Brukerhå ndbok for mikrobiologi, Ullevå l

Transkript

1 Brukerhå ndbok for mikrobiologi, Ullevå l Høsten 2016 gikk hele Oslo universitetssykehus over til ny internett plattform for sine nettsider. Dette har medført at den tidligere nettbaserte versjonen av laboratoriehåndboken ved Avdeling for Mikrobiologi, Ullevål fra og med 1.januar 2017 ikke lenger er tilgjengelig. Avdelingen jobber med å utvikle en ny laboratoriehåndbok, men frem til denne er klar vil dette dokumentet fungere som oppslagsdokument for avdelingens rekvirenter for undersøkelser utført ved Avdeling for mikrobiologi, Ullevål. Dokumentet har dessverre noen begrensninger med begrenset struktur. Avdelingen beklager dette, og henviser sine rekvirenter til å ta direkte kontakt med avdelingen dersom de har spørsmål eller behov for ytterligere. (Se oversikt over telefonnummer i vedlagt tabell) Ny nettbasert laboratoriehåndbok forventes publisert i løpet av første kvartal Kontakt informasjon: Enhet: Telefonnummer: Bakteriologi / Molekylærdiagnostikk og virologi Serologi / Prøvemottak

2 Innhold Generelt om rekvirering, prøvetaking og... 3 Bestilling av prøvetakingsutstyr og transportmedier... 4 Oppbevaringstid for primærprøver... 5 Levering av prøver... 6 Hasteprøver... 6 Utfylling av rekvisisjoner... 6 Prøvetakingsveiledning ved kliniske problemstillinger... 7 Smittestoffer Analyseoversikt Antibiotikaindusert kolitt Bakteriologiske og mykologiske analyser: Akkrediteringsomfang og svartider Henvisningslaboratorier Molekylære og virologiske analyser: akkrediteringsomfang og svartider Mykobakteriologiske analyser: Akkrediteringsomfang og svartider Parasittologiske analyser: Akkrediteringsomfang og svartider Serologiske analyser: akkrediteringsomfang og svartider

3 Generelt om rekvirering, prøvetaking og Riktig valg av prøvemateriale samt korrekt prøvetaking og transport er viktige forutsetninger for å oppnå et riktig resultat. En forutsetning for at laboratorieresultatene skal kunne bidra til å stille en korrekt diagnose og initiere adekvat behandling er at de som utfører prøvetakingen forstår laboratoriets behov for kliniske opplysninger og utfører prøvetaking og av prøven på riktig måte. Prøver til mikrobiologiske undersøkelser inneholder ofte levende mikroorganismer, noe som krever rask og profesjonell prøvebehandling. På bakgrunn av dette er det viktig å være oppmerksom på følgende: Ta prøven fra riktig anatomisk lokalisasjon Ta prøven med riktig teknikk og utstyr Benytt korrekt transportmedium for å sikre overlevelse av det man ønsker å påvise og for å hindre lekkasje av prøvemateriale Send prøven så raskt som mulig til laboratoriet. Hvis n tar tid må prøven oppbevares på en slik måte og ved en slik temperatur at overlevelse av mistenkte mikroorganismer sikres Valg av representativt prøvemateriale Det å velge representativt prøvemateriale kan i utgangspunktet virke enkelt. Imidlertid får avdelingen daglig inn prøver som ikke er tatt hensiktsmessig. Analyseresultater fra slike prøver kan ofte være misvisende og føre til feilaktig diagnostikk og behandling. Avdelingen har rutiner for å vurdere alle tilsendte prøver med gjennomgang av kliniske opplysninger og hvorvidt prøvematerialet er representativt. Rekvisisjoner Sentrallageret leverer til sykehusets avdelinger. Andre må bestille hos Emballasjetjenesten, Oslo universitetssykehus, Ullevål, postboks 4956 Nydalen, 0424 Oslo. Tel: (tlf.tid: og ) Fax: Oversikt over rekvisisjonene finnes her. Enkelte kan lastes ned og fylles ut elektronisk. 3

4 Bestilling av prøvetakingsutstyr og transportmedier Mikrobiologisk avdeling leverer til sykehusets avdelinger. Andre må bestille hos Emballasjetjenesten, Sentrallageret, Oslo universitetssykehus HF, Ullevål, postboks 4956 Nydalen, 0424 Oslo. Tel: (tlf.tid: og ). Fax: Prøvetakingsutstyr og transportmedier Medium/beholder/pensel AMIES W/CH Tykk/tynn pensel Copan spesialpensel (nylon) i UTM-RT transportmedium Klamydia transportmedium med svart kork (BD Qx Swab Diluent). Spesialpensel. Plastbeholder merket: Urin til påvisning av Chlamydia trachomatis LQ CARY BLAIR Plastbeholder med skje (uten tilsetning) 30 ml plastbeholder (uten tilsetning) 50 ml plastbeholder (uten tilsetning) Urin-Monovette med borsyre Urin-Monovette (uten tilsetning) Beregnet på Dyrking av bakterier og sopp (gjærog muggsopp, ikke hud/neglsopp). Påvisning av virus og bakteriene Bordetella pertussis, Chlamydophila pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae, Treponema pallidum. Påvisning av Chlamydia trachomatis (nukleinsyreamplifikasjonsteknikk). Fæces til dyrking av tarmpatogene bakterier. Fæces til påvisning av Clostridium difficile toksin, EHEC og virus. Parasittundersøkelse av fæces (påvisning av cyster og egg ved mikroskopi). Sterile væsker. Pluss biopsier eller fremmedlegemer som er tilsatt fysiologisk NaCl for å hindre uttørking. Ekspektorat, trakealsekret, bronkialsekret, biopsi, fremmedlegeme (IKKE til tyntflytende materialer pga fare for lekkasje). Urin til dyrkning av bakterier og sopp. Beholderen må fylles helt opp. Urin til dyrkning av bakterier og sopp. Holdbarhet / Oppbevaring Utløpsdato er angitt på pakningen. Mørkt i romtemp Utløpsdato er angitt på pakningen. Romtemp. Utløpsdato er angitt på pakningen. Romtemp. Utløpsdato er angitt på pakningen. Romtemp. 4

5 Normalflora Ved prøvetaking som omfatter hud og slimhinner vil normalflora (bakterier og sopp) i større eller mindre grad komplisere tolkningen av prøvefunnene. Laboratoriet vil i disse tilfellene lete spesifikt etter mikroorganismer som er sykdomsfremkallende. Hos immunsupprimerte pasienter kan tolkningen av mikrobiologiske funn være spesielt krevende. I alle tilfelle er viktig at prøver blir tatt på en slik måte at kontaminering med normalflora minimaliseres. Oppbevaringstid for primærprøver Oppbevaring av undersøkte prøver. Primærprøver oppbevares som følger: Prøvemateriale Oppbevaringstid Prøver til vanlige bakteriologisk undersøkelser 3 dager Biopsiprøver samt prøver fra sterile områder (inkludert spinalvæsker) til 7 dager bakteriologiske undersøkelser Prøver til bakteriologisk undersøkelser som er 2 uker avviste Prøver til mykobakteriologiske undersøkelser - direkte mikroskopi 3 dager - dyrkning ingen Serum/plasmaprøver til infeksjonsserologiske undersøkelser. 10 år Spinalvæske til infeksjonsserologiske undersøkelser Luftveisprøver Inneværende sesong + 2 fulle sesonger Fæces til Norovirus Min. 1 mnd. Fæces til Rota- 3 dager /Adenovirus Prøver til Spinalvæsker Min. 5 år molekylærdiagnostiske / virologiske HIV-RNA Min. 1 år undersøkelser kvantitering HCV kvantitering Min. 5 år HIV DNA Provirus Min. 2 år Penselprøve til Herpes Simplex virus Min. 3 uker / Varicella Zoster virus 5

6 Levering av prøver Alle prøver som sendes i posten og med budbil, skal pakkes etter retningslinjer som gjelder for transport av biologisk materiale, se Veileder om av smittefarlig biologisk materiale. Direktoratet for samfunnssikkerhet og beredskap (ISBN ) og Forsendelse av smittefarlig biologisk materiale. Praktisk veileder. Direktoratet for samfunnssikkerhet og beredskap (ISBN ) for nærmere retningslinjer. I henhold til retningslinjene skal ferdige prøver (i innerbeholder) plasseres i ytterbeholder (transportcontainer) før prøven legges i konvolutten. Copan transportmedium kan sendes uten ytterbeholder. Hasteprøver Rekvirenten bør kontakte avdelingen for å melde om hasteprøver. Gjennomgang av prøver ved prøvemottak Laboratoriet har retningslinjer for gjennomgang av prøver som ankommer laboratoriet. Der det er fare for at feilaktig prøvetaking og/eller transport kan føre til misvisende resultater, blir prøven enten avvist eller den blir besvart med et forbehold om gyldigheten av analysesvaret. Avdeling for mikrobiologi sin politikk for ette rekvirering og/eller strykning av rekvirerte analyser: Ved mottak av prøver vil laboratoriets faglige ansvarlige vurdere hvorvidt det skal rekvireres ytterligere undersøkelser, eller om rekvirerte undersøkelser ikke er aktuelle å utføre. Vurdering skjer ut fra kliniske opplysninger og prøvematerialets beskaffenhet. Dersom rekvirerte undersøkelser ikke blir utført, vil dette bli begrunnet i svarrapporten. Etterrekvirering av analyser på allerede innsendte prøver kan avtales telefonisk, med unntak av primær HIV-diagnostikk, som alltid må rekvireres skriftlig. Utfylling av rekvisisjoner Avdeling for mikrobiologi har utarbeidet rekvisisjoner som skal følge prøver som sendes til laboratoriet. Rekvisisjonene til pasientundersøkelser sikrer tilstrekkelige opplysninger, herunder: 1. Entydig identifikasjon av pasienten; navn, kjønn, fødselsnummer, adresse (inkl. fylke). 2. Identifikasjon av rekvirenten; HPR-nr. og navn på lege, post/avdeling/legekontor/institusjon (adresse og telefonnummer). 3. Opplysninger som identifiserer betaler. 4. Prøvemateriale og lokalisasjon 5. Antimikrobiell behandling 6. som er rekvirert 7. Relevante kliniske opplysninger, inkludert 1. sykdomsdag. 8. Dato og klokkeslett for prøvetaking For prøver som ikke er knyttet til enkeltperson skal følgende opplysninger være påført: 1. Entydig identifikasjon av prøven 2. Identifikasjon av rekvirenten; HPR-nr. og navn på lege, post/avdeling/legekontor/institusjon (adresse og telefonnummer) 3. Opplysninger som identifiserer betaler 4. Prøvemateriale 5. som er rekvirert 6. Problemstilling (dersom relevant) 7. Dato og klokkeslett for prøvetaking 6

7 Prøvetakingsveiledning ved kliniske problemstillinger Endokarditt Vanligste agens Materiale Prøvetaking og Alfahemolytiske streptokokker Stafylokokker HACEK-gruppen Blodkulturer Se Anlegging av blodkulturer Aerob og anaerob dyrking (7 dager når endokarditt-mistanke formidles til laboratoriet). Epiglotitt Sykdom / vanligste agens Materiale Prøvetaking og Haemophilus influenzae Svelgsekret, nasofarynxsekret (dyp neseprøve eller aspirat). Penselprøve i Amies transportmedium, aspirat i steril beholder (rask transport). Alminnelig bakteriologisk dyrking (2-3 dager). Blodkultur. Se Anlegging av blodkulturer Dyrking (5 dager). Gastroenteritt (bakteriell) Sykdom / vanligste agens Standard diagnostikk: Materiale Prøvetaking og Salmonella spp. Shigella spp./eiec Yersinia spp. Campylobacter spp. Fæces i "LQ CARY BLAIR" transportmedium (ved transport >4 timer) eller fæces uten tilsetning (ved transport <4 timer). Dyrking "tarmpatogene bakterier" (2-3 dager). 7

8 Andre agens: Vibrio spp. Aeromonas spp. Plesiomonas shigelloides EPEC (enteropatogen E. coli) Staphylococcus aureus (barn innlagt i sykehus) EHEC (enterohemorrhagisk E.coli) Vibrio cholerae Clostridium difficile se Antibiotika indusert kolitt Fæces med mest mulig slim, blod og puss. Rectalpensel (innenfor sfinkter) er en nødløsning. Fæces fra "riskornholdige" porsjoner. Fæces i "LQ CARY BLAIR" transportmedium (ved transport >4 timer) eller fæces uten tilsetning (ved transport <4 timer). Dyrking "tarmpatogene bakterier" (2-3 dager). Spesialdyrking (2-3 dager), må rekvireres spesielt. Spesialdyrking inklusive nukleinsyreamplifikasjonstest (PCR) (2-3 dager), må rekvireres spesielt. EHEC undersøkes alltid ved angitt opplysninger om: - mistanke om HUS (hemolytisk-uremisk syndrom) - blodig avføring - barn innlagt med diaré Spesialdyrking (2-3 dager) må rekvireres spesielt. 8

9 Gastroenteritt (toksinmediert, matforgiftning) Vanligste agens Materiale Prøvetaking og Staphylococcus aureus Bacillus cereus Clostridium perfringens Matvare, oppkast, fæces Toksinpåvisning utføres ikke ved Mikrobiologisk avdeling, OUS, Ullevål. Kontakt Mattilsynet på tlf Senter for mattrygghet ved Norges Veterinærhøgskole kan også kontaktes for informasjon på tlf For matbårne infeksjoner se Gastroenteritt (bakteriell) eller Gastroenteritt (viral) Gastroenteritt (viral) Virus Prøve til virus-påvisning Serologi Norovirus Fæces til PCR Nei Gastroenteritt (viral, barn) Virus Prøve til virus-påvisning Serologi Rotavirus og adenovirus Fæces Nei Norovirus Fæces til PCR Nei Hepatitt Virus Prøve til virus-påvisning Serologi Hepatitt A virus (HAV) Ikke aktuelt Ja Hepatitt B virus (HBV) Serum Ja Hepatitt C virus (HCV) EDTA plasma til PCR Ja Epstein-Barr virus (EBV) Cytomegalovirus (CMV) EDTA-blod til PCR (utføres ved Rikshospitalet) EDTA-blod til PCR (etter avtale). Se også Intrauterin infeksjon, generell sykdom hos nyfødte (utføres ved Rikshospitalet) Ja Ja 9

10 Hud- og bløtdelsinfeksjoner Vanligste agens Materiale Prøvetaking og Staphylococcus aureus Betahemolytiske streptokokker (gr. A, C, G). Andre aerobe og anaerobe bakterier kan være agens ved dype infeksjoner, infeksjoner i kroniske sår og etter kirurgiske inngrep. Overflatiske prøver: Sårsekret fra sårbunn/kant etter vask med sterilt saltvann. Dype prøver: Puss Haematom Vevsprøve Penselprøve i Amies transportmedium Ev. punksjon/aspirasjon, materiale i steril beholder (rask transport) og på pensel i Amies transportmedium. Biopsi på steril beholder, ev. tilsatt litt saltvann (rask transport). Alminnelig bakteriologisk dyrking (2 dager). Aerob og anaerob dyrking (2 dager). Ev. direkte mikroskopi hvis rekvirert og mottatt materiale på steril beholder. Aerob og anaerob dyrking (2-5 dager). Etter dyrebitt: Pasteurella multocida Sårsekret Penselprøve i Amies transportmedium. Aerob og anaerob dyrking (2 dager). Mykobakterier Se Tuberkulose og andre mykobakterieinfeksjoner Sepsis Sykdom / vanligste agens Materiale, prøvetaking og E.coli S.aureus S.pneumoniae Klebsiella spp. Enterococcus faecalis Bacteroides spp. Candida albicans For barn <12 år: 1-3 ml blod i barneflaske BACTEC PEDS (rosa kork) (betydelig mindre blodvolum aksepteres hos nyfødte og barn med lav vekt). For voksne og barn >12 år: Aerob flaske: 8-10 ml blod i BACTEC AEROB (grå kork). Anaerob flaske: 8-10 ml blod i BACTEC ANAEROB (orange kork). Ved mistanke om soppinfeksjon: Fyll flaske merket: BACTEC MYCOSIS IC/F (grønn kork). Se også Anlegging av blodkulturer. Flaskene blandes godt etter prøvetaking. Oppbevares i romtemperatur før transport til laboratoriet. Dyrking (5 dager). Dyrking (5 dager). Dyrking (7 dager). 10

11 Serologisk diagnostikk Kliniske opplysninger er avgjørende for at laboratoriet skal kunne velge optimale undersøkelser og gi best mulig vurdering av resultatene. For blodprøver til antistoffundersøkelse må det angis om det dreier seg om aktuell infeksjon, bærertilstand eller immunstatusundersøkelse etter gjennomgått infeksjon eller vaksinasjon. Prøvemateriale til serologi: Minst 2-3 ml serum eller 10 ml fullblod uten anti-koagulans, fortrinnsvis på gel-rør. Nødvendig prøvevolum er avhengig av antall ønskede analyser. Prøve fra nyfødt: Samtidig tatt prøve fra mor og barn er nødvendig for rasjonell undersøkelse av barneserumet (oftest lite volum). Prøvene må merkes slik at samhørigheten er entydig. Spinalvæske: Samtidig tatt serumprøve er nødvendig for rasjonell us. av spinalvæsken. Ved mistanke om intratekal produksjon av antistoffer utføres ratio-bestemmelse (forhold mellom antistoffer i spinalvæske/serum). Tidsintervallet mellom prøvene bør ikke overskride én time. Undersøkelse av enkeltstående spinalvæske har mindre verdi. Om antistoffanalyse ved diagnostikk av aktuelle infeksjoner: IgM antistoff dannes tidlig i sykdomsforløpet. Disse kan vanligvis påvises fra 3-5 døgn til 1-6 måneder etter sykdomsdebut. Indikasjon på aktuell infeksjon. IgG antistoffer kan ved hjelp av følsomme metoder påvises fra ca 10 dager etter sykdomsdebut og oftest livet ut. Titerstigning er indikasjon på aktuell infeksjon. Høyt antistofftiter i enkeltprøve eller høye, ikke signifikant forskjellige titer i serumpar, kan også bety aktuell infeksjon. Et høyt titer kan imidlertid hos enkelte vedvare i lang tid (år) etter infeksjon. Høyt titer som følge av kryssreagerende antigener forekommer også. Sinusitt Sykdom / vanligste agens Streptococcus spp. Hemophilus influenzae Moraxella catarrhalis Anaerobe bakterier Staphylococcus aureus Pseudomonas spp. Enterobacteriaceae Sopp (Aspergillus spp. etc.) Materiale Nasopharynxsekret. Sinussekret. Prøvetaking og Penselprøve i Amies transportmedium. Aspirasjon fra sinus på sterilt glass (rask levering) og på pensel i Amies transportmedium. Alminnelig bakteriologisk dyrking (2 dager). Soppdyrking (7-14 dager) hvis rekvirert. Alminnelig bakteriologisk dyrking (2 dager). Anaerob dyrking (2 dager). Soppdyrking (7-14 dager) hvis rekvirert. 11

12 Tonsilitt pharyngitt Sykdom / vanligste agens Beta-hemolytiske streptokokker Materiale Sekret tonsillekrypter / bakre svelgvegg. Prøvetaking og Penselprøve i bakt. transportmedium. Dyrking betahemolytiske streptokokker (1 dag). Tuberkulose og andre mykobakterieinfeksjoner Sykdom / vanligste agens Tuberkulose: Mycobacterium tuberculosiskomplekset I dette komplekset inngår: M. tuberculosis M. africanum M. canetii M. bovis som alle kan gi human tuberkulose. NTM (Nontuberculous mycobacteria) infeksjon: Langsomtvoksende: M. avium-komplekset (MAC) M. kansasii M. malmoense M. marinum Hurtigvoksende: M. abscessus M. chelonae M. fortuitum-gruppen Materiale, prøvetaking og Ekspektorat: Tas helst om morgenen (munnen skylles først), ideelt 5-10 ml, minst 3 prøver (3 ulike dager), sendes atskilt i steril beholder. Indusert sputum: Inhalasjon av hypertont saltvann via forstøverapparat, induserer hoste og ekspektorat, ideelt 5-10 ml, minst 3 prøver (kan tas samme dag), sendes adskilt i steril beholder. Bronkialsekret/væske: Minst 5 ml, sendes i steril beholder. Bronkoskopet må ikke kontamineres med springvann. Ventrikkelaspirat: Aktuelt for barn <10-12 år og ev. andre som ikke greier å produsere tilstrekkelig ekspektorat. Tas fastende om morgenen, 5-10 ml aspireres, minst 3 prøver (3 ulike dager), sendes adskilt i steril beholder. Tilsett 100 mg natriumkarbonat innen 4 timer (for å oppnå nøytral ph). Alle prøver dyrkes på spesialmedier: Flytende medium 6 uker (Bactec MGIT 960). Fast medium 8 uker (Løwenstein-Jensen). Direkte PCR M. tuberculosiskomplekset (MTB): Primært på respiratorisk matriale, men kan også gjøres på annet prøvematriale (ikke på pleuravæske eller urin). Best sensitivitet på respiratorisk matriale. Ikke egnet til kontroll av behandling. Ikke påvist MTB ved PCR utelukker ikke tuberkulose! 12

13 Urin: Tas helst om morgenen, 40 ml midtstrømsprøve, minst 3 prøver (3 ulike dager), sendes atskilt i steril beholder. Kroppsvæsker (pleura-, spinal-, pericard- og peritonealvæske): Så stort volum som mulig, minst 2 ml spinalvæske, sendes i steril beholder. Vev/biopsier (lymfeknute, hud etc.): Minst 1 g, sendes i steril beholder, tilsatt litt sterilt fysiologisk saltvann for å forhindre inntørking. IKKE tilsett formalin. Puss, aspirat, sårsekret: Så mye materiale som mulig, sendes i steril beholder, ev. penselprøve i Amies transportmedium (kun hvis ikke annet er mulig). Blodkultur: Flaske: BACTEC MYCO F lytic (rød kork). Ved mistanke om systemisk infeksjon, for eksempel MACinfeksjon hos immunsupprimerte (AIDS) eller miliær tuberkulose. Fæces: Ved mistanke om MACinfeksjon hos immunsupprimerte (AIDS) eller gastrointestinal tuberkulose. Minst 1 g, sendes i steril beholder. Direkte mikroskopi (Ziehl- Neelsen): Påviser syrefaste staver, men utelukker ikke TB eller NTM inf. hvis ikke påvist! Utføres alltid når MTB er påvist ved PCR, men også aktuelt ved mistanke om alvorlig pulmonal NTM infeksjon. Utføres også på annet prøvemateriale som puss, biopsier og aspirat (ikke rutine på pleuravæske eller urin). Må rekvireres spesielt hvis ønsket ved kontroll av behandling. 13

14 TUBERKULOSE, andre analyser Mycobacterium tuberculosiskomplekset NB! Spesielle prøvetakingsglass og særskilt prøvebehandling. Kontakt laboratoriet for mer informasjon. Interferon-gamma release assay (IGRA): Quantiferon TB Gold Påviser immunrespons mot Mycobacterium tuberculosiskomplekset. Skiller ikke mellom latent og aktiv sykdom. Tyfoidfeber Vanligste agens Materiale Prøvetaking og Blod Blodkulturflaske, Se Anlegging av blodkulturer Dyrking (5 dager). Salmonella typhi Salmonella paratyphi Fæces. Rectalpensel (innenfor sfinkter) er en nødløsning. Urin Fæces i "LQ CARY BLAIR" transportmedium (ved transport >4 timer) eller fæces uten tilsetning (rask transport). Urinprøve nedkjølt i steril beholder. Ved transport >24 timer tilsett borsyre. Dyrking "Tarmpatogene bakterier" (2-3 dager). Dyrking (2 dager). Uretritt Vanligste agens Materiale Neisseria gonorrhoeae Chlamydia trachomatis Sekret / puss fra urethra, eventuelt også rectum og hals. Sekret fra urethra, eventuelt rectum og hals. Urin Prøvetaking og Penselprøve i Amies transportmedium (med kull). Rask transport. Dyrking "Gonokokker" (2 dager) 14

15 Urinveisinfeksjon Vanligste agens - E. coli Andre Gram negative staver: - Proteus mirabilis - Klebsiella spp. - Enterobacter spp. - Staphylococcus saprophyticus - Beta-hemolytiske streptokokker gruppe B - Enterokokker Materiale Prøvetaking og Urin: Urin i steril Midtstrømsprøve beholder (2-3 timer etter (nedkjølt før siste vannlating) transport, rask transport). Kateterprøve Urin, blærepunksjon Urin på Uricult: agarplate helles/dyppes i urin, la overflødig urin renne av før den settes i beholder. Ved transporttid >24 timer, benytt beholder med borsyre (beholderen må fylles helt). Uricult inkuberes i timer i 36±2 C eller 1-3 dager ved romtemperatur, før eventuell sending. Kvantitativ dyrking av 1 µl urin (1-2 dager). Signifikant bakteriuri: Voksne og barn >3år: cfu/ml Barn <3 år: cfu/ml Kvantitativ dyrking av 10 µl urin (1-2 dager). All vekst, dvs mer enn 100 cfu/ml, oppfattes som signifikant. Signifikant bakteriuri: Voksne og barn >3år: cfu/ml Barn <3 år: cfu/ml Identifikasjon og eventuell resistensbestemmelse (1-2 dager). 15

16 Abscesser, empyem, og purulente væsker fra lukkede hulrom Vanligste agens Materiale Prøvetaking og Aerobe og anaerobe bakterier, ofte polymikrobiell flora, avhengig av prøvelokalisasjon. Puss, purulent væske. Punksjon/aspirasjon, materiale i steril beholder (rask transport) og på penselprøve i Amies transportmedium. Aerob og anaerob dyrking (2 dager). Ev. direkte mikroskopi hvis rekvirert og mottatt materiale på steril beholder. Mykobakterier Se Tuberkulose og andre mykobakterieinfeksjoner Anlegging av blodkulturer For å unngå kontaminasjon av blodkulturflaskene er det viktig at prosedyren utføres aseptisk. Etter palpasjon av venen desinfiseres prøvetakingsstedet med flere tupfere vætet med klorhexidinspritoppløsning 5 mg/ml. Tørketid minimum 30 sekunder. Husk også desinfeksjon av flaskenes gummimembran. Små barn: Flaske: BACTEC PEDS m/ rosa kork. Blodvolum: 1-3 ml blod. Bland innholdet. Betydelig mindre mengde blodvolum aksepteres hos nyfødte og barn med lav vekt. Voksne og barn > 12 år: Aerob flaske: BACTEC AEROB m/ grå kork. Blodvolum: 8-10 ml Anaerob flaske: BACTEC ANAEROB m/ oransje kork. Blodvolum: 8-10 ml Hovedregel: Det anbefales en aerob og en anaerob flaske i hvert blodkultursett. Det anbefales at det tas to BLODKULTURSETT i forbindelse med symptomdebut. Disse kan tas SAMTIDIG men med 2 ULIKE INNSTIKK. Bland innholdet godt. I tillegg til pasientidentifikasjon MÅ flaskene merkes med prøvetakingsdato, klokkeslett og hvilke flasker som hører til samme sett. Ikke klistre over flaskenes strekkode. Ved mistanke om: Sopp: fyll i tillegg en flaske BACTEC MYCOSIS IC/F m/ grønn kork. Mykobakterier (TB): fyll i tillegg en flaske BACTEC MYCO F lytic m/ rød kork Levering av blodkulturer: Settes på depot ved siden av kjøleskapet. Skal ikke stå kaldt. Kan ikke sendes i rørpost. 16

17 Biopsi (indre organ, bein, hjerne) Vanligste agens Materiale Prøvetaking og Aerobe og anaerobe bakterier, avhengig av prøvelokalisasjon. Vevsprøve Biopsi på steril beholder, ev. tilsatt litt saltvann (rask transport). Aerob og anaerob dyrking (5 dager). Ev. direkte mikroskopi hvis rekvirert. Mykobakterier Se Tuberkulose og andre mykobakterieinfeksjoner Difteri Sykdom / vanligste agens Materiale Prøvetaking og Corynebacterium diphteria Sekret tonsillekrypter / bakre svelgvegg og ev. dyp neseprøve. Kontakt laboratoriet før prøvetakning. Penselprøve i Amies transportmedium. Spesialdyrking (3 dager) hvis rekvirert Eksantem, enantem (makulopapuløst) Virus Prøve til virus-påvisning Serologi Morbillivirus Munn-/hals-pensel til PCR Ja Rubellavirus Ikke aktuelt Ja Enterovirus Fæces, hals (ev. vesikkel) Nei Molluscum contagiosum Biopsi til elektronmikroskopi Nei 17

18 Eksantem, enantem (vesikulært) Virus Prøve til virus-påvisning Serologi Herpes simplex virus (HSV) Vesikkelvæske / sårsekret Ja (bare av verdi ved primærinfeksjon) Varicella zoster virus (VZV) Vesikkelvæske / sårsekret Ja (bare av verdi ved primærinfeksjon) Enterovirus (Coxsackie A virus) Fæces / vesikkelvæske / hals Nei Endoftalmitt Sykdom / vanligste agens Materiale Prøvetaking og Streptococcus spp. Haemophilus influenzae Staphylococcus spp. Gram-negative staver Bacillus cereus (post-traumatisk) Propionibacterium acnes Candida spp. Muggsopp Væske fra corpus vitreum/forkammer Sterilt glass/forseglet sprøyte (rask transport). Alminnelig bakteriologisk dyrking (5 dager). Anaerob dyrking (2 dager). Soppdyrking (3 uker). Direkte mikroskopi hvis tilstrekkelig prøvemateriale Mykologiske undersøkelser 1. Dyrking: Dermatofytter Gjærsoppdyrkning Muggsoppdyrkning (3-4 uker) (2-7 dager) (2 uker) Ved overfladiske mykoser tas tørt materiale fra hud, hår eller negler. Sparsomt materiale sendes mellom to objektglass som er 'tapet' på alle kanter. Rikelig materiale sendes i prøveglass uten tilsetning. 2. Resistensbestemmelse: Vesentlig av gjærsopp ved invasive, systemiske infeksjoner. 18

19 Nedre luftveisinfeksjon Sykdom / vanligste agens Materiale Prøvetaking og Pneumokokker Haemophilus influenzae Moraxella spp. Sjeldnere (innlagte i sykehus, kronisk lungesyke, immunsvekkede) : Staphylococcus aureus Enterobacteriaceae Pseudomonas aeruginosa Anaerobe bakterier (etter aspirasjon). Aspergillus spp. Candida spp. Nasofarynxsekret (dyp neseprøve eller aspirat). Trakelasekret, indusert sputum, BAL. Penselprøve i Amies transportmedium, aspirat i steril beholder (rask transport). Steril beholder (rask transport). Alminnelig bakteriologisk dyrking (2-3 dager). Alminnelig bakteriologisk dyrking (2-3 dager). Hvis rekvirert: Soppdyrking (7-14 dager). Anaerob dyrking (2-3 dager) av prøvematriale tatt ved bronkoskopi. Blodkultur. Se Anlegging av blodkulturer Dyrking (5 dager). Chlamydophila pneumoniae Inntil 4 uker etter sykdomsdebut: Nasofarynxsekret (dyp neseprøve eller aspirat) og svelgsekret, trakealsekret, indusert sputum, BAL. Copan pensel (nylon) eller sekret i UTM-RT transp.medium. Nukleinsyreamplifikasjonsteknikk (PCR) (2-3 dager). Mycoplasma pneumoniae Inntil 4 uker etter sykdomsdebut: Nasofarynxsekret (dyp neseprøve eller aspirat) og svelgsekret, trakealsekret, indusert sputum, BAL. Copan pensel (nylon) eller sekret i UTM-RT transp.medium. Nukleinsyreamplifikasjonsteknikk (PCR) (2-3 dager). 19

20 Legionella sp. Ekspektorat, indusert sputum, trakealsekret, BAL. Steril beholder. Spesialdyrking (7 dager). Legionella pneumophila serogruppe 1. Urin Steril beholder. Påvisning av antigen: Legionella pneumophila serogruppe 1 (samme dag). Pneumocystis jiroveci (tidligere P. carinii) Indusert sputum, BAL. Steril beholder. Direkte mikroskopi (samme dag på hverdager, når prøven er mottatt før kl ). Otitis externa Sykdom / vanligste agens Materiale Prøvetaking og Staphylococcus aureus Beta-hemolytiske streptokokker Pseudomonas aeruginosa Aspergillus spp. Candida spp. Sekret fra øregang. Penselprøve i Amies transportmedium. Alminnelig bakteriologisk dyrking (2 dager). Soppdyrking (7-14 dager) hvis rekvirert. Otitis media Sykdom / vanligste agens Materiale Prøvetaking og Streptococcus spp. Hemophilus influenzae Moraxella catarrhalis Øresekret etter perforasjon, ev. nasofarynx-sekret. Penselprøve i Amies transportmedium. Alminnelig bakteriologisk dyrking (2 dager) 20

21 Pertussis (kikhoste) Testnavn Svar Kommentar IgG IgM POS/NEG Kommenteres. Se også direkte-påvisning av B.pertussis B. pertussis toxin IgG Prostatitt Vanligste agens Materiale Prøvetaking og Aerobe bakterier Eksprimat (sekret etter prostatamassasje) Penselprøve i Amies transport-medium. Dyrking (2 dager). Proteseinfeksjon Vanligste agens Materiale Prøvetaking og Hvite stafylokokker. Propionebakterier. Biopsi, fremmedlegeme (skruer, proteser). Steril beholder, ev. tilsatt litt saltvann, rask transport. Aerob dyrking (7 dager) og anaerob dyrking (5 dager). Prøvetakningsveiledning For mykobakterier se Prøvetakingsveiledning mykobakterier For serologi se Prøvetaking serologi Abscess/puss Puss fra abscesser skaffes helst ved aspirasjon med sprøyte etter desinfeksjon av huden. Luft i sprøyten fjernes for å sikre materiale til både aerob og anaerob dyrkning. Sprøyten lukkes forsvarlig med propp. Materialet kan overføres til steril beholder uten tilsetning. Rask til laboratoriet er viktig. Eventuelt kan en i tillegg ta puss på pensel og forsende dette i Amies transportmedium. Ascites/peritoneal-væske 1-3 ml i steril beholder uten tilsetning. 21

22 Autopsimateriale Vevsbiter tatt med sterilt utstyr sendes i steril beholder uten tilsetning. Fysiologisk NaCl kan tilsettes for å hindre uttørking. Til påvisning av virus: Biter tatt med sterilt utstyr sendes i 1-2 ml transportmedium 1 (i nødsfall sterilt, fysiologisk saltvann) i steril beholder. Barnemark - tapepreparat Prøven bør tas om morgenen før toalettbesøk. En gjennomsiktig tapebit trykkes mot endetarmsåpningen og festes deretter på et objektglass. Sendes i transporthylse beregnet på objektglass. Biopsimateriale Som autopsimateriale. Blod til HCV PCR Blod til HIV PCR Blod til kvantitativ CMV-PCR (gjøres på Rikshospitalet) Blod til kvantitativ EBV-PCR (gjøres på Rikshospitalet) Blodkultur Påvisning av bakterier og sopp i blod gjøres ved hjelp av et eget blodkultursystem. Én blodkulturflaske trekker ca. 8 ml blod, minste anbefalte blodvolum pr. flaske er 3 ml. Pasientens hud desinfiseres med klorhexidinsprit, likeså toppen av blodkulturflaskene. Desinfeksjonsmiddel skal tørke før prøvetaking utføres. Ved anleggelse av blodkultur bør det brukes én flaske for aerob og én flaske for anaerob dyrkning. Ved mistanke om soppinfeksjon benyttes spesialflaske for sopp, og ved mistanke om mykobakteriemi benyttes egne mykobakterieflasker. Dette må rekvireres særskilt. En aerob flaske + en anaerob flaske + evt. soppflaske tatt i samme stikk utgjør ett blodkultursett. Blodkultur bør om mulig tas ved frostanfall/febertopper. Det bør rutinemessig anlegges 2 sett, disse kan tas samtidig, men i ulike stikk. Dersom pasienten har dårlige blodårer slik at to venepunksjoner er vanskelig, tappes begge blodkultursett fra samme punksjon. Ved mistanke om endokarditt anbefales 3 sett initialt (to sett fra ulike innstikk tatt på samme tid, det siste settet 1-2 timer senere), eventuelt to nye sett neste dag. Prøvetaking hos barn: >6år: som hos voksne, om det lar seg gjøre prøveteknisk. <6 år: For aerob og anaerob bakteriologisk dyrkning brukes pediatrisk flaske pluss en anaerob flaske. Anaerob flaske fylles med 2-7 ml blod. Der det er mulig gjøres dette 2 ganger med forskjellig innstikk. Dersom soppundersøkelse er rekvirert bør det i tillegg tas en soppflaske, eventuelt istedenfor anaerob flaske. Fullbårne nyfødte og spedbarn: For aerob dyrkning og soppdyrkning tas 1 pediatrisk flaske. Ideelt sett gjøres dette to ganger med forskjellig innstikk. Dersom anaerob undersøkelse er rekvirert brukes i tillegg anaerob flaske som fylles med inntil 3 ml blod. Premature: For aerob dyrkning og soppdyrkning tas 1 pediatrisk flaske med (0,5-)1ml blod eventuelt mer. Dersom anaerob undersøkelse er rekvirert brukes i tillegg anaerob flaske som fylles med inntil 3 ml blod. Oppgi om det er lavt blodvolum på remissen. Overvåkning av kulturene foregår automatisk i et eget inkubatorskap på laboratoriet. Det er derfor viktig at prøvene straks etter prøvetaking transporteres til laboratoriet og før oppbevares ved romtemperatur. Utenom åpningstid vil portørtjenesten ta hånd om plasseringen av flaskene. 22

23 Bronkialskyllevann Minst 2 ml uten tilsetning i steril beholder. Drensekret Kan tas ved aspirasjon med sprøyte. Luft i sprøyten fjernes for å sikre materiale til både aerob og anaerob dyrkning. Sprøyten lukkes forsvarlig med propp. Materialet kan overføres til steril beholder uten tilsetning. Kan alternativt tas med pensel som plasseres i Amies transportmedium. Dårlig egnet materiale for viruspåvisning. Bør unngås. Ekspektorat Prøve tas helst om morgenen før pasienten har spist. Pasienten bør skylle først munnen med vann og fjerne evt. løse tenner. Pasienten må instrueres om å hoste kraftig og dypt slik at materiale fra nedre luftveier sikres. Sendes i steril beholder uten tilsetning. Vennligst send egen prøve til dyrkning av mykobakterier. Fæces til us av patogene tarmbakterier Penselprøve fra fæces i LQ Cary Blair transportmedium (Copan fecal Swab med grønn kork). Alle prøver oppbevares i kjøleskap før. Fæces til undersøkelse av Clostridium difficile toksin Ca 5 ml feces uten tilsetning. Prøvene er holdbare i inntil 3 døgn i kjøleskap. Fæces til undersøkelse av parasitter 5-10 g (tilsvarende en stor teskje) overføres til prøvebeholder tilsatt 4 % formalin. Alternativt kan EcoFix transportmedium anvendes. Trofozoitter (Giardia lamblia, Entamoeba histolytica, Strongiloides larver): Prøve uten tilsetning må undersøkes raskest mulig helst innen 30 minutter ( rykende fersk avføring ). Fæces til påvisning av virus 5-10 g (tilsvarende en stor teskje) overføres med spatel til steril prøvebeholder uten tilsetning. Galle Kan tas ved aspirasjon med sprøyte. Luft i sprøyten fjernes for å sikre materiale til både aerob og anaerob dyrkning. Sprøyten lukkes forsvarlig med propp. Materialet kan overføres til steril beholder uten tilsetning. Kan alternativt tas med pensel som plasseres i Amies transportmedium. Dårlig egnet materiale for viruspåvisning. Bør unngås. Halsprøve En vattpensel gnis over tonsiller, bakre svelgvegg og eventuelle lesjoner mens tungen holdes nede med spatel. Forsøk å unngå tenner og tannkjøtt. Pensel settes ned i et rør med Amies transportmedium. Til påvisning av virus: En pensel 1 gnis over tonsiller, ganebuer, bakre svelgvegg og eventuelle lesjoner og settes ned i et rør med virustransportmedium. Halsskyllevann Til påvisning av virus: Godt egnet materiale fra personer som greier å gurgle. Pasienten må gurgle godt med noen ml fysiologisk saltvann som deretter overføres til et rør med virustransportmedium. 23

24 Konjunktivalsekret Materiale tas fra konjunktivalsekken med pensel som deretter settes ned i et rør med Amies transportmedium eller UTM-RT transportmedium for viruspåvisning. Leddvæske Minst 0,25 ml i steril beholder uten tilsetning. Nasofarynxprøve Til vanlig bakteriologisk undersøkelse tas prøve fra nasofarynx med tynn, bøyelig prøvepinne. Penselen føres gjennom nesekaviteten til den treffer bakre vegg av nasopharynx. Hvis mulig holdes pensel på prøvested i sek. for å suge opp materiale. Penselen settes deretter i Amies transportmedium. Ved mistanke om kikhoste, Chlamydophila pneumoniae eller Mycoplasma pneumoniae (PCRundersøkelse) benyttes prøvetakingssett for virus (Copan spesialpensel (nylon) i UTM-RT transportmedium). Til påvisning av virus: Godt egnet materiale fra små barn. En ernæringssonde (nr. 5-8) kobles til en 20 ml sprøyte. Sonden føres gjennom et nesebor til nasofarynx (4-6 cm) og det aspireres mens sonden trekkes langsomt ut. Samme prosedyre gjentas fra det annet nesebor. Til slutt suges 2 ml virustransportmedium gjennom sonden, og slim med transportmedium sprøytes tilbake til prøveglasset som sendes til laboratoriet. Ved behov for oppbevaring over natt lagres prøvematerialet i kjøleskap. Neseprøve til viruspåvisning Tynn pensel i virus transportmedium. Prøven tas fra bunnen av nesegangen, så langt baktil som mulig. Kan sendes i samme rør som hals-/ svelg-prøve. Nese-, hals- og perineumprøve til MRSA-undersøkelse Prøve til hurtigtest må tas på e-swab fra Copan. Neseprøve tas fra ytre del av begge nesebor med samme pensel. Ved tørre forhold må penselen fuktes med sterilt vann/saltvann før prøvetaking. Pensel plasseres i transportmedium, skaft brekkes av ved angitt merke og kork settes på. Prøver som kun skal dyrkes, kan tas på Amies transportmedium. Pericardvæske Minst 0,25 ml i steril beholder uten tilsetning. Til påvisning av virus: Minst 1 ml i steril beholder uten tilsetning. Pleuravæske 1-3 ml i steril beholder uten tilsetning. Sinussekret Tas ved aspirasjon fra sinus eller ved skylling av sinus. Sendes i steril, lufttom beholder (eks sprøyte) for å sikre materiale til både aerob og anaerob dyrkning. Spinalvæske For påvisning av bakterier/sopp: 1-3 ml i steril beholder uten tilsetning. For påvisning av virus: 1-3 ml i egen beholder. 24

25 Sårsekret/pensel fra hud/slimhinner Det er viktig å angi type sår på rekvisisjonen. Kun dype sår undersøkes med anaerob dyrkning. Sår vaskes med sterilt saltvann og løst debris, skorper mv fjernes forsiktig. Deretter tas det prøve med pensel fra kanten av såret. Penselen settes ned i Amies transportmedium. Til påvisning av virus: Sårbunnen/bunnen av vesikler/pustler gnis kraftig med pensel, slik at cellemateriale følger med. Penselen settes ned i et rør med virustransportmedium. Tubesekret Sendes i steril beholder uten tilsetning. Urethra Pensel føres inn i ytre urethra, roteres. Forsendes i Amies transportmedium for bakterier/sopp eller UTM- RT transportmedium for viruspåvisning. For klamydia: Chlamydia trachomatis Urin Spontant latt urin: Rutinemessig tas prøve som midtstrømsurin, helst som morgenurin, eventuelt 2-3 timer etter siste vannlating. Prøvetaking hos kvinner skjer ved at kjønnsleppene holdes fra hverandre og at den første porsjonen urin kastes. Hos menn holdes på samme måte forhuden tilbake før midtstrømsurin samles. Vaskeprøve hos sengeliggende eller inkontinente pasienter. Kateterprøve: Etter desinfeksjon tas det prøve fra særskilt prøvetakingssted på kateteret, evt kan det tas prøve direkte med sprøyte og kanyle gjennom kateterveggen. Det skal ikke tas prøve fra samleposen. Kateterspisser er uegnet som prøvemateriale og vil ikke bli undersøkt. Poseprøve: Hos små barn settes pose på etter vask av området rundt genitalia. Så snart det er kommet urin i posen, tas denne av. Blærepunksjon: Suprapubisk innstikk på full blære med steril teknikk. Oppbevaring og transport av urinprøver: Ved kort transporttid innen sykehuset kan urin oppbevares og forsendes uten tilsetning. Oppbevaring før i kjøleskap. Rask transport til laboratoriet er viktig. Urin uten tilsetning er holdbar i romtemperatur i 2 timer, i kjøleskap i 24 timer. Ved lengre transporttid benyttes tilsetning av borsyre. Urin fylles helt opp i borsyreglass. Holdbarhet i romtemperatur er 48 timer. Chlamydia trachomatis Schistosoma egg: 4 timers urin, helst mellom kl Evt. døgnurin uten tilsetning. Ved transporttid > 1 døgn tilsett 1-2 ml 10 % formalin per 100 ml urin. Til påvisning av virus: 0,5-1 ml i steril beholder uten tilsetning. Vagina/cervix Cervixprøve tas etter innstilling av portio med vaginalspekel og avtørring med tupfer. Pensel føres inn i cervikalkanalen og roteres. Forsendes i Amies transportmedium. Chlamydia trachomatis Prøver fra gravide for undersøkelse på gruppe B streptokokker tas først fra vagina og deretter fra anus (samme pensel kan benyttes). Forsendes i Amies transportmedium. Vesikkelinnhold Til påvisning av virus: Vesiklene punkteres og innholdet fanges opp på pensel som settes ned i et rør med virustransportmedium. Se for øvrig sårsekret. Prøver som ikke kan bringes til laboratoriet samme dag, oppbevares i kjøleskap. 25

26 Øreprøver Ved otitis media tas prøve aller helst etter incisjon av trommehinne og oppsamling av sekret. Alternativt kan prøve tas med tynn pensel gjennom øretrakt uten å berøre veggen i ytre øregang. Penselen settes deretter i Amies transportmedium. Ved otitis externa tas prøve fra ytre øregang uten særskilte forholdsregler. 1 Det anvendes UTM-RT transportmedium og tilhørende pensel fra Copan. I nødsfall kan sterilt, fysiologisk saltvann og dakronpensel brukes. Langvarig feber hos immunosupprimerte pasienter Virus Prøve til virus-påvisning Serologi Cytomegalovirus (CMV) EDTA-blod til PCR (gjøres på Rikshospitalet) Ja Epstein-Barr virus (EBV) EDTA-blod til PCR (gjøres på Rikshospitalet) Ja Leverabscess Vanligste agens Materiale Prøvetaking og Entamøba histolytica Abscessmateriale Serum Sterilt glass Mikroskopi og antigentest Serologi Luftveisinfeksjon viral Sykdom / vanligste agens Materiale Prøvetaking og - Influensavirus A og B - Respiratorisk syncytial virus (RSV) - Parainfluensavirus (1-4) - Adenovirus - Humant metapneumovirus - Rhinovirus Inntil 2 uker etter sykdomsdebut: Nasofarynxsekret (dyp neseprøve eller aspirat) og svelgsekret, trakealsekret, indusert sputum, BAL. Copan pensel (nylon) eller sekret i UTM-RT transportmedium. Nukleinsyreamplifikasjonsteknikk (PCR) Ikke tilgjengelig serologi 26

27 Meningitt (bakterier og sopp) Vanligste agens Materiale Prøvetaking og Spinalvæske 2-3 ml spinalvæske i sterilt glass. Eventuelt direkte utsæd på brunskål. Må ikke avkjøles. Direkte mikroskopi samme dag som prøven er mottatt i laboratoriet. Dyrking (3 dager). Hvis fremmedlegeme også anaerob dyrking (7 dager). - Pneumokokker - Neisseria meningitidis - Beta-hemolytiske streptokokker gruppe B - Gram negative stavbakterier - Haemophilus influenzae - Listeria monocytogenes Event. nukleinsyreamplifikasjonsteknikk (PCR), ved klinisk mistanke om meningitt uten vekst, eller hvis antibiotika startet før prøvetakning. Fremmedlegeme i spinalkanalen: Stafylokokker. Propionebakterier. Blod Blodkulturflaske. Se Anlegging av blodkulturer Dyrking (5 dager). Ev. urin Antigenpåvisning (samme dag som prøven er mottatt i laboratoriet): Betahemolytiske streptokokker gruppe B, pneumokokker. Må rekvireres spesielt. 27

28 Immunsupprimerte: Candida spp. Kryptokokker Spinalvæske 2-3 ml spinalvæske i sterilt glass. Eventuelt direkte utsæd på brunskål. Må ikke avkjøles. Direkte mikroskopi samme dag som prøven er mottatt laboratoriet. Soppdyrking (7-21 dager) hvis rekvirert. Kryptokokk-antigen Event. nukleinsyreamplifikasjonsteknikk (PCR) hvis rekvirert Blod Blodkulturflaske, Se Anlegging av blodkulturer Dyrking (7 dager). Meningitt (viral, serøs), encefalitt, pareser Virus Prøve til virus-påvisning Serologi Enterovirus (coxsackievirus, echovirus, poliovirus) Spinalvæske, fæces / hals Nei Parechovirus Spinalvæske, fæces / hals Nei Herpes simplex virus (HSV) Spinalvæske, vesikkelvæske Ja (bare av verdi ved primærinfeksjon) Varicella zoster virus (VZV) Spinalvæske, vesikkelvæske Ja (bare av verdi ved primærinfeksjon) Parotittvirus (Spinalvæske) Ja Mononukleose Virus Prøve til virus-påvisning Serologi Epstein-Barr virus (EBV) Ikke aktuelt Ja 28

29 Mononukleoselignende sykdom Virus Prøve til virus-påvisning Serologi Cytomegalovirus (CMV) Ikke aktuelt Ja Myalgia epidemica, pericarditt / myocarditt Virus Prøve til virus-påvisning Serologi Enterovirus Fæces / hals Nei Infeksjoner i kvinnelig genital-traktus Vanligste agens Materiale Prøvetaking og Neisseria gonorrhoeae Sekret / puss fra cervix og urethra, eventuelt også rectum og hals. Penselprøve i Amies transportmedium (med kull). Rask transport. Dyrking "Gonokokker" (2 dager). Chlamydia trachomatis Sekret fra cervix / vagina og urethra, eventuelt også rectum og hals. Urin Bakteriell vaginose (forskjøvet vaginalflora, med dominans av anaerobe bakterier). Påvises ved den kliniske undersøkelsen. Gir homogen, tynn, illeluktende utflod med ph > 4,5. Mikroskopi av vaginalsekret viser typiske clueceller (vaginalepitelceller dekket med små bakterier), stor mengde kokker og korte stavformede bakterier og fravær av stavformede laktobasiller. Gardnerella vaginalis finnes hos opptil 50% av kvinner uten symptomer, og betydningen av et dyrkningsfunn er derfor vanskelig å vurdere. Hvis spesialdyrking allikevel er indisert, send cervix/vaginalsekret på pensel i Amies transportmedium. 29

30 Candida spp. Vaginalsekret Påvises ved den kliniske undersøkelsen. Ved kronisk residiverende infeksjoner kan artsog resistensbestemmelse være aktuelt. Penselprøve på Amies transportmedium sendes inn til "Gjærsopp" dyrking (3-4 dager). Trichomonas vaginalis Forekommer sjeldent. Diagnosen stilles enklest ved direkte mikroskopi av vaginalsekret på legekontoret. Hvis spesialdyrking allikevel er indisert, send vaginalsekret på pensel i Amies transportmedium, raskt transport til laboratoriet er avgjørende. Infeksjoner etter fødsel, abort eller kirurgiske inngrep: aerobe og anaerobe bakterier, gram positive og gram negative. Puss fra infeksjonsfokus (cervix, uterus etc). Penselprøve i Amies transportmedium (med kull). Alminnelig bakteriologisk dyrking (2 dager), aerobt og eventuelt anaerobt, avhengig av prøvemateriale. Alminnelig bakteriologisk dyrking av fluor vaginalis hos fertile kvinner har liten verdi og er sjelden indisert. Prøven blir ikke undersøkt. Prøver fra jenter før pubertet blir alltid undersøkt. 30

31 Intrauterin infeksjon eller generell sykdom hos nyfødte NB! Blodprøve fra mor er viktig Smittestoff Prøve til agenspåvisning Serologi Rubellavirus Ikke aktuelt Ja Cytomegalovirus (CMV) Hals / urin / spinalvæske / EDTA-blod (utføres på Rikshospitalet) Ja Herpes simplex virus (HSV) Hals / vesikkelvæske / spinalvæske Ja Enterovirus Parechovirus Fæces / spinalvæske / hals (ev. EDTA-blod) Nei Parvovirus B19 Serum / benmarg / biopsi / fostervann / spinalvæske (utføres ved Rikshospitalet) Ja Toxoplasma gondii Fostervann / EDTA-blod / spinalvæske / biopsi (utføres på Rikshospitalet) Ja Kateterspisser (intravasale katetre og liknende) Vanligste agens Materiale Prøvetaking og Hvite stafylokokker Kateterspisser Steril beholder, ev. tilsatt litt saltvann, rask transport. Semikvantitativ utsæd (intravasale katetre) og aerob dyrking (2 dager). 31

32 Keratitt Sykdom / vanligste agens Materiale Prøvetaking og Staphylococcus spp. Streptococcus spp. Pseudomonas spp. Enterobacteriaceae Moraxella spp. Haemophilus spp. Bacillus (fr.legeme) Nocardia (kirurgi) Candida spp. Muggsopp Avskrap av cornea. Kontakt øyeavdeling (utsed direkte på brunskål og buljong). Alminnelig bakteriologisk dyrking (5 dager). Soppdyrking (7-14 dager). Virus Avskrap av cornea. Kontakt øyeavdeling. Copan pensel i UTM- RT transportmedium. Nukleinsyreamplifikasjonstest. Acantamoeba spp. Avskrap av cornea. Kontakt øyeavdeling og laboratoriet. Spesialdyrking Kikhoste Sykdom / vanligste agens Materiale Prøvetaking og Bordetella pertussis Inntil 4 uker etter sykdomsdebut: Nasofarynxsekret (dyp neseprøve eller aspirat). Copan pensel (nylon) eller aspirat i UTM- RT transportmedium. Nukleinsyreamplifikasjonsteknikk (PCR) (2-3 dager). Hvis bakteriestammen ønskes isolert: Nasofarynxsekret (dyp neseprøve eller aspirat). Penselprøve i Amies transportmedium, aspirat i steril beholder (rask transport). Spesialdyrking (10 dager). Fra 3 uker etter sykdomsdebut: Serum Se serologisk diagnostikk Se Kikhoste serologi 32

33 Konjunktivitt (bakteriell) Sykdom / vanligste agens Materiale Prøvetaking og Staphylococcus aureus Streptococcus spp. Hemophilus influenzae Moraxella spp. Neisseria meningitidis Puss/mucus fra konjunktiva. Penselprøve i Amies transportmedium (kull ved mistanke om gonokokker). Alminnelig bakteriologisk dyrking (2 dager). Neisseria gonorrhoeae Spesial dyrking (2 dager) hos spedbarn eller hvis rekvirert. Chlamydia trachomatis Konjunktivitt (viral) Virus Prøve til virus-påvisning Serologi Adenovirus Øyepensel til PCR Nei Kusma Virus Prøve til virus-påvisning Serologi Parotittvirus Ikke aktuelt Ja 33

34 Væske fra normalt sterile hulrom f.eks. ledd-, ascites- og perikardvæske Vanligste agens Materiale Prøvetaking og Aerobe og anaerobe bakterier, oftest monomikrobiell flora, avhengig av prøvelokalisasjon. Væske fra normalt sterile hulrom. Væske i steril beholder (krever rask transport) og penselprøve i Amies transport-medium. Kan suppleres med: Aerob og anaerob blodkulturflaske (oppbevares ved romtemperatur før inkubering i blodkulturskap). Direkte mikroskopi utføres på purulent materiale mottatt på steril beholder. Ved utsæd på fast medium: Aerob dyrking (3 dager) og anaerob dyrking (2 dager). Hvis materialet mottas på blodkulturflasker, inkuberes de i 5 dager (både aerobt og anaerobt). Mykobakterier Se Tuberkulose og andre mykobakterieinfeksjoner 34

35 Smittestoffer Hydatid - Echinococcus infeksjon Vanligste agens Echinococcus granulosus (unilocular cyste) Echinococcus multilocularis (multilocular cyste) Echinococcus vogeli (multilocular cyste) Materiale Cysteinnhold Serum Prøvetaking og Steril beholder. Direkte mikroskopi (1 dag). Videresendes til Smittskyddsinstituttet (Stockholm), for rekvirentens regning. Legionella Testnavn Svar Kommentar Videresendes / send direkte til For påvisning av Legionella i Forsvarets mikrobiol. lab. Legionella luftveissekret eller urin, se Enkeltprøve er av liten Nedre luftveisinfeksjon diagnostisk verdi. Leishmaniasis Agens Materiale Prøvetaking og Leishmania spp. Biopsi fra hudlesjoner, milt, lever og lymfeknuter, benmargsaspirat og fullblod Benmargsaspirat og fullblod på EDTA-rør. Biopsi i fysiologisk saltvann eller RPMImedium. Real-time PCR på DNA isolert direkte fra prøvemateriale. Svartid 2-4 dager. Ved påvist Leishmania DNA utføres sekvensering for artsbestemmelse. Svar innen 1 uke. 35

36 Leptospira Testnavn Svar Kommentar Leptospira Videresendes / send direkte til Smittskyddsinstitutet, Stockholm Listeriose Sepsis, endokarditt, meningitt, perinatal infeksjon Vanligste agens Listeria monocytogenes Materiale Blod Sterilt materiale: spinalvæske, placenta. Ikke sterilt materiale: cervix/vaginaprøve, overflateprøver (fra nyfødte). Fæces Rectalpensel (innenfor sfinkter) er en nødløsning. Prøvetaking og Blodkulturflaske. Se Anlegging av blodkulturer Væske eller biopsi i steril beholder. Penselprøve i Amies transportmedium. Fæces i "LQ CARY BLAIR" transportmedium (ved transport >4 timer) eller fæces uten tilsetning (ved transport <4 timer). Dyrking (5 dager). Dyrking (7 dager). Nukleinsyreamplifikasjonstest (PCR). Spesialdyrking (kuldeanrikning) (7 dager). Spesialdyrking (utføres på Rikshospitalet). 36