GENOMISK SELEKSJON EN REVOLUSJON I AVLSARBEIDET. Øyvind Nordbø og Håvard Tajet

GENOMISK SELEKSJON EN REVOLUSJON I AVLSARBEIDET Øyvind Nordbø og Håvard Tajet

GENOMISK SELEKSJON Oversikt Grunnkurs i genetikk Hvordan utnytter vi genotypedata i avlsarbeidet? Genomisk seleksjon øker den genetiske framgangen Hvordan skal man fortsatt avle i samme retning som før man introduserte av GS

STORFEGENOMET Genomisk seleksjon - ny teknikk - nye muligheter Består av 30 kromosompar Totalt ca. 3 000 000 000 basepar Ca. 22 000 gen Genotyping Leser av hvilke basepar som dyret har på spesielle posisjoner det er variasjon mellom dyr (SNP) 50 000 SNPs, jevnt fordelt utover DNA Disse SNPene ligger ofte i nærheten av et gen og nedarves dermed sammen med genet C G

LITT GENETIKK Genomisk seleksjon - ny teknikk - nye muligheter

Dyr 5000000.. Dyr 12000.. Dyr 1 ETT-STEGS GENOMISK SELEKSJON Genomisk seleksjon - ny teknikk - nye muligheter All slektskaps-info, all genotypeinfo og alle fenotyper blir utnytta i ei og samme kjøring Dyr 1 Dyr 12000 Dyr 5000000 G A C G

EKSEMPEL PÅ HVORDAN ETT STEGS GS FUNGERER I PRAKSIS Eliteoksen 11308 Hofstad: - Har 170 døtre - Disse har bevist at han er mye bedre enn gjennomsnitt av foreldrene sine. - Hvordan kunne vi oppdaget at han var så god allerede som kalv? - Ettstegs GS (ssgblup) A Linné 20 Ingvild Hofstad 39

EKSEMPEL PÅ HVORDAN ETT STEGS GS FUNGERER I PRAKSIS Orraryd 14 Lisa A Linné 20 Ingvild Hofstad 39

EKSEMPEL PÅ HVORDAN ETT STEGS GS FUNGERER I PRAKSIS Orraryd 14 Lisa Haugset 8 Gøril A Linné 20 Ingvild Hofstad 39

EKSEMPEL PÅ HVORDAN ETT STEGS GS FUNGERER I PRAKSIS Brenden 19 a=0,125 Orraryd 14 Lisa Haugset 8 Gøril A Linné 20 Ingvild Hofstad 39

EKSEMPEL PÅ HVORDAN ETT STEGS GS FUNGERER I PRAKSIS Backgård 1 a=0,1875 Brenden 19 a=0,125 Orraryd 14 Lisa Haugset 8 Gøril A Linné 20 Ingvild Hofstad 39

EKSEMPEL PÅ HVORDAN ETT STEGS GS FUNGERER I PRAKSIS Backgård 1 a=0,1875 Brenden 19 a=0,125 Orraryd 14 Lisa Haugset 8 Gøril A Linné 20 g=0,52 Ingvild Hofstad 39

EKSEMPEL PÅ HVORDAN ETT STEGS GS FUNGERER I PRAKSIS Backgård 1 a=0,1875 Brenden 19 a=0,125 Orraryd 14 g=0,28 Lisa Haugset 8 Gøril A Linné 20 g=0,52 Ingvild Hofstad 39

EKSEMPEL PÅ HVORDAN ETT STEGS GS FUNGERER I PRAKSIS Backgård 1 a=0,1875 Brenden 19 a=0,125 Orraryd 14 g=0,28 Lisa Haugset 8 g=0,19 Gøril A Linné 20 g=0,52 Ingvild Hofstad 39

EKSEMPEL PÅ HVORDAN ETT STEGS GS FUNGERER I PRAKSIS Backgård 1 a=0,1875 Brenden 19 a=0,125 Orraryd 14 g=0,28 Lisa Haugset 8 g=0,19 Gøril Forv g=0,31 A Linné 20 g=0,52 Ingvild Hofstad 39

EKSEMPEL PÅ HVORDAN ETT STEGS GS FUNGERER I PRAKSIS Backgård 1 a=0,1875 Brenden 19 a=0,125 F. g= 0,155 Orraryd 14 g=0,28 Lisa Haugset 8 g=0,19 Gøril Forv g=0,31 A Linné 20 g=0,52 Ingvild Hofstad 39

EKSEMPEL PÅ HVORDAN ETT STEGS GS FUNGERER I PRAKSIS Backgård 1 a=0,1875 Brenden 19 a=0,125 F. g= 0,155 g=0,19 Orraryd 14 g=0,28 Lisa Haugset 8 g=0,19 Gøril Forv g=0,31 A Linné 20 g=0,52 Ingvild Hofstad 39

EKSEMPEL PÅ HVORDAN ETT STEGS GS FUNGERER I PRAKSIS Backgård 1 a=0,1875 g=0,16 Brenden 19 a=0,125 F. g= 0,155 g=0,19 Orraryd 14 g=0,28 Lisa Haugset 8 g=0,19 Gøril Forv g=0,31 A Linné 20 g=0,52 Ingvild Hofstad 39

EKSEMPEL PÅ HVORDAN ETT STEGS GS FUNGERER I PRAKSIS Verdien av å genotype kuer: 7394 døtre Brenden 19 a=0,125 F. g= 0,155 g=0,19 Gøril Forv g=0,31 Ingvild Hofstad 39

EKSEMPEL PÅ HVORDAN ETT STEGS GS FUNGERER I PRAKSIS Verdien av å genotype kuer: 7394 døtre Gj.sn g=0,095 Min g=0,000 Max g=0,190 Brenden 19 a=0,125 F. g= 0,155 g=0,19 Gøril Forv g=0,31 Ingvild Hofstad 39

EKSEMPEL PÅ HVORDAN ETT STEGS GS FUNGERER I PRAKSIS Verdien av å genotype kuer: ranking kg mjølk 1 10507 2 10228 3 10194 7392 5206 7393 5081 7394 4893 7394 døtre Gj.sn g=0,095 Min g=0,000 Max g=0,190 Brenden 19 a=0,125 F. g= 0,155 g=0,19 Gøril Forv g=0,31 Ingvild Hofstad 39

EKSEMPEL PÅ HVORDAN ETT STEGS GS FUNGERER I PRAKSIS Verdien av å genotype kuer: ranking kg mjølk 1 10507 2 10228 3 10194 7392 5206 7393 5081 7394 4893 g>0,095 7394 døtre Gj.sn g=0,095 Min g=0,000 Max g=0,190 Brenden 19 a=0,125 F. g= 0,155 g=0,19 Gøril Forv g=0,31 Ingvild Hofstad 39

EKSEMPEL PÅ HVORDAN ETT STEGS GS FUNGERER I PRAKSIS Verdien av å genotype kuer: ranking kg mjølk 1 10507 2 10228 3 10194 7392 5206 7393 5081 7394 4893 g>0,095 g<0,095 7394 døtre Gj.sn g=0,095 Min g=0,000 Max g=0,190 Brenden 19 a=0,125 F. g= 0,155 g=0,19 Gøril Forv g=0,31 Ingvild Hofstad 39

EKSEMPEL PÅ HVORDAN ETT STEGS GS FUNGERER I PRAKSIS Backgård 1 a=0,1875 g=0,16 Brenden 19 a=0,125 F. g= 0,155 g=0,19 Orraryd 14 g=0,28 Lisa Haugset 8 g=0,19 Gøril Forv g=0,31 A Linné 20 g=0,52 Ingvild Hofstad 39

GENERASJONSINTERVALL 7 years

GENERASJONSINTERVALL 3 years

SIKKERHET PÅ AVLSVERDI Med avkomsgransking Fra 0.65 (fruktbarhet) til 0.95 (produksjonsegenskaper) Med genomisk seleksjon fra 0.4 (fruktbarhet) til 0.7 (produksjonsegenskaper)

GENETISK FRAMGANG G = sikkerhet Generasjonsintervall Avkomsgransking G = sikkerhet 7 Kgp (produksjon) Aix (fruktbarhet) 0.95 7 = 0.14 0.64 7 = 0.09 Genomisk seleksjon G = sikkerhet 3 0.72 3 = 0.24 0.42 3 = 0.14

GENETISK RESPONS Avkomsgranska okser født etter 2000 10432 Velsvik 11308 Hofstad 11039 Skjelvan 11033 Reitan2

GENETISK RESPONS GS-testa okser

GENETISK RESPONS Avlsmål: komponent av kgp (melk) og antall inseminasjoner (fruktbarhet)

GENETISK RESPONS Gjennomsnitt av 15 beste avkomsgranska okser

GENETISK RESPONS Gjennomsnitt av beste 40 GS-okser

GENETISK RESPONS Hvilken respons får vi dersom vi dreier avlsmålet?

RESULTATER AV ALTERNATIV VEKTING MED GS Eksisterende avlsmål på avkomsgranska okser Eksisterende avslmål på okser med døtre Egenskapsgruppe Indeks Økonomisk % Vekt respons respons Total indeks 100 % kr 159.20 Mjølk 28 % 0.59 kr 53.17 Kjøtt 6 % 0.24 kr 2.57 Fruktbarhet 18 % 0.23 kr 11.32

RESULTATER AV ALTERNATIV VEKTING MED GS Eksisterende avlsmål på unge okser Eksisterende avslmål på okser med døtre Eksisterende avslmål på unge okser Egenskapsgruppe Indeks Økonomisk Indeks Økonomisk % Vekt respons respons % Vekt respons respons Total indeks 100 % kr 159.20 100 % kr 211.45 Mjølk 28 % 0.59 kr 53.17 28 % 1.00 kr 101.45 Kjøtt 6 % 0.24 kr 2.57 6 % 0.24 kr 2.69 Fruktbarhet 18 % 0.23 kr 11.32 18 % -0.19 kr -9.68

RESULTATER AV ALTERNATIV VEKTING MED GS Alternativt avlsmål på unge okser Eksisterende avslmål på okser med døtre Eksisterende avslmål på unge okser Alernativt avslmål på unge okser Egenskapsgruppe Indeks Økonomisk Indeks Økonomisk Indeks Økonomisk % Vekt respons respons % Vekt respons respons % Vekt respons respons Total indeks 100 % kr 159.20 100 % kr 211.45 100 % kr 234.79 Mjølk 28 % 0.59 kr 53.17 28 % 1.00 kr 101.45 24 % 0.75 kr 77.07 Kjøtt 6 % 0.24 kr 2.57 6 % 0.24 kr 2.69 4 % 0.09 kr 1.99 Fruktbarhet 18 % 0.23 kr 11.32 18 % -0.19 kr -9.68 24 % 0.14 kr 9.68