Problembakterier karakterisering og genotyping. André Ingebretsen Avdeling for smittevern og Avdeling for mikrobiologi Oslo universitetssykehus
|
|
|
- Edmund Lauritzen
- 8 år siden
- Visninger:
Transkript
1 Problembakterier karakterisering og genotyping André Ingebretsen Avdeling for smittevern og Avdeling for mikrobiologi Oslo universitetssykehus
2 Mikroorganismer finnes i alle miljøer?
3
4
5 Estimat av biodiversitet
6 Estimat av biodiversitet Rappé & Giovannoni2003AnnRev Microb 57:
7 Helgenomprosjekter Totalt 3701 ferdige genomprosjekter Bakterier: 3359 Archaea: 159 Eukaryoter: pågående genomprosjekter Bakterier: Archaea: planlagte genomprosjekter Bakterier:1537 Genomes online database
8
9 Strategi for genotyping av Primærstrategi: Overvåkning av infeksjonssykdommer Bekrefte reinfeksjon eller residiv infeksjon Utbruddsoppklaring i sykehus Sekundærstrategi: Fylogenetiske studier, populasjons genetikk Patogenese studier, virulens Kvalitetssikring: Krysskontaminering i lab mikroorganismer
10 Utbrudd i sykehus Bruk av typingsmetoder genererer og tester hypoteser Korrekt bruk av typing vil øke effektiviteten på kontrolltiltakene som kan føre til avledning av utbruddet Fokus på disse mikroorganismene: Saureus Cdifficile Paeruginosa Abaumannii Smaltophilia Gramnegative med økt resistens (ESBL, NDM-1) Gjær- og muggsopp
11 Klassifisering av Bacteria og Archaea Tidsepoke Før 1900 Historikk Klassifisering i hovedsak basert på Morfologi, Vekstbetingelser, Sykdomsfremkallende potensiale Morfologi, Fysiologi, Biokjemi Kjemotaksonomi, Numerisk taksonomi, DNA-DNA hybridisering Genotypiske analyser, Multilokus sekvensanalyser, Average Nucleotide Identity, Helgenom analyser
12 Genotyping Genetisk karakterisering av organismer Optimalt: Helgenomanalyse Genetiske markører Genotyping: forandringer i markørsekvenser
13 Klassifisering av typingsmetoder MORFOLOGI MLEE MLST Mikrosatellitter Populasjons biologi Evolusjon Langsiktig epidemiologi FAG-TYPING RESISTENS TYPING Typing av bakterier Kortsiktig epidemiologi METABOLSK TYPING SEROTYPING RIBOTYPING Fenotypiske metoder Genotypiske metoder VNTR/SLST PFGE NGS Systematikk OPPLØSLIGHET
14 Utbrudd av Ecoli O104:H STEC utbruddet i Tyskland 2011 Bønnespirer 3842 tilfeller 2987 labkonfirmerte Ecoli gastroenterittert 18 dødsfall 855 HUS 35 dødsfall
15 Sekvenseringsplatformer OpGen Argus Optical Mapper Ion Torrent PGM (Semiconductor
16 Utbrudd av Ecoli O104:H Mellmann A et al (2011) PLoS ONE 6(7): e22751 doi:101371/journalpone
17 Optical mapping
18 Optical mapping
19 Utbrudd av Ecoli O104:H Mellmann A et al (2011) PLoS ONE 6(7): e22751 doi:101371/journalpone
20 Helgenomsekvensering Gir oss nye metoder for å utforske den genetiske diversiteten mellom stammer av samme art Gir oss mulighet til å modifisere eksisterende metodikk Gir oss mulighet til å designe nye molekylære verktøy for rask genotyping Gir oss mulighet til å spesialkonstruere medier
21
22 PFGE = Genomisk scanning Deteksjon av DNA migrasjon
23 PFGE
24 KLEB ESBL April 2011 (21 entries) PFGE PFGE UR SS IA BLD TR TR TR UR UR UR UR BLD UR UR UR TR UR UR UR UR UR KIRTXS MEPNYOBS BKLS4 NKIS2 INTI1 INTI1 INTI1 KIRUROS OFNS3 MEPNYTX MEPNYTX MEPNYTX MEPNYTX MEPNYTX MEPNYTX NKIV1S KIRTXS KIRTXS KIRUROS BKLS4 BKLS4
25 Clostridium difficile
26 PCR ribotyping 16S 23S 5S rrna operon - Flere rrna operons pr genom -Stammeavhengig variasjon av størrelse på regionen mellom 16S-23S -Variasjon av PCR produkter der antall og størrelse vil variere fra stamme til stamme
27 Ribotyping av C difficile i Norge
28 Tandem repeats GAGCGATACAAACTGGGAAACAGGGAAACTGGGTCCACAGGA Tandem repeats Flanke Repeats Flanke
29 Variasjon i Tandem repeats Stamme 1 Stamme 2 Stamme 3 Stamme 4 Variable-Number Tandem Repeats = VNTR
30 Multilocus VNTR analyse (MLVA) Regioner med korte, tandemrepeterte DNAsekvenser finnes over hele genomet Varierer mellom bakteriestammer Antall korte, repeterte sekvenser ved valgte loci gir en unik profil innen bakteriestammen
31 MLVA på Cdifficile Markør Repetert sekvens Lokalisasjon i CD 630 A6 AAGAGC B7 ATCTTCT C6 TATTGC E7 ATAGATT F3 TTA A6 B7 C6 E7 F3 G8 H (Van den Berg et al J Clin Microb 2006; 45: ) G8 TAAAAGAG H9 TCTTCTTCC
32
33 Populasjonsstruktur Clostridium difficile
34
35 European Clostridium difficile Infection Survey laboratorier 34 land 509 pasienter Karakterisering av isolerte stammer Nov`08 65 forskjellige PCR ribotyper identifisert Lancet 2011;377:63-73
36 ECDIS net : Laboratorienettverk Harmonisering laboratoriediagnostikk Harmonisering av typingsteknikk Felles stammebank Overvåkning på Europeisk plan Overvåkning i Norge-MSIS
Clostridium difficile - diagnostikk og epidemiologi i Norge
Clostridium difficile - diagnostikk og epidemiologi i Norge André Ingebretsen Avd. for smittevern og Avd. for mikrobiologi Nasjonalt referanselaboratorium for Clostridium difficile Oslo universitetssykehus
PBM 233 Mikrobiologi for farmasøyter
PBM 233 Mikrobiologi for farmasøyter Faglærer 2004: Per Arne Risøen Biologisk seksjon, ZEB Kap. 11 Mikrobiell evolusjon og systematikk Dateringer av fossiler viser at bakterier oppstod for ca. 3,6 milliarder
Vegard Eldholm. Molekylær TB epidemiologi
Vegard Eldholm Molekylær TB epidemiologi Molekylærepidemiologiske metoder Sannsynliggjøre eller avkrefte transmisjonslinker mellom TB pasienter. Avdekke krysskontaminasjon i laboratoriet Skille reinfeksjon
Hva kan vi bruke WGS til?
Hva kan vi bruke WGS til? (innen klinisk bakteriologi / forskning) Ola Brynildsrud Bioinformatiker/forsker Folkehelseinstituttet En forelesning på Bioingeniørdagen, 11. april 2018 «In five years time,
Helgenomsekvensering for epidemiologisk overvåking av TB Nasjonalt referanselaboratorium for mykobakterier Avdeling for tuberkulose, blod og seksuell
Helgenomsekvensering for epidemiologisk overvåking av TB Nasjonalt referanselaboratorium for mykobakterier Avdeling for tuberkulose, blod og seksuell smitte Anne Torunn Mengshoel Overlege Bidrag fra Vegard
Laboratoriemedisinsk klinikk Avdeling for medisinsk mikrobiologi ÅRSRAPPORT fra. Nasjonalt referanselaboratorium for Streptococcus agalactiae
Laboratoriemedisinsk klinikk Avdeling for medisinsk mikrobiologi ÅRSRAPPORT 2017 fra Nasjonalt referanselaboratorium for Streptococcus agalactiae Postadresse: St. Olavs Hospital HF, Sentral stab, Fagavdelingen,
Clostridium difficile
1 Clostridium difficile nettundervisning 13.06.2013 Annette Onken Avdeling for medisinsk mikrobiologi Bærum sykehus - VVHF 2 Clostridium difficile Mikrobiologi, patogenese Epidemiologi Diagnostikk, særlig
ÅRSRAPPORT fra. Postadresse: St. Olavs Hospital HF, Sentral stab, Fagavdelingen, Postboks 3250, Sluppen, 7006 TRONDHEIM
Laboratoriemedisinsk klinikk Avdeling for medisinsk mikrobiologi ÅRSRAPPORT 2018 fra Nasjonalt referanselaboratorium for Streptococcus agalactiae Postadresse: St. Olavs Hospital HF, Sentral stab, Fagavdelingen,
Laboratoriemedisinsk klinikk Avdeling for medisinsk mikrobiologi ÅRSRAPPORT fra. Nasjonalt referanselaboratorium for Streptococcus agalactiae
Laboratoriemedisinsk klinikk Avdeling for medisinsk mikrobiologi ÅRSRAPPORT 2016 fra Nasjonalt referanselaboratorium for Streptococcus agalactiae Postadresse: St. Olavs Hospital HF, Sentral stab, Fagavdelingen,
CLOSTRIDIUM DIFFICILE OG SMITTEVERN
CLOSTRIDIUM DIFFICILE OG SMITTEVERN 19. 20. og 27. april 2016 Torunn Nygård Smittevernlege OUS Ullevål CLOSTRIDIUM DIFFICILE Gram positiv, anaerob stav Sporedanner Isolert første gang i 1935, Hall & O`Toole
Framtidstrender innen mikrobiologi. Fredrik Müller Mikrobiologisk avdeling, Oslo universitetssykehus HF
Framtidstrender innen mikrobiologi Fredrik Müller Mikrobiologisk avdeling, Oslo universitetssykehus HF 1 Dette vil jeg si noe om: 1. Samfunnsmessige trender i. Befolkningstall ii. Alderssammensetning iii.
Clostridium difficile
Clostridium difficile -antibiotikaens svøbe Jørgen Vildershøj Bjørnholt Avdeling for mikrobiologi, OUS og Institutt for klinisk medisin, UiO Disclosures: None. The author is solely responsible for the
Genetic characterisation of Flavobacterium psychrophilum isolates from Norway and Chile
Genetic characterisation of Flavobacterium psychrophilum isolates from Norway and Chile Patricia Apablaza Fiskesykdomsgruppen Institutt for biologi Universitet i Bergen FriskFisk konferanse Bergen, februar
Påvisning av resistensmekanismer ved hjelp av MALDI-TOF massespektrometri
Påvisning av resistensmekanismer ved hjelp av MALDI-TOF massespektrometri André Ingebretsen Avd. for smittevern og Avd. for mikrobiologi Oslo Universitetssykehus NordicAST workshop 2012, Gøteborg MALDI-TOF
Seksualatferd og klamydia blant elever i videregående skole i Finnmark 1
Seksualatferd og klamydia blant elever i videregående skole i Finnmark 1 Bakgrunn Klamydia: vanligste seksuelt overført infeksjonen i Norge 22 500 tilfeller i 2011 Finnmark har gjennom mange år ligget
Multinasjonalt utbrudd av Salmonella Enteritidisi Europa. Lin Thorstensen Brandal Avd. for smitte fra mat, vann og dyr Nasjonalt folkehelseinstitutt
Multinasjonalt utbrudd av Salmonella Enteritidisi Europa Lin Thorstensen Brandal Avd. for smitte fra mat, vann og dyr Nasjonalt folkehelseinstitutt Nasjonal referansefunksjon for næringsmiddelbårne bakterier
Vankomycinresistente enterokokker VRE Epidemiologi/utbruddet på Haukeland Universitetssjukehus
Vankomycinresistente enterokokker VRE Epidemiologi/utbruddet på Haukeland Universitetssjukehus Kristin Stenhaug Kilhus LIS, Mikrobiologisk avdeling Haukeland Universitetssykehus 2 Enterokokker Gram positive
Streptococcus agalactiae. Andreas Radtke overlege Nasjonal referanselaboratorium for gruppe B streptokokker
Streptococcus agalactiae Andreas Radtke overlege Nasjonal referanselaboratorium for gruppe B streptokokker 1 Streptococcus agalactiae S.agalactiae eneste streptokokken som agglutinerer gruppe B antistoffer
Antibiotikabruk og mikrobielle økologiske effekter
Antibiotikabruk og mikrobielle økologiske effekter Ragnhild Raastad Oslo universitetssykehus Disposisjon I. Introduksjon II. a. Hva er økologi? b. Normalflora Antibiotikabruk og resistens a. Internasjonalt
ÅRSRAPPORT fra. Nasjonalt referanselaboratorium for Streptococcus agalactiae
ÅRSRAPPORT 2012 fra Nasjonalt referanselaboratorium for Streptococcus agalactiae Avdeling for medisinsk mikrobiologi, St. Olavs Hospital Besøksadresse: Erling Skjalgsons gate 1 Postadresse: St. Olavs Hospital,
MOLEKYLÆR EPIDEMIOLOGI
MOLEKYLÆR EPIDEMIOLOGI Mikrobiologiske metoder for undersøkelse av utbrudd av infeksjonssykdommer Kåre Bergh Avdeling for mikrobiologi, St.Olavs Hospital Institutt for laboratoriemedisin, barne- og kvinnesykdommer,
Laboratoriemedisinsk klinikk Avdeling for medisinsk mikrobiologi ÅRSRAPPORT fra. Nasjonalt referanselaboratorium for Streptococcus agalactiae
Laboratoriemedisinsk klinikk Avdeling for medisinsk mikrobiologi ÅRSRAPPORT 2013 fra Nasjonalt referanselaboratorium for Streptococcus agalactiae Postadresse: St. Olavs Hospital HF, Sentral stab, Fagavdelingen,
ÅRSRAPPORT fra. Nasjonalt referanselaboratorium for Streptococcus agalactiae
ÅRSRAPPORT 2011 fra Nasjonalt referanselaboratorium for Streptococcus agalactiae Avdeling for medisinsk mikrobiologi, St. Olavs Hospital Besøksadresse: Erling Skjalgsons gate 1 Postadresse: St. Olavs Hospital,
Bruk av DNA-sekvensering i mikrobiologisk diagnostikk. Øyvind Kommedal Haukeland Universitetssykehus
Bruk av DNA-sekvensering i mikrobiologisk diagnostikk Øyvind Kommedal Haukeland Universitetssykehus Hvordan sekvensering revolusjonerte mikrobiologien Bakterienes morfologi Fenotypisk identifikasjon Fylogentisk
Tuberkulose, bruk av nye metoder i smitteoppsporing. Trude Margrete Arnesen, FHI Smitteverndagene
Tuberkulose, bruk av nye metoder i smitteoppsporing Trude Margrete Arnesen, FHI Smitteverndagene 2019 1405-14.30 Kort om tuberkulose, smitteoppsporing, molekylærepidemiologiske metoder -hva er nytt? Kort
Allmennmedisin i modul 1 våren 2017 Blokk 1: Statistikk, helse, biologi og samfunn ( 9. januar - 9. mars)
Allmennmedisin i modul 1 våren 2017 Blokk 1: Statistikk, helse, biologi og samfunn ( 9. januar - 9. mars) UndervisningsformTema dag dato tid Allmennmed. lærer Samarbeid Koord. Fastlegens oppgaver Man 09.jan
Anthrax, beredskap, varsling, erfaringer m.m.
Anthrax, beredskap, varsling, erfaringer m.m. Ingeborg S. Aaberge Avdeling for bakteriologi og infeksjonsimmunologi Nasjonalt folkehelseinstitutt Beredskapskonferanse 2009 Bacillus anthracis Årsak til
Brukerundersøkelsen 2015
Brukerundersøkelsen 15 Brukerundersøkelsen 15 Gjennomført mai/juni 15 NORM-ansvarlig lege og bioingeniør v/ 22 medisinsk mikrobiologiske laboratorier i Norge ble invitert til å delta spørsmål i Questback-format
Strategimøte nr 14, 2000: STAFYLOKOKKER
Strategimøte nr 14, 2000: STAFYLOKOKKER Rapport fra strategimøte nr 14 Avdeling for bakteriologi Statens institutt for folkehelse, 2000 EKSTERNE KVALITETSVURDERINGER I BAKTERIOLOGI, MYKOLOGI OG PARASITTOLOGI
VRE-utbrudd ved St.Olavs Hospital Vancomycinresistente enterokokker. Smittevern St. Olavs Hospital HF
VRE-utbrudd ved St.Olavs Hospital Vancomycinresistente enterokokker Marthe Lind Kroknes Spesialbioingeniør Andreas Radtke Smittevernlege Smittevern St. Olavs Hospital HF Enterokokker Enterokokker er i
C. DIFF QUIK CHEK COMPLETE. Få hele det diagnostiske bildet med bare én test. TRYKK HER FOR Å SE NESTE SIDE
C. DIFF QUIK CHEK COMPLETE Få hele det diagnostiske bildet med bare én test. TRYKK HER FOR Å SE SIDE KLINIKER Vil anvendelige C. difficiletestresultater på under 30 minutter bedre pasientbehandlingen?
AVL MOT ILA. FHFs ILA workshop Borghild Hillestad April 2017
AVL MOT ILA FHFs ILA workshop Borghild Hillestad April 2017 HVA BOR I GENOMET TIL EN ART? Det genetiske mangfoldet hos en art kan være enormt MENNESKER KAN STYRE GENETIKKEN I FLERE RETNINGER En negativ
Forskningsprosjekter på Sørlandet sykehus HF. Unn Ljøstad og Åslaug R. Lorentzen Nevrologisk avdeling
Forskningsprosjekter på Sørlandet sykehus HF Unn Ljøstad og Åslaug R. Lorentzen Nevrologisk avdeling ÅPENT MØTE OM DIAGNOSTIKK AV LYME BORRELIOSE 16.NOVEMBER 2013 Sørlandet sykehus har forsket på Epidemiologi
MRSA referanselaboratorium 2008
Oppsummering 2008 var første året Nasjonalt referanselaboratorium for MRSA, St. Olavs Hospital, Trondheim, systematisk og fortløpende fikk tilsendt isolater fra nyoppdagede MRSA positive personer fra alle
MRSA. Antibiotikaresistens i husdyrbruket, Gardermoen 27.-28. mai 2015
MRSA Antibiotikaresistens i husdyrbruket, Gardermoen 27.-28. mai 2015 Carl Andreas Grøntvedt, Dipl. ECPHM Svinehelseansvarlig Veterinærinstituttet Postboks 750 Sentrum 0106 Oslo Tel: 23 21 63 87 Mob: 91
Aminoglykosidresistensi Enterobacteriaceae påvisning og molekylær epidemiologi
Aminoglykosidresistensi Enterobacteriaceae påvisning og molekylær epidemiologi NORM-dagen 10. november 2011 Bjørg C. Haldorsen Innhold Aminoglykosider Aminoglykosidresistens Bakgrunn og formål Materiale
Oppsummering. Aktiviteter. Resultater. MRSA referanselaboratorium 2007
Oppsummering Referanselaboratoriumet har etablert rutinemessig spa-typing på alle isolater tilsendt i 2007 i tillegg til pulsfelt gelelektroforese (PFGE). Undersøkelse i forhold til Panton Valentine Leukocidin
Clostridium Difficile - Meldingsbeskrivelse for kommaseparert filformat
Nasjonalt folkehelseinstitutt IT og ehelse avdelingen Clostridium difficile Clostridium Difficile - Meldingsbeskrivelse for kommaseparert filformat INTRODUKSJON... 2 1.1 OM DOKUMENTET... 2 1.2 AVGRENSNINGER...
Styring av antibiotikabruk i sykehus INGRID SMITH, OVERLEGE/ 1. AMAN. KAS, FOU- AVD, HELSE-BERGEN/ KLIN. INST. 2, UIB
Styring av antibiotikabruk i sykehus INGRID SMITH, OVERLEGE/ 1. AMAN. KAS, FOU- AVD, HELSE-BERGEN/ KLIN. INST. 2, UIB Transplantasjon Prematur Intensiv Kreft Protese Brannskade Antibiotikagrupper norske
Oslo universitetssykehus HF
Oslo universitetssykehus HF Styresak Dato møte: 25. september 2015 Saksbehandler: Viseadm. dir. Medisin Helsefag og utvikling Vedlegg: SAK 59/2015 ANTIBIOTIKARESISTENS VED OSLO UNIVERSITETSSYKEHUS HF Forslag
Oversikt over tidligere nettundervisninger
2012 Oversikt over tidligere nettundervisninger 20.07.12 30.05.12 09.05.11 Enerom, et smitte- og sykdomsforebyggende tiltak i sykehus? Hygienesykepleier Anita Wang Børseth St. Olavs Hospital 18.04.12 Challanges
NGS (Neste Generasjons Sekvensering) i diagnostikk, erfaringer og resultater
NGS (Neste Generasjons Sekvensering) i diagnostikk, erfaringer og resultater Emiel Janssen Seksjonsleder for Kvantitativ og Molekylær Patologi Daglig leder for laboratoriet for molekylær biologi Avdeling
EHEC-situasjonen i Norge smitteverntiltak ved enkelttilfeller og under utbrudd
EHEC-situasjonen i Norge smitteverntiltak ved enkelttilfeller og under utbrudd Katrine Borgen Avdeling for infeksjonsovervåkning Nasjonalt folkehelseinstitutt November 2013 Overvåkning av EHEC og HUS EHEC:
Akutte hendelser innen smittevernet. Oppdage, varsle og oppklare. Systemer for å: Georg Kapperud
Akutte hendelser innen smittevernet Systemer for å: Oppdage, varsle og oppklare Georg Kapperud Hva er en akutt hendelse? Sykdomsutbrudd eller et enkelttilfeller av alvorlig, smittsom sykdom Utbrudd Flere
Aminoglykosidresistens hos Enterobacteriaceae
Aminoglykosidresistens hos Enterobacteriaceae NordicAST workshop 2012 Bjørg Haldorsen K-res Universitetssykehuset Nord-Norge Antibakteriell virkningsmekanisme Yttermembranen Erstatter Mg 2+ and Ca 2+ som
Bærerskap av ESBL blant Tromsøs befolkning
Bærerskap av ESBL blant Tromsøs befolkning Samt bærerskap av Klebsiella pneumoniae Masterprosjekt 2015-2017 Lotte Leonore Eivindsdatter Andreassen UiT(IMB)/UNN (K-res) Begrepsavklaring β-laktamase = enzym
Pasientnær testing av infeksjonssykdommer
Pasientnær testing av infeksjonssykdommer André Ingebretsen Avdeling for mikrobiologi og Avdeling for smittevern Oslo universitetssykehus Avdeling for smittevern, OUS Kompetansesenter for smittevern i
Antibiotikaresistens. Kristin Stenhaug Kilhus Mikrobiologisk avdeling Haukeland Universitetssykehus
Antibiotikaresistens Kristin Stenhaug Kilhus Mikrobiologisk avdeling Haukeland Universitetssykehus Hva er antibiotikaresistens? Antibiotikaresistens En mikrobes evne til å motstå virkningen av antibiotika
Muligheter og begrensninger med genotypisk påvisning av resistens DAGENS ARBEIDSFLYT. Whole genome sequencing (WGS) 19.11.2014
Muligheter og begrensninger med genotypisk påvisning av resistens TØ-28244 Antibakterielle resistensmekanismer, metoder for påvisning, tolkning og klinisk betydning Tromsø, 20.11.14 Arnfinn Sundsfjord
Antibiotikaresistens - forekomst, konsekvenser og utfordringer. Regionsmøte Helse Vest, mai 2019 Petter Elstrøm Folkehelseinstituttet
Antibiotikaresistens - forekomst, konsekvenser og utfordringer Regionsmøte Helse Vest, mai 2019 Petter Elstrøm Folkehelseinstituttet Disposisjon Forbruk av antibiotika Forekomst av resistente bakterier
Nøyaktig og presis? Er vi skikket til å utføre resistensbestemmelse? Årlig kvalitetskontroll av bioingeniører.
Nøyaktig og presis? Er vi skikket til å utføre resistensbestemmelse? Årlig kvalitetskontroll av bioingeniører. Astrid Lia Fagansvarlig for resistensbestemmelse Mikrobiologisk avdeling, Sykehuset i Vestfold
Klinisk molekylærmedisin (4): Indirekte diagnostikk ved koblingsanalyser
PEDENDO_SISTE_slutt.qxd 18.12.2003 21:34 Side 32 Pediatrisk Endokrinologi 2003;17: 34-38 Klinisk molekylærmedisin (4): Indirekte diagnostikk ved koblingsanalyser Pål Rasmus Njølstad 1,2,3,Jørn V. Sagen
ÅRSRAPPORT for 2013 fra
ÅRSRAPPORT for 2013 fra Nasjonalt referanselaboratorium for MRSA Avdeling for medisinsk mikrobiologi, St. Olavs Hospital Besøksadresse: Erling Skjalgssons gate 1 Postadresse: St. Olavs Hospital, 7006 Trondheim
Enerom, et smitte- og sykdomsforebyggende tiltak i sykehus?
Enerom, et smitte- og sykdomsforebyggende tiltak i sykehus? - En deskriptiv retrospektiv epidemiologisk studie Master of Public Health (Godkjent NHV 23. September 2011) Anita Wang Børseth Regional smittevernrådgiver
LA-MRSA. Estimert at over 60% av kommende menneskepatogene bakterier stammer fra dyr. Cutler, Emerging Infect Dis 2010 NATURE VOL 499 25 JULY 2013
LA-MRSA NATURE VOL 499 25 JULY 2013 Estimert at over 60% av kommende menneskepatogene bakterier stammer fra dyr 1 Cutler, Emerging Infect Dis 2010 LA-MRSA S.aureus med meca/ mecc gen nytt penicillinbindende
Visjonene bakteriologi / genteknologi
NFMM Fagmøte 29.01.09 Medisinsk mikrobiologi - et fag nær undergangen? Visjonene bakteriologi / genteknologi Kåre Bergh NTNU / DMF ; St.Olavs Hospital, AMM For de med anlegg for å se mørkt på perspektivene:
Nasjonalt referanselaboratorium for humant papillomavirus (HPV)
Nasjonalt referanselaboratorium for humant papillomavirus (HPV) Seksjon for forskning og utvikling, Avdeling for mikrobiologi og smittevern, 1478 Lørenskog Årsrapport 2013 HPV referansefunksjonen er organisert
Antibiotikaresistens Hva er det, og hvorfor angår det sykehjemmene?
Antibiotikaresistens Hva er det, og hvorfor angår det sykehjemmene? Overlege Ragnhild Raastad Regionalt kompetansesenter for smittevern HSØ Disposisjon Hva er antibiotikaresistens? Hvordan oppstår det?
Mikrobiologisk prøvetakning hva og hvordan
Mikrobiologisk prøvetakning hva og hvordan Karianne Wiger Gammelsrud Overlege, PhD Avd. for mikrobiologi, Oslo Universitetssykehus Smitteverndagen Diakonhjemmet 25.09.18 Disposisjon Brukerhåndbok Rekvisisjonen
ESBL. Anna Senske Lege Avdeling for smittevern 19. 20 og 27. april 2016
ESBL Anna Senske Lege Avdeling for smittevern 19. 20 og 27. april 2016 April 2016 Inndeling Hva er ESBL? Forekomsten av ESBL ESBL-spredning ESBL-bærerskap Betydning av ESBL på sykehuset Terapi og sanering
2.8 BACHELORGRADSPROGRAM I BIOMATEMATIKK
2.8 BACHELORGRADSPROGRAM I BIOMATEMATIKK SIDE 111 2.8 BACHELORGRADSPROGRAM I BIOMATEMATIKK 2.8.1 INNLEDNING Dette er et treårig studieprogram med emner fra matematikk,, biologi og medisin. Programmet er
Har vi resistensproblemer i medisinsk mykologi i Norge?
1 Har vi resistensproblemer i medisinsk mykologi i Norge? Årskonferansen 01.12.2016 Cecilie Torp Andersen overlege Avdeling for mikrobiologi OUS Soppinfeksjoner og antimykotika Overfladiske infeksjoner
Akvatisk smitteovervåkning med miljø-dna
Akvatisk smitteovervåkning med miljø-dna edna sporing av Gyrodactylus salaris edna overvåkning av Aphanomyces astaci - krepsepest Trude Vrålstad Forskningsgruppe Fiskehelse Haakon Hansen Trude Vrålstad
Meldingspliktige resistente bakterier og C. difficile
Rapport kvartal 2/2013 Meldingspliktige resistente bakterier og C. difficile Folkehelseinstituttet vil fremover publisere kvartalsvise rapporter om forekomst av infeksjon og bæreskap forårsaket av utvalgte
Undervisning på Dialysen 27/2
Undervisning på Dialysen 27/2 Anaerob sporedannende bakterie Tilhører tykktarmens normalflora hos 5 10 % av oss (50% hos spedbarn, 2 3% hos voksne) Bakterien dør fort utenfor tarmen, men sporene utskilles
Bruk av statistikkfunksjonen i MLx. Overlege Dagfinn Skaare Mikrobiologisk avdeling Sykehuset i Vestfold HF 27.05.2010
Bruk av statistikkfunksjonen i MLx Overlege Dagfinn Skaare Mikrobiologisk avdeling Sykehuset i Vestfold HF 27.05.2010 Agenda Eksempler på bruksområder Utvelging og lagring av data Bearbeiding og presentasjon
Hvordan ser fremtiden ut?
Hvordan ser fremtiden ut? For bioingeniører Fremtiden Bioingeniørjobber i fremtiden (Helse og omsorg 2040) Hva styrer etterspørselen etter bioingeniører? Medisinsk og teknologisk utvikling Vitenskapsåret
Populasjonsgenomikk på torsk -et verktøy for identifisering av viktige genomiske regioner for oppdrettsnæringen.
Programkonferansen HAVBRUK 2012, Stavanger, 16.-18. april 2012 Populasjonsgenomikk på torsk -et verktøy for identifisering av viktige genomiske regioner for oppdrettsnæringen. Paul R. Berga, Bastiaan Stara,
Håndtering av ESBL i sykehjem. Tore W Steen 21.04.2015
Håndtering av ESBL i sykehjem Tore W Steen 21.04.2015 ESBL-holdige bakterier Extended Spectrum BetaLactamase Hovedtyper: - ESBL A(mbler) - ESBL M(iscellaneous) - ESBL CARBA ESBL A, ESBL M resistente mot
Meldingspliktige resistente bakterier og C. difficile
Rapport kvartal 4/2013 Meldingspliktige resistente bakterier og C. difficile Folkehelseinstituttet publiserer kvartalsvise rapporter om forekomst av infeksjon og bæreskap forårsaket av utvalgte resistente
Arabidopsis thaliana, vårskrinneblom
Arabidopsis thaliana, vårskrinneblom Tilhører Brassicaceae familien og ligger under ordenen Capparales. Nært beslektede planter er f. eks. raps og kål. Arabidopsis thaliana har i flere år vært en av modell
ÅRSRAPPORT for 2012. fra. Nasjonalt referanselaboratorium for MRSA
ÅRSRAPPORT for 2012 fra Nasjonalt referanselaboratorium for MRSA Avdeling for medisinsk mikrobiologi, St. Olavs Hospital Besøksadresse: Erling Skjalgssons gate 1 Postadresse: St. Olavs Hospital, 7006 Trondheim
Årsrapport 2006. Nasjonalt referanselaboratorium for MRSA
Årsrapport 00 Nasjonalt referanselaboratorium for MRSA Oppsummering St. Olavs Hospital (StO) ved Avdeling for medisinsk mikrobiologi (AMM), ble høsten 00 oppnevnt som nasjonalt referanselaboratorium for
NFR : Avansert overvåking av introdusert krepsepest (Aphanomyces astaci) for bedre forvaltning av truet ferskvannskreps
NFR-183986 : Avansert overvåking av introdusert krepsepest (Aphanomyces astaci) for bedre forvaltning av truet ferskvannskreps Prosjektleder: Trude Vrålstad Prosjektstipendiat: David Strand Veterinærinstituttet
Antibiotikaresistens og antibiotikapolitikk i kommunene. Andreas Radtke Smittevernoverlege, PhD St.Olavs Hospital
Antibiotikaresistens og antibiotikapolitikk i kommunene Andreas Radtke Smittevernoverlege, PhD St.Olavs Hospital 1 2 Works Progress Administration, 1936 From: Trends in Infectious Disease Mortality in
Spesielle problembakterier begreper, forkortelser og smittevernmessig relevans
Spesielle problembakterier begreper, forkortelser og smittevernmessig relevans Nettundervisning for smittevernpersonell i Helse Sør 15.september 2010 Per Bjark,smittevernlege,Sykehuset i Vestfold, Tønsberg
Nyfødtintensivutbrudd 2016 Helse Stavanger HF. Lars Kåre Kleppe smittevernlege, Stavanger
Nyfødtintensivutbrudd 2016 Helse Stavanger HF Lars Kåre Kleppe smittevernlege, Stavanger Innledning Mellom 300 og 400 barn fødes årlig i Norge som ekstremt premature med vekt under 1000 g og/eller svangerskapsuke
Masterspesialiseriger innen LUN
1 Masterspesialiseriger innen LUN Masterspesialisering i matematikk - anvendt matematikk m/fysikk - anvendt matematikk m/kjemi Masterspesialisering i fysikk - fornybar energifysikk - biologisk fysikk Masterspesialisering
Foredlingsmetoden fra plusstreutvalg og avkomtesting til molekylær genetikk! Øystein Johnsen, Skog og landskap
Foredlingsmetoden fra plusstreutvalg og avkomtesting til molekylær genetikk! Øystein Johnsen, Skog og landskap St.meld. nr. 39; Klimautfordringene Regjeringen mener økt innsats i skogplanteforedlingen
Resistensrapport for Sykehuset Innlandet 2017
Resistensrapport for Sykehuset Innlandet Rapportmalen er utarbeidet av Seksjon for mikrobiologi og smittevern, Akershus universitetssykehus, brukt med tillatelse fra seksjonsoverlege Silje Bakken Jørgensen.
GLYKOPEPTID- RESISTENS HOS ENTEROKOKKER
GLYKOPEPTID- RESISTENS HOS ENTEROKOKKER KRISTIN HEGSTAD INNHOLD Enterokokker Utvikling og spredning av resistens hos enterokokker van cluster spredning Persistens Peptidoglykan oppbygging repetisjon Glykopeptidantibiotika
Legionella dyrkning Daglig (man-lør) 7 dager hvis negativ > 7 dager hvis positiv Listeria dyrkning (fra sterile områder) Daglig (man-lør) 5 dager hvis
Dokumentansvarlig: Eirik Steinland Godkjent av: Terje Aspenes Gyldig for: Avdeling for mikrobiologi og smittevern UNN Dokumentnummer: PB0265 Endringskontroll labhåndbok: Ved endringer i dette dokumentet
RESISTENSPROBLEMATIKK. Pål A. Jenum. september 2015
RESISTENSPROBLEMATIKK Pål A. Jenum september 2015 1 Hva er resistens? Motstandskraft mot ytre påvirkning Mikrober antibiotika desinfeksjonsmidler 2 Hva er naturlig resistens? Iboende egenskaper: Villtype
SCREENING AV VRE OG ESBL
SCREENING AV VRE OG ESBL Laboratoriediagnostikk Anja Hannisdal Kvalitetskoordinator Sykehuset i Vestfold, Mikrobiologisk avdeling Anja Hvorfor screening av VRE? Forekomsten av vankomycinresistente enterokokker
Master. Biologi (BIOL)
UMB, Institutt for plante- og miljøvitenskap Master i Biologi (BIOL) H:studieplaner/2009_2010/MasterBiologi Master Biologi (M-BIOL) Mastergraden er på 120 studiepoeng (sp). 70 sp er obligatoriske for alle,
Resistensrapport for Sykehuset Innlandet 2018
Resistensrapport for Sykehuset Innlandet Rapportmalen er utarbeidet av Seksjon for mikrobiologi og smittevern, Akershus universitetssykehus, brukt med tillatelse fra seksjonsoverlege Silje Bakken Jørgensen.
Overvå kning åv resistente båkterier Årsrapport
Overvå kning åv resistente båkterier Årsrapport 2015 1 Avdeling for infeksjonsovervåking Epost: she@fhi.no www.fhi.no/tema/antibiotikaresistens FHI: Oliver Kacelnik, Elisabeth Astrup, Jørgen V. Bjørnholt
Antibiotikaresistens og resistensmekanismer
Antibiotikaresistens og resistensmekanismer RELIS Fagseminar 290118 Overlege Hege Enger Avd. for medisinsk mikrobiologi St Olavs hospital Disposisjon Introduksjon Hva er antibiotikaresistens? Eksempler
Kap.2 Sentrale begreper og definisjoner 1
Kap.2 Sentrale begreper og definisjoner 1 Sentrale begreper og definisjoner Antibiotikaassosiert diaré colitt forårsaket av antibiotikabehandling, hvor bakterien Clostridium difficile produserer toksiner
Hva mener vi med Emerging. En introduksjon
Fagtreff 28. januar 2008 Hva mener vi med Emerging Pathogens? En introduksjon Øyvin Østensvik Norges veterinærhøgskole Institutt for Mattrygghet og Infeksjonsbiologi Utgangspunkt Vi blir ikke kvitt smittestoffene
Resistensrapport for Sykehuset Innlandet 2016
Resistensrapport for Sykehuset Innlandet Rapportmalen er utarbeidet av Seksjon for mikrobiologi og smittevern, Akershus universitetssykehus, brukt med tillatelse fra seksjonsoverlege Silje Bakken Jørgensen.
PCR-analyser i rutinediagnostikken Pål A. Jenum
PCR-analyser i rutinediagnostikken Pål A. Jenum september 2015 1 Utvikling Antall genmolekylære analyser pr år (unntatt klamydia og gonokokker: Ca 32.000 i 2015) 120000 Stipulert for hele året 100000 80000
Last ned Innføring i mikrobiologi - Arne Tronsmo. Last ned
Last ned Innføring i mikrobiologi - Arne Tronsmo Last ned Forfatter: Arne Tronsmo ISBN: 9788215025926 Antall sider: 383 Format: PDF Filstørrelse:15.01 Mb Endelig kommer en norsk grunnbok i mikrobiologi.
Campylobacteriose et aktuelt problem. Kjetil K. Melby Mikrobiologisk avdeling Oslo universitetssykehus
Campylobacteriose et aktuelt problem Kjetil K. Melby Mikrobiologisk avdeling Oslo universitetssykehus Temaliste Campylobacterjejuni/coli infeksjoner Epidemiologi Enkeltpasienter (Vannbårne) utbrudd (Norge)
Smittevern sett fra veterinærsiden utfordringer framover
Smittevern sett fra veterinærsiden utfordringer framover Nasjonal konferanse om antibiotikaresistens og infeksjoner i helsetjenesten, Gardermoen 11. november 2015 Anne Margrete Urdahl Smittevern hindre
Den nye smittevernutfordringen Candida auris?
Den nye smittevernutfordringen Candida auris? Egil Lingaas Oslo universitetssykehus Genus Candida Omfatter omkring 200 species Minst 30 candida species har vært påvist som årsak til sykdom hos mennesker
Blomster i sykehus, fint eller farlig?
Nettundervisning i smittevern 26. september 2012 Blomster i sykehus, fint eller farlig? En litteraturgjennomgang Egil Lingaas, Liudmyla Fagerbakk og Mylene Rimando Avd. for smittevern Oslo universitetssykehus
Antibiotikaforbruk og resistens Globalt - Nasjonalt - Lokalt. Gunnar Skov Simonsen NORM UNN HF
Antibiotikaforbruk og resistens Globalt - Nasjonalt - Lokalt Gunnar Skov Simonsen NORM UNN HF 2 En kvinne med sepsis etter brannskade i Pakistan Onarheim H, Brekke RL, Leiva RA, Oma DH, Kolstad H, Samuelsen
AFA-kurs 2013 6. November OUS-Rikshospitalet
ESBL A & ESBL M-C AFA-kurs 2013 6. November OUS-Rikshospitalet Ørjan Samuelsen, Forsker Kompetansetjeneste for påvisning av antibiotikaresistens (K-res) Avd. for mikrobiologi og smittevern Universitetssykehuset
LEKSJON 4: BIOTEKNOLOGI HVORDAN VI BRUKER NATURENS EGNE MEKANISMER TIL VÅR FORDEL, OG UTFORDRINGENE SOM FØLGER MED
LEKSJON 4: BIOTEKNOLOGI HVORDAN VI BRUKER NATURENS EGNE MEKANISMER TIL VÅR FORDEL, OG UTFORDRINGENE SOM FØLGER MED KOMPETANSEMÅL Forklarebegrepene krysning og genmodifisering, og hvordan bioteknologi brukes