Visjonene bakteriologi / genteknologi

Like dokumenter
Legionella dyrkning Daglig (man-lør) 7 dager hvis negativ > 7 dager hvis positiv Listeria dyrkning (fra sterile områder) Daglig (man-lør) 5 dager hvis

Svartider for analyser utført av AMS Dokumentansvarlig: Eirik Steinland Godkjent av: Gunnar Skov Simonsen Versjon: 1.16 Gyldig for: Avdeling for mikro

Hurtigtester innen mikrobiologi. Fredrik Müller Avdeling for mikrobiologi, Oslo universitetssykehus HF

PCR-analyser i rutinediagnostikken Pål A. Jenum

Holdbarhet (maksimal tid): Kommentar: Prøvebeholder/ Transport-medium: Materiale/ lokasjon: Undersøkelse. Universalcontainer. 2 t ved romtemp.

22 Serum Egen instruks for sending til utland. Post. 23 Serum Mandag-torsdag helsebuss. Fredag post.

22 Serum Egen instruks for sending til utland. Post. 23 Serum Mandag-torsdag helsebuss. Fredag post.

22 Serum Egen instruks for sending til utland. Konf. lege før sending. Mandag-torsdag helsebuss. Fredag post. Mandag-torsdag helsebuss. Fredag post.

Mandag-fredag morgen helsebuss. Fredag: Sett kjølig, send mandag.

Undersøkelse Miclis-kode Materiale Info om transp Sendes til

Bruk av genteknologiske analyser ved diagnostikk av luftveisinfeksjoner. Gardermoen Svein Arne Nordbø

Undersøkelse Miclis-kode Materiale Info om transp Sendes til

Klinikk for diagnostikk

Undersøkelse Miclis-kode Materiale Info om transp Sendes til

SEROLOGIE INFECŢIOASĂ

Norsk kvalitetsforbedring av laboratorieundersøkelser. Program (mikrobiologi, 01/ ) i samarbeid med. Side1

FilmArray i praksis Spesialbioingeniør Hanna Ilag, Bakteriologisk enhet Lege i spesialisering Hanne Brekke, Bakteriologisk enhet

Oppgave: MED3300-2_MIKROBIOLOGI_H18_ORD

Sendeprøver, oversikt - Medisinsk mikrobiologi SSHF Side 1 av 6 Dokumentplassering: II.MSK.FEL.LAB FEL.MMIK FEL.8-5

St. Olavs Hospital Universitetssykehuset i Trondheim. Årsrapport Laboratorium for medisinsk mikrobiologi

Infeksjoner i allmennpraksis. Anne Ma Dyrhol Riise, Infeksjon, K2, UIB

Avdeling for medisinsk mikrobiologi. Årsrapport 2011

Serologisk diagnostikk av luftveisinfeksjoner; Hva kan vi? Nina Evjen Mikrobiologisk avdeling Ahus

St. Olavs Hospital Universitetssykehuset i Trondheim. Årsrapport Avdeling for medisinsk mikrobiologi

Infeksjoner og fatigue. Nina Langeland Infeksjonsseksjonen Haukeland Universitetssykehus og Universitetet i Bergen

St. Olavs Hospital Seksjon for smittevern Isolering oversikt over infeksjoner og smittestoffer og deres isoleringsmåte Side 1 av 18

Avdeling for medisinsk mikrobiologi. Å r s r a p p o r t 2006

Nukleinsyrediagnostikk i medisinsk mikrobiologi

Luftveisinfeksjoner - PCR-basert diagnostikk. Anne-Marte Bakken Kran Overlege, førsteamanuensis Mikrobiologisk avd. UOS Ullevål

Fredagsklinikk. Anne Ma Dyrhol Riise Infeksjon- K2. UiB

Generell Informasjon om prøvetaking. Anbefalt prøvetakingsutstyr: Gå til det aktuelle prøvematerialet. Tabellen leses fra venstre mot høyre.

Infeksjoner og isolering, alfabetisk

Program 2019 mikrobiologi og patologi

1. Forord 3 2. Avdelingens funksjoner 5 3. Organisasjon 5 4. Bemanning 6 5. Datasystem 6 6. Aktivitet Seksjon for bakteriologi 6 6.

Liste over analyser som utføres/evt. videresendes, Enhet for virologi og infeksjonsimmunologi (VIM)

One assay. Multiple pathogens detection

2. Avdelingens funksjoner

Forord til 3. utgave

Gynekologi hos fastlegen

Hvorfor er kliniske opplysninger viktig for en mikrobiolog?

Rekvirere SOI-prøver i DIPS

Gonoré. Høstkonferansen i Mikrobiologi Brita Pukstad Hudavdelingen, St.Olavs Hospital

Pasientnær analysering innen medisinsk mikrobiologi

Antibiotikaresistens - forekomst, konsekvenser og utfordringer. Regionsmøte Helse Vest, mai 2019 Petter Elstrøm Folkehelseinstituttet

Yrkesbetingede infeksjoner hos helsearbeidere

Avdeling for medisinsk mikrobiologi. Årsrapport 2010

Generell Informasjon om prøvetaking

Mikrobiologisk prøvetakning hva og hvordan

VEDLEGG NR. 2 TEST CASER

Se etter nye elektroniske etikettoppdateringer på før testen utføres.

artus HI Virus-1 QS-RGQ Kit

N-Sm M1610 Medisinsk mikrobiolog, bakteriologi Blodkultur Bakterier, sopp Blodprodukter, Bakterier, sopp dialysefilter og bein til beinbank Enterokokk

1. Forord...3 Mål Avdelingens funksjoner Organisasjon Bemanning IKT Kvalitetssikring og HMS Aktivitet...

Avdeling for medisinsk mikrobiologi. Å r s r a p p o r t 2008

rapport Årsrapport 2016 Utbrudd av smittsomme sykdommer i Norge

RespiFinder RG Panel. Ytelsesegenskaper. November Sample & Assay Technologies. Deteksjonsgrense (LOD)

Det integrerte universitetssykehuset

Hurtigtest., luftveier, gastro, generelt

Legerollen i fremtidens mikrobiologi innspill fra en allmennlege KNUT EIRIK ELIASSEN, ALLMENNLEGE, STIPENDIAT VED ASP, UIO,

Molekylær fæcesdiagnostikk St. Olavs Hospital

Utbrudd av smittsomme sykdommer i Norge i 2017

Mikrobiologisk avdeling

Utredning av kronisk utmattelse på fastlegens kontor

Virusinfeksjoner hos den immunsupprimerte pasienten. Samarbeidsmøte om pancreas- og øycelletransplantasjon

Hurtigdiagnostikk ved luftveisinfeksjoner

Epidemiologi ved luftveisinfeksjoner (LVI) Susanne G. Dudman og Gabriel Ånestad Avdeling for virologi Nasjonalt folkehelseinstitutt

Infeksjonssykdommer, alfabetisk liste over viktige Side 1 av 10 Godkjent dato:

Seksuelt overførbare infeksjoner. HFU-dagene 2018 Medisinskfaglig ansvarlig lege, Marius Johansen

Hva mener vi med Emerging. En introduksjon

Lokale smittevernutfordringar siste år ein epidemiologisk oversikt.

Oslo universitetssykehus 2015

Når skal det tas prøver til mikrobiologiske undersøkelser?

Hurtigtest., luftveier, gastro, generelt

Infeksjoner som årsak til ME/CFS. Oddbjørn Brubakk

Medisinsk mikrobiologi et fag nær n r undergangen?

God jul. Tilbud om PET-CT ved Sykehuset i Vestfold INFORMASJON KOMMUNIKASJON SAMARBEID PRAKSISKONSULENTORDNINGEN. Nummer 7 - desember 2015

Antibiotikaresistens og resistensmekanismer

Framtidstrender innen mikrobiologi. Fredrik Müller Mikrobiologisk avdeling, Oslo universitetssykehus HF

Problembakterier karakterisering og genotyping. André Ingebretsen Avdeling for smittevern og Avdeling for mikrobiologi Oslo universitetssykehus

Risikostyring ved innføring av nye analyser

NA-S5m M1610 Medisinsk mikrobiolog, bakteriologi Dokumentansvarlig: Margaret Frøseth Li Dokumentnummer: SJ7404 Godkjent av: Oddny Kristin Remlo Versjo

Mikrobiologisk avdeling

Fagplan. Medisinsk mikrobiologi og virologi

artus HBV QS-RGQ-sett

Diagnostikk av Shigella etter innføring av Maldi-Tof MS i laboratoriet. Heidi Nerbø Aasen Tomren, avd for medisinsk mikrobiologi, seksjon Molde

Betalaktamasepåvisning

Årsrapport Nasjonalt referanselaboratorium for MRSA

Organisering og praktisk bruk ved OUS

Virus: problematikk i forbindelse med immunsuppresjon

REGIME. Nei. Direkte/indirekte kontakt Dråpesmitte* *Ja. Kontakt Dråpesmitte K D* Kontakt Dråpesmitte

Persontilpasset medisin

ÅRSRAPPORT for fra. Nasjonalt referanselaboratorium for MRSA

Utbrudd Varsling og Vesuv. Thale Cathrine Berg Kurs utbruddsetterforskning i sykehus 29. mai 2018

Forekomst og overlevelse av mikroorganismer i norsk overflatevann

Tverrfaglig laboratoriemedisin og medisinsk biokjemi Tverrfaglig laboratoriemedisin og medisinsk biokjemi (TLMB)

AFA-kurs November OUS-Rikshospitalet

ÅRSRAPPORT Nasjonalt referanselaboratorium for Francisella tularensis

Molekylær diagnostikk av Leishmaniasis og Malaria

Hvordan ser fremtiden ut?

Direkte identifikasjon av mikrober fra positive blodkulturer ved hjelp av MALDI-TOF

Transkript:

NFMM Fagmøte 29.01.09 Medisinsk mikrobiologi - et fag nær undergangen? Visjonene bakteriologi / genteknologi Kåre Bergh NTNU / DMF ; St.Olavs Hospital, AMM

For de med anlegg for å se mørkt på perspektivene: Stress pga: Økonomi viktigere enn pasientsentrerte behov Krav om økt administrativ (les: økonomi) kunnskap Bygningsmessige / planløsninger / personalomfordeling: Fjernere fra kliniske hverdag Spredning av aktiviteter Forstå & implementere nye komplekse molekylære metoder Kompleksitet i (bio)informatikk teknologi

Fournier-PE, Drancourt-M, Raoult-D. Lancet Infect Dis. 2007;7:711-23 Totalt pr Jan.2009: 771

Diagnostisk PCR ved AMM, St. Olavs Hospital 50000 45000 43784 40000 35000 30000 34160 30437 25000 20000 15000 10000 5000 16 5 7 7 9823 6850 7 12 3 2 2 6 2 6 1 881 19 7 9 2306 2690 3454 4443 5446 0 1989 1990 1991 1992 1993 1994 1995 1996 1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 År Antall prøver

Repertoir PCR analyser AMM St. Olavs Hospital jan 2009 16s rdna (bakterieidentifikasjon) Adenovirus Bartonella henselae Bordetella pertussis (kikhoste) Bordetella parapertussis Chlamydophila pneumoniae TWAR) Chlamydophila psittaci (ornitose) Chlamydia trachomatis Coronavirus (OC43, 229E, NL63) SARS-coronavirus Cytomegalovirus (CMV) Enterokokker, vancomycinresistens E.coli, enterohemorrhagisk (EHEC) E.coli, enteroinvasiv (EIEC) E.coli, enteropatogen (EPEC) E.coli, enterotoksigene (ETEC) Enterovirusgruppe Epstein-Barr virus (EBV) Francisella tularensis Helicobacter pylori (cag og vaca) Hepatitt B virus (HBV) Hepatitt C virus (HCV) Hepatitt G virus (HGV) Herpes simplex virus (HSV) 1 og 2 Humant bocavirus Humant herpesvirus 6, 7, og 8 Humant immunsviktvirus 1 (HIV) Humant metapneumovirus Humant papillomavirus, inkl typing Influenza A virus (inkl. H5N1) Influenza B virus Legionella (genus) Legionella pneumophila Listeria moncytogenesmeslingvirus Mycobacterium tuberculosis Mycoplasma genitalium Mycoplasma pneumoniae Neisseria meningitidis Neisseria meningitidis B+C Norovirus (tidl.calicivirus) Parainfluenzavirus 1, 2, 3, 4 Parotittvirus Parvovirus B19 Pneumocystis jiroveci Respiratorisk syncytial virus Rhinovirus MRSA Staphylococcus spec. Staphylokokk exfoliativ toksin, PVL Streptococcus agalacticae Streptococcus pneumoniae Tropheryma whipplei Ureaplasma urealyticum Varicella zoster virus

Hovedtrekk i fremtidig klinisk mikrobiologi Påvirkes av samfunnsmessige forhold - økonomisk utvikling, beslutninger, strategier - økt internasjonal reise og migrasjon Personell: Reduksjon? andre yrkeskategorier? Mindre grunnleggende / tradisjonell mikrobiologi Mer genteknologi (deteksjon, karakterisering, typing) Mer automatisering, avansert utstyr, andre teknologier Mer point-of-care testing Behov for raskt å detektere nye og uvanlige: - human- og dyresykdommer - mikrobielle agens og resistens

Hovedtrekk i fremtidig medisinsk mikrobiologi Genetisk påvisning av mikroorganismen ikke sannhet alene Kombinasjon med virulensprofilering fordelaktig For kausal sammenheng : - kombineres med tester for human genomisk respons (syndrom- baserte paneler?)

Molekylær mikrobiologi Molekylære metoder har fallgruver: Behov for forstå bruk og begrensninger (Falske positive Falske negative) Prøvetaking/prosessering (timing, relevans..) Definitiv fordel med tosidig tilnærming (fenotypisk og genotypisk ) Kvalitetsaspektet blir essensielt! parametre approved tests? orphan tests? avh. av kompetansenivå Økonomiske begrensninger

Klinikers hverdag ved reduksjon / faglig svekkelse av klinisk mikrobiologi Vanskeligere å få preliminær info om pasient-isolater Kvalifisert klinisk kompetent lab.personell kan gi educated guess underveis Kritiske beslutninger uten mikrobiologisk input (f.eks vil kunne gi mer defensiv og bredspektret antibiotikabehandling)

Dagens utdanning av leger Basisutdanning mht mikrobiologi og infeksjonsmedisin? økende gap: hva som gjøres i faget fronten i faget forskningskompetanse nye modaliteter Mange sykehus med mangel på infeksjonskunnskap og mikrobiologi

Konklusjon: Endringer i teknologi / utstyr forventes i stor grad Medisinsk mikrobiologi også i fremtiden garantert spennende fag med masse faglige utfordringer Fremtidig behov for kompetent klinisk mikrobiolog blir ikke mindre - men behov og krav mht kompetanse vil nok endres

Takk for oppmerksomheten!