Akvatisk smitteovervåkning med miljø-dna

Størrelse: px

Begynne med side:

Download "Akvatisk smitteovervåkning med miljø-dna"

Kamilla Holter
4 år siden
Visninger:

1 Akvatisk smitteovervåkning med miljø-dna edna sporing av Gyrodactylus salaris edna overvåkning av Aphanomyces astaci - krepsepest Trude Vrålstad Forskningsgruppe Fiskehelse

2 Haakon Hansen Trude Vrålstad Sigurd Hytterød Johannes Rusch David Strand Mari Darrud Forskningsgruppe Fiskehelse

3 Miljø-DNA = Environmental DNA = edna «Genetisk materiale hentet fra miljøprøver uten noen åpenbare tegn på biologisk kildemateriale»

4 Kilder til edna Akvatiske dyr avgir celler med DNA til vannmiljøet gjennom avføring, hud, urin, sperm, egg, slim, blod, døde individer

5 Kilder til edna Mikroorganismer inkludert sykdomsfremkallende patogener (smittestoff) er i vannmiljøet, eller frigis fra smittede dyr

6 Oppkonsentrering av cellesuppe Uten å forstyrre, stresse eller drepe

7 Nye/ukjente smittestoff Molekylære analyser gir et øyeblikksbilde avkrepsepest hva som er tilstede Gyrodactylus edna isoleres fra filtrert cellesuppe Biodiversitet Metagenomikk/ Metabarkoding Bredspektret påvisning Målspesifikk qpcr/ ddpcr edna Målrettet påvisning

8 Kvantitativ PCR krepsepest Fra diagnostisk metode til fullskala edna overvåkningsverktøy Rødlistet Edelkreps Krepsepest (Aphanomyces astaci) Svartelistet Signalkreps

Rødlistet Edelkreps Ørje sluse Rødenessjøen

krepsekatastrofe Ørje sluse (Østfold) stengt siden

Introduksjon signalkreps = miljøkriminalitet

Signalkreps Signalkreps flyttet ulovlig oppstrøms

9 Rødlistet Edelkreps Ørje sluse Rødenessjøen edna-validering i Haldenvassdraget Under en varslet krepsekatastrofe Ørje sluse (Østfold) stengt siden 2005 hindre spredning av krepsepest/signalkreps Introduksjon signalkreps = miljøkriminalitet Strafferamme 6 års fengsel Smittebærende Svartelistet Signalkreps Signalkreps flyttet ulovlig oppstrøms sluse Oppdaget under overvåkning 2014 Ensbetydende med krepsepest utbrudd Øymarksjøen

overvåkning edelkreps = teinefiske Nasjonal overvåkning krepsepest = burforsøk Rødenessjøen

10 edna-validering i Haldenvassdraget Hølandselva Skulerudsjøen Under en varslet krepsekatastrofe Sammenligne pågående konvensjonell overvåkning med edna overvåkning Nasjonal overvåkning edelkreps = teinefiske Nasjonal overvåkning krepsepest = burforsøk Rødenessjøen Krepsepest edna påvises 3 uker før kreps dør i bur Oktober 2014 Ørje sluse edna påvisning Burforsøk Teinefiske

11 Hølandselva Skulerudsjøen edna-validering i Haldenvassdraget Under en varslet krepsekatastrofe Kreps dør i bur før edna prøvetaking Rødenessjøen April 2015 Ørje sluse edna påvisning Burforsøk Teinefiske

12 Hølandselva Skulerudsjøen edna-validering i Haldenvassdraget Under en varslet krepsekatastrofe Krepsepest edna påvises ~1 uke før kreps dør i bur Rødenessjøen Mai 2015 Ørje sluse edna påvisning Burforsøk Teinefiske

13 Hølandselva Skulerudsjøen edna-validering i Haldenvassdraget Under en varslet krepsekatastrofe Krepsepest edna påvises 2,5 uker før kreps dør i bur Rødenessjøen Juni 2015 Ørje sluse edna påvisning Burforsøk Teinefiske

edna-validering i Haldenvassdraget Hølandselva

funn: edna kan påvise smitte i vannet ~3 uker før

utryddelse Fravær av edna og tomme Krepsepest edna

teiner indikerer lokal ingen dødelighet i bur utryddelse

14 edna-validering i Haldenvassdraget Hølandselva Skulerudsjøen Under en varslet krepsekatastrofe Viktige funn: edna kan påvise smitte i vannet ~3 uker før burforsøk edna-spor forsvinner rask etter utbrudd og utryddelse Fravær av edna og tomme Krepsepest edna påvises, Påstand: Metode bør kunne erstatte burforsøk teiner indikerer lokal ingen dødelighet i bur utryddelse av edelkreps Rødenessjøen Juli-August 2015 Ørje sluse edna påvisning Burforsøk Teinefiske

15 edna inn i krepsepestovervåkning edna og burforsøk i 2016 edna uten burforsøk i 2017 Samordnes med nasjonal krepseovervåkning i 2018

16 edna sporing av Gyrodactylus salaris edna påvisning av G. salaris (og to verter) i felt Rusch et al - submitted

Pågående edna prosjekter ved VI Vannfiltrering og edna analyse kan

bidra til (MT å oppdage smitte tidlig både i OK-Krepsepest 2018):

verktøy for utvalgte patogener i natur og ogakvakultur grensesnittet

laboratorium for edna påvisning av lakselus, AGD og rømt oppdettsfisk

edna/ernaav modeller for å studere dyr i redusere levende

DNAqua-Net (EU COST Action CA15219 2016-2020): Utvikling av overvåkning

SAFEGUARD (NFR 2017-2020): edna/erna verktøy for virusovervåkning og

17 Pågående edna prosjekter ved VI Vannfiltrering og edna analyse kan TARGET (NFR ): edna verktøy for edelkreps og dens trussler bidra til (MT å oppdage smitte tidlig både i OK-Krepsepest 2018): Overvåkningsprogram for krepsepest ednaqua-fresh (NVI ): edna verktøy for utvalgte patogener i natur og ogakvakultur grensesnittet mellom natur, akvakultur handel ISMOTOOL (NFR ): Flytende laboratorium for edna påvisning av lakselus, AGD og rømt oppdettsfisk Det kan gi bedre helse og velferd, og KOMPAKT (NFR ):offer edna/ernaav modeller for å studere dyr i redusere levende mikrobiologisk balanse og overvåke laksepatogener i lukkede merder DNAqua-Net (EU COST Action CA ): Utvikling av overvåkning genetiske verktøy for bio-overvåkning av akvatiske økosystemer i Europa SAFEGUARD (NFR ): edna/erna verktøy for virusovervåkning og -kontroll i lakseoppdrett Diskuterer gjerne med dere! Jeg står på speed date stasjon: «Lakselus og biosikkerhet»

Like dokumenter

NFR : Avansert overvåking av introdusert krepsepest (Aphanomyces astaci) for bedre forvaltning av truet ferskvannskreps

NFR : Avansert overvåking av introdusert krepsepest (Aphanomyces astaci) for bedre forvaltning av truet ferskvannskreps NFR-183986 : Avansert overvåking av introdusert krepsepest (Aphanomyces astaci) for bedre forvaltning av truet ferskvannskreps Prosjektleder: Trude Vrålstad Prosjektstipendiat: David Strand Veterinærinstituttet