KJM-MEF Modul 3 Kvantekjemiske metoder

Like dokumenter
KJM-MEF Modul 3 Kvantekjemiske metoder. Repetisjon. Geometrioptimering. Hartree Fock

KJM Molekylmodellering

KJM Molekylmodellering. Hartree Fock - repetisjon. Hartree Fock. Hartree Fock

KJM Molekylmodellering

KJM Molekylmodellering. Semi-empiriske metoder - repetisjon. Generell ytelse

KJM-MEF Modul 3 Kvantekjemiske metoder. Introduksjon. Kvantekjemiske metoder. Kvantekjemiske metoder

KJM-MEF Modul 3 Kvantekjemiske metoder

KJM Molekylmodellering. Korrelerte metoder - repetisjon. Korrelerte metoder

KJM Molekylmodellering. Molekylorbitalteori - repetisjon. Variasjonsprinsippet. Kvantemekanikk. systemet

KJM-MEF Modul 3 Kvantekjemiske metoder

KJM Molekylmodellering. Molekyler i løsning. Introduksjon. Introduksjon

TKJ4170 Midtsemesterrapport

KJM Molekylmodellering. Basissett - repetisjon. Basissett oppsummert. Hartree Fock-grensen

KJM-MEF Modul 3 Kvantekjemiske metoder. Repetisjon. Kvantekjemiske metoder. Basissett oppsummert

KJM Molekylmodellering

KJM Molekylmodellering

KJM Molekylmodellering. Monte Carlo simuleringer og molekyldynamikk - repetisjon. Statistisk mekanikk

KJM-MEF Modul 3 Kvantekjemiske metoder

KJM Molekylmodellering

KJM Molekylmodellering. Introduksjon. Molekylmodellering. Molekylmodellering

KJM Molekylmodellering

KJM Molekylmodellering

Det virtuelle kjemilaboratoriet. Trygve Helgaker. Centre for Theoretical and Computational Chemistry. Kjemisk institutt, Universitetet i Oslo

KJM2600-Laboratorieoppgave 1

KJM Molekylmodellering. Molekylmekanikk. Oversikt. Introduksjon

Kvantekjemi kjemiens nye verktøy

Teoretisk kjemi. Trygve Helgaker. Centre for Theoretical and Computational Chemistry. Kjemisk institutt, Universitetet i Oslo. Onsdag 13.

Kvantekjemi fremtidens virtuelle laboratorium

KJM Molekylmodellering

KJM Molekylmodellering. Introduksjon. Molekylmodellering. Molekylmodellering

UNIVERSITETET I OSLO Det matematisk-naturvitenskapelige fakultet

Eten % 1.2%

Angir sannsynligheten for å finne fordelingen av elektroner i rommet

KJM Molekylmodellering

Kvantekjemi. en fascinerende kjemi helt uten eksperimenter. Trygve Helgaker. Kjemisk institutt, Universitetet i Oslo

BOKMÅL NORGES TEKNISK-NATURVITENSKAPELIGE UNIVERSITET INSTITUTT FOR KJEMI KJ1041 KJEMISK BINDING, SPEKTROSKOPI OG KINETIKK HØSTEN 2010

FYS 3710 Biofysikk og Medisinsk Fysikk, Bindingsteori - hybridisering - molekylorbitaler

Kvantemekanikk på datamaskiner: kjemiens nye verktøy

Kvantemekanikk på datamaskiner: kjemiens nye verktøy

Løsningsforslag for FYS2140 Kvantefysikk, Mandag 3. juni 2019

FY1006/TFY Øving 9 1 ØVING 9

Kvantemekanikk på datamaskiner: kjemiens nye verktøy

FYS 3710 Biofysikk og Medisinsk Fysikk, Bindingsteori - atomorbitaler

MNF, UiO 24 mars Trygve Helgaker Kjemisk institutt, Universitetet i Oslo

VÅREN Oppgave II. b) Hamilton-operatoren for en partikkel med masse m på en ring med radius r er gitt ved

Oppgave 1 (Teller 34 %) BOKMÅL Side 1 av 5. NORGES TEKNISK-NATURVITENSKAPELIGE UNIVERSITET Institutt for fysikk

KJM2600-Laboratorieoppgave 2

FY2045/TFY4250 Kvantemekanikk I, løsning øving 14 1 LØSNING ØVING 14. ψ 210 z ψ 100 d 3 r a.

Løsningsforslag Eksamen 26. mai 2006 TFY4215 Kjemisk fysikk og kvantemekanikk

LØSNING EKSTRAØVING 2

Oppgave 1 (Deloppgavene a, b, c og d teller henholdsvis 6%, 6%, 9% og 9%) NORSK TEKST Side 1 av 7

Eten. Innledning. TFY4215 Kjemisk fysikk og kvantemekanikk Våren 2006 Kjemisk fysikk Øving 1 Innleveringsfrist, gruppe 1: gruppe 2:

EKSAMEN I FAG SIF4065 ATOM- OG MOLEKYLFYSIKK Fakultet for naturvitenskap og teknologi 13. august 2002 Tid:

A.5 Stasjonære og ikke-stasjonære tilstander

UNIVERSITETET I OSLO Det matematisk-naturvitenskapelige fakultet

Løsningsforslag Eksamen 4. desember 2007 TFY4250 Atom- og molekylfysikk/fy2045 Kvantefysikk

FYS 3710 Biofysikk og Medisinsk Fysikk, Bindingsteori - atomorbitaler

Eten. Innledning. TFY4215 Innføring i kvantefysikk Øving 11 Molekylfysikk

University of Oslo. Department of Physics. FYS 3710 Høsten EPR spektroskopi. EPR-Labotratory

Løsningsforslag Eksamen 29. mai 2010 FY1006 Innføring i kvantefysikk/tfy4215 Kjemisk fysikk og kvantemekanikk

Kapittel 7 Atomstruktur og periodisitet Repetisjon 1 ( )

Kvantemekanikk på datamaskiner: kjemiens nye verktøy

FY1006 Innføring i kvantefysikk og TFY4215 Kjemisk fysikk og kvantemekanikk Våren 2009 Kjemisk fysikk Øving 1 Innleveringsfrist: Mandag

Løsningsforslag til eksamen i TFY4170 Fysikk 2 Tirsdag 9. desember 2003

EKSAMEN I FY2045 KVANTEMEKANIKK I/ TFY4250 KVANTEMEKANIKK I Tirsdag 10. august 2010 kl

A) λ < 434 nm B) λ < 534 nm C) λ < 634 nm D) λ < 734 nm E) λ < 834 nm

EKSAMEN I TFY4215 KJEMISK FYSIKK OG KVANTEMEKANIKK onsdag 5. august 2009 kl

KJM Molekylmodellering. Molekylmekanikk - repetisjon. Kraftfeltenergien. Klassisk modell

EKSAMEN I TFY4215 KJEMISK FYSIKK OG KVANTEMEKANIKK 26. mai 2006 kl

UNIVERSITETET I OSLO Det matematisk-naturvitenskapelige fakultet

UNIVERSITETET I OSLO Det matematisk naturvitenskapelige fakultet

Figur 1: Skisse av Franck-Hertz eksperimentet. Hentet fra Wikimedia Commons.

Løsningsforslag Eksamen 4. august 2008 TFY4250 Atom- og molekylfysikk

FY2045/TFY4250 Kvantemekanikk I, løsning øving 4 1 LØSNING ØVING 4

FY1006/TFY4215 Innføring i kvantefysikk, - Ekstraøving 2 1. Ekstraøving 2. = 1 2 (3n2 l 2 l), = 1 n 2, 1 n 3 (l ), 1 n 3 l(l + 1.

Oppgave 2 Molekylmekanikk

Løsningsforslag til eksamen i FYS1000, 14/8 2015

TFY Løsning øving 6 1 LØSNING ØVING 6. Grunntilstanden i hydrogenlignende atom

Løsningsforslag Eksamen 7. august 2006 TFY4215 Kjemisk fysikk og kvantemekanikk

KJM Molekylmodellering

TFY løsning øving 9 1 LØSNING ØVING 9

Atomets oppbygging og periodesystemet

KAPITEL 1. STRUKTUR OG BINDINGER.

UNIVERSITETET I OSLO Det matematisk-naturvitenskapelige fakultet

Løsningsforslag Eksamen 11. august 2010 FY1006/TFY4215 Innføring i kvantefysikk

FY1006/TFY Øving 7 1 ØVING 7

TFY Øving 7 1 ØVING 7. 3-dimensjonal isotrop harmonisk oscillator

Institutt for fysikk. Eksamensoppgave i TFY4215 Innføring i kvantefysikk

Hvorfor studere kjemi?

FY1006/TFY Løsning øving 9 1 LØSNING ØVING 9

1) Redoksreaksjoner, reaksjoner hvor en forbindelse. 2) Syre basereaksjoner, reaksjoner hvor en. elektronrik forbindelse reagerer med en

Energiband i krystallar. Halvleiarar (intrinsikke og ekstrinsikke) Litt om halvleiarteknologi

Løsningsforslag Eksamen 16. august 2008 TFY4215 Kjemisk fysikk og kvantemekanikk

Atommodeller i et historisk perspektiv

Løsningsforslag Eksamen 13. august 2011 FY1006/TFY4215 Innføring i kvantefysikk

Kjemiske bindinger. Som holder stoffene sammen

Løsningsforslag Eksamen 5. august 2009 TFY4215 Kjemisk fysikk og kvantemekanikk

Løsningsforslag Eksamen 26. mai 2008 TFY4215 Kjemisk fysikk og kvantemekanikk

Transkript:

KJM-MEF 4010 - Modul 3 Kvantekjemiske metoder Vebjørn Bakken Kjemisk institutt, UiO 27. august 2004 KJM-MEF 4010 - Modul 3 Kvantekjemiske metoder p.1/45

Repetisjon Repetisjon p.2/45

Repetisjon p.3/45 Hartree Fock Hartree Fock er en ab initio metode, der elektronene kun vekselvirker gjennom et midlere, statisk felt Ingen momentane elektron elektron-vekselvirkninger MO ene bestemmes iterativt Nokså rask metode, kan benyttes på ganske store molekyler Skalerer teoretisk som N 4 (i praksis noe bedre)

Repetisjon p.4/45 Geometrioptimering Born Oppenheimer-approksimasjonen grunnlag for potensialflater (PES) Entydig energi som funksjon av kjernekoordinatene Stasjonære punkter viktige Likevektsstrukturer minima Overgangstilstander sadelpunkter Kan diskutere reaksjonsveier, energiforskjeller, barrierehøyder m.m.

Repetisjon p.5/45 Typisk beregning To løkker: En indre optimerer bølgefunksjonen for gitt geometri, en ytre optimerer geometrien

Basissett Basissett p.6/45

Basissett p.7/45 Basissett ab initio beregninger, som Hartree Fock, krever at man aktivt velger et basissett Et basissett definerer et sett av basisfunksjoner χ i for hvert grunnstoff MO ene uttrykkes ved disse: φ = i C i χ i (1) Velger vanligvis blant ferdigdefinerte basissett

Basissett p.8/45 Basissett Ett av de viktigste valgene i beregningen! Det finnes i praksis ingen universelle sett... Flere basisfunksjoner mer fleksibel bølgefunksjon lavere energi (variasjonsprinsippet),... men lengre beregningstid! Et godt basissett dekker de viktige delene av rommet med et moderat antall funksjoner av fornuftig funksjonell form

Basissett p.9/45 Gauss-funksjoner Av beregningstekniske grunner benyttes normalt GTOer (Gaussian-type orbitals) som basisfunksjoner GTO ene har gal oppførsel nær kjerner og langt fra kjerner Kompenserer ved å øke antallet funksjoner

Basissett p.10/45 Kontraksjon Varieres samtlige MO-koeffisienter fritt, brukes mye krefter på de indre orbitalene Viktige for energien, men betyr lite for kjemiske egenskaper Core-orbitalene er tilnærmet uavhengige av valensbindingssituasjonen Hensiktsmessig å konstruere faste lineærkombinasjoner av primitive GTO er Prosessen kalles kontraksjon

Basissett p.11/45 Basissett-familier De to viktigste familiene av kontraherte GTO-baserte basissett: Poples basissett Dunnings korrelasjons-konsistente basissett Begge familiene danner hierarkier av sett Enkle sett kan utvides i ulike retninger avhengig av behov

Basissett p.12/45 Basissett STO-3G kalles single-ζ (SZ) Én basisfunksjon for hver type okkupert orbital (core såvel som valens) Et basissett med to funksjoner for hver AO kalles dobbel-ζ (DZ), videre har vi TZ, QZ... Split-valence basissett: Representerer core-orbitaler med én kontrahert funksjon Valens-orbitalene med flere funksjoner: valens-dobbel-ζ VDZ, VTZ, VQZ...

Basissett p.13/45 Poples basissett Pople-settene 3-21G, 4-31G, 6-31G og 6-311G eks. på split-valence sett Første tall angir antall primitive i core-orbitalene Tallene etter bindestreken angir antall primitive i hver valens-orbital To tall = valens-dobbel-ζ; Tre tall = valens-trippel-ζ Eksponenter og kontraksjonskoeffisienter bestemt variasjonelt vha. testsett

Basissett p.14/45 Poples basissett Eksempel: HF-beregning av energien til difenyl (C 6 H 5 ) 2 Basissett Prim. Kont. Energi (E h ) CPU tid (s) STO-3G 210 70-454.647560 14.2 3-21G 210 128-457.688386 33.0 4-31G 280 128-459.602693 40.8 6-31G 304 128-460.095780 45.6 6-311G 362 186-460.171011 119.5

Basissett p.15/45 Dunnings basissett Dunning har også utviklet en familie split-valence basissett Heter cc-pvdz, cc-pvtz osv. cc står for correlation-consistent p står for polarisasjon

Basissett p.16/45 Dunnings basissett Eksempel (forts.): HF-beregning av energien til difenyl (C 6 H 5 ) 2 Basissett Prim. Kont. Energi (E h ) CPU tid (s) cc-pvdz 466 218-460.289315 343 cc-pvtz 806 500-460.401164 6327 cc-pvqz 1474 960-460.429162 86430

Basissett p.17/45 Polarisasjonsfunksjoner MO ene skal beskrive kjemisk binding Krever mer fleksibilitet enn tilsvarende enkeltatomer Basisfunksjoner med et kvantetall høyere angulærmoment enn valensorbitalene Kalles polarisasjonsfunksjoner p-funksjoner for hydrogen; d-funksjoner for 2. periode Viktig for geometrier, spesielt vinkler

Basissett p.18/45 Polarisasjonsfunksjoner En p-funksjon på hydrogen vil polarisere s-funksjonen Ladningssenteret kan skyves ut fra atomsenteret Antall basisfunksjoner øker raskt med polarisasjonsfunksjoner

Basissett p.19/45 Polarisasjonsfunksjoner For Pople-settene: * betyr ett sett polarisasjonsfunksjoner på alle ikke-hydrogener (6-31G*) ** betyr ett sett polarisasjonsfunksjoner på samtlige atomer (6-31G**) Evt. eksplisitt: 6-311G(3d2fg,2pd) Dunnings basissett balansert: cc-pvdz inneholder (d,p) cc-pvtz inneholder (2df,2pd) cc-pvqz inneholder (3d2fg,3p2df)

Basissett p.20/45 Diffuse funksjoner Anioner, eksiterte tilstander m.m. har mer diffuse elektronskyer Kan legge til diffuse funksjoner Bedre beskrivelse av ytre deler av elektronskyen For Pople-settene: + betyr én diffus s og ett sett diffuse p på alle ikke-hydrogener (6-31+G) ++ betyr i tillegg én diffus s på hydrogen (6-31++G)

Basissett p.21/45 Diffuse funksjoner Dunning-settene benytter prefiks aug-, daugog taug- (aug-cc-pvtz) aug- legger til ett sett diffuse funksjoner for hvert angulærmoment som allerede er inkludert Diffuse s, p og d for 2. periode i aug-cc-pvdz Diffuse s, p, d og f for 2. periode i aug-cc-pvtz

Basissett p.22/45 Diffuse funksjoner Eksempel: IR intensiteter for H 2 O Basissett I 1 (km/mol) I 2 I 3 CPU tid (s) cc-pvdz 80.70 21.18 60.48 10.5 cc-pvtz 90.30 14.57 75.25 27.8 cc-pvqz 93.68 15.06 85.55 643.2 aug-cc-pvdz 93.15 14.40 87.88 13.6 aug-cc-pvtz 96.38 15.10 92.29 106.6 aug-cc-pvqz 96.43 15.15 92.82 3001.0

Basissett p.23/45 Tette funksjoner Dunnings basissett kan også utvides med tette funksjoner (tight/steep functions), cc-pcvxz (X = D, T, Q, 5) GTO er med høye eksponenter Forbedrer beskrivelsen nær kjernen Viktig for visse egenskaper som f.eks. Fermi-kontakt vekselvirkning (bidrag til spinn spinn koblingskonstanter i NMR)

Basissett p.24/45 Basissett oppsummert Standard basissett kan bygges ut Tette funksjoner (core-region) Polarisasjonsfunksjoner (indre valensregion) Diffuse funksjoner (ytre valensregion) Polarisasjonsfunksjoner påkrevd for gode strukturer og energier Områder som bidrar lite til energien kan være helt avgjørende for andre egenskaper

Basissett p.25/45 Valg av basissett Kvantekjemiske program inkluderer gjerne bibliotek av basissett Andre sett kan hentes fra EMSL (http://www.emsl.pnl.gov/ forms/basisform.html) Standardsett kan modifiseres, f.eks. dekontraheres Konstruksjon av egne sett er siste utvei

Basissett p.26/45 Hartree Fock-grensen Hartree Fock-grensen nås med uendelig stort basissett Avviker fra eksakt resultat! cc-pvxz og cc-pcvxz er konstruert for å kunne ekstrapolere X kalles kardinaltall Kan plottes som X 1 og ekstrapoleres til X = Alternativ: Approksimer med stort basissett

Hartree Fock-grensen Basissett p.27/45

Kvantekjemiske metoder Kvantekjemiske metoder p.28/45

Kvantekjemiske metoder HF representerer et veiskille Kvantekjemiske metoder p.29/45

Semi-empiriske metoder To-elektronintegralene i HF er det tidkrevende leddet Kan man unngå å beregne alle disse? Integraler kan parametriseres basert på eksperimentelle data (empiri) Enkelte integraler neglisjeres Andre beregnes fra enkle analytiske uttrykk Kvantekjemiske metoder p.30/45

Semi-empiriske metoder Eksempler på semi-empiriske modeller er CNDO, INDO, MNDO, AM1 og PM3 Konkurrerer først og fremst på beregningsmessig kostnad, ikke på kvalitet Skalerer som N 2, kan behandle store systemer Problemer med bl.a. svake bindinger og barrierer Feil er tilfeldige, ikke systematiske, energidifferanser blir svært usikre Kvantekjemiske metoder p.31/45

Eksempel Taxol: Finnes i barken til en Stillehavsart av barlind, benyttes som kreftmedisin Energiberegning AM1: 20 sekunder Energiberegning HF/STO-3G: 11 minutter Kvantekjemiske metoder p.32/45

Hartree Fock HF beregner alle integraler eksakt Normalt mer nøyaktig enn de semi-empiriske metodene Spesielt med polarisert dobbel-ζ basis gjør HF det bra Kansellering av like store feil med motsatt fortegn: Mangel på fleksibilitet i basissettet Mangel på momentane vekselvirkninger mellom elektronene Kvantekjemiske metoder p.33/45

Hartree Fock Potensielt farlig å stole på slik flaks! HF får f.eks. problemer når bindingsforhold endres mye Populært slagord innen teoretisk kjemi for tiden: The right answer for the right reason Ønsker derfor metoder som er mer nøyaktige enn Hartree Fock (uten å basere seg på kansellering av feil) Kvantekjemiske metoder p.34/45

Korrelerte metoder En HF-beregning med uendelig stor basis gir Hartree Fock-grensen, denne avviker fra eksakt bølgefunksjon Differansen er korrelasjonsenergien E korr (typisk 1-2% av totalenergien): E korr = E eksakt E HF (2) Korrelerte metoder forsøker å plukke opp mest mulig av denne korrelasjonsenergien Kvantekjemiske metoder p.35/45

Korrelerte metoder To typer korrelasjonsenergi, men ikke mulig å partisjonere: Statisk korrelasjon: Oppstår ved (nær) degenererte elektroniske tilstander Dynamisk korrelasjon: Momentane vekselvirkninger mellom elektronene, dvs. korrelerte elektronbevegelser Dynamisk korrelasjon er generelt viktigst Kvantekjemiske metoder p.36/45

Korrelerte metoder HF beskriver systemet vha. én determinant Lineærkombinasjon av flere determinanter vil gi mer nøyaktig bølgefunksjon: Ψ = c 0 Ψ HF + c 1 Ψ 1 + c 2 Ψ 2 +... (3) HF-determinanten normalt det dominerende ledd, alle andre c i vil da være små Summen av mange små ledd kan likevel gi signifikante bidrag Kvantekjemiske metoder p.37/45

Korrelerte metoder Det finnes et antall ulike korrelerte kvantekjemiske metoder Single-referanse metoder som typisk tar utgangspunkt i Ψ HF Multi-referanse metoder som starter fra et (lite) sett ulike elektronkonfigurasjoner Viktig ved statisk korrelasjon Skal kort se på: Perturbasjonsteori Coupled-cluster Kvantekjemiske metoder p.38/45

Perturbasjonsteori E korr liten del av totalenergien Perturbasjon til ukorrelert energi Ĥ = Ĥ0 + λ ˆV (4) Styrken på perturbasjonen bestemt av λ Behandles med Møller Plesset perturbasjonsteori (MPPT) Perturbasjonene er eksitasjoner fra Ψ HF Kvantekjemiske metoder p.39/45

Perturbasjonsteori Både bølgefunksjon og energi ekspanderes Ψ 0 = Ψ (0) 0 + Ψ (1) 0 + Ψ (2) 0 +... (5) E 0 = E (0) 0 + E (1) 0 + E (2) 0 +... (6) Summen av E (0) 0 og E (1) 0 er E HF MPn inkluderer de n-første leddene Andreordens korreksjon første av interesse (MP2) Kvantekjemiske metoder p.40/45

Perturbasjonsteori MP2 klart mest brukt Skalerer grovt sett som N 5 Plukker opp signifikant del av korrelasjonsenergien Tendens til å overkorrigere molekylære egenskaper NB! Ingen garanti for konvergens av MPn etter hvert som n øker! Kvantekjemiske metoder p.41/45

Coupled-cluster Sentralt punkt i coupled-cluster-teori (CC) er den eksponentielle ansatz, der eksakt bølgefunksjon skrives Ψ = e T Ψ HF (7) Cluster-operatoren T for n-elektronsystem T = T 1 + T 2 + T 3 +... + T n (8) T i genererer samtlige determinanter med i eksitasjoner fra referansetilstanden Kvantekjemiske metoder p.42/45

Coupled-cluster Trunkering av T gjør teorien interessant CCSD tar med T 1 og T 2, skalerer som N 6 CCSDT inkluderer T 3, skalerer som N 8 Mer vanlig å behandle trippeleksitasjonene med perturbasjonsteori CCSD(T) har blitt referansemetode Merk: CC-metodene krever fleksible basissett Kvantekjemiske metoder p.43/45

Kvantekjemiske metoder Skalering N 4 N 5 N 6 N 7 N 8 N 9 N 10 Metode(r) HF MP2 MP3, CISD, CCSD, QCISD MP4, CCSD(T), QCISD(T) MP5, CISDT, CCSDT MP6 MP7, CISDTQ, CCSDTQ Kvantekjemiske metoder p.44/45

Kvantekjemiske metoder One-electron expansion Basis set limit for a given N-electron model N-electron models The exact solution Exact solution in a given one-electron basis Kvantekjemiske metoder p.45/45