EGFR mutasjonsanalyse



Like dokumenter
Faggruppe Lunge/ØNH patologi:

NGS (Neste Generasjons Sekvensering) i diagnostikk, erfaringer og resultater

Cytologisk og histologisk diagnostikk av lungetumor

Muligheter og utfordringer ved diagnostikk av lungekreft. Marius Lund-Iversen Avd. for patologi Oslo universitetssykehus

Lungekreft diagnostiske utfordringar i patologi

Persontilpasset medisin PD L1

Hvilke nye krav stiller den persontilpassede kreftdiagnostikken patologifaget overfor?

The 2015 World Health Organization Classification of Lung Tumors

Forslag til nasjonal metodevurdering

Molekylærdiagnostikk i GI-tractus. Marius Lund-Iversen Avd. for patologi, OUS

NGS = Next generation sequencing Massiv parallell sekvensering (MPS) Dypsekvensering

Forslag til nasjonal metodevurdering

Bakgrunnsstoff om lungekreft og Iressa til pressen på forespørsel

Genfeil i kreftsvulster nøkkelen til en mer persontilpasset behandling?

Hva gjør vi på molekylærpatologisk laboratorium?

Molekylær patologi Amplifikasjonsmetoder

Dette vil jeg si noe om

Thyreoidea. Bethesda-systemet og SNOMED-koder. NASJONALE RETNINGSLINJER FOR THYREOIDEA - Revisjon av tidligere

Persontilpasset medisin

Nytt fra Norsk Bryst Cancer Gruppe (NBCG) Lars A. Akslen, Jan Baak, Torill Sauer, Per Bøhler, Peter Blom, Anna Bofin (avtroppende) og Elin Mortensen

Nasjonalt kvalitetsregister for. lungekreft. «Fra insidens til revisjon»

Sverre Sörenson. Docent, Hälsouniversitetet i Linköping Overlege, Länssjukhuset Ryhov, Jönköping

CELLETYPER I PATOLOGIEN

Lungekreft tiden teller

Lunge state of the art. Post-ASCO 2017

Lunge Cancer. Fra 1930 dramatisk økning i den vestlige verden! Nå hyppigst diagnostiserte kreftsykdom i verden!

Ytelseskarakteristikker

Lungekreft. Martin Petersen, overlege lungeseksjonen, SUS

En nasjonal plattform for persontilpasset kreftbehandling

Bioingeniørens rolle innen immunhistokjemi

LUNGECYTOLOGI. Lars Helgeland Avdeling for patologi, Gades laboratorium for patologi Haukeland Universitetssykehus. Årsmøte NFKC januar 2016

Bioingeniørens rolle innen molekylærpatologi

Påskenøtt 2 DNP årsmøte Linda Hatleskog, kst overlege Stavanger universitetssjukehus

Mikrobiologiske prøver ved borreliose i allmennpraksis. Nils Grude Avd. ovl. Mikrobiologisk avd. SiV, Tønsberg

Celleforandringer i livmorhalsen -ikke alltid rett frem. Hans Kristian Haugland Avdeling for patologi Haukeland universitetssykehus

Aktuelt nytt fra Faggruppe for mammapatologi

HER2 status ved brystkreft - oppdatering 2019

Utredning og diagnostikk av lungekreft ved St. Olavs Hospital

Påskeegg 9. Jon Lømo Overlege. Avdeling for patologi. Oslo universitetssykehus. Avdeling for patologi

Formål med Laboratoriemappen

FNAC-kurs Kasus no 7. Peter Jebsen OUS - Rikshospitalet

Ikke - kirurgisk behandling av lungekreft nå og i fremtiden.

Privat kreftbehandling på Aleris - kuriositet eller todelt helsevesen?

Aktuelt nytt fra Faggruppe for Mammapatologi. Den norske patologforening torsdag 7. mars 2019

Bruk av immun og spesialfarger. Jan Kristian Godøy Overlege, patolog Sykehuset Østfold

Preanalyse. Kurs i Molekylærpatologi Oslo, juni 2017

Påskeegg 6. Årsmøte i Patologforeningen mars 2011

Om persontilpasset medisin

Lunge Cancer. Fra 1930 dramatisk økning i den vestlige verden! Nå hyppigst diagnostiserte kreftsykdom i verden!

NORCYT INFO nr

Utvikling av molekylære metoder

Kvalitetssikring i patologi. Sveinung Sørbye Universitetssykehuset Nord-Norge Mars 2017

HPV DNA og HPV mrna ved celleforandringer i cervix. Sveinung Sørbye Overlege, Klinisk Patologi Universitetssykehuset Nord-Norge

Utvikling av nye kreftbehandlinger -hundens rolle

MSI erfaringer fra Tromsø

Cytologiens rolle i HPV primærscreening Screening av kjente HPV-pos Bruk av kriterier ASC-US/LSIL

«Immunterapi» Kreftutvikling. Myelomatose. Immunterapi. Anders'Sundan Senter'for'myelomforskning Institutt'for'klinisk'og'molekylær'medisin,'NTNU

Persontilpasset kreftbehandling - med fokus på brystkreft Biomedical Network

Målrettet behandling

Patologirapport 2016 Oversikt over rapportering fra patologiavdelingene

Hurtigtesten som utføres per i dag. Åpent møte 7 januar 2008 Gentesting ved bryst- og eggstokkreft

Refusjonsrapport. Vurdering av søknad om forhåndsgodkjent refusjon Statens legemiddelverk

Borreliadiagnostikk ved Mikrobiologisk avdeling SIV. bioingeniør Anne-Berit Pedersen

NORCYT INFO nr

Forslag til nasjonal metodevurdering

Cancer pulmones. Cancer pulmones. Cancer pulmones. Aldersfordeling. Årsaker. hva er aktuell i utredning og behandling?

Bildebiomarkører ved endometriecancer

Genetiske undersøkelser av biologisk materiale

Persontilpasset kreftbehandling. - Ønsket forskjellsbehandling

MetAction actionable targets in cancer metastasis from bed to bench to byte to bedside

Lungekreft. Sykdomsforløp, ulike behandlingsformer. Robin Norvaag LiS Kreftklinikken St. Olavs hospital

Fotograf: Wilse, A. B. / Oslo byarkiv

Nytt innen kreftforskning. Marianne Frøyland, PhD, rådgiver i Kreftforeningen

Bruk av genteknologiske analyser ved diagnostikk av luftveisinfeksjoner. Gardermoen Svein Arne Nordbø

GIST og andre mesenkymale tumores i GI-tractus

Testing av sarkomer Molekylærpatologiske metoder

Oncogenic Mutations Affecting Cell Proliferation

Forslag til nasjonal metodevurdering

Diagnostisering av endometriecancer i allmennmedisin

Brystkreft og gener. Vårmøtet Britt Fritzman

Klinisk molekylærmedisin (5): Eksempler på funksjonelle analyser

Påvisning av. Mucorales DNA

Forslag til nasjonal metodevurdering

Hjernemetastaser. Bakgrunn. Bakgrunn Alle krefttyper kan spre seg til hjernen

Ulike typer screening

Tumor Nekrose Faktor Reseptor Assosiert Periodisk Syndrom (TRAPS) eller Familiær Hiberniansk Feber

Hurtigdiagnostikk ved luftveisinfeksjoner

Påskeegg nr. 8 Årsmøtet for DNP Kasuspresentasjon av: Sverre Dahl, LIS ved Avd. for Patologi, AHUS.

Kliniske studier: et pasientperspektiv

Forslag til nasjonal metodevurdering av pembrolizumab

Populasjonsovervåkning av brunbjørn (Ursus Arctos)

Bløtvevssarkomer. Bløtvev. Fettvev. Muskulatur Heterogen gruppe - mer enn 50 ulike grupper

ØNH: Kul på halsen. Thyreoideapatologi- og cytologisk Bethesda klassifikasjon. Ultralydundersøkelse! Kurs Hode- og halspatologi 8-9.

Praktisk gjennomføring av primærscreening HPV

Forslag til nasjonal metodevurdering

Digital patologi -hvordan påvirkes patologer og bioingeniører?

Den kroniske kreftpasienten. Hvordan kan fastlegen involveres. Hva menes med «kronisk kreft»?

UTFORDRINGER OG MULIGHETER. Ingvild Koren Lobmaier Overlege avd. for Patologi OUS

Søk. Nøkkelinformasjon. Sammendrag og figur. Klasser. IPC-klasse. Søker. Innehaver. Finn patenter, varemerker og design i Norge

Materiale/ Beskrivelse Metode Markør for MRD

Transkript:

EGFR mutasjonsanalyse ved ikke-småcellet lungekreft (NSCLC) Lars Helgeland Avdeling for patologi, Gades institutt Haukeland Universitetssykehus NFKC årsmøte Gardermoen 3/2-12

Ved NSCLC er det funnet forandringer i bestemte nøkkelgener involvert i regulering av celledeling og cellevekst ( driver mutations ). Forandringer i disse nøkkelgenene er hovedsakelig ikke-overlappende mellom ulike svulster. Ulike mhp. biologi, behandlingsrespons og prognose. EGF-R K-RAS ALK-EML4 B-RAF MET HER2 Utvikles nye medikamenter som spesifikt hemmer aktiviteten til disse molekylene.

Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) tilhører erb-familien av reseptor tyrosin kinaser Liganden er Epidermal Growth Factor (EGF) Samer Al-Saad 2010

Målstyrt kreftbehandling rettet mot EGFR Angreps- punkt Vekstfaktor inhibitor (anti-egfr) Cellemembran Reseptorinhibitor (TKI) Kjerne Transkri ripsjon Celledeling

Tyrosine Kinase Inhibitor (TKI) - lite molekyl som penetrerer cellemembranen og binder seg til intracellulært domene med tyrosinkinase-aktivitet To typer på markedet (1. generasjon) - gefitinib (Iressa) - erlotinib (Tarceva) Tidlige studier viste god respons hos - ikke røykere - kvinner - asiater - histologi adenokarsinom opptil 50% responsrate

Kvinne, 63 år, NSCLC Før behandling 4 uker med gefitinib

TKI kan være effektive, har lite bivirkninger, men er kostbare Bergens Tidende 13/2 2005

Ved NSCLC kan EGFR genet være - amplifisert -mutert - begge deler -mutasjonspositivitet predikerer med høy sannsynlighet respons på TKI IPASS (Iressa Pan ASia Study) studien - 1200 pasienter med avansert lungekreft - mutasjonspositive bedre overlevelse med TKI enn konvensjonell kjemoterapi - mutasjonsnegative bedre overlevelse med konvensjonell kjemoterapi enn TKI

Hva nå? Testing for EGFR mutasjoner Hvilke pasienter Hvilke metoder

Translasjonsgruppa i Norsk lungekreftgruppe -lungeleger, onkologer, patologer og molekylærbiologer -jobber med spørsmål rundt rutinemessig EGFR mutasjonstesting, metoder, innsamling av data, studier Odd Terje Brustugun, Onk-Radium (leder) Åslaug Helland, Onk-Radium Lars Fjellbirkeland, Lungemed-RH Peter Jebsen, Pat-RH Helge Scott, Pat-RH Per Arne Andresen, Molpat-RH Sarah Ariansen, Molpat-RH Lars Helgeland, Pat-Haukeland Bjørn Grønberg, St.Olav Thomas Berg, Molpat-UNN Tom Dønnem, Onk-UNN

Anbefalinger fra gruppa - i utgangspunktet skal alle med påvist NSCLC testes - til 2011 alle NSCLC non-plate histologi - fra 2011 alle NSCLC - opererte pasienter: variabel praksis, noen tester up-front - biopsimateriale: må vurderes mhp. representativitet - biopsimateriale foretrekkes fremfor cytologi - hvis bare cytologisk tumormateriale: evt. teste eller ny biopsi - foreløpig ingen anbefaling om testing av metastaser - foreløpig ingen anbefaling om testing av residiv, mhp. utvikling av mutasjoner som gir resistens mot TKI

Anbefalinger fra gruppa forts. - EGFR genet analyseres eksonene 18, 19, 20, 21 (tyrosinkinase-domenet) - analysen bestilles av patologen som primært har stilt diagnosen - resultatet ettersendes, vanligvis innen 7-10 dager - signeres av ansvarlig patolog, resultatet vurderes opp mot prøvemateriale, mengde, tumorcelleandel - testing foregår på OUS, Haukeland, St. Olav, UNN (SUS under etablering) - diagnose stilt på andre patologiavdelinger: vurderes av lokal patolog mhp. representativitet, evt. merking av tumorområde, HE-snitt + blokk sendes testlaboratorium

EGFR mutasjoner - testmetoder 1. mutasjons screening teknikker - direkte sekvensering -dhplc - pyrosekvensering 2. målrettet deteksjon av kjente mutasjoner - ARMS (amplification refractory mutation system) - PNA/LNA clamp - SNaPshot - RFLP (restriction fragment length polymorphism) - kommersielle kit PCR inngår i alle metoder (før eller under)

Screening analyser - prosedyre 18 19 20 21 PCR reaksjon 1 PCR reaksjon 2 PCR reaksjon 3 PCR reaksjon 4 direkte sekvensering dhplc pyrosekvensering mer sensitiv enn direkte sekvensering

Direkte sekvensering - fortsatt gullstandard - detekterer alle slags mutasjoner, også nye og ukjente - takstsystem økonomisk gunstig for laboratoriet -begrensning i sensitivitet - helst mer en 25% andel tumorceller - kan påvise mutasjon ved lavere andel (10-25%, evt. lavere) - jo lavere andel jo høyere sannsynlighet for falskt negativ resultat -bør kommenteres i besvarelsen - prøver med for lav andel (<10%) bør avvises for EGFR testing - krav til minimum mengde celler (500-2000) standard 3x10μm til DNA isolasjon - sensitivitet kan bedres med manuell mikrodisseksjon tumorområde skjæres ut av blokken

48 år gammel mann. Adenokarsinom i lunge. Bronkialbiopsi.

EGFR ekson 19 Delesjon påvist i ekson 19. God respons på TKI.

Den reelle mengde DNA, og relativ mengde tumorcelle DNA i PCR produktet bestemmes av en rekke variable, som man ikke har full kontroll over i den enkelte prøve * absolutt mengde DNA varierer med prøvebehandling, fiksering og fremføring * tumorcelle-andel varierer med - andel tumorvev i forhold til benignt vev i prøven - andel tumorceller i forhold til benigne bakgrunnsceller (stromaceller, inflammatoriske celler) varierer fra tumor til tumor - lungesvulster er morfologisk heterogene - tumorcellene har høyere proliferasjon enn benigne bakgrunnsceller - mange svulster med EGFR mutasjon har samtidig amplifisering av EGFR genet

adenokarsinom med minimalt stroma adenokarsinom med rikelig stroma

Målrettet deteksjon av mutasjoner i EGFR to spesifikke mutasjoner finnes hos 80-90% av alle NSCLC med EGFR mutasjon 1. Delesjon i ekson 19 (del 746-750) 2. Punktmutasjon i ekson 21 (L858R) Disse mutasjonene predikerer høy sannsynlighet for respons på TKI. Andre mutasjoner generelt mer variable og ikke alle like godt kartlagt mhp. TKI respons.

Mutasjon L858R spesifikk Realtime PCR EGFR exon 21 L858 CTG Primer wt EGFR exon 21 Primer mut1 Primer mut2 x x CGG R x AGG R probe probe Primer R Primer R Hong Yan Dai, St. Olav

B16851/02 L858R

Mutasjon beriket PCR MseI GAATTAA CTTAATT Exon 19 X Primer L E L Primer R 1. PCR Wt Mut x 2. Restriction enzyme Mut MseI PCR 3. PCR 4. Sekvensering av PCR produkt

Metoder for EGFR testing ved molekylærpatologiske laboratorier i Norge pr. 2012 UNN og St. Olav direkte sekvensering + egne oppsett for de to vanligste mutasjonene - delesjon ekson 19 - punktmutasjon L858R ekson 21 - UNN: + insersjon ekson 20 Haukeland direkte sekvensering kommersielt kit (Roche) under utprøving Rikshospitalet kommersielt kit (Therascreen) + eget oppsett for delesjon ekson 19 Resultater fra translasjonsgruppa hittil tyder ikke på noen vesentlig forskjell i mutasjons-deteksjonsrate mellom laboratoriene

Testmetoder - oppsummering Direkte sekvensering * påviser alle slags mutasjoner, kjente og nye * nye mutasjoner sannsynligvis sporadiske - usikker betydning mhp. tumorbiologi og repons på TKI * tidkrevende * begrenset sensitivitet Kommersielle kit * tidsbesparende * arbeidsbesparende * standardisert * høyere sensitivitet for de mutasjonene de tester for * høyere kostnad * oppdager ikke alle kjente, og ikke nye mutasjoner * økt sensitivitet for de vanligste mutasjonene kan være viktigere enn å finne alle og evt. nye mutasjoner

62 år gammel kvinne, ikke-røyker. Tumor høyre lunge og sannsynlig metastaser i venstre lunge. Bronkialbiopsi.

Direkte sekvensering EGFR ekson 18-21: Mutasjon ikke påvist. Startet på kjemoterapi, med noe effekt på hovedtumor men ikke på metastaser. 2 måneder senere materialet testet med kit (Roche): Påvist mutasjon, delesjon i ekson 19. Vurderes nå mhp. TKI. Pasienter med profil med stor sannsynlighet for mutasjon: Vurdere prøvemateriale, dialog med kliniker.

Cytologisk materiale * kan brukes til flere molekylære analyser (FISH og PCR) * materialkvalitet ulemper: - lite prøvemateriale - uegnet for manuell mikrodisseksjon (evt. direkte på glass) fordeler: - ingen eller mild fiksering (sprit) - minimalt med tumorstroma *flere måter å benytte cytologisk materiale 1. ferske celler i suspensjon 2. (rest)materialet formalinfikseres og støpes inn i celleblokk 3. materialet skrapes direkte av fra utstryk på glass brukt til diagnostikk

58 år gammel kvinne. Adenokarsinom i lunge. Karsinomceller i pleuravæske, utstrøket på glass.

EGFR ekson 21 Mutasjon påvist i ekson 21 (L858R). Assosiert med god respons på TKI.

ALK gen rearrangering ved NSCLC - ALK (anaplastic lymphoma kinase) genet translokert til (vanligvis) EML4 (echinoderm microtubule-associated protein-like 4) - anslått å forekomme i 3-5% av alle NSCLC - assosiert med ikke-røykere, adenokarsinom-histologi (signetringcelle-) - fusjonsprotein med tyrosinkinaseaktivitet - spesifikk hemmer (crizotinib) utviklet og under klinisk utprøving - ALK protein kan påvises med immunhistokjemi - tilgjengelige antistoff ikke tilfredsstillende sensitivitet -ønskes nær 100% evt. med lavere spesifisitet -eneste validerte analyse er FISH - FISH kit fra Abbott (Vysis prober), FDA godkjent - under utprøving på Haukeland fra høst 2011

31 år gammel mann, aldri-røyker. Påvist metastase til skjelett fra adenokarsinom i lunge. EGFR-mutasjon negativ.

split FISH (Dual color break-apart probe) for ALK ALK translokasjon påvist

Kravene til innhold i patologibesvarelsen øker - uten at vevsmaterialet øker tilsvarende informasjonskrav materialkvalitet tid

Behov for standardiserte retningslinjer for hvordan patologimateriale av NSCLC skal håndteres Anbefalinger fra IASLC/ATS/ERS for behandling av småbiopsier / cytologiske prøver W.Travis et al. 2011 Journal of Thoracic Oncology vol.6 no.2 p.244

1. Morfologi Tilnærming til småbiopsier og cytologiske prøver lungekarsinom SCLC NSCLC evt. immunhistokjemi adeno- plate- NSCLC NOS diagnose begrenset immunhistokjemi

2. Immunhistokjemi -subklassifisering av NSCLC NOS NSCLC NOS TTF1+ p63- / CK5/6- TTF1- p63+ / CK5/6+ TTF1+ p63+ / CK5/6+ TTF1- p63- / CK5/6- NSCLC -passer med adenokarsinom NSCLC -passer med plateepitel karsinom NSCLC -passer med adenoskvamøst karsinom NSCLC NOS * ikke grunn til mer omfattende immunhistokjemi for nærmere subklassifisering prioriter materialet for molekylære analyser

3. Molekylære analyser evt. et snitt til ALK immunhistokjemi evt. et snitt til ALK FISH 3x10μm snitt til DNA isolasjon evt. manuell mikrodisseksjon EGFR mutasjonstesting evt. testing for andre mutasjoner (K-RAS)