Molekylær kreftdiagnostikk i moderne kreftbehandling. Bioingeniørkongressen 2016

Størrelse: px

Begynne med side:

Download "Molekylær kreftdiagnostikk i moderne kreftbehandling. Bioingeniørkongressen 2016"

Oscar Gundersen
7 år siden
Visninger:

1 Molekylær kreftdiagnostikk i moderne kreftbehandling Bioingeniørkongressen 2016 Hege G. Russnes Seksjonsleder, molekylær diagnostikk, avd. for patologi og Forsker, avd. for kreftgenetikk, Institutt for Kreftforskning Oslo Universitetssykehus Kreftdiagnose Vevsbiopsi er avgjørende for de fleste kreftdiagnoser Kreft ikke kreft Type kreft og undergrupper Biomarkører for behandlingsvalg 1

for kreftgenetikk, Institutt for Kreftforskning Oslo Universitetssykehus Kreftdiagnose

2 Histologisk grad Kreftdiagnostikk, eksempel brystkreft Grade 1 ER, PgR, Ki67, HER2 Alder Størrelse, LN, metastaser TNM Grade 2 Grade 3 Estrogen receptor, ER HER2/erbB2 HER2/erbB2 Norske retningslinjer for adjuvant systemisk behandling av brystkreft

Grade 3 Estrogen receptor, ER HER2/erbB2 HER2/erbB2 Norske

3 Kreftdiagnostikk, eksempel hematopatologi Benmargs biopsi Blodutstryk Fenotype: Flowcytometri, IHC Tilleggsanalyser Genomiske endringer: Molekylærpatologi Strukturelle genetiske endringer: FISH, Cytogenetikk Klinisk informasjon samt mikroskopisk undersøkelse er avgjørende for valg av tilleggsanalyser 3

Molekylærpatologi Strukturelle genetiske endringer: FISH, Cytogenetikk

4 Molekylære forandringer Cell nucleus DNA endringer; mutasjoner, translokasjoner kopitallsendringer m.fl. DNA endringer; epigenetiske modifikasjoner Cell cytoplasm RNA endringer, ekspresjon, degradering, spleice varianter m.fl. Protein variasjoner, endret protein, ekspresjon, modifiseringer Cell Modified from rg Enkle tilleggsanalyser Analyser kan gi informasjon om: Klassifisering (leukemier, lymfomer, sarkomer) Prediksjon av behandlingsrespons (HER2, PML- RARA, BCR-ABL, KRAS, BRAF...etc) Prognose In situ analyser er også molekylære teknikker! (IHC, FISH) 4

Protein variasjoner, endret protein, ekspresjon, modifiseringer Cell Modified from http://nobelprize.

5 IHC FISH PCR Sequencing Microarrays Protein DNA RNA DNA, RNA DNA, RNA, protein Few proteins Visual interpretation, -simple -correlation with type of cell, histology Variation between interpretators Easy to integrate Low cost Few genes Visual interpretation, -simple -correlation with type of cell, histology Variation between interpretators Easy to integrate Low cost Single genes/subsets Automatized interpretation, -dependent on software -No correlation with type of cell, histology Company based, difficult to integrate Costly Single geneswhole genome Automatized interpretation, -dependent on software -No correlation with type of cell, histology From easy to difficult to integrate From low cost to costly Multiple Automatized interpretation, -dependent on software -No correlation with type of cell, histology Company based, difficult to integrate Costly Massiv parellell sekvensering ÉN analyse kan erstatte multiple enkelt analyser Genpaneler kan standardiseres DNA, RNA Innen proteomics ser man en tilsvarende teknologisk revolusjon Meyerson M, Nature Rev Genet

Automatized interpretation, -dependent on software -No correlation with type of cell, histology Company based, difficult to integrate Costly Single geneswhole genome Automatized interpretation,

6 Persontilpasset medisin I helsetjenesten beskriver begrepet persontilpasset medisin en medisinsk modell der helsetilbudet tilpasses eller skreddersys individet i diagnostikk, behandling og forebygging. Målsettingen er å kunne tilby den enkelte en bedre behandling med færre bivirkninger, bygget på pasientens særegne biologiske egenskaper Fra rapporten Persontilpasset medisin i helsetjenesten, Okt Helse og Omsorgsdepartementet OSBREAC cohort studier Multiple cohorter fra normal-preinvaisv-invasiv-avansert sykdom. Totalt mer enn 4000 patienter inkludert Multidisciplinary -Oslo BREAst cancer Consortium (OSBREAC) Multilevel -OMICS 6

Målsettingen er å kunne tilby den enkelte en bedre behandling med færre bivirkninger, bygget på pasientens særegne biologiske egenskaper Fra rapporten

7 Kan man klassifisere svulster ved detaljerte sekvensdata? Kopitallsendringer/translokasjonstyper ( arkitektur ) Mutasjonsmønstre Fortsatt begrenset antall sekvenserte svulster internasjonalt, men dette endres dramatisk nå! Svulsttyper og subtyper karakteriseres ikke bare ved DNA forandringer men også ved epigenetiske, RNA og proteinforandringer Signaturer TCGA: ICGC: 7

sekvenserte svulster internasjonalt, men dette endres dramatisk nå!

8 Alexandrov et al. Nature

9 Fra store cohort studier til diagnostikk Utredning og behandling Blodprøver Vevsundersøkelser Undersøkelser Behandling Oppfølgning Klinisk undersøkelse Radiologi 9

10 Basal Translasjonell Forskning Klinisk Ny diagnostikk, prospektive studier Endret klinisk praksis Klinisk undersøkelse, blodprøver, vevsprøver, radiologi etc. Undersøkelser Behandling Oppfølgning Molekylær diagnostikk Basal Translasjonell Klinisk KREFTFORSKNING 10

11 Status Nov. 2016: EMIT PAM50 Phase 1 Standard histopatology Behandling etter gjeldende retningslinjer Parallel testing av PAM50, sammenligning av behandlingsvalg basert på molekylære analyser vs standard markører PAM50 ROR analysis Hvem får endret behandlings kategori? Hva vil konsekvensene være? Analysis at OUS in Clinical mode ROR-score Intrinsic subtype Other primary tumor analyses in parallel Feasibility of PAM50 in routine setting Testing of logistics, questionnaires, health economy parameters/analyses...men arbeidet foregår mye mer integrert Preliminar cytology report FISH IonTorrent Molecular Board (week 1.5) MolPat (Validation) Comparison with primary tumor histopathology Final pathology report Final molecular report Tumor Board (week 2-2.5) 11

standard markører PAM50 ROR analysis Hvem får endret behandlings kategori? Hva vil konsekvensene være?

12 Vis flytskjema fra nasjonal rapport Fra helsedirektoratets Strategi for persontilpasset medisin 12

13 Moderne kreftbehandling Anne-Lise Børresen-Dale Hege Russnes prosjektgruppe: Inga H. Rye Bente Risberg Helen Vålerhaugen Arne V. Pladsen My Anh Tu Universitetet i Oslo: Ole CHr. Lingjærde, Arnoldo Frigessi OSBREAC: Kristine Kleivi Sahlberg, Rolf Kåresen, Bjørn Naume, Anne-Lise Børresen-Dale, Vessela N. Kristensen, Øystein Fodstad, Jahn M. Nesland, Torill Sauer, Jon Lømo, Øystein Garred, Gunhild Mælandsmo, Tone Baaten, Helle Skjerven, Jurgen Geissler, Britt Fritzmann, Ellen Schlichting, Olav Engebråten, Solveig Hofvind, Elin Borgen, Gry Geitvik Hans Kristian M. Vollan, Åslaug Helland, Anna Sætersdal, Therese Sørlie Kornelia Polyak Vanessa Almendro Michael Stratton Peter Campbell David Wedge Anders Zetterberg Michael Wigler James Hicks Per Eystein Lønning Stian Knappskog Peter Van Loo Carlos Caldas Sarah-Jane Dawson Florian Markowetz 13

Nesland, Torill Sauer, Jon Lømo, Øystein Garred, Gunhild Mælandsmo, Tone Baaten, Helle Skjerven, Jurgen Geissler, Britt Fritzmann, Ellen Schlichting, Olav Engebråten, Solveig Hofvind, Elin Borgen,

Like dokumenter

Fagruppe molekylær patologi

Fagruppe molekylær patologi Aktuelt faglig nytt Hege G. Russnes Årsmøte, Patologforeningen OUS 18.03.2015 Faggruppe molekylærpatologi Hege G. Russnes, Oslo Olav Vintermyr, Bergen Sonja Steigen, Tromsø