Nevroendokrin regulering av kjønnsmodning

Størrelse: px
Begynne med side:

Download "Nevroendokrin regulering av kjønnsmodning"

Transkript

1 Nevroendokrin regulering av kjønnsmodning Finn-Arne Weltzien Norges veterinærhøgskole NFR Havbrukskonferanse april 2012

2 Regulering av pubertet og kjønnsmodning

3 Hjerne-hypofyse-gonadeaksen External stimuli (temperature, photoperiod, pheromones, etc.) Hjerne GnRH Dopamin + - Internal stimuli (biological clocks, nutritional status, etc.) GnRH = gonadotropi n-releasi ng hormone FSH = folli cle-sti mulati ng hormone LH = luteinizing hormone Hypofyse FSH LH + + Kjønnssteroider ++ +/- Gonader Steroidogenese og Gametogenese

4 Plasmanivå av FSH og LH hos regnbueørret - Hvordan reguleres den differensierte sekresjon av FSH og LH? Davies et al 1999 Gen Comp Endocrinol

5 NFR Havbruk: Differensiert regulering av FSH og LH Cellesignalering (elektrofysiologi / Ca 2+ imaging) Endringer ved pubertet Regulering av gonadotrope celler BPGkomponenter i tidlig utvikling Sesongvariasjoner Globalt genuttrykk (High-throughput sekvensering)

6 Komplementære modeller Medaka (Oryzias latipes) Torsk (Gadus morhua)

7 Oversikt 1. Elektrofysiologi og Ca 2+ imaging i gonadotrope celler 2. Transkriptomanalyse i gonadotrope celler

8 Mange endokrine celler fyrer aksjonspotesialer Frislipp av nevrotransmitter Na + Na + Ca 2+ Frislipp av nevrohormon Na + Ca 2+ Hormonsekresjon fra endokrine celler Na + Ca 2+

9 Dette involverer bl.a. Ca 2+ -strømmer Voltagedependent channels Agonistgated channels Ca 2+ Storeoperated channels Ca 2+ Ca 2+ Ca 2+ Ca 2+ ATP ATP 3Na + Ca 2+- binding proteins Ca 2+ Endoplasmic reticulum Mitochondria K + Voltagedependent channels Ca 2+ -activated channels

10 Membranpotensial og hormonsekresjon varierer med [Ca 2+ ] i

11 Metode: Primærkultur fra hypofyse 1) Modnende torsk 2) Disseksjon av hypofyse Hypofyse 3) Primær cellekultur i petriskåler (Hodne et al Gen Comp Endocrinol 2012) 4) Elektrofysiologi / Ca2+ imaging Poreforming antibiotics Permeant ions Impermeant solutes

12 Spontane aksjonspotensialer fra gonadotrop celle hos torsk (sesongavhengig) Vmembrane (mv) s Haug et al. Neuroendocrinology 2007

13 Identifikasjon av ionekanaler i cellemembran Na+ L Ca2 K+ K+ 4-AP s ensitive vol ta ge gated (A-type) pota ssium channels TEA s ensitive vol ta ge gated (delayed rectifiers) pota ssium channels + Ni fedipine s ensitive vol ta ge gated L-type Ca l cium channels Bl ocking the calcium cha nnels wi th cobalt reduced outwa rd currents 20 Vmembrane (mv) TTX s ensitive vol ta ge gated s odium channels K+ 0 Indikasjon på Ca 2+ a kti verte K+ ka naler s Haug et al. Neuroendocrinology 2007

14 Single-cell qpcr for identifisering av cellene Gonadotrope celler (FSH og LH) cell harvest a) For fenotyping av celler etter elektrofysiologi b) Genekspresjonsstudier 18 qpcr -(d/dt) fluorescence fluorescence amplification curve 1 cell 1 cell -RT EC NTC Høsting av cytosol gjennom Patch-pipetten revers transkripsjon cdna presipitering 0 cycle number Temperatur, C Hodne et al BMC Mol Biol 2010

15 Identifikasjon av spesifikke GnRH reseptorer i gonadotrope celler Harvesting of cytosol trough a patch pipette Linear amplification of RNA Reverse transcription of RNA into cdna Hodne et al. in prep

16 Både FSH- og LH-celler får økt cytosolisk Ca2+ etter GnRH-stimulering (Fura-2 målinger) LH celle 0.5 ratio 50 s GnRH FSH celle GnRH Hodne et al. in prep

17 LH- og FSH-produserende celler viser ulik respons til GnRH (sesongavhengig) LH-celle FSH-celle 0 mv 0 mv GnRH GnRH Hodne et al. in prep

18 Kalsium-aktiverte kaliumkanaler (Kca) deltar i reguleringen av gonadotrope celler hos torsk Single-cell qpcr Halestrøm blokkeres vha KCa kanal blokkere 10 na 1s Hodne et al. in prep

19 Modell for LH-produserende celle hos torsk Na L + Ca2 K+ + Ca2+ Store IP3 γ β Na + L Ca2 α PLC PIP2 SK K+ K(Ca) + GnRH 1b and/or 2a receptor

20 Modell for FSH-produserende celle hos torsk Na L + Ca2 + BK L K(Ca) Ca2 K+ Ca2+ Store - Forskjellige signalveier fra GnRH-binding til sekresjon IP3 sesong - Genutrykk og membranegenskaper varierer med γ β Na + α PLC L Ca2 + K+ GnRH 1b and/or 2a receptor PIP2

21 Oversikt 1. Elektrofysiologi og Ca2+ imaging i gonadotrope celler 2. Transkriptomanalyse i gonadotrope celler

22 RNA-seq av lhb-gfp celler hos medaka - Transkriptomet før og etter pubertet Ager-Wick et al. in prep

23 Fra DNA-chips til RNA-Seq Ser bare det som er på chipen Én verdi per probe Unbiased deteksjon Millioner av korte sekvenser (reads) Normalisering Differensiert uttrykk Mapping/Kvantifisering Normalisering Differensiert uttrykk/alternativ splicing/ nye gener

24 Isolering av lhb-gfp gonadotrope celler lhb-gfp transgen medaka (hunnfisk) Disseksjon av hypofyser lhb-gfp gonadotroper sortert vha FACS RNA isolert fra lhb-gfp gonadotroper

25 Sekvensering av transkriptomet i LH-celler cdna syntetisert fra isolert RNA og amplifisert Amplifisert cdna sequenced vha Illumina HiSeq2000 Samarbeid med Norwegian Sequencing Center (Dr Robert Lyle, Ullevål sykehus)

26 Noen tall Stadium Hypoofyser Celler RNA cdna* Sekvenser (reads) Juvenil ng 3 µg 81 x 106 Adult ng 5 µg 68 x 106 * etter a mplifisering Ager-Wick et al. in prep

27 Mapped reads (%) Reads mapped til genom % 94 % Adult Juvenile

28 Expressed genes (%) Andel gener som er uttrykt i LH-celler % Juvenile 78 % Adult

29 Eksempel 1: Genuttrykksmønster 0 Juvenil 100 Adult

30 Eksempel 2: Spesifikke gener lhb genet er svært høyt uttrykt i LH-celler fra både juvenil og voksen medaka GnRH reseptorer (3 stk) er uttrykt på ulike nivå i LH-celler fra juvenil og voksen medaka Alle Ca2+-aktiverte K+-kanaler (BK, IK, SK1, SK2, SK3) er uttrykt i LH-celler

31 Konklusjon - transkriptomikk 1. Metode etablert for sekvensering av transkriptomet i LH- celler 2. Sekvensering av celler fra juvenile vs adulte hunnfisk 3. Sekvensanalyser pågår - Hvordan endrer gonadotropene seg gjennom pubertet? - Reseptorer for GnRH o.a. - Ionekanaler, spesielt KCa og Ca2+ - Intracellulære signalveier

32 Acknowledgements Finn-Arne Weltzien Rønnaug Strandabø Trude M. Haug Isabelle Heikkinen Jon Hildahl Rasoul Nourizadeh-Lillabadi Nouri Salima Aroua Kjetil Hodne Stine Berg Vaule Gunnveig Toft Bjørndal Kristine von Krogh Eirill Ager-Wick Rikke Lifjeld Line Victoria Moen

33 BAC konstrukt 25 kb upstream of lhb translation start site lhb exon 1 hrgfpii lhb Kozac + intron 1 ATG BAC golwb108_h20 BAC = Bacterial Artificial Chromosome 78 kb downstream of lhb lhb exon 2 poly A

34 lhb & lhr developmental gene expression - qpcr lhb 0,00025 B B 0,012 Norm s ta rt mrna exp lhr Norm s ta rt mrna exp 0,014 0, ,010 0,008 0,00015 AB AB AB AB AB 0,006 0,004 A 0,002 A A A AB 0,00010 A A AB 0,00005 AB AB AB AB AB AB AB A 0, hpf dpf 0, hpf dpf

35 Oversikt over delprosjekter 1. Transgen medaka (gfp-lhb) ny funksjon i tarm? 2. The first kiss of life 3. Elektrofysiologi og kalsium-imaging 4. Transkriptomanalyse i gonadotrope celler 5. Veien videre

36 Hjerne-hypofyse-gonadeaksen External stimuli Internal stimuli (temperature, photoperiod, pheromones, etc.) (biological clocks, nutritional status, etc.) Hjerne GnRH = gonadotropi n-releasi ng hormone FSH = folli cle-sti mulati ng hormone LH = lutei ni zi ng hormone GnRH Dopamin + Hypofyse FSH LH + + Gonader Steroidogenese og Gametogenese Kjønnssteroider ++ +/-

37 Mikroinjeksjon på én-cellestadiet (transgene linjer, gene knock-down)

38 Transgen linje lhb-gfp - medaka 4 dpf Collaboration: Dr K Okubo and Dr Y Nagahama

39 lhb-gfp uttrykk hpf 48 hpf 200 m 48 hpf 200 m 48 hpf 48 hpf 200 m 48 hpf 200 m 48 hpf 70 μm 70 μm 96 hpf 200 m 96 hpf 200 m Hildahl et al 2012 Dev Dyn

40 lhb-gfp uttrykkes først i tarm Dette bildet k an ik k e v ises for øy eblik k et. 4dpfLH i tidlig tarm? - Hva gjør Dette bildet k an ik k e v ises for øy eblik k et. 4dpf 4dpf Hildahl et al 2012 Dev Dyn

41 Developmental tracing of lhb gene expression using gfp-transgenic medaka reveals a putative novel developmental function Photo: K Okubo Collaboration: Dr K Okubo and Dr Y Nagahama

42 Oversikt over delprosjekter 1. Transgen medaka (gfp-lhb) ny funksjon i tarm? 2. The first kiss of life 3. Elektrofysiologi og kalsium-imaging 4. Transkriptomanalyse i gonadotrope celler 5. Veien videre

43 Hjerne-hypofyse-gonadeaksen External stimuli Internal stimuli (temperature, photoperiod, pheromones, etc.) (biological clocks, nutritional status, etc.) Hjerne GnRH = gonadotropi n-releasi ng hormone FSH = folli cle-sti mulati ng hormone LH = lutei ni zi ng hormone GnRH Dopamin + Hypofyse FSH LH + + Gonader Steroidogenese og Gametogenese Kjønnssteroider ++ +/-

44 Kisspeptin «The gatekeeper of GnRH neurons» Pineal Fotoperiode Melatonin Gonader Binyrer Kjønnsteroider Glukokortikoider KISS nevron GnRH nevron

45 qpcr viser embryonalt uttrykk av kiss ligander og reseptorer Hodne et al (in prep.)

46 Knockdown av kiss ligand eller reseptor gir store misdannelser i utvikling av øyne og forhjerne Villtype Kiss1 KD Kissr2 KD Kissr1 KD A E I B F J Six3 Dag 1 M Dag 3 Øye N Manipulasjon for å hindre kjønnsmodning C - Hvilke følger får det? G K O Dlx2 Dag 2 Øye D H L Dag 3 Øye Hodne et al (in prep.) P

47 Involvement of calcium activated potassium channels (Kca) in regulating the electrical properties of gonadotrope cells in cod Hodne et al. in prep

48 Involvement of calcium activated potassium channels (Kca) in regulating the electrical properties of gonadotrope cells in cod The s ize of the tail current va ries depending on the s eason The s ize of the tail current correlates with the s ize of the fa s t after hyperpolarization (AHP) in fshb producing cells but NOT i n lhb producing cells 25 AHP (mv ) Y = ± X ± R = Tail p (AS ) Ap duratio n (ms) R = Tail p (AS) Hodne et al. in prep

Zebrafish as a model for human development and disease. Jon Vidar Helvik

Zebrafish as a model for human development and disease. Jon Vidar Helvik Zebrafish as a model for human development and disease. Jon Vidar Helvik Mann versus fish Zebrafish is an important model for human development and disease. Most human organ system can be study on a cellular

Detaljer

Hva viser genanalyser av muskulatur hos laks med mørke flekker. Aleksei Krasnov, Hooman Moghadam Nofima, Ås

Hva viser genanalyser av muskulatur hos laks med mørke flekker. Aleksei Krasnov, Hooman Moghadam Nofima, Ås Hva viser genanalyser av muskulatur hos laks med mørke flekker Aleksei Krasnov, Hooman Moghadam Nofima, Ås Spørsmål Har mørke flekker lik eller ulik profil? Vevsskade og nydannelse av vev? Type betennelse?

Detaljer

Immunstimulanter for potensiering av torskens naturlige immunsystem

Immunstimulanter for potensiering av torskens naturlige immunsystem Store programmer HAVBRUK - En næring i vekst Faktaark www.forskningsradet.no/havbruk Immunstimulanter for potensiering av torskens naturlige immunsystem Prosjekt: Immunostimulation of Atlantic cod (Gadus

Detaljer

Introduksjon til RNA & Transkriptomikk

Introduksjon til RNA & Transkriptomikk Introduksjon til RNA & Transkriptomikk Steinar Daae Johansen RNA & Trancriptomics group, IMB - Helsefakultetet, Universitetet i Tromsø Marine Genomics group, Fakultet for Biovitenskap og Akvakultur Høgskolen

Detaljer

Transport av ioner og næringsstoffer over cellemembranen

Transport av ioner og næringsstoffer over cellemembranen Transport av ioner og næringsstoffer over cellemembranen Terje Espevik, IKM Innhold: Diffusjonshastighet av molekyler over et lipiddobbeltlag Ionekonsentrasjoner innenfor og utenfor en typisk celle Transportere

Detaljer

Nytt fotopigment funnet hos fisk

Nytt fotopigment funnet hos fisk Nytt fotopigment funnet hos fisk I vår molekylære søken etter synspigmenter hos torsk ble et nytt fotopigment funnet, som tidligere ikke er kjent fra teleoster. Dette fotopigmentet hører til melanopsin

Detaljer

NORGES TEKNISK-NATURVITENSKAPELIGE UNIVERSITET INSTITUTT FOR FYSIKK EKSAMEN I EMNE TFY4260 CELLEBIOLOGI OG CELLULÆR BIOFYSIKK

NORGES TEKNISK-NATURVITENSKAPELIGE UNIVERSITET INSTITUTT FOR FYSIKK EKSAMEN I EMNE TFY4260 CELLEBIOLOGI OG CELLULÆR BIOFYSIKK Side av 1 av5 NORGES TEKNISK-NATURVITENSKAPELIGE UNIVERSITET INSTITUTT FOR FYSIKK EKSAMEN I EMNE TFY4260 CELLEBIOLOGI OG CELLULÆR BIOFYSIKK Faglig kontakt under eksamen: Catharina Davies Tel 73593688 eller

Detaljer

Stamfisk og kjønnsmodning. Birgitta Norberg, Havforskningsinstituttet, Forskningsstasjonen Austevoll

Stamfisk og kjønnsmodning. Birgitta Norberg, Havforskningsinstituttet, Forskningsstasjonen Austevoll Stamfisk og kjønnsmodning Birgitta Norberg, Havforskningsinstituttet, Forskningsstasjonen Austevoll En vellykket reproduksjon er forutsetningen for alt liv kontroll av reproduksjonen hos en art er en forutsetning

Detaljer

Kapittel 20, introduksjon

Kapittel 20, introduksjon Kapittel 20, introduksjon Ekstracellulær signalisering Syntese Frigjøring Transport Forandring av cellulær metabolisme, funksjon, utvikling (trigga av reseptor-signal komplekset) Fjerning av signalet Signalisering

Detaljer

Genkartlegging. Hva er egentlig et genkart? Genetisk og fysisk kartlegging

Genkartlegging. Hva er egentlig et genkart? Genetisk og fysisk kartlegging NTNU Genkartlegging 1 Termin IC Frank Skorpen Institutt for laboratoriemedisin, barne- og kvinnesykdommer Hva er egentlig et genkart? Kartet over det humane genom gir oss posisjonen av de ca 25,000 genene

Detaljer

Reproduksjon av dyrevirus. Adsorpsjon Penetrasjon og avkledning Replikasjon og transkripsjon Syntese og samling (assembly) av viruskapsid Frigjøring

Reproduksjon av dyrevirus. Adsorpsjon Penetrasjon og avkledning Replikasjon og transkripsjon Syntese og samling (assembly) av viruskapsid Frigjøring Reproduksjon av dyrevirus Adsorpsjon Penetrasjon og avkledning Replikasjon og transkripsjon Syntese og samling (assembly) av viruskapsid Frigjøring ATTACHMENT Click after each step to view process PENETRATION

Detaljer

Reproduksjon av dyrevirus. Adsorpsjon Penetrasjon og avkledning Replikasjon og transkripsjon Syntese og samling (assembly) av viruskapsid Frigjøring

Reproduksjon av dyrevirus. Adsorpsjon Penetrasjon og avkledning Replikasjon og transkripsjon Syntese og samling (assembly) av viruskapsid Frigjøring Reproduksjon av dyrevirus Adsorpsjon Penetrasjon og avkledning Replikasjon og transkripsjon Syntese og samling (assembly) av viruskapsid Frigjøring ATTACHMENT Click after each step to view process PENETRATION

Detaljer

EKSAMEN I EMNE SIF4070 CELLEBIOLOGI Mandag 7. mai 2001 Tid: kl Ingen trykte eller håndskrevne hjelpemidler tillatt.

EKSAMEN I EMNE SIF4070 CELLEBIOLOGI Mandag 7. mai 2001 Tid: kl Ingen trykte eller håndskrevne hjelpemidler tillatt. Side av 5 NORGES TEKNISK-NATURVITENSKAPELIGE UNIVERSITET INSTITUTT FOR FYSIKK Faglig kontakt under eksamen: Navn: Bjørn Torger Stokke Tlf: 93434 BOKMÅL EKSAMEN I EMNE SIF4070 CELLEBIOLOGI Mandag 7. mai

Detaljer

ML-208, generell informasjon

ML-208, generell informasjon ML-208, generell informasjon Emnekode: ML-208 Emnenavn: Molekylærbiologi Dato:20.12.2017 Varighet:4 timer Tillatte hjelpemidler: Ingen Merknader:Lag gjerne tegninger og figurer for å illustrere og forklare

Detaljer

Vekst og kjønnsmodning i kveite: Interaksjoner og koblinger til lysperiode

Vekst og kjønnsmodning i kveite: Interaksjoner og koblinger til lysperiode Sluttrapport, prosjekt nr. 128754/122 Vekst og kjønnsmodning i kveite: Interaksjoner og koblinger til lysperiode Birgitta Norberg og Finn-Arne Weltzien Prosjektansvarlig: Dr Birgitta Norberg, Havforskningsinstituttet,

Detaljer

Bruk av genteknologiske analyser ved diagnostikk av luftveisinfeksjoner. Gardermoen 27.02.08. Svein Arne Nordbø

Bruk av genteknologiske analyser ved diagnostikk av luftveisinfeksjoner. Gardermoen 27.02.08. Svein Arne Nordbø Bruk av genteknologiske analyser ved diagnostikk av luftveisinfeksjoner Gardermoen 27.2.8 Svein Arne Nordbø Aktuelle genteknologiske metoder Hybridiseringsmetoder Ampifikasjonsmetoder PCR Konvensjonell

Detaljer

Transport av ioner og næringsstoffer over cellemembraner. Læringsmål IA: Beskrive ulike mekanismer for transport over membraner

Transport av ioner og næringsstoffer over cellemembraner. Læringsmål IA: Beskrive ulike mekanismer for transport over membraner Transport av ioner og næringsstoffer over cellemembraner Læringsmål IA: 2.1.2.6 Beskrive ulike mekanismer for transport over membraner Transport Passiv Aktiv Diffusjon Fasilitert diffusjon Ionekanaler

Detaljer

Den komplette DNA sekvens fra en organisme.

Den komplette DNA sekvens fra en organisme. Definisjoner: Hva er et genom? Den komplette DNA sekvens fra en organisme. Den komplette samlingen av gener som koder for alle proteiner, pluss ribosomalt RNA, trna, snrna (involvert i mrna spleising)

Detaljer

Eksamensoppgave i Bi3016 Celle og molekylærbiologi Examination in Bi3016 Cell and molecular biology

Eksamensoppgave i Bi3016 Celle og molekylærbiologi Examination in Bi3016 Cell and molecular biology Institutt for biologi / Department of Biology Eksamensoppgave i Bi3016 Celle og molekylærbiologi Examination in Bi3016 Cell and molecular biology Faglig kontakt under eksamen / Contact person during exam:

Detaljer

Kapittel 14: Det eukaryote genom og dets uttrykksregulering

Kapittel 14: Det eukaryote genom og dets uttrykksregulering Kapittel 14: Det eukaryote genom og dets uttrykksregulering Innhold: 1. Det humane genom 2. Struktur av protein-kodende gener 3. RNA processering 4. Transkripsjonell kontroll 5. Posttranskripsjonell kontroll

Detaljer

NGS (Neste Generasjons Sekvensering) i diagnostikk, erfaringer og resultater

NGS (Neste Generasjons Sekvensering) i diagnostikk, erfaringer og resultater NGS (Neste Generasjons Sekvensering) i diagnostikk, erfaringer og resultater Emiel Janssen Seksjonsleder for Kvantitativ og Molekylær Patologi Daglig leder for laboratoriet for molekylær biologi Avdeling

Detaljer

Cellesignalisering II: Reseptor tyrosin kinaser, cytosoliske kinaser

Cellesignalisering II: Reseptor tyrosin kinaser, cytosoliske kinaser Cellesignalisering II: Reseptor tyrosin kinaser, cytosoliske kinaser! Introduksjon! Definisjon og klassifisering! Kinasefamilier: Receptor/cytosol! Receptor Tyrosin kinase-mediert signalisering! MAP kinase

Detaljer

BMXART0814 ( ) M340 8 inn ana TC/RTD, 2*FCN

BMXART0814 ( ) M340 8 inn ana TC/RTD, 2*FCN Produktdatablad Karakteristikk BMXART0814 (45 461 79) M340 8 inn ana TC/RTD, 2*FCN Alternativer Analog/digital conversion Oppløsning analog inngang Inngangsimpedans Permitted overload on inputs Common

Detaljer

ML-208, generell informasjon

ML-208, generell informasjon ML-208, generell informasjon Emnekode: ML-208 Emnenavn: Molekylærbiologi Dato:20.12.2017 Varighet:4 timer Tillatte hjelpemidler: Ingen Merknader:Lag gjerne tegninger og figurer for å illustrere og forklare

Detaljer

Examination paper for Bi2014 Molecular Biology

Examination paper for Bi2014 Molecular Biology Department of Biology Examination paper for Bi2014 Molecular Biology Academic contact during examination: Professor Atle M. Bones Phone: (+47-)91897237 Examination date/eksamensdag: 8. December 2017 Examination

Detaljer

Examination paper for Bi2014 Molecular Biology

Examination paper for Bi2014 Molecular Biology Department of Biology Examination paper for Bi2014 Molecular Biology Academic contact during examination: Professor Atle M. Bones Phone: (+47-)91897237 (+47-73598692) Examination date/eksamensdag: 9. June

Detaljer

Oppgave: MED2200-2_OPPGAVE1_H16_ORD

Oppgave: MED2200-2_OPPGAVE1_H16_ORD Side 2 av 38 Oppgave: MED2200-2_OPPGAVE1_H16_ORD Del 1: OM RUS OG RUSS Jeanette er 19 år og russ. Hun og flere i hennes familie har familiær hyperkolesterolemi, en sykdom som gjør at pasienten har høyt

Detaljer

Studie av tidlig mangel av mikronæringsstoff i regnbueørret med neste-generasjons sekvenseringsteknologi

Studie av tidlig mangel av mikronæringsstoff i regnbueørret med neste-generasjons sekvenseringsteknologi Studie av tidlig mangel av mikronæringsstoff i regnbueørret med neste-generasjons sekvenseringsteknologi Rune Waagbø, Gro-Ingunn Hemre og Pål Olsvik (NIFES) Mikronæringsstoffmangel - i norsk oppdrett?

Detaljer

Janus kreftbiobank og mirna forskning

Janus kreftbiobank og mirna forskning Janus kreftbiobank og mirna forskning Big data og biomedisinsk næringsutvikling Fra genomikk til real world data 7. mai 2015 Hilde Langseth, Forsker PhD, leder Janus Serumbank Kreftregisteret Institutt

Detaljer

2. Å R S B E R E T N I N G O G R E G N S K A P F O R A ) Å r s b e r e t n i n g o g r e g n s k a p f o r

2. Å R S B E R E T N I N G O G R E G N S K A P F O R A ) Å r s b e r e t n i n g o g r e g n s k a p f o r I N N K A L L I N G T I L O R D I N Æ R G E N E R A L F O R S A M L I N G 2 0 1 0 O r d i n æ r g e n e r a l f o r s a m l i n g i, a v h o l d e s m a n d a g 3. m ai 2 0 1 0, k l. 1 8 0 0 p å T r e

Detaljer

Populasjonsgenomikk på torsk -et verktøy for identifisering av viktige genomiske regioner for oppdrettsnæringen.

Populasjonsgenomikk på torsk -et verktøy for identifisering av viktige genomiske regioner for oppdrettsnæringen. Programkonferansen HAVBRUK 2012, Stavanger, 16.-18. april 2012 Populasjonsgenomikk på torsk -et verktøy for identifisering av viktige genomiske regioner for oppdrettsnæringen. Paul R. Berga, Bastiaan Stara,

Detaljer

Nye stjerner hos AH diagnostics AH diagnostics introduserer det nye ECO Real Time PCR systemet fra. Kompakt. Super effektiv

Nye stjerner hos AH diagnostics AH diagnostics introduserer det nye ECO Real Time PCR systemet fra. Kompakt. Super effektiv VÅREN 2012 Nye stjerner hos AH diagnostics AH diagnostics introduserer det nye ECO Real Time PCR systemet fra Kompakt Halve prisen Agaroser Super effektiv Integrated Fluidic Circuits teknologi - revolusjonér

Detaljer

Amplifikasjonsteknikker - andre metoder

Amplifikasjonsteknikker - andre metoder Amplifikasjonsteknikker - andre metoder Svein Arne Nordbø TH-28973 17.03.15 Alternative amplifikasjonsmetoder Templat-amplifikasjons metoder Signal-amplifikasjonsmetoder Templat-amplifikasjons metoder

Detaljer

DM6814/DM5814 User s Manual

DM6814/DM5814 User s Manual (Real Time Devices) Table 1-1 Factory Settings Switch/ Jumper Function Controlled Factory Settings (Jumpers Installed) P4 Connects a P14 jumper selectable interrupt source to an interrupt

Detaljer

EKSAMENSOPPGAVE I BI2014 MOLEKYLÆRBIOLOGI

EKSAMENSOPPGAVE I BI2014 MOLEKYLÆRBIOLOGI Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet Institutt for biologi EKSAMENSOPPGAVE I BI014 MOLEKYLÆRBIOLOGI Faglig kontakt under eksamen: Ralph Kissen Tlf.: 41344134 (mobil) - Eksamensdato: 11. desember

Detaljer

europeisk patentskrift

europeisk patentskrift (12) Oversettelse av europeisk patentskrift (11) NO/EP 2125711 B1 (19) NO NORGE (51) Int Cl. C07C 321/20 (2006.01) A61K 31/216 (2006.01) A61K 31/421 (2006.01) A61K 31/4402 (2006.01) A61K 31/495 (2006.01)

Detaljer

Kan muskelproblemer hjelpe til med å forklare bevegelser hos pasienter med Huntingtons sykdom? En stor bevegelse

Kan muskelproblemer hjelpe til med å forklare bevegelser hos pasienter med Huntingtons sykdom? En stor bevegelse Forskningsnyheter om Huntingtons sykdom. I et lettfattelig språk. Skrevet av forskere. Til det globale HS-fellesskapet. Kan muskelproblemer hjelpe til med å forklare bevegelser hos pasienter med Huntingtons

Detaljer

Avhengighet og gener - et evolusjonært perspektiv

Avhengighet og gener - et evolusjonært perspektiv Avhengighet og gener - et evolusjonært perspektiv Dag O. Hessen University of Oslo, Dept. Biology Center of Ecological and Evolutionary Synthesis (CEES) Det sentrale spørsmål Er vår adferd og preferanser

Detaljer

Vil laksegenomet løse sykdomsproblematikken i akvakulturnæringen? Unni Grimholt CEES, Biologisk Institutt, UiO

Vil laksegenomet løse sykdomsproblematikken i akvakulturnæringen? Unni Grimholt CEES, Biologisk Institutt, UiO Vil laksegenomet løse sykdomsproblematikken i akvakulturnæringen? Unni Grimholt CEES, Biologisk Institutt, UiO tja Men det er et skritt videre i riktig retning? Patogene problemer i oppdrett Antall oppdretts

Detaljer

Examination paper for Bi2014 Molecular Biology

Examination paper for Bi2014 Molecular Biology Department of Biology Examination paper for Bi2014 Molecular Biology Academic contact during examination: Professor Atle M. Bones Phone: 91897237 (73598692) Examination date/eksamensdag: 7. December 2016

Detaljer

Farmakodynamikk! Farmakodynamikk, definisjon:! Legemidlers virkningssted (targets) og virkningsmåte. Reseptorbegrepet; definisjon

Farmakodynamikk! Farmakodynamikk, definisjon:! Legemidlers virkningssted (targets) og virkningsmåte. Reseptorbegrepet; definisjon Farmakodynamikk! Farmakodynamikk, definisjon:! Læren om legemidlenes biokjemiske og fysiologiske effekter og deres virkningsmekanismer! Ueland, P.M! Legemidlers virkningssted (targets) og virkningsmåte

Detaljer

Flervalgsoppgaver: Nervesystemet

Flervalgsoppgaver: Nervesystemet Flervalgsoppgaver - nervesystemet Hver oppgave har ett riktig svaralternativ Nervesystemet 1 Hva er riktig navn på strukturene? A. I: Ranviers innsnøring II: myelinhinne III: cellekropp B. I: myelinhinne

Detaljer

Sammenligningen mellom Arabidopsis thaliana genomet og de kjente genomene fra cyanobakterier, gjær, bananflue og nematode, viser bl. a.

Sammenligningen mellom Arabidopsis thaliana genomet og de kjente genomene fra cyanobakterier, gjær, bananflue og nematode, viser bl. a. Sammenligningen mellom Arabidopsis thaliana genomet og de kjente genomene fra cyanobakterier, gjær, bananflue og nematode, viser bl. a. Antall gener som er involvert i cellulær kommunikasjon og signaloverføring

Detaljer

Hvordan trenger sårbakterier gjennom laksens hudbarriere?

Hvordan trenger sårbakterier gjennom laksens hudbarriere? Hvordan trenger sårbakterier gjennom laksens hudbarriere? Gustav Vaaje-Kolstad Akvakulturseminar, 17. desember 2015, Vitenparken Norwegian University of Life Sciences 1 Kitinnedrytning GH18 GH20 LPMO10

Detaljer

GENER, genregulering, og genfamilier

GENER, genregulering, og genfamilier GENER, genregulering, og genfamilier 1-A, H-11 Forelesning 21.11.11 Frank Skorpen, Institutt for Laboratoriemedisin, Barne- og Kvinnesykdommer, DMF, NTNU Gener Kromosom, kromatin og DNA Hva er et gen?

Detaljer

SERK1/2 Acts as a Partner of EMS1 to Control Anther Cell Fate Determination in Arabidopsis

SERK1/2 Acts as a Partner of EMS1 to Control Anther Cell Fate Determination in Arabidopsis SERK1/2 Acts as a Partner of EMS1 to Control Anther Cell Fate Determination in Arabidopsis Supplemental Data Supplemental Figure S1 Supplemental Figure S1. Identification of the ems1-2 weak allele. A,

Detaljer

Måling av kjønnshormoner. Kjønnshormonforstyrrelser menn. Ellen M Haave, Hormonlaboratoriet November 2015

Måling av kjønnshormoner. Kjønnshormonforstyrrelser menn. Ellen M Haave, Hormonlaboratoriet November 2015 Måling av kjønnshormoner Kjønnshormonforstyrrelser menn Ellen M Haave, Hormonlaboratoriet November 2015 Referanseområde, testosteron S Testosteron 18 40 år: 7,2 24 nmol/l S-testosteron 16 nmol/l Testosteronmangel?

Detaljer

Viktige opplysninger: Oppgavesettet utgjør totalt 100 vekttall. Antall vekttall er vist i parentes ved hver spørsmålsgruppe.

Viktige opplysninger: Oppgavesettet utgjør totalt 100 vekttall. Antall vekttall er vist i parentes ved hver spørsmålsgruppe. Ordinær eksamen, MEDSEM/ODSEM/ERNSEM2 Vår 2012 Onsdag 20. juni 2012 kl. 09:00-15:00 Oppgavesettet består av 6 sider, inkludert vedlegg Viktige opplysninger: Oppgavesettet utgjør totalt 100 vekttall. Antall

Detaljer

Plan. Pensum i bioinformatikk. Hva er bioinformatikk?

Plan. Pensum i bioinformatikk. Hva er bioinformatikk? Bioinformatikk - en innføring fra en statistikers ståsted Mette Langaas Plan Hva er bioinformatikk? Hva er gen og genom? Forskningsområder innen bioinformatikk. Funksjonell genomikk: genekspresjon og DNA

Detaljer

Utvikling av forskningsinfrastruktur i samspill med brukerne og hvordan sikre transparent prosjektutvelgelse. Dag Undlien

Utvikling av forskningsinfrastruktur i samspill med brukerne og hvordan sikre transparent prosjektutvelgelse. Dag Undlien Utvikling av forskningsinfrastruktur i samspill med brukerne og hvordan sikre transparent prosjektutvelgelse Dag Undlien www.sequencing.uio.no Vertsinstitusjonene Institutt for biovitenskap - CEES Avdeling

Detaljer

Bioteknologi/digital teknikk

Bioteknologi/digital teknikk Teknologisprang for utvikling av havrommet Bioteknologi/digital teknikk Stig W. Omholt NTNU Biotechnology: the Confluence of Life Sciences, Mathematical Sciences and Engineering Bioteknologi - definisjon

Detaljer

NORMAL PUBERTET. D. Veimo. Bergen 2012 DV

NORMAL PUBERTET. D. Veimo. Bergen 2012 DV NORMAL PUBERTET D. Veimo Puberteten * Særegen, avgrenset fase i individets mentale, sosiale og kroppslige utvikling * Særegen, avgrenset fase i den vekstmessige og endokrinologiske balanse og utvikling

Detaljer

HIV / AIDS -infeksjon - behandling

HIV / AIDS -infeksjon - behandling HIV / AIDS -infeksjon - behandling HIV / AIDS 1981 første gang anerkjent som distinkt sykdom Opprinnelig overført fra sjimpanse Viruset kan ha sirkulert fra 1915-1941 Trolig sirkulert blant populasjoner

Detaljer

Supplemental Data. Wiludda et al. Plant Cell. (2012) /tpc

Supplemental Data. Wiludda et al. Plant Cell. (2012) /tpc Supplemental Figure 1. Analysis of mrna 5' ends in leaves of transgenic A. thaliana and F. bidentis harboring the GLDPA-Ft:GUS transgene. (A) Schematic structure of the GLDPA-Ft construct. TSS, transcription

Detaljer

NORGES TEKNISK-NATURVITENSKAPELIGE UNIVERSITET INSTITUTT FOR FYSIKK EKSAMEN I EMNE TFY4260 CELLEBIOLOGI OG CELLULÆR BIOFYSIKK

NORGES TEKNISK-NATURVITENSKAPELIGE UNIVERSITET INSTITUTT FOR FYSIKK EKSAMEN I EMNE TFY4260 CELLEBIOLOGI OG CELLULÆR BIOFYSIKK Side av 1 av 4 Studentnr... Studieprogram... Sidenr. NORGES TEKNISK-NATURVITENSKAPELIGE UNIVERSITET INSTITUTT FOR FYSIKK EKSAMEN I EMNE TFY4260 CELLEBIOLOGI OG CELLULÆR BIOFYSIKK Faglig kontakt under eksamen:

Detaljer

Foreleser: Eivind Coward, kontor 5. etg. Datablokken. coward@ii.uib.no Gruppeleder: Harald Barsnes

Foreleser: Eivind Coward, kontor 5. etg. Datablokken. coward@ii.uib.no Gruppeleder: Harald Barsnes Foreleser: Eivind Coward, kontor 5. etg. Datablokken. coward@ii.uib.no Gruppeleder: Harald Barsnes Forelesninger: tirsdag og fredag 12 14 rom 2104 Øvinger: fredag 10 12 rom 2143 Gi en innføring i noen

Detaljer

Institutt for biologi Faglig kontaktperson under eksamen: Berit Johansen, 98691. EKSAMEN I: BI1001 Celle- og molekylærbiologi BOKMÅL

Institutt for biologi Faglig kontaktperson under eksamen: Berit Johansen, 98691. EKSAMEN I: BI1001 Celle- og molekylærbiologi BOKMÅL Side 1 av 5 Norges teknisknaturvitenskapelige universitet Fakultet for naturvitenskap og teknologi Institutt for biologi Faglig kontaktperson under eksamen: Berit Johansen, 98691 EKSAMEN I: BI1001 Celle-

Detaljer

4.5 Lakselus vaksineutvikling

4.5 Lakselus vaksineutvikling 4.5 Lakselus vaksineutvikling Petter Frost og Frank Nilsen, Havforskningsinstituttet Ved Havforskningsinstituttet er det nylig utført forsøk som klart indikerer at det er mulig å vaksinere mot lakselus.

Detaljer

Embryologi og normal fosterutvikling for patologer

Embryologi og normal fosterutvikling for patologer Embryologi og normal fosterutvikling for patologer Utvalgte mekanismer med en del teratogenese Joel C. Glover Division of Physiology Department of Molecular Medicine Institute of Basic Medical Sciences

Detaljer

Oncogenic Mutations Affecting Cell Proliferation

Oncogenic Mutations Affecting Cell Proliferation Oncogenic Mutations Affecting Cell Proliferation Fra RTK til Nucleus (Boka s.1070-74) Normalt kreves et vekst stimulerende signal ( growth factor eks. PDGF, EGF, NGF) for at celler skal gå inn i celledeling,

Detaljer

Oversikt over kap. 11. Kap. 11 Den direkte påvisning av genotype skiller individuelle genomer. Fire klasser av DNA polymorfismer.

Oversikt over kap. 11. Kap. 11 Den direkte påvisning av genotype skiller individuelle genomer. Fire klasser av DNA polymorfismer. Kap. 11 Den direkte påvisning av genotype skiller individuelle genomer Oversikt over kap. 11 Fire klasser av DNA variasjon til direkte påvisning av genotype. Metoder som bruker hybridisering, elektroforese,

Detaljer

Kjønnssortering av torskeyngel. Contact: Managing Director Dr. Reid Hole Tel: + 47 90 09 81 60, rhole@online.no

Kjønnssortering av torskeyngel. Contact: Managing Director Dr. Reid Hole Tel: + 47 90 09 81 60, rhole@online.no Kjønnssortering av torskeyngel Contact: Managing Director Dr. Reid Hole Tel: + 47 90 09 81 60, rhole@online.no GenderGuide AS GenderGuide AS ble etablert i 2005 med målsetting om å levere teknologi og

Detaljer

NITO Bioingeniørfaglig Institutt kurs i Immunologi The Edge, Tromsø, 11. februar 2015. Generell Immunologi

NITO Bioingeniørfaglig Institutt kurs i Immunologi The Edge, Tromsø, 11. februar 2015. Generell Immunologi NITO Bioingeniørfaglig Institutt kurs i Immunologi The Edge, Tromsø, 11. februar 2015 Generell Immunologi Tor B Stuge Immunologisk forskningsgruppe, IMB Universitetet i Tromsø Innhold: 1. Immunsystemets

Detaljer

Repetisjonsoppgaver samling 1 Cellen

Repetisjonsoppgaver samling 1 Cellen Repetisjonsoppgaver samling 1 Cellen 1) Tegn og forklar hvordan cellemembranen er oppbygd? 2) Hvordan er mitokondrier oppbygd og hvilke funksjoner har de? 3) Hva kan vesikler/blærer i cytoplasma inneholde?

Detaljer

Regulering av DNA Transkripsjon i Eukaryote Organismer. ID, Kull 99, Vår 2001 Frank Skorpen IKM, DMF

Regulering av DNA Transkripsjon i Eukaryote Organismer. ID, Kull 99, Vår 2001 Frank Skorpen IKM, DMF Regulering av DNA Transkripsjon i Eukaryote Organismer ID, Kull 99, Vår 2001 Frank Skorpen IKM, DMF 1 Regulering av gen-uttrykk på mange nivåer Klargjøring av DNA Transkripsjon Initiering Stopp hnrna prosessering

Detaljer

HIV / AIDS - infeksjon - behandling. PBM 233 Mikrobiologi Siri Mjaaland

HIV / AIDS - infeksjon - behandling. PBM 233 Mikrobiologi Siri Mjaaland HIV / AIDS - infeksjon - behandling PBM 233 Mikrobiologi 10.02.2005 Siri Mjaaland HIV / AIDS 1981 første gang anerkjent som distinkt sykdom Opprinnelig overført fra sjimpanse Viruset kan ha sirkulert fra

Detaljer

FHF prosjekt nr 900658: Multifaktorielle sykdommer i norsk lakseoppdrett. Lill-Heidi Johansen

FHF prosjekt nr 900658: Multifaktorielle sykdommer i norsk lakseoppdrett. Lill-Heidi Johansen FHF prosjekt nr 900658: Multifaktorielle sykdommer i norsk lakseoppdrett Lill-Heidi Johansen Prosjektdeltagere: Aleksei Krasnov, Sven Martin Jørgensen, Gerrit Timmerhaus, Lill-Heidi Johansen (prosjektleder)

Detaljer

Arabidopsis thaliana, vårskrinneblom

Arabidopsis thaliana, vårskrinneblom Arabidopsis thaliana, vårskrinneblom Tilhører Brassicaceae familien og ligger under ordenen Capparales. Nært beslektede planter er f. eks. raps og kål. Arabidopsis thaliana har i flere år vært en av modell

Detaljer

Molekylærbiologiske målemetoder: Mange metoder og noen anvendelser

Molekylærbiologiske målemetoder: Mange metoder og noen anvendelser Molekylærbiologiske målemetoder: Mange metoder og noen anvendelser Kari Bente Foss Haug, Seksjon for forskning Avdeling for medisinsk biokjemi Oslo universitetssykehus, Ullevål Molekylærbiologi: Molekylære

Detaljer

Protein Sorting- Kap. 17

Protein Sorting- Kap. 17 Forelesninger i BI 212 - Cellebiologi - Våren 2002 Protein Sorting- Kap. 17 Tor-Henning Iversen, Plantebiosenteret (PBS),Botanisk institutt,ntnu e-mail : Tor- Henning.Iversen@chembio chembio.ntnu.no Tlf.

Detaljer

Supplemental Information

Supplemental Information Supplemental Information Figure S1. 2D gel electrophoresis of ipt-transgenic broccoli at harvesting and after cooking. Protein composition of ipt-transgenic broccoli lines 102 and 103 and non-transgenic

Detaljer

Lysstyring - kjønnsmodning laks og torsk

Lysstyring - kjønnsmodning laks og torsk Lysstyring - kjønnsmodning laks og torsk Geir Lasse Taranger, Ørjan Karlsen, Eva Andersson, Miklos Pall, Erik Vikingstad, Cathrine Kristoffersen, Frode Oppedal, Sigurd Stefansson*, Herve Migaud**, Rüdiger

Detaljer

BI 212- Protein Sorting - Kap. 17 Syntese og mål for mitokondrie- og kloroplast-proteiner (forts.)

BI 212- Protein Sorting - Kap. 17 Syntese og mål for mitokondrie- og kloroplast-proteiner (forts.) Syntese og mål for mitokondrie- og kloroplast-proteiner (forts.) Veiene for opptak fra cytosol av kloroplast-proteiner Opptak av proteiner fra cytosol til kloroplaster ligner mye på mitokondrie-importen

Detaljer

Mette Langaas. Norsk Regnesentral Mette Langaas 1. Plan

Mette Langaas. Norsk Regnesentral Mette Langaas 1. Plan Bioinformatikk - en innføring fra en statistikers ståsted Mette Langaas Figur fra The Human Genome Project http://www.ornl.gov/hgmis / 08.05.2001 Mette Langaas 1 Plan Hva er bioinformatikk? Hva er gen

Detaljer

Regulering av karbohydratstoffskiftet

Regulering av karbohydratstoffskiftet Regulering av karbohydratstoffskiftet DEL I : Oppsummering og oversikt sentrale hormoner og organer i regulering av karbohydratstoffskiftet: Bukspyttkjertel : insulin, glukagon Binyrebark/marg : kortisol/adrenalin

Detaljer

NORGES TEKNISK-NATURVITENSKAPELIGE UNIVERSITET INSTITUTT FOR FYSIKK EKSAMEN I EMNE SIF4070 CELLEBIOLOGI

NORGES TEKNISK-NATURVITENSKAPELIGE UNIVERSITET INSTITUTT FOR FYSIKK EKSAMEN I EMNE SIF4070 CELLEBIOLOGI Side 1 av 6 NORGES TEKNISK-NATURVITENSKAPELIGE UNIVERSITET INSTITUTT FOR FYSIKK EKSAMEN I EMNE SIF4070 CELLEBIOLOGI Faglig kontakt under eksamen: professor Catharina Davies Tel.73593688 Eksamensdato: 9.

Detaljer

Fordøyelse i tidlige livsstadier:

Fordøyelse i tidlige livsstadier: Proteinfordøyelse hos torsk Prosjektgruppe stor torsk: Grethe Rosenlund, Nutreco Ørjan Karlsen & Rolf Erik Olsen: HI Ann Cecilie Hansen & Gro-Ingunn Hemre, NIFES Torskelarver: Kristin Hamre, Audil Kvåle,

Detaljer

Epigenetikk: 2 Fosterhjemskontakt 2/17. Om forfatterene

Epigenetikk: 2 Fosterhjemskontakt 2/17. Om forfatterene Alt Epigenetikk: er ikke bare g Om forfatterene Anette S. B Wolff (PhD) tok dr.graden ved Universitetet i Bergen i 2005 og har siden jobbet som forsker ved det samme universitetet. Bergithe Eikeland Oftedal

Detaljer

Idrett og energiomsetning

Idrett og energiomsetning 1 Medisin stadium IA, Tonje S. Steigedal 2 ATP er den eneste forbindelsen som kan drive kontraksjon av musklene. ATPnivået i muskelcellene er imidlertid begrenset, og må etterfylles kontinuerlig. Ved ulike

Detaljer

Et virus assosiert med HSMB er kartlagt. Del 2: Metodikk og potensiale. Torstein Tengs

Et virus assosiert med HSMB er kartlagt. Del 2: Metodikk og potensiale. Torstein Tengs Et virus assosiert med HSMB er kartlagt. Del 2: Metodikk og potensiale Torstein Tengs Ukjente patogener I alle systemer finnes det sykdommer hvor man mistenker et infektiøst agens, men hvor dette ikke

Detaljer

Fragilt X syndrom. Gry Hoem Lege, PhD, Medisinsk Genetikk, UNN

Fragilt X syndrom. Gry Hoem Lege, PhD, Medisinsk Genetikk, UNN Fragilt X syndrom Gry Hoem Lege, PhD, Medisinsk Genetikk, UNN Disposisjon Hva er fragilt X syndrom introduksjon Genetikk og sykdoms smuligheter Spekteret av Fragilt X syndrom den hyppigste arvelige årsaken

Detaljer

RelEx v. 1.0 (2004) Michael J. MacCoss and John D. Venable, The Scripps Research Institute, La Jolla, CA (2002)

RelEx v. 1.0 (2004) Michael J. MacCoss and John D. Venable, The Scripps Research Institute, La Jolla, CA (2002) RelEx v. 1.0 (2004) Michael J. MacCoss and John D. Venable, The Scripps Research Institute, La Jolla, CA (2002) P CE00015 locus:drs-1 Aspartyl-tRNA synthetase status:partially_confirm 0.876 0.074 7 R U

Detaljer

Reproduksjonsfysiologi hos marine kaldtvannsarter i oppdrett

Reproduksjonsfysiologi hos marine kaldtvannsarter i oppdrett Produksjon Reproduksjonsfysiologi hos marine kaldtvannsarter i oppdrett Fra ekstensivt til intensivt oppdrett av marin fisk Vannkvalitet laksefisk Effekter av intensiv produksjon med særlig vekt på matfisk:

Detaljer

Hva kan vi bruke WGS til?

Hva kan vi bruke WGS til? Hva kan vi bruke WGS til? (innen klinisk bakteriologi / forskning) Ola Brynildsrud Bioinformatiker/forsker Folkehelseinstituttet En forelesning på Bioingeniørdagen, 11. april 2018 «In five years time,

Detaljer

Molekylær patologi Amplifikasjonsmetoder

Molekylær patologi Amplifikasjonsmetoder Molekylær patologi Amplifikasjonsmetoder Emiel Janssen Seksjonsleder for Kvantitativ og Molekylær Patologi Daglig leder for laboratoriet for molekylær biologi Avdeling for Patologi Stavanger Universitetssjukehus

Detaljer

Oppgavesett, Runde 1 Norsk Biologiolympiade, Skoleåret 2016/2017

Oppgavesett, Runde 1 Norsk Biologiolympiade, Skoleåret 2016/2017 Oppgavesett, Runde 1 Norsk Biologiolympiade, Skoleåret 2016/2017 Dag: Valgfri dag i uke 40-42 Varighet: 45 minutter Maksimal poengsum: 30 Oppgavesettet er på 10 sider og består av 30 flervalgsoppgaver

Detaljer

Mikromatriser introduksjon. Strategi for mikromatrise eksperimenter. Forelesning # 8. Bruksområder. Mikromatriser trinn for trinn. Lars O.

Mikromatriser introduksjon. Strategi for mikromatrise eksperimenter. Forelesning # 8. Bruksområder. Mikromatriser trinn for trinn. Lars O. Mikromatriser introduksjon Strategi for mikromatrise eksperimenter Forelesning # 8 probe Lars O. Baumbusch Radiumhospitalet Rikshospitalet HF Senter for Bioinformatikk, IFI, UiO Biological Question Lars

Detaljer

Effekten av doseeskalering på tumorkrympning ved ekstern strålebehandling av lokalavansert livmorhalskreft

Effekten av doseeskalering på tumorkrympning ved ekstern strålebehandling av lokalavansert livmorhalskreft Medfys 2016 Effekten av doseeskalering på tumorkrympning ved ekstern strålebehandling av lokalavansert livmorhalskreft Marius Røthe Arnesen 1,2, Taran Paulsen Hellebust 1,2,Eirik Malinen 1,2 1 Avdeling

Detaljer

I N N K A L L I N G T I L O R D I N Æ R T S A M E I E R M Ø T E

I N N K A L L I N G T I L O R D I N Æ R T S A M E I E R M Ø T E I N N K A L L I N G T I L O R D I N Æ R T S A M E I E R M Ø T E 2 0 0 9 O r d i n æ r t s am e i e rm øt e i S am e i e t W al d em a rs H a g e, a v h o l d e s t o rs d a g 1 8. j u n i 2 0 0 9, k l.

Detaljer

Semmelweis University. Genetic and epigenetic regulation of. Dept. GCI. the immune response. András Falus. November

Semmelweis University. Genetic and epigenetic regulation of. Dept. GCI. the immune response. András Falus. November Genetic and epigenetic regulation of the immune response András Falus Do-Re-Mi November 5. 2013. Semmelweis University Dept. GCI Encyclopedy of DNA elements of human genome released: April, 2012 The human

Detaljer

T h e J o u r n a l o f E x p e r i m e n t a l M e d i c i n e

T h e J o u r n a l o f E x p e r i m e n t a l M e d i c i n e T h e J o u r n a l o f E x p e r i m e n t a l M e d i c i n e SUPPLEMENTAL MATERIAL Nishikawa et al., http://www.jem.org/cgi/content/full/jem.20092144/dc1 JEM S1 Figure S1. Flow cytometric analysis of

Detaljer

Eksamensoppgave i PSY1013/PSYPRO4113 biologisk psykologi 1

Eksamensoppgave i PSY1013/PSYPRO4113 biologisk psykologi 1 Institutt for psykologi Eksamensoppgave i PSY1013/PSYPRO4113 biologisk psykologi 1 Faglig kontakt under eksamen: Audrey van der Meer Tlf.: 73 59 19 60 Eksamensdato: 1. desember 2017 Eksamenstid (fra-til):

Detaljer

Epigenetikk; arvesynden i ny innpakning? Dag O. Hessen University of Oslo, Dept. Biology Center of Ecological and Evolutionary Synthesis (CEES)

Epigenetikk; arvesynden i ny innpakning? Dag O. Hessen University of Oslo, Dept. Biology Center of Ecological and Evolutionary Synthesis (CEES) Epigenetikk; arvesynden i ny innpakning? Dag O. Hessen University of Oslo, Dept. Biology Center of Ecological and Evolutionary Synthesis (CEES) Den genetiske kode Oppnøstingen av den genetiske kode foregikk

Detaljer

Hormonsystem. Soneterapi og massasjeterapi Gihealth.com. Læringsmål hormonsystemet

Hormonsystem. Soneterapi og massasjeterapi Gihealth.com. Læringsmål hormonsystemet Hormonsystem Soneterapi og massasjeterapi Gihealth.com Læringsmål hormonsystemet Etter gjennomført emne er det forventet at studenten kan Kjenne til hovedinndelingen av det endokrine systemet Beskrive

Detaljer

1. VETERINÆRPREPARATETS NAVN. Receptal vet. 4 mikrog/ml injeksjonsvæske, oppløsning 2. KVALITATIV OG KVANTITATIV SAMMENSETNING

1. VETERINÆRPREPARATETS NAVN. Receptal vet. 4 mikrog/ml injeksjonsvæske, oppløsning 2. KVALITATIV OG KVANTITATIV SAMMENSETNING 1. VETERINÆRPREPARATETS NAVN Receptal vet. 4 mikrog/ml injeksjonsvæske, oppløsning 2. KVALITATIV OG KVANTITATIV SAMMENSETNING 1 ml injeksjonsvæske, oppløsning inneholder: Virkestoff(er): Buserelinacetat

Detaljer

Hva gjør vi på molekylærpatologisk laboratorium?

Hva gjør vi på molekylærpatologisk laboratorium? Bioingeniørkongressen 2016 Hva gjør vi på molekylærpatologisk laboratorium? Dag Andre Nymoen Ingeniør/stipendiat Patologen OUS Laboratorium for molekylærpatologi www.molpat.no Operasjon Biopsi Makrobeskjæring

Detaljer

KYSTTORSK OG SKREI I LOFOTEN 2009

KYSTTORSK OG SKREI I LOFOTEN 2009 KYSTTORSK OG SKREI I LOFOTEN 2009 Resultater fra DNA-typing av torsk ved bruk av PCR metode Websaknr. 09/12473 Fiskeridirektoratet region Nordland Fiskerikontoret i Svolvær Mai 2009 Erun Thesen Bioingeniør/Inspektør

Detaljer

GENETISKE MEKANISMER INVOLVERT I SPREDING AV RESISTENS

GENETISKE MEKANISMER INVOLVERT I SPREDING AV RESISTENS GENETISKE MEKANISMER INVOLVERT I SPREDING AV RESISTENS KRISTIN HEGSTAD OUTLINE Hvordan erverves nye egenskaper? Mekanismer for horisontal genoverføring (HGT) Genetiske elementer involvert i spredning Definisjoner

Detaljer