberkulosekontrollprogram: Viktigste
DetaljerMeslingesituasjonen i Norge og Europa
Meslingesituasjonen i Norge og Europa Øistein Løvoll Avdeling for infeksjonsovervåking Vaksinedagene, 25.09.2008 Meslinger globalt - 2006 242 000 døde av meslinger (beregnet 68% reduksjon fra 2001 Flest
DetaljerErfaringer fra SARS av relevans for MERS?
Erfaringer fra SARS av relevans for MERS? Arne Broch Brantsæter Infeksjonsmedisinsk avdeling og NBC-senteret Oslo universitetssykehus Fagseminar 25.09.2013 Innhold SARS Kort historikk Svikt Suksess SARS
DetaljerINNOVASJON OG PRODUKTUTVIKLING
Nina Santi -Nyheter fra AquaGen INNOVASJON OG PRODUKTUTVIKLING Produktutviklingsløp for QTL-innOva Fenotyping Genotyping QTL-søk Utvikle test Validere Markeds -lansere Felt evalueri ng Mekanis me 1-3 år
DetaljerAVL MOT ILA. FHFs ILA workshop Borghild Hillestad April 2017
AVL MOT ILA FHFs ILA workshop Borghild Hillestad April 2017 HVA BOR I GENOMET TIL EN ART? Det genetiske mangfoldet hos en art kan være enormt MENNESKER KAN STYRE GENETIKKEN I FLERE RETNINGER En negativ
DetaljerLaboratorieundersøkelser av mykobakterier. Christian Lidstedt. Bioingeniør ved avdeling for medisinsk mikrobiologi
Laboratorieundersøkelser av mykobakterier Christian Lidstedt. Bioingeniør ved avdeling for medisinsk mikrobiologi 1. Arbeid i P3-lab 2. Bakteriens virulensegenskaper 3. Prøvetakning Strenge smittevernregler
DetaljerLA-MRSA. Estimert at over 60% av kommende menneskepatogene bakterier stammer fra dyr. Cutler, Emerging Infect Dis 2010 NATURE VOL 499 25 JULY 2013
LA-MRSA NATURE VOL 499 25 JULY 2013 Estimert at over 60% av kommende menneskepatogene bakterier stammer fra dyr 1 Cutler, Emerging Infect Dis 2010 LA-MRSA S.aureus med meca/ mecc gen nytt penicillinbindende
DetaljerForekomst av tuberkulose globalt og nasjonalt. Einar Heldal og Trude Margrete Arnesen 23 april 2013
Forekomst av tuberkulose globalt og nasjonalt Einar Heldal og Trude Margrete Arnesen 23 april 2013 Tuberkulose-statistikk: Kilder - MSIS-og tuberkuloseregisteret, foreløpige tall fra 2012. www.fhi.no.
DetaljerEHEC-situasjonen i Norge smitteverntiltak ved enkelttilfeller og under utbrudd
EHEC-situasjonen i Norge smitteverntiltak ved enkelttilfeller og under utbrudd Katrine Borgen Avdeling for infeksjonsovervåkning Nasjonalt folkehelseinstitutt November 2013 Overvåkning av EHEC og HUS EHEC:
DetaljerHandlingsplan for å opprettholde Norge fritt for poliovirus
Handlingsplan for å opprettholde Norge fritt for poliovirus Dokumentet er utarbeidet ved Nasjonalt folkehelseinstitutt høsten 2002, basert på THE NORWEGIAN PLAN OF ACTION TO SUSTAIN A POLIOMYELITIS-FREE
DetaljerMiljøundersøkelse ved tuberkulose - erfaringer fra en kommune
Miljøundersøkelse ved tuberkulose - erfaringer fra en kommune Fagdag om tuberkulose Førde sentralsjukehus 16.05.17 Kommuneoverlegen i X kommune En telefon fra tuberkulosekoordinator Mandag 23.januar: Telefon
DetaljerRAPPORT ÅRSRAPPORT. Trude M Arnesen Einar Heldal Anne Torunn Mengshoel Karine Nordstrand
RAPPORT 2019 ÅRSRAPPORT Tuberkulose i Norge 2018 med behandlingsresultater for 2017 Trude M Arnesen Einar Heldal Anne Torunn Mengshoel Karine Nordstrand Årsrapport Tuberkulose i Norge 2018 med behandlingsresultater
DetaljerRAPPORT. Trude M Arnesen Einar Heldal Anne Torunn Mengshoel Karine Nordstrand Karin Rønning
2017 RAPPORT ÅRSRAPPORT Tuberkulose i Norge 2016 med behandlingsresultater for 2015 Trude M Arnesen Einar Heldal Anne Torunn Mengshoel Karine Nordstrand Karin Rønning Årsrapport Tuberkulose i Norge 2016
DetaljerOppfølging av meslingetilfeller
Oppfølging av meslingetilfeller Siri Helene Hauge Overlege, spesialist i samfunnsmedisin Avdeling for infeksjonsovervåking Divisjon for smittevern Vaksinedagene 2015 Innhold Status på meslingetilfeller
DetaljerRAPPORT ÅRSRAPPORT. Karine Nordstrand Trude M Arnesen Einar Heldal Anne Torunn Mengshoel Karin Rønning
RAPPORT 218 ÅRSRAPPORT Tuberkulose i Norge 217 med behandlingsresultater for 216 Karine Nordstrand Trude M Arnesen Einar Heldal Anne Torunn Mengshoel Karin Rønning Årsrapport Tuberkulose i Norge 217 med
DetaljerAntibiotikaresistens Hva er det, og hvorfor angår det sykehjemmene?
Antibiotikaresistens Hva er det, og hvorfor angår det sykehjemmene? Overlege Ragnhild Raastad Regionalt kompetansesenter for smittevern HSØ Disposisjon Hva er antibiotikaresistens? Hvordan oppstår det?
DetaljerHepatitt E infeksjon hos blodgivere
Hepatitt E infeksjon hos blodgivere Svein Arne Nordbø Nasjonal Blodbankkonferanse 3. juni 2015 Virale hepatitter A B C D E Viruskilde feces blod blod blod feces Overføring fecal-oralt parenteralt parenteralt
DetaljerHar vi resistensproblemer i medisinsk mykologi i Norge?
1 Har vi resistensproblemer i medisinsk mykologi i Norge? Årskonferansen 01.12.2016 Cecilie Torp Andersen overlege Avdeling for mikrobiologi OUS Soppinfeksjoner og antimykotika Overfladiske infeksjoner
DetaljerPIAH med fokus på overvåking av antibiotikabruk, Overvåkingsdagen 2010. Janne Møller-Stray Lege Avdeling for infeksjonsovervåking
PIAH med fokus på overvåking av antibiotikabruk, Overvåkingsdagen 2010 Janne Møller-Stray Lege Avdeling for infeksjonsovervåking PIAH? Prevalens av Infeksjoner og Antibiotikabruk i Helseinstitusjoner Prevalensundersøkelser
DetaljerHØRINGSBREV - FORSLAG TIL ENDRING AV FORSKRIFT OM VARSEL OG MELDING OM SJUKDOM HOS DYR
Deres ref: Vår ref: 2015/202349 Dato: 25.06.2018 Org.nr: 985 399 077 HØRINGSBREV - FORSLAG TIL ENDRING AV FORSKRIFT OM VARSEL OG MELDING OM SJUKDOM HOS DYR Det foreslås å innføre meldings og varslingsplikt
DetaljerPoliosituasjonen i verden 2014. Smittevernkonferanse Hamar 23.10. 2014 Karin Rønning Avdelingsdirektør, avdeling for infeksjonsovervåking
Poliosituasjonen i verden 2014 Smittevernkonferanse Hamar 23.10. 2014 Karin Rønning Avdelingsdirektør, avdeling for infeksjonsovervåking Innhold Polio- litt historikk og litt klinikk Status vedr utrydding
DetaljerNFR : Avansert overvåking av introdusert krepsepest (Aphanomyces astaci) for bedre forvaltning av truet ferskvannskreps
NFR-183986 : Avansert overvåking av introdusert krepsepest (Aphanomyces astaci) for bedre forvaltning av truet ferskvannskreps Prosjektleder: Trude Vrålstad Prosjektstipendiat: David Strand Veterinærinstituttet
DetaljerInfluensaliknende sykdom/influenza-like illness 2004-05 2008-09 2009-10 2010-11 2011-12 2012-13. Uke/Week
40 42 44 46 48 50 52 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 % pasienter med ILS % of patients with ILI Influensaovervåking 2012-13, uke 8 Influensaovervåkingen viser at forekomsten av influensaliknende sykdom i uke
DetaljerTuberkulose i Norge 2013. Trude M Arnesen Kari Åse Eide Gunnstein Norheim Anne Torunn Mengshoel Synne Sandbu Brita Winje
2014 Tuberkulose i Norge 2013 - med behandlingsresultater for 2012 Trude M Arnesen Kari Åse Eide Gunnstein Norheim Anne Torunn Mengshoel Synne Sandbu Brita Winje Tuberkulose i Norge 2013 - med behandlingsresultater
DetaljerOppfølging av asylsøkere med tuberkulose. Overlege PhD Ingunn Harstad
Oppfølging av asylsøkere med tuberkulose Overlege PhD Ingunn Harstad Innhold Hva er tuberkulose? Forekomst Smitte Klinikk og behandling Bakgrunn for studien Metode Resultater Oppfølging av screeningfunn
DetaljerMRSA. Antibiotikaresistens i husdyrbruket, Gardermoen 27.-28. mai 2015
MRSA Antibiotikaresistens i husdyrbruket, Gardermoen 27.-28. mai 2015 Carl Andreas Grøntvedt, Dipl. ECPHM Svinehelseansvarlig Veterinærinstituttet Postboks 750 Sentrum 0106 Oslo Tel: 23 21 63 87 Mob: 91
DetaljerOppdatert versjon Forkortinger; FHI=Folkehelseinstituttet, MT = Mattilsynet, Hdir = Helsedirektoratet, FAQ = Frequently asked questions
Retningslinjer for samordning av ekstern informasjon ved nasjonale sykdomsutbrudd i befolkningen som kan skyldes smitte fra næringsmidler eller andre kilder under Mattilsynets forvaltning Oppdatert versjon
Detaljersporing av «rømt» laks med SNP-basert slektskapstesting Kjøglum S., Lien S., Kent M.; Grove H.; Lie Ø.
Konseptbevisgenetisk sporing av «rømt» laks med SNP-basert slektskapstesting Kjøglum S., Lien S., Kent M.; Grove H.; Lie Ø. Bakgrunn Myndigheter, NGO-er og FHL vil ansvarlig gjøre norske oppdrettere for
DetaljerPankreas disease (PD) i Norge betydning av SAV2 og SAV3. v/hilde Sindre, Veterinærinstituttet
Pankreas disease (PD) i Norge betydning av SAV2 og SAV3 v/hilde Sindre, Veterinærinstituttet Pankreas disease (PD) i Norge betydning av SAV2 og SAV3 Resultater fra FHF-prosjekt (900799): Hva betyr ny PDvariant
DetaljerInfluensaovervåking , uke 7
Influensaovervåking 2012-13, uke 7 Influensaovervåkingen viser at forekomsten av influensaliknende sykdom i uke 7 for landet som helhet gikk noe ned sammenliknet med uken før. Antall viruspåvisninger har
DetaljerTuberkulose og forebyggende behandling i Norge, nytt fra FHI
Tuberkulose og forebyggende behandling i Norge, nytt fra FHI Trude Margrete Arnesen, FHI 25.03.2019 Forekomst av tuberkulose i Norge i 2018 Sammenlignet med forekomsten i Europa i 2017 NB! 2018 data er
DetaljerNøyaktig og presis? Er vi skikket til å utføre resistensbestemmelse? Årlig kvalitetskontroll av bioingeniører.
Nøyaktig og presis? Er vi skikket til å utføre resistensbestemmelse? Årlig kvalitetskontroll av bioingeniører. Astrid Lia Fagansvarlig for resistensbestemmelse Mikrobiologisk avdeling, Sykehuset i Vestfold
DetaljerCLOSTRIDIUM DIFFICILE OG SMITTEVERN
CLOSTRIDIUM DIFFICILE OG SMITTEVERN 19. 20. og 27. april 2016 Torunn Nygård Smittevernlege OUS Ullevål CLOSTRIDIUM DIFFICILE Gram positiv, anaerob stav Sporedanner Isolert første gang i 1935, Hall & O`Toole
DetaljerTuberkulose i Norge forekomst og utfordringer
Tuberkulose i Norge forekomst og utfordringer Brita Askeland Winje Avdeling for infeksjonsovervåking Landskonferanse om tuberkulose, 24.03.2009 Meldte tilfeller tuberkulose i Norge 1962-2008, etter opprinnelse
DetaljerHvor mange tb-tilfeller hos våre HIV-pasienter kunne vi forhindret? Arild Mæland Oslo 19.mars 2013
Hvor mange tb-tilfeller hos våre HIV-pasienter kunne vi forhindret? Arild Mæland Oslo 19.mars 2013 Øivind Nilsen, FHI, Mars 2013 Våre egne anbefalinger «fra gammmelt av» Nye HIV-pasienter Mantoux-testes
DetaljerTuberkulose - fremdeles en trussel for folkehelsen? Smittevernkonferansen 03.11.15 Tore Stenstad, seksjonsleder infeksjon - hematologi
Tuberkulose - fremdeles en trussel for folkehelsen? Smittevernkonferansen 03.11.15 Tore Stenstad, seksjonsleder infeksjon - hematologi Disposisjon Bakgrunn og historikk Epidemiologiske trender Globalt
DetaljerGenetiske undersøkelser av biologisk materiale
Genetiske undersøkelser av biologisk materiale Torunn Fiskerstrand, overlege PhD Senter for klinisk medisin og molekylærmedisin, Haukeland Universitetssykehus Institutt for klinisk medisin, Universitetet
DetaljerTvangssaker etter smittevernloven
Oslo kommune Helseetaten Tvangssaker etter smittevernloven Tore W Steen 21.03.2014 Bakgrunn Smittevernloven i kraft fra januar 1995 Hovedprinsipp: frivillighet Kapittel 5: tvangstiltak 5-1: En smittet
DetaljerForskningsprosjekter på Sørlandet sykehus HF. Unn Ljøstad og Åslaug R. Lorentzen Nevrologisk avdeling
Forskningsprosjekter på Sørlandet sykehus HF Unn Ljøstad og Åslaug R. Lorentzen Nevrologisk avdeling ÅPENT MØTE OM DIAGNOSTIKK AV LYME BORRELIOSE 16.NOVEMBER 2013 Sørlandet sykehus har forsket på Epidemiologi
DetaljerAnkomstscreening og smittsomme sykdommer blant nyankomne innvandrere
Ankomstscreening og smittsomme sykdommer blant nyankomne innvandrere 24 oktober Trude M. Arnesen, overlege dr. med Avdeling for tuberkulose, blod- og seksuell smitte Verden blir liten. Smittsomme sykdommer
DetaljerResistensbestemmelse av gonokokker. Martin Steinbakk Avd. for bakteriologi og infeksjonsimmunologi, Div. for smittevern, FHI
Resistensbestemmelse av gonokokker Martin Steinbakk Avd. for bakteriologi og infeksjonsimmunologi, Div. for smittevern, FHI Neisseria gonorrhoeae G-negativ diplokokk Kravstor 11 arter Neisseria koloniserer
DetaljerPåvisning av resistens hos M. tuberculosis-komplekset
Påvisning av resistens hos M. tuberculosis-komplekset Anne Torunn Mengshoel Overlege Avdeling for tuberkulose, blod og seksuell smitte Nasjonalt referanselaboratorium for mykobakterier Folkehelseinstituttet
DetaljerAkutte hendelser innen smittevernet. Oppdage, varsle og oppklare. Systemer for å: Georg Kapperud
Akutte hendelser innen smittevernet Systemer for å: Oppdage, varsle og oppklare Georg Kapperud Hva er en akutt hendelse? Sykdomsutbrudd eller et enkelttilfeller av alvorlig, smittsom sykdom Utbrudd Flere
DetaljerIndekser i avlsarbeidet: Kan vi se om de virker? Jørgen Ødegård Avlsforsker
Indekser i avlsarbeidet: Kan vi se om de virker? Jørgen Ødegård Avlsforsker Gentisk fremgang Hver generasjon står på skulderne til forrige generasjon Fremgangen er varig Selv om avlsarbeidet skulle stoppe
DetaljerEksomsekvensering og MODY Nålen i høystakken eller nyttig diagnostisk verktøy?
Eksomsekvensering og MODY Nålen i høystakken eller nyttig diagnostisk verktøy? Lege og stipendiat Henrik Irgens KG Jebsen Senter for diabetesforskning HUS/UIB MODY Klassiske kliniske kriterier: Dominant
DetaljerAntibiotikaresistens og antibiotikapolitikk i kommunene. Andreas Radtke Smittevernoverlege, PhD St.Olavs Hospital
Antibiotikaresistens og antibiotikapolitikk i kommunene Andreas Radtke Smittevernoverlege, PhD St.Olavs Hospital 1 2 Works Progress Administration, 1936 From: Trends in Infectious Disease Mortality in
DetaljerPopulasjonsgenomikk på torsk -et verktøy for identifisering av viktige genomiske regioner for oppdrettsnæringen.
Programkonferansen HAVBRUK 2012, Stavanger, 16.-18. april 2012 Populasjonsgenomikk på torsk -et verktøy for identifisering av viktige genomiske regioner for oppdrettsnæringen. Paul R. Berga, Bastiaan Stara,
DetaljerInfluensaliknende sykdom/influenza-like illness Uke/Week
40 42 44 46 48 50 52 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 % pasienter med ILS % of patients with ILI Influensaovervåking 2012-13, uke 5 Influensaovervåkingen viser at forekomsten av influensaliknende sykdom i uke
DetaljerInfluensaovervåking , uke 6
40 42 44 46 48 50 52 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 % pasienter med ILS % of patients with ILI Influensaovervåking 2012-13, uke 6 Influensaovervåkingen viser at forekomsten av influensaliknende sykdom i uke
DetaljerResistensbestemmelse av gonokokker. Martin Steinbakk Avd. for bakteriologi og infeksjonsimmunologi, Div. for smittevern, FHI
Resistensbestemmelse av gonokokker Martin Steinbakk Avd. for bakteriologi og infeksjonsimmunologi, Div. for smittevern, FHI Neisseria gonorrhoeae G-negativ diplokokk Kravstor 11 arter Neisseria koloniserer
DetaljerVaksinasjon mot poliomyelitt i norske flyktningemottak 2014. Smitteverndagene 2014 Karin Rønning Avdelingsdirektør, avdeling for infeksjonsovervåking
Vaksinasjon mot poliomyelitt i norske flyktningemottak 2014 Smitteverndagene 2014 Karin Rønning Avdelingsdirektør, avdeling for infeksjonsovervåking Innhold Polio- klinikk og vaksiner Status vedr utrydding
DetaljerAFA-kurs 2013 6. November OUS-Rikshospitalet
ESBL A & ESBL M-C AFA-kurs 2013 6. November OUS-Rikshospitalet Ørjan Samuelsen, Forsker Kompetansetjeneste for påvisning av antibiotikaresistens (K-res) Avd. for mikrobiologi og smittevern Universitetssykehuset
DetaljerResistent lakselus - kvifor er det eit problem og korleis diagnostisere resistens?
University of Bergen Resistent lakselus - kvifor er det eit problem og korleis diagnostisere resistens? Frank Nilsen Sea Lice Research Centre Institutt for Biologi, Universitetet i Bergen Norwegian School
DetaljerGentesting ved alvorlig sykdom. Rapport fra
Gentesting ved alvorlig sykdom Rapport fra Torunn Fiskerstrand, dr philos, Laboratorieoverlege, spesialist i medisinsk genetikk, amanuensis Møte i Prioriteringsutvalget, Helsedirektoratet 6 april 2017
DetaljerTuberkulose i Norge Med behandlingsresultater
www.fhi.no 2012 Utgitt av Nasjonalt folkehelseinstitutt Februar 2012 Postboks 4404 Nydalen NO-0403 Oslo Telefon: 21 07 70 00 Rapporten kan lastes ned eller bestilles fra Folkehelseinstituttets nettsider
DetaljerOvervåkning av MRSA i Norge Hva gjøres og hva finner vi. Kjersti Wik Larssen Nasjonalt referanselaboratorium for MRSA St.
Overvåkning av MRSA i Norge Hva gjøres og hva finner vi Kjersti Wik Larssen Nasjonalt referanselaboratorium for MRSA St. Olavs Hospital HF Innhold Kort om MRSA Historikk Kort om påvisning av MRSA Overvåkning
DetaljerHendelsesbasert overvåking
Hendelsesbasert overvåking Katrine Borgen Avdeling for infeksjonsovervåking Folkehelseinstituttet Smitteverndagene 18. 19. mai 2011 Hendelse? 300 ungdommer fra Sverige, Danmark og Norge er samlet på et
DetaljerGenkartlegging. Hva er egentlig et genkart? Genetisk og fysisk kartlegging
NTNU Genkartlegging 1 Termin IC Frank Skorpen Institutt for laboratoriemedisin, barne- og kvinnesykdommer Hva er egentlig et genkart? Kartet over det humane genom gir oss posisjonen av de ca 25,000 genene
DetaljerILA virus HPR0 i norsk oppdrettslaks fylogeografi
Programkonferansen HAVBRUK 2012, Stavanger 16-18 april 2012 ILA virus HPR0 i norsk oppdrettslaks fylogeografi Trude M Lyngstad a, Anja B Kristoffersen a, Monika J Hjortaas a, Magnus Devold b, Vidar Aspehaug
DetaljerMedikamentresistens ved tuberkulose
Medisin og vitenskap Oversiktsartikkel www Medikamentresistens ved tuberkulose 2588 92 Sammendrag Bakgrunn. Fremveksten av resistent tuberkulose er en av hovedutfordringene i bekjempelse av tuberkulose
DetaljerMuligheter og begrensninger med genotypisk påvisning av resistens DAGENS ARBEIDSFLYT. Whole genome sequencing (WGS) 19.11.2014
Muligheter og begrensninger med genotypisk påvisning av resistens TØ-28244 Antibakterielle resistensmekanismer, metoder for påvisning, tolkning og klinisk betydning Tromsø, 20.11.14 Arnfinn Sundsfjord
DetaljerNGS (Neste Generasjons Sekvensering) i diagnostikk, erfaringer og resultater
NGS (Neste Generasjons Sekvensering) i diagnostikk, erfaringer og resultater Emiel Janssen Seksjonsleder for Kvantitativ og Molekylær Patologi Daglig leder for laboratoriet for molekylær biologi Avdeling
DetaljerTuberkulose i Norge - og fastlegen. PMU 22.10.2014 Karin Rønning, avdelingsdirektør/ overlege
Tuberkulose i Norge - og fastlegen PMU 22.10.2014 Karin Rønning, avdelingsdirektør/ overlege Faglig veileder FHI Smitteverntiltak Screening Smitteoppsporing Plikter og retter Lov og forskrift Begrensninger
DetaljerAntibiotikaresistens - forekomst, konsekvenser og utfordringer. Regionsmøte Helse Vest, mai 2019 Petter Elstrøm Folkehelseinstituttet
Antibiotikaresistens - forekomst, konsekvenser og utfordringer Regionsmøte Helse Vest, mai 2019 Petter Elstrøm Folkehelseinstituttet Disposisjon Forbruk av antibiotika Forekomst av resistente bakterier
DetaljerTuberkulose i Afrika for Afrikastudiet 2012-1 Sykdommen. Lungelege Phd Ingunn Harstad
Tuberkulose i Afrika for Afrikastudiet 2012-1 Sykdommen Lungelege Phd Ingunn Harstad Innhold Risikofaktorer for tuberkulose Smitte - sykdom Hva er tuberkulose (TB) Barn Diagnose Behandling Konsekvenser
DetaljerTuberkulose i Norge Trude Arnesen Einar Heldal Turid Mannsåker Synne Sandbu Karin Rønning Kari Åse Eide
2012 Tuberkulose i Norge 2010-2011 Med behandlingsresultater 2009-2010 Trude Arnesen Einar Heldal Turid Mannsåker Synne Sandbu Karin Rønning Kari Åse Eide Tuberkulose i Norge 2010 og 2011 Behandlingsresultater
Detaljer«Hvorfor er tuberkulose fortsatt viktig?»
1 Tale fra Camilla Stoltenberg på Tuberkulosedagen, Oslo kongressenter 25. mars 2019 «Hvorfor er tuberkulose fortsatt viktig?» Globalt hvis vi vender blikket ut i verden - er dette lett å svare på dette
DetaljerHvilke nye krav stiller den persontilpassede kreftdiagnostikken patologifaget overfor?
DMArena: Kreftkonferanse 2014 DM Kreftkonferanse 2014: Det Norske Radiumhospital, 3 April, kl. 13.00-18.00 Hvilke nye krav stiller den persontilpassede kreftdiagnostikken patologifaget overfor? Disclosure:
DetaljerAlle pasienter som gjennomgår det eller de inngrep som overvåkes ved sykehuset, skal inkluderes.
NOIS Rapportering [Oppdatert 28.02.2013 av Daniel Gjestvang] Formålet med NOIS er å forebygge infeksjoner gjennom en fortløpende og systematisk innsamling, analyse, tolkning og rapportering av opplysninger
DetaljerVisjonene bakteriologi / genteknologi
NFMM Fagmøte 29.01.09 Medisinsk mikrobiologi - et fag nær undergangen? Visjonene bakteriologi / genteknologi Kåre Bergh NTNU / DMF ; St.Olavs Hospital, AMM For de med anlegg for å se mørkt på perspektivene:
DetaljerAlvorlige resistensformer påvist hos bakterier fra norske produksjonsdyr
Alvorlige resistensformer påvist hos bakterier fra norske produksjonsdyr ARVE LUND OG MARIANNE SUNDE Veterinærinstituttet Innledning Norsk overvåkingsprogram for antibiotikaresistens i mikrober fra fôr,
DetaljerPopulasjonsovervåkning av jerv ved hjelp av ikke-invasiv DNA analyse.
Populasjonsovervåkning av jerv ved hjelp av ikke-invasiv DNA analyse. Bakgrunn Den skandinaviske populasjonen av jerv er i dag gjennom yngleregistreringer estimert til 595 ± 69 SE individer og må ansees
Detaljer10. april 2014 Folkehelseinstituttet 1 GONORÉ OG SYFILIS I NORGE I 2013
GONORÉ OG SYFILIS I NORGE I 2013 Folkehelseinstituttet overvåker gonoré- og syfilissituasjonen i Norge ved anonymiserte meldinger fra leger til Meldingssystem for smittsomme sykdommer (MSIS). Både antall
DetaljerLINEZOLIDRESISTENS HOS GRAM-POSITIVE KOKKER
LINEZOLIDRESISTENS HOS GRAM-POSITIVE KOKKER KRISTIN HEGSTAD INNHOLD Linezolid Prevalens resistens Tedizolid nytt oxazolidinon Kliniske brytningspunkter Resistensmekanismer Molekylære metoder for deteksjon
DetaljerÅrsrapport for 2017: Cytomegalovirus referanse- Funksjon ved Avdeling for mikrobiologi, Oslo universitetssykehus
Årsrapport for 2017: Cytomegalovirus referanse- Funksjon ved Avdeling for mikrobiologi, Oslo Agens Cytomegalovirus (CMV) Oslo Postboks 4956 Nydalen 0424 Oslo Klinikk for laboratoriemedisin Avdeling for
DetaljerPlan for å eliminere meslinger og rubella i Norge
Plan for å eliminere meslinger og rubella i Norge Vaksinedagene 2012 Avdelingsdirektør Karin Rønning, Folkehelseinstituttet avdeling for infeksjonsovervåking Hvorfor overvåke? Hvorfor lage plan for eliminasjon
DetaljerUtbruddet i 2005 Nasjonalt Folkehelseinstitutt:
Utbruddet i 2005 Nasjonalt Folkehelseinstitutt: Smitten kan med stor sannsynlighet tilskrives skrubber ved Borregaard: Anlegget kan ha riktig temperatur, biofilm og spre aerosoler Bosteds- og bevegelsesanalyser
DetaljerKosmos SF. Figurer kapittel 8 Den biologiske tidsalderen Figur s. 214 BIOTEKNOLOGI. Næringsmiddelindustri. Landbruk. Akvakultur
Figurer kapittel 8 Den biologiske tidsalderen Figur s. 214 Proteiner fra olje og gass Bryggerier Meierivirksomhet Næringsmiddelindustri Fiskeavl Akvakultur Genmodifiserte organismer Planteavl Landbruk
DetaljerHva vet vi om effekt og gjennomføring av BCG-vaksinering i Norge? Hanne Nøkleby Folkehelseinstituttet
Hva vet vi om effekt og gjennomføring av BCG-vaksinering i Norge? Hanne Nøkleby Folkehelseinstituttet 19. mars 2018 Problemstilling: Hva har skjedd etter at BCG ble tatt ut av barnevaksinasjonsprogrammet
DetaljerRødalger i ferskvann
Rødalger i ferskvann Kunnskapsstatus med oversikt over arter i Norge (og Norden) Eli-Anne Lindstrøm, NIVA Jan Rueness, Universitetet i Oslo Maia Røst Kile, NIVA Mål Status for eksisterende kunnskap om
DetaljerMRSA og tuberkulose i allmenpraksis. Nidaroskongressen 22.10.2015 Kjersti Wik Larssen
MRSA og tuberkulose i allmenpraksis Nidaroskongressen 22.10.2015 Kjersti Wik Larssen Hensikt Kjenne til forekomst av MRSA og tuberkulose i Norge og Globalt Kjenne til prøvetaking/diagnostikk for MRSA og
DetaljerMette Klouman, 27/03/2007. Fagsjef, internasjonal tuberkuloseavdeling LHL LHL. Landsforeningen for hjerte- og lungesyke
Mette Klouman, Fagsjef, internasjonal tuberkuloseavdeling LHL LHL 1 27/03/2007 1 Global utbredelse av tuberkulose 2 2 FAKTA- tuberkulose Nærmere 2 milliarder er smittet 8 millioner utvikler sykdommen årlig
DetaljerTuberkulose i Norge Trude M. Arnesen Einar Heldal Anne Torunn Mengshoel Karine Nordstrand Karin Rønning Synne Sandbu
2016 Tuberkulose i Norge 2015 - med behandlingsresultater for 2014 Trude M. Arnesen Einar Heldal Anne Torunn Mengshoel Karine Nordstrand Karin Rønning Synne Sandbu Tuberkulose i Norge 2015 -med behandlingsresultater
DetaljerYersiniose hos laksefisk. Geir Olav Melingen Smoltkonferansen på Smøla 31.oktober 2013
Yersiniose hos laksefisk Geir Olav Melingen Smoltkonferansen på Smøla 31.oktober 2013 Disposisjon Årsak Historikk og utbredelse Sykdomsbeskrivelse Diagnostikk Epidemiologi Forebygging og behandling Bakteriofagterapi
DetaljerESBL. Anna Senske Lege Avdeling for smittevern 19. 20 og 27. april 2016
ESBL Anna Senske Lege Avdeling for smittevern 19. 20 og 27. april 2016 April 2016 Inndeling Hva er ESBL? Forekomsten av ESBL ESBL-spredning ESBL-bærerskap Betydning av ESBL på sykehuset Terapi og sanering
DetaljerForedlingsmetoden fra plusstreutvalg og avkomtesting til molekylær genetikk! Øystein Johnsen, Skog og landskap
Foredlingsmetoden fra plusstreutvalg og avkomtesting til molekylær genetikk! Øystein Johnsen, Skog og landskap St.meld. nr. 39; Klimautfordringene Regjeringen mener økt innsats i skogplanteforedlingen
DetaljerMøtedato: 23. mai 2017 Arkivnr.: Saksbeh/tlf: Sted/Dato: Hanne H. Haukland, Bodø,
Møtedato: 23. mai 2017 Arkivnr.: Saksbeh/tlf: Sted/Dato: Hanne H. Haukland, 75 51 29 00 Bodø, 12.5.2017 Styresak 60-2017 Internasjonal helse - prosjekt Formål Adm. direktør i Helse Nord RHF har orientert
DetaljerGENOMISK SELEKSJON EN REVOLUSJON I AVLSARBEIDET. Øyvind Nordbø og Håvard Tajet
GENOMISK SELEKSJON EN REVOLUSJON I AVLSARBEIDET Øyvind Nordbø og Håvard Tajet GENOMISK SELEKSJON Oversikt Grunnkurs i genetikk Hvordan utnytter vi genotypedata i avlsarbeidet? Genomisk seleksjon øker den
DetaljerØkologiske og genetiske prosesser i naturlige bestander
Økologiske og genetiske prosesser i naturlige bestander 140 Antall voksne individer 120 100 80 60 40 0 1994 1996 1998 2000 2002 2004 2006 År Dr. Henrik Jensen Senter for bevaringsbiologi (CCB) NTNU, Trondheim
DetaljerNy kunnskap i avlsprogram. Anna K. Sonesson
Ny kunnskap i avlsprogram Anna K. Sonesson Avlsprogram Design: strategien som brukes for å forbedre genetiske anlegg Avlsverdiberegning/seleksjonskriterium Avlsmål/ definisjon av egenskaper Nye teknikker
DetaljerVankomycinresistente enterokokker VRE Epidemiologi/utbruddet på Haukeland Universitetssjukehus
Vankomycinresistente enterokokker VRE Epidemiologi/utbruddet på Haukeland Universitetssjukehus Kristin Stenhaug Kilhus LIS, Mikrobiologisk avdeling Haukeland Universitetssykehus 2 Enterokokker Gram positive
DetaljerForskning og nytte, hvordan utvikle samspillet mellom forskning og næringsliv
Forskning og nytte, hvordan utvikle samspillet mellom forskning og næringsliv Einar Rasmussen Tromsø 6. oktober 2015 Økt verdiskaping: Forskning som er relevant for næringslivet? Kunnskapsoverføring blant
DetaljerOm tuberkulose i et globalt perspektiv
Om tuberkulose i et globalt perspektiv Seminar om tuberkulose, Markering av Verdens tuberkulosedag, Oslo 6.april 2016 Einar Heldal, Nasjonalt folkehelseinstitutt Innhold Hvorfor er TB-situasjonen globalt
Detaljer