Tradisjonelle virologiske metoder. Halvor Rollag Avdeling for mikrobiologi Oslo Universitetssykehus Rikshospitalet

Like dokumenter
Serologisk diagnostikk av luftveisinfeksjoner; Hva kan vi? Nina Evjen Mikrobiologisk avdeling Ahus

VEDLEGG NR. 2 TEST CASER

Legionella dyrkning Daglig (man-lør) 7 dager hvis negativ > 7 dager hvis positiv Listeria dyrkning (fra sterile områder) Daglig (man-lør) 5 dager hvis

Erfaringer med diagnostikk av kusmavirus i Trondheim

Oppgave 16.2 fortsetter

Bruk av genteknologiske analyser ved diagnostikk av luftveisinfeksjoner. Gardermoen Svein Arne Nordbø

Holdbarhet (maksimal tid): Kommentar: Prøvebeholder/ Transport-medium: Materiale/ lokasjon: Undersøkelse. Universalcontainer. 2 t ved romtemp.

Svartider for analyser utført av AMS Dokumentansvarlig: Eirik Steinland Godkjent av: Gunnar Skov Simonsen Versjon: 1.16 Gyldig for: Avdeling for mikro

Hurtigdiagnostikk ved luftveisinfeksjoner

Virus: problematikk i forbindelse med immunsuppresjon

Infeksjoner i svangerskapet. Grete A.B. Kro Mikrobiologisk avdeling, OUS Rikshospitalet

Oppgave: MED3300-2_MIKROBIOLOGI_H18_ORD

Parvovirusinfeksjoner Virologi, Klinikk, Patogenese, Diagnostikk. Halvor Rollag Mikrobiologisk institutt Rikshospitalet

Liste over analyser som utføres/evt. videresendes, Enhet for virologi og infeksjonsimmunologi (VIM)

Virusinfeksjoner hos den immunsupprimerte pasienten. Samarbeidsmøte om pancreas- og øycelletransplantasjon

FilmArray i praksis Spesialbioingeniør Hanna Ilag, Bakteriologisk enhet Lege i spesialisering Hanne Brekke, Bakteriologisk enhet

Nytte av prokalsitonin og nøytrofil CD64 som markør for postoperativ infeksjon

Enterovirus D68. Sidsel Krokstad Spesialbioingeniør Avdeling for medisinsk mikrobiologi St.Olavs Hospital

Laboratorieundersøkelser av mykobakterier. Christian Lidstedt. Bioingeniør ved avdeling for medisinsk mikrobiologi

Generell Informasjon om prøvetaking. Anbefalt prøvetakingsutstyr: Gå til det aktuelle prøvematerialet. Tabellen leses fra venstre mot høyre.

Påvisning av anti dsdna men forskjellige metoder og teknikker. Innhold. Årsaksmekanismer. Metoder. Forekomst

Luftveisinfeksjoner - PCR-basert diagnostikk. Anne-Marte Bakken Kran Overlege, førsteamanuensis Mikrobiologisk avd. UOS Ullevål

Hurtigtester innen mikrobiologi. Fredrik Müller Avdeling for mikrobiologi, Oslo universitetssykehus HF

Oppgave: MED1100-3_OPPGAVE4_H17_ORD

Laboratoriediagnostikk ved luftveislidelser

Klinikk for diagnostikk

Norsk kvalitetsforbedring av laboratorieundersøkelser. Program (mikrobiologi, 01/ ) i samarbeid med. Side1

PCR-analyser i rutinediagnostikken Pål A. Jenum

Epidemiologi ved luftveisinfeksjoner (LVI) Susanne G. Dudman og Gabriel Ånestad Avdeling for virologi Nasjonalt folkehelseinstitutt

Vi endrar metode for påvisning av anti dsdna i desse dagar

Mikrobiologisk diagnostikk ved ebolainfeksjon

Virusinfeksjoner ved immunsvikt

CMV STRATEGIMØTE. Diagnostikk ved cytomegalovirus-infeksjoner 12. november Oppsummering, anbefalinger og forelesningsmanuskripter.

KIKHOSTE Diagnostikk. Susanne G. Dudman Overlege dr. med. Avd. for virologi Nasjonalt folkehelseinstitutt

Hvor og hvordan stilles diagnosen. Kort om sykdommen infeksiøs lakseanemi (ILA) Diagnostikk som gjøre av Veterinærinstituttet. Møte Værnes 3.4.

Generell Informasjon om prøvetaking

Mikrobiologisk prøvetakning hva og hvordan

Mikrobiologiske prøver ved borreliose i allmennpraksis. Nils Grude Avd. ovl. Mikrobiologisk avd. SiV, Tønsberg

Hva er en vaksine? Hanne Nøkleby, Nasjonalt folkehelseinstitutt

Influensavaksiner - fra produksjon til injeksjon

Romtemperatur: 24 t Skal ikke fryses benmargsaspirat m Heparin. Kjøleskap 2-8 C: 48 t Romtemperatur: 48 t

ÅRSRAPPORT fra. Nasjonalt referanselaboratorium for Francisella tularensis

Diagnostikk av HIV-infeksjon

Diagnostiske tester. Friskere Geiter Gardermoen, 21. november Petter Hopp Seksjon for epidemiologi

Program 2019 mikrobiologi og patologi

NYHETSAVIS NR. 1/2000 Mai 2000

Virus. Viroider. Prioner. PBM233-Mikrobiologi

Yrkesbetingede infeksjoner hos helsearbeidere

Undersøkelse Miclis-kode Materiale Info om transp Sendes til

SEROLOGIE INFECŢIOASĂ

Cellebiologiske prosesser som respons på virusinfeksjon

Auto/alloadsorbering. Linda Skordal Stavanger universitetssykehus Avdeling for immunologi og transfusjonsmedisin Nasjonal blodbankkonferanse 2018

Legionellaseminar Kristiansund Prøvetaking, analysemetoder og svartid v/ Anne Kristin Gussiås, fagansvarlig analytiker mikrobiologi

Preanalyse. Kurs i Molekylærpatologi Oslo, juni 2017

Påviste og mistenkte tilfeller av pankreassykdom (PD) innsendt til Veterinærinstituttet januar-desember 2011

Naturfag for ungdomstrinnet

Immunitet hos eldre. Lisbeth Meyer Næss Divisjon for smittevern. Vaksinedagene 2010

Hvorfor er kliniske opplysninger viktig for en mikrobiolog?

LEKSJON 4: BIOTEKNOLOGI HVORDAN VI BRUKER NATURENS EGNE MEKANISMER TIL VÅR FORDEL, OG UTFORDRINGENE SOM FØLGER MED

Oppgave: MED1100-3_OPPGAVE2_V18_ORD

Overordna utdanningsplan for medisinsk mikrobiologi i Helse Førde

Smi$eutsa$e grupper MSM Gravide. Torgun Wæhre Infeksjonsmedisinsk avdeling OUS Ullevål

Gynekologi hos fastlegen

Elementærmikrobiologi

Påviste og mistenkte tilfeller av pankreassykdom (PD) innsendt til Veterinærinstituttet januar-desember 2013

Visjonene bakteriologi / genteknologi

Infeksjoner og fatigue. Nina Langeland Infeksjonsseksjonen Haukeland Universitetssykehus og Universitetet i Bergen

Clostridium difficile

Påviste og mistenkte tilfeller av pankreassykdom (PD) innsendt til Veterinærinstituttet januar-desember 2012

Undersøkelse Miclis-kode Materiale Info om transp Sendes til

Vaksiner før og nå (med litt om herpes zoster og ebola)

Årsrapport for 2017: Cytomegalovirus referanse- Funksjon ved Avdeling for mikrobiologi, Oslo universitetssykehus

Flowcytometri ved PNH

BIOS 1 Biologi

Undersøkelse Miclis-kode Materiale Info om transp Sendes til

Påviste og mistenkte tilfeller av Pancreas disease (PD) januar - desember 2009

STRATEGIMØTE MIKROBIOLOGISK DIAGNOSTIKK VED VIRALE CNS- INFEKSJONER 31. OKTOBER Plenumssaken i vaksinebygget, Folkehelseinstituttet

Hepatitt E. Nettundervisning NFIM Overlege Jørn-Åge Longva Medisinsk avd., Ålesund sjukehus

Diagnostikk av diabetes. HbA1c, hvordan skal vi bruke den i hverdagen? Feilkilder og kritisk differanse

Australsk prospektiv studie. Metode Hicke et al. Mononukleose. Resultater Hickie et al. Mange opplever at sykdommen startet med en infeksjon

Virale luftveisinfeksjoner

STRATEGIMØTE DIAGNOSTIKK AV VIRUSINFEKSJONER HOS GRAVIDE OG NYFØDTE. 6. november 2003

ARBEIDSGRUPPE HELSEDIREKTORATET. Testing: ELISA OG WESTERN BLOT (Immunoblot) Min konklusjon

Lab forelesning. C-vitamin. Enzymer i hverdagen

Influensa og immunsystemet Kristin G-I Mohn HUS, Influensasenteret i Bergen

ÅRSRAPPORT Nasjonalt referanselaboratorium for Francisella tularensis

Vinterens virusvarianter Hva visste vi? Hva vet vi? Regionmøte HSØ 5.mars 2018 Avdeling for smittevern, OUS Per Bjark

Borreliadiagnostikk ved Mikrobiologisk avdeling SIV. bioingeniør Anne-Berit Pedersen

Elementær mikrobiologi

a) Hvordan kan alkoholbruk i svangerskapet skade fosteret? (2 poeng)

Hepatitt E infeksjon hos blodgivere

5. T cellers effektorfunksjoner

Viralencephalitt. Nettundervisning

Årsrapport for 2018: Cytomegalovirus-referansefunksjon

Cytomegalovirus (CMV) Medfødt CMV infeksjon CMV - Mikrobiologi Disposisjon Mikrobiologi CMV - Mikrobiologi CMV - Patogenese Patogenese Mikrobiologi

autoimmunologi T E O R I O G R U T I N E D I A G N O S T I K K

Er det noe i utsagnet fra Zambia: Anbefaler nå geitemelk og vitaminer mot HIV. Christine M. Jonassen, Seniorforsker, Senter for laboratoriemedisin

När och hur kan man mäta koagulationsfaktor III?

Utbrudd og utbruddsmelding i sykehjem. Fylkeskonferanse i Buskerud, april 2015 Emily MacDonald Rådgiver, Folkehelseinstituttet

Side 1 av 35 MED1100-3_H15_ORD. Eksamensbesvarelse. Eksamen: MED1100-3_H15_ORD

Transkript:

Tradisjonelle virologiske metoder Halvor Rollag Avdeling for mikrobiologi Oslo Universitetssykehus Rikshospitalet 1

Organisering Påvisning av virus Historisk utvikling Cellekultur Direktepåvisning i prøvematerialer Serologiske metoder KBR HAI Nøytralisasjonstest 2

Diagnostikk av virusinfeksjon ved Påvisning av virus og av spesifikke antistoffer Agens 3

Mosaikksykdom på tobakksplanten 1886. Aldolf Mayer overførte sykdommen med plantesaft. Ingen bakterier 1898 M.W.Beijerinck. Saften beholdt sin sykdomfremkallende også etter filtrering gjennom porselensfiltre. 4

Virus og dyresykdommer Løffler og Frosch 1898 Filtrerbart materiale fra blemmer i munnslimhinnen hos syke dyr kan overføre sykdommen. 5

Tumorfremkallende filtrerbare agens Wilhelm Ellemann og Olaf Bang, 1908 kyllingleukemi Francis Peyton Rous 1910 nobelpris 1967 Filtrat fra blod og og tumor hos høns med sarkom overfører sykdommen til friske høns. 6

Bakterievirus F.W.Twort 1915 F. D herelle 1917 Enzym eller levende vesen 7

Filtrering med ulik porestørrelse 8

Svedbergs ultrasentrifuge 9

Påvirsning av virus ved mikroskopi Lysmikroskopi Florescensmikrospi med UV lys ned mot 0,2µ Elektronmikroskopi fra ca 1930 10

Elektronmikroskopi 10 6 partikler/ml ca 50.000x forst. Adenovirus Rotavirus (courtesy of Linda Stannard, University of Cape Town, S.A.) Anvendelse: virus i avføring, hurtigpåvisning av koppevirus 11

Dyrking av virus I levende dyr I embryonerte egg I vevskultur I cellekultur 12

Inokulasjon av enterovirus på pattende mus 13

Dyrking av virus på embryonerte egg 14

Vevskultur Oppdaget 1906/7 R.G. Harrison Satt i system 1924/25 av Alexis Carrel viste at Roussarkomavirus kunne dyrkes i det uendelige. 1mm 3 vevsbiter i en dråpe serum, hengende, På objektglass I kolber 15

Dyrkning av virus i cellekultur Første dyrking av virus i cellekultur: 1949 dyrking av poliovirus i humane embryonale celler. Nobelpris i 1954 til Fredrick C. Robbins John F. Enders Thomas H. Welles 16

Cellekultur monolayer 17

Cellekultur Primærceller. Fra vev hos dyr eller mennesker. 20 30 passasjer. Eks. HE.celler, monocytter, lymfocytter Apenyrer Cellelinjer Fra cancer celler (Vero, HeLa, A549) Immortaliserte primærceller Eks Raji (EBV) 18

Vekstmedier Vanlige medier: Salter,(BSS, Eagle,Hank) Energi Glukose Essensielle aminosyrer (obs glutamin) Vitaminer Hypoxantin for nukleinsyreprod. Serum (vekstfaktorer) Rensede eller syntetiske vekstfaktorer EGF, IL3, G CSF, Insulin etc avhengig av celletype. Antibiotika Penicillin G, Streptomycin, ev amfoterecin B 19

Vanlig brukte cellekulturer HE celler: Humane embryonale fibroblaster MRC5. Fibroblaster Hep 2 cells Oral cancercellelinje Vero celler: apenyrecellelinje HeLa celler: Cervixcarcinomcellelinje A 549: Lungecancer (pleura?) THP1 celler: Makrofaglignende 20

Virusisolasjon Prøvemateriale i transportmedium. Vevsbiter må homogeniseres. Tilsettes celler som er i deling dvs ikke helt konfluente Inkuberes et visst antall dager avh av virus HSV:3 d CMV: 3 uker 21

Virusisolasjon Mikroskopere 1 3x ukentlig for åse etter cytopatogen effekt. Cytopatogen effekt (CPE) er endringer i cellkulturens morfologi som kan være virusbetinget. Noen virus gir liten eller ingen CPE Ved mistanke om virusinfeksjon passereres celler/medium til ny cellekultur 22

Virus i cellkultur II De fleste cellkulturer er permissive for noen virus. HE: CMV, herpes, adenovirus Vero: Herpes, influensa, enterovirus A 549. Adenovirus Noen virus lar seg ikke dyrke I cellekultur Eks. HBV, HCV 23

Cellekultur monolayer Uinfisert Infisert med adenovirus 24

Cytopatogen effect Influensavirus Herpes simplexvirus 25

Identifikasjon av virus Typisk CPE etter en bestemt tid (CMV) Virusnøytralisasjonstest. (Adeno, influensa etc) Påvisning av virus og type med IF teknikk (HSV) Hemadsorpsjon (orthomyxovirus og paraorthomyxovirus) Elektronmikroskopi PCR 26

Haemadsorption Syncytial formation caused by mumps virus and haemadsorption of erythrocytes onto the surface of the cell sheet. (courtesy of Linda Stannard, University of Cape Town, S.A.) 27

Virusnøytralisasjon Ukjent virus + Kjent antistoff + Cellekultur = Ingen CPE (match mellom virus og antistoff) CPE (ikke match mellom virus og antistoff) 28

Måling av mengde virus ved Plaque-titrering 10 3 10 4 10 5 29

Snøggdiagnostikk 30

Shell vial kultur Celle på et dekkglass I et flatbunnet rør. Legge prøvematerialet på cellelaget Centrifugerer 1500g i 30 min. Vasker Inkuberer I 1 2 døgn Påviser virus med IF teknikk 31

Direkte påvisning av virus i prøvematerialer Nasofarynkssekret Influensavirus A og B, Parainfluensavirus, adenovirus, RS virus Hudblemmer/sår HSV 1 og 2, VZV Blod Cytomegalovirus 32

Influensa virus i celler fra nesen Utstryk av virus på objektglass Fikseres Tilsetting av fluorescinmerket antistoff Ev umerket spesifikt a.s. Deretter merket antiantistoff. 33

Herpes simplexvirus i en hudlesjon 34

CMV pp65 in leukocytter 35

Immundiffusjon 36

Counter immunoelectrophoresis Hepatitt B test 37

Agglutinasjon Påvisning Av virus/virusproteiner Partikler + antistoff Virus Partikler med Spesifikt antistoff Virus Agglutinasjon F.eks hepatitt B virus diagnostikk 38

Pre EIA antistofftester Komplementbindingsreaksjon Haemagglutinasjonsreaksjon Virusnøytralisasjonsreaksjon Gelpresipitasjon Fluorescerende antistoffbestemmelse 39

Typical Serological Profile After Acute Infection Note that during reinfection, IgM may be absent or present at a low level transiently 40

Komplementbindingsreaksjon KBR Bordet og Gengou proisnippet 1901 Syfilistest Wassermann og Neisser 1906 41

Komplementbindingsreaksjon Reaksjon 1 Pasientserum (antistoff?) varmeinaktivert Antigen (virus) Komplement (marsvinserum i forhåndsbestemt mengde) Reaksjon 2 Saueblodlegemer Hemolysin (anti saublod produsert i kanin) (inaktivert) 42

Komplementbindingsreaksjon Serum 56oC (ukjent)+ Virusantigen + Komplement Hemolysin + Erytrocytter Komplement Ingen hemolyse antistoff tilstede. dvs komplement brukt Hemolyse antistoff ikke tilstede komplement til overs Anvendelse: Luftveisvirus (infl.a+b), parainfluensavirus, RSV, adenovirus, HSV 43

Complement Fixation Test Complement Fixation Test in Microtiter Plate. Rows 1 and 2 exhibit complement fixation obtained with acute and convalescent phase serum specimens, respectively. (2 fold serum dilutions were used) The observed 4 fold increase is significant and indicates recent infection. 44

Hemolyse i gel for påvisning av antistoffer mot rubella og influensa virus Brønn med serum (inakivert) Gel med saueblodl med antigen (virus) Komplement (marsvin) 45

Haemagglutinasjon Matte Knapp 46

Haemagglutinasjon inhibisjon Virus + serum (antistoff) + røde blodlegemer Ingen agglutinasjon (Knapp)= antistoff har bundet virus Agglutinasjon (matte) = ikke antistoff tilstede Anvendelse: Influensavirus A B og rubellavirus 47

48

Co agglutinering Virusantistoffpåvisning: Antistoffer mot røde hunder 49

Virusnøytralisasjonstest Høyere sensitivitet enn KBR og HAI. Egnet for immunstatus Kjent virus + ukjent serum + cellekultur Ingen CPE: spesifikt antistoff tilstede CPE: ikke antistoff tilstede eller i for lav konsentrasjon ved titrering 50

Påvisning av IgM antistoffer Skille IgG og IgM ved ultrasentrifugering Fraksjonere det sentrifugerte serum Bestemme hvilke fraksjoner som inneholdt IgG og eller IgM. Utføre serologisk test på hver enkelt fraksjon. 51

Immundiffusjon Anti IgG Eller IgM Serumfraksjoner 52

Oppsummering Identifikasjon av det filtrerbare agens som virus. Påvisning av virus ved isolasjon og direkte metoder Serologiske metoder for påvisning av virusantistoffer 53