Hvordan påvirker valg av glattingsfilter PET-avbdildning av små svulster? Eksperimenter og simuleringer



Like dokumenter
Karakterisering av CT rekonstruksjonsfiltre ved måling av halvverdibreddeog

Utvikling av en realistisk gelmodell for kontroll av nøyaktigheten til en ny algoritme for automatisk bestemmelse av svulstoverflate fra PET bilder

Bildekvalitet i Røntgendiagnostikk. Bjørn Helge Østerås Medisinsk Fysiker Bilde og Intervensjonsklinikken Oslo Universitetssykehus, Ullevål

UNIVERSITETET I OSLO

Lyshastighet=30 cm per milliardels sekund

UNIVERSITETET I OSLO

Innledning. Innledning. Skantid,, matrise, bildekvalitet. Skantid. Pixel og Voxel. En enkel sinuskurve. Faseforskyvning

Statuskontroll av Leverandør X, 16 snitts CT skanner, Sykehus X

INF Stikkord over pensum til midtveis 2017 Kristine Baluka Hein

TMA Kræsjkurs i Matlab. Oppgavesett 3 Versjon 1.2

Temaer i dag. Mer om romlig oppløsning. Optisk avbildning. INF 2310 Digital bildebehandling

Sampling av bilder. Romlig oppløsning, eksempler. INF Ukens temaer. Hovedsakelig fra kap. 2.4 i DIP

Gråtonehistogrammer. Histogrammer. Hvordan endre kontrasten i et bilde? INF Hovedsakelig fra kap. 6.3 til 6.6

Temaer i dag. Repetisjon av histogrammer II. Repetisjon av histogrammer I. INF 2310 Digital bildebehandling FORELESNING 5.

Midtveiseksamen Løsningsforslag

Eksamen AA6524 Matematikk 3MX Elevar/Elever AA6526 Matematikk 3MX Privatistar/Privatister. Nynorsk/Bokmål

9. Femords setninger CD2 spor 2 11

Repetisjon av histogrammer

, men det blir svært tungvindt her.) 3 xe3x 1 9 e3x C 1 9 e3x 3x 1 C

Pilkast og kjikvadrat fordelingen

Løsningsforslag. og B =

UNIVERSITETET I OSLO

Eksamensoppgavehefte 1. MAT1012 Matematikk 2: Mer funksjonsteori i en og flere variabler

NORGE. (5i)int. ci. 5 G 01 T 1/164/ 7/00. [B] <u) UTLEGNINGSSKRIFT OD M (") [NO] STYRET FOR DET INDUSTRIELLE RETTSVERN (83)

Flater, kanter og linjer INF Fritz Albregtsen

Midtveiseksamen. INF Digital Bildebehandling

Mer om Histogramprosessering og Convolution/Correlation

GeoGebra-opplæring i Matematikk S2

Alle svar skal grunngis. Alle deloppgaver har lik vekt.

INF februar 2017 Ukens temaer (Kap 3.3 i DIP)

0.1 Kort introduksjon til komplekse tall

LØSNINGSFORSLAG TIL EKSAMEN I MA0001 BRUKERKURS A Tirsdag 14. desember 2010

Statisk magnetfelt. Kristian Reed a, Erlend S. Syrdalen a

Innledning. Skantid, matrise, bildekvalitet. Pixel og Voxel. Innledning. En enkel sinuskurve. Faseforskyvning

NORGES TEKNISK- NATURVITENSKAPELIGE UNIVERSITET Side 1 av 5

Prosjekt 3 - Introduksjon til Vitenskapelige Beregninger

Terningkast. Utfallsrommet S for et terningskast med en vanlig spillterning med 6 sider er veldefinert 1, 2, 3, 4, 5, 6

Prøve i R2 Integrasjonsmetoder

Dataøving 2. TTK5 Kalmanfiltrering og navigasjon Løsningsforslag

1. En tynn stav med lengde L har uniform ladning λ per lengdeenhet. Hvor mye ladning dq er det på en liten lengde dx av staven?

UNIVERSITETET I OSLO

Hurtigtest femords setninger

Individuell skriftlig eksamen. IBI 312- Idrettsbiomekanikk og metoder. Mandag 4. mai 2015 kl Hjelpemidler: kalkulator

3x + 2y 8, 2x + 4y 8.

UNIVERSITETET I OSLO

TMA4105 Matematikk 2 Vår 2014

R2 eksamen høsten 2017 løsningsforslag

HØGSKOLEN I BERGEN Avdeling for Ingeniørutdanning

UNIVERSITETET I OSLO

De større europeiske støvsugerprodusentene har utarbeidet en standard, som beskriver, hvordan de forskjellige egenskapene skal defineres og måles.

Statiske magnetfelt. Thomas Grønli og Lars A. Kristiansen Institutt for fysikk, NTNU, N-7491 Trondheim, Norge 19. mars 2012

UNIVERSITETET I OSLO

Alle svar skal grunngis. Alle deloppgaver har lik vekt.

Automatisk dosemodulering CT

Motivasjon. Litt sett-teori. Eksempel. INF Mesteparten av kap i DIP Morfologiske operasjoner på binære bilder.

NFTR Protokoll 2: CT lunger / HRCT Thorax. Om indikasjoner for protokollen. Generelt Parameter Teknikk Kommentar

BACHELOR I IDRETTSVITENSKAP MED SPESIALISERING I IDRETTSBIOLOGI 2011/2013. Individuell skriftlig eksamen. IBI 312- Idrettsbiomekanikk og metoder

UNIVERSITETET I OSLO

Løsningsforslag til eksamen i TMA4105 matematikk 2,

KONTINUASJONSEKSAMEN TFY4155 ELEKTROMAGNETISME Fredag 11. august 2006 kl

Eksamensoppgave i MA0002 Brukerkurs i matematikk B - LØSNING

Eksamensoppgave i TMA4320 Introduksjon til vitenskapelige beregninger

Indikasjoner. Generelt. CT nevroendokrin tumor. Parameter Teknikk Kommentar. Nevroendokrin tumor.

Filter-egenskaper INF Fritz Albregtsen

L Kan lage ringartefakter J Bedre kollimering av spredt

Generell informasjon om faget er tilgjengelig fra fagets nettside, og for øvinger brukes It s learning. med Kalman-filter og RLS.

EKSAMEN I NUMERISK MATEMATIKK (TMA4215)

INF januar 2017 Ukens temaer (Kap med drypp fra kap. 4. i DIP)

LØSNINGSFORSLAG EKSAMEN TMA4105 MATEMATIKK 2 Lørdag 14. aug 2004

Prøve i Matte 1000 BYFE DAFE 1000 Dato: 03. mars 2016 Hjelpemiddel: Kalkulator og formelark. Alle svar skal grunngis. Alle deloppgaver har lik vekt.

. 2+cos(x) 0 og alle biter som inngår i uttrykket er kontinuerlige. Da blir g kontinuerlig i hele planet.

ST0202 Statistikk for samfunnsvitere

Øving 3. Oppgave 1 (oppvarming med noen enkle oppgaver fra tidligere midtsemesterprøver)

Elektrisk potensial/potensiell energi

Kalmanfilter på svingende pendel

Areal - difflikninger - arbeid Forelesning i Matematikk 1 TMA4100

TMA4100 Matematikk 1 Høst 2014

Seksjon 1.3 Tetthetskurver og normalfordelingen

Galton-brett og sentralgrenseteorem

Oppgaver og fasit til seksjon

Repetisjon av histogrammer. Repetisjon av histogrammer II. Repetisjon av gråtonetransform. Tommelfingerløsning

Løsningsforslag til øving 12

ST0202 Statistikk for samfunnsvitere

UNIVERSITETET I OSLO

EKSAMEN FY1003 ELEKTRISITET OG MAGNETISME Mandag 4. desember 2006 kl

NOTAT. 1 Orientering. 2 Grenseverdier for støy. 3 Målinger

METEOROLOGISKE DATA FOR ÅS 2011

HELDAGSPRØVE. Fredag 9 Mai Løsningsskisse (versjon )

DEL 1 (Uten hjelpemidler, leveres etter 3 timer) 3(a + 1) 4(1 a) (6a 1) = 3a a 6a + 1

Eksamen. Fag: AA6524/AA6526 Matematikk 3MX. Eksamensdato: 7. desember Vidaregåande kurs II / Videregående kurs II

UNIVERSITETET I OSLO

Kapittel 7 - Pipe, trapp og innredning... 3

Medisinsk statistikk Del I høsten 2009:

Eksamen MAT1013 Matematikk 1T Våren 2013

Eksamensoppgave i TMA4320 Introduksjon til vitenskapelige beregninger

Tenk deg at du skal lage figurer av blå og hvite ruter som vist ovenfor.

Kan vi stole på resultater fra «liten N»?

UNIVERSITETET I BERGEN Det matematisk-naturvitenskapelige fakultet. Obligatorisk innlevering 3 i emnet MAT111, høsten 2016

Transkript:

Hvordan påvirker valg av glattingsfilter PET-avbdildning av små svulster? Eksperimenter og simuleringer Arne Skretting 1, Otto Glomset 1, Trond V Bogsrud 1 Seksjon for diagnostikkfysikk Avdeling for nukleærmedisin, Oslo Universitetssykehus Gardermoen. november 009

Problemet Ulike gaussiske glatte-filtre som brukes som en del av Siemens Biograph64 OSEM-rekonstrusjon av PET-bilder har en sterk effekt på SUV-verdier. SUV = standardized uptake value = (Signal fra svulst)/(signal fra en voksel hvor den injiserte aktivitet tenkes uniformt fordelt i kroppen) Hvordan karakterisere signalintensiteten fra små svulster?

Bildedannelse og filtrering kan beskrives som en intensitets-diffusjon og simuleres med en matematisk metode (3D-foldning (convolution)) Rekonstruert bildeintensitet FOR PUNKTKILDE: Mye glatting (høy FWHM) Indre romlig oppløsningsevne for PET skanneren Lite glatting (lav FWHM) Posisjon Glatting med økende bredde på den gaussiske Glattefunsjonen (filteret) representerer økende intensitets diffusjon

Recovery coefficients For voksler midt inne i en struktur med homogent opptak: For små svulster eller strukturer fører intensitetsdiffusjon til at intensiteten flyter markant utover og maksimal intensitet svarer ikke lenger til aktivitetskonsentrasjonen Recovery coefficient = RC(r) (max i aktuell svulst)/(max i meget stor svulst) SUV(r) = konstant*rc(r)

Method I: Lag en kildekonfigurasjon med eksakt kjent aktivitetsfordeling (og aktivitets- konsentrasjon) Et fantom som både inneholder simulerte kuleformede tumorer og en uniform vevsbakgrunn. Idealisert leverfantom laget av PMMA med uforandret tverrsnitt langs lengdeaksen (z-aksen) Alginat gel- svulster langs en tråd.

Metode II: Tillaging av 18 F-gelkuler Former med gjennomgående tråd Kapillærkrefter holder gelen på plass tråd Gel injeksjon Splittes her etter stivning. Radioaktive gel-kuler langs en tråd.

Eksempel: Radioaktive kuler i en radioaktive normal vevs omgivelse ratio 5:1 4 mm 8 mm 10 mm 1 mm 10 mm 10 mm Henter ut det maksimale signalet i eksakt samme posisjoner og analyserer 19 x 19 x 19 voksler rundt disse posisjonene. Resultatparametre: Maksimal signal og dessuten støyen (standardavvik på bildeintensiteten) i et like stort tilgrensende område.

Signal = max(kule)-middelverdi_bakgrunn middelverdi_bakgrunn tumor diameter: 10 mm Signal FWHM filter mm 3.5 mm 5 mm signal 4 iterasjoner 3.07±0.10.4±0.0 1.85±0.04 6 iterasjoner 3.5±0.13.56±0.07 1.97±0.05 8 iterasjoner 3.38±0.15.63±0.08.0±0.05 støy (Det riktige signalet burde være 4.0) støy

For å kunne gjennomføre simuleringer er det nødvendig å karakterisere oppløsningsevne, d v s måle den reelle FWHM for rekonstruksjon med ulike filtre.

) ( r e k r f x y x ) ( x e c x f ) ( ) ( ) ( x x y e konst e dy e k dy r f x p Projeksjon ned på x-aksen: Gaussisk punkt- og linjespredefunksjon

Basis prinsippet: rekonstruerer alltid intensities i områder med endelig vokselstørrelse Målt h/ FWHM Ønsket h/ Hvordan bestemme Gaussfunksjonen?

Omforming til kumulativ funksjon Målt fordeling på tvers av linjekilde Kumulativ fordeling: søyler summert fra venstre

PSF tilnærmet til gaussisk funksjon Enten pixel-grensene går ved svarte eller røde streker vil integralet fra venstre alltid ligge på den kumulative gaussfunksjonen. pixeldimensjon Pixelkoordinat

Probit-plot av en kumulativ fordelng F(x) F(x m +) 50% For Gaussfordeling: FWHM=.35 F(x m -) x m - x m x m + x

Tilpasning Gjør oppslag for å finne cut-off -verdiene v i slik at p(x i <v i )=F(x i ) Hvor x i er koordinat for vokselgrensene. Gauss cutoff value function mm

Hvor stor er den indre oppløsning? total inner FWHM=.35σ filter FWHM total FWHM total FWHM inner FWHM Skjæring med y-aksen svarer til FWHM inner = 4.03 mm filter FWHM filter

Simulert intensitetsdiffusjon Lag en kuleformet tumo med lik intensitet innenfor hver voksel og med voksel størrelse 0.5 mm. Utfør en 3D convolusjon med en gaussfunksjon hvor FWHM er gitt ved: ( FWHM og ( FWHM xy) z) total total 4.04 3.14 FWHM FWHM filter filter Bestem middelverdi over en.5 x.5 x.5 mm voksel i sentrum og for en voksel som har et hjørne som berører sentrum. Sentral voksel Sentral berøringsvoksel

Vokselposisjon relativt objekt Voksel-sideflater Middelverdi A Middelverdi B Denne effekten forsterkes når man går over til en 3D-situasjon.

Simulert intensitetsdiffusjon (kurver) vs eksperimentelle (punkter) resultater: recovery coefficients FWHM= recovery coefficients FWHM=5

FWHM filter =.0 mm SUV max =4. Malign tumor LLL, aksial diameter (CT) = 1.3 cm Legg merke til ulike støynivå i lever FWHM filter = 3.5 mm SUV max =3.3 FWHM filter = 5.0 mm SUV max =.7 (default)

Konklusjoner Den reelle oppløsningsevnen er langt dårligere enn hva leverandøren spesifiserer Stol ikke på SUV for små svulster Dersom svulststørrelsen er kjent kan SUV korrigeres Filteret bør sannsynligvis velges slik at det er smalest i områder med lav bakgrunnsaktivitet (lungene?).