Status spredning av virussjukdommer. Peder A. Jansen

Transkript

1 tatus spredning av virussjukdommer Peder A. Jansen

2 Vil snakke om: Data ykdommer/smitte ILA/ILAV PD/AV Konklusjoner og fremtidige muligheter

3 Data fisk Havbruksregisteret geo-referanser eierskap/konsesjoner Havbruksdata Bestander av oppdrettslaks knyttet til lokalitet jølokaliteter for laksefisk

4 Havbruksdata: laks og regnbueørret i sjø Trend: mer fisk på færre lokaliteter + Enestående tidsserie data + Avgjørende å vite hvor det står fisk til enhver tid -Flytting av fisk er vanskelig å spore # fish holding sites # fish (10 6 ) Biomass (tonnes 5 ) Year

5 Data sykdom Prøvejournal systemet VI: sykdomsdiagnoser knyttet til lokalitet og tid VI referanselaboratorium for fiskesykdommer -> dekker alt for meldepliktige sykdommer som ILA og etter hvert PD

6 Data opparbeidet med GI: sjøavstander

7 ILA: Horisontal smittespredning vs. vertikal smittespredning? Horisontal smitte passiv drift i vann smittekontakt driftsopperasjoner brønnbåter smittebekjempelse ved utslakting av syk/smittet fisk Vertikal smitte stamfisk smolt screening for smittestoff Number of IA outbreaks Year almonid production (1000 tonnes)

8 Kyst.no landets fremste ekspert på Infeksiøs lakseanemi går kraftig ut mot statens måte å håndtere denne sykdommen på. påvist at ILA ikke smitter horisontalt. Det vil si at det ikke er smittefare mellom anleggene. Derfor må regelverket endres.

9 Fordeling av ILA-utbrudd Enlarged area ILA-utbrudd fordelt langs det meste av kysten Tendens til klumping av utbrudd? Enlarged area

10 Modell for spredning av ILA i norsk lakseoppdrett ( ) Antar at et gitt ILA-utbrudd ble infisert fra: infiserte nabolokaliteter driftskontakt med infiserte lokaliteter ukjente kilder Modellerer smitteintensitet fra gitte variable for alle lokaliteter samtidig Beregner effekter ut fra forholdet mellom smittet lokalitet og øvrige i alle smittetidspunkt

11 Andel av total risiko for ILA utbrudd Liten avstand og lokale kontaktnettverk forklarer omtrent 30% av utbruddene horisontal smitte 70% av utbruddene smittet fra ukjente kilder De fleste utbruddene isolert I tid og rom Men, også mindre ansamlinger av utbrudd som tyder på lokal smittespredning

12 Kyst.no Kritisk til analysen Dette studiet er i likhet med tidligere studier mer eller mindre ubrukelig. Man har ikke gått inn på analyser av ILA-virus fra de enkelte utbrudd. tudiet sier med andre ord svært lite om spredning av ILA virus, men også lite om hvilke faktorer som kan utløse ILA i en smittet populasjon. På denne bakgrunn føyer dette studiet seg inn i en rekke av tilsvarende studier som ikke er særlig informative.

13 Genotyping Gruppering ILAV segment 6 G3 G2 G1

14 Resultater ILA utbrudd Lyngstad et al. (2007)

15 Par av ILA lokaliteter med mulig smittekontakt: Matched Outbreaks Months apart <1 1 1 Genogroup G3, G3 G1, G1 G1, G1 G2, G2 G2, G2 G2, G2 Proximity Contact molt upplier -nærhet -drift -smoltopphav < G2, G2 G2, G3 G3, G3 G1, G3 G2, G3 G1, G1 G3, G3 F F F G3, G G1&G3, G G1, G2 F G3, G1 F ummary statistics binomial test N Observed Expected P

16 Konklusjoner Lokal smittespredning horisontal smitte Ikke grunnlag for å hevde at deling av smoltopphav er av betydning

17 ILA Prosjekt ILA sporing

18 Resultater Astafjorden 17 ILA utbrudd ILAV påvist på 9 av 19 risiko-lokaliteter Antatt lavvirulent HPR0 virus på 7 av disse

19 lektskapsvariabel (Avhengig variabel) Binær variabel (1/0) er konstruert på grunnlag av genetisk avstand He genet, og gyldig HPR delesjon He genet

20 Analyse - Logistisk regresjon Assosiasjon mellom slektskap og forklaringsvariablene ble analysert ved hjelp av en logistisk regresjons modell: logit p i β 0 β j ( pi ) = β 0 + β j X ij ~ sannsynlighet for likhet ~ konstantledd ~ stigningstall X ij ~ forklaringsvariabel j

21 Univariat analyse Risikofaktorer (Forklaringsvariabler) Nivå Ulike n=571 Like n=209 p verdi jøavstand (km) Gjennomsnitt < (5%, 95%) (20, 844) (5, 52) σ AIC Dager mellom postitive prøver Gjennomsnitt (5%, 95%) (9, 542) (7, 678) σ Deler driftsoperasjoner < * Deler settefiskleverandør < *

22 ensitivitet for slektskapskriteriet

23 Hva med alle utbrudd (>50%) av ILA som ikke kan forklares med lokal smitte?

24 ILAV HE- & F- genet ILAV HPR0 svært utbredt i sjø Også utbredt i ferskvann tørre genetisk variasjon enn HPR

25 50 40 a Gill samples Kidney samples Organ mix samples Heart samples amples (#) Ct verdier for ILAlokaliteter (a) risikolokaliteter med virulente stammer ILAV (b) og risikolokaliteter med HPR0 ILAV(c). HPR0 subtype høyere verdier => mindre virulent amples (#) Ct-values b Ct-values c 40 amples (#) Ct-values

26 Konklusjoner ILA ILA sprer seg lokalt mellom lokaliteter Lavvirulent HPR0 ILAV svært utbredt HPR0 ILAV kan mutere til høy-virulent HPR ILAV. Fører til sykdomsutbrudd og potensielt videre lokal spredning. HPR0 => HPR sannsynligvis sjeldne hendelser Vertikal smittespredning? ILAV også utbredt i settefisk lektskap mellom chilensk og norsk ILAV

27 PD - AV

28 Analysert med variabel: mittepress a 1 a 3 smittepress = i a 2 xi f( sjøavstand) Utarbeidet ulike varianter: For x i : 1 antall fisk biomasse For sjøavstand: avstand avstand kvadrert

29 annsynlighet for PD utbrudd i fiskeutsett Beste scenario ikke høstsmolt ikke PD i andre lokaliteter innen samme konsesjon Verste scenario høstsmolt PD innen samme konsesjon (kontaktsmitte?)

30 Lokaliteter i Florø-området tudie periode: 2005 Juli 2008 Utbrudd av PD i 13 fiskeutsett 2x

31 Mål: Bidrar strømmodeller til å forklare spredning av PD? Konsentrasjon (ml/l) predning fra Kvitskjer torevik Austneståa Timer To steg: 1. Utvikling av strømmodell for området (ROM) 2. Integrere strømmodellen inn i en modell for spredning av PD Oddane 1 dag 2 dager 3 dager Vågsøya predning fra Kvitskjer Hesteneset Veidesund Marøytåa Ålvora Austneståa Kvitskjer Klavelandet Øyasundet veholmane Dag 3 0:00 torevik korva Konturlinje for konsentrasjoner på 0.2 ml/l x

32 Estimering av vannkontakt, P, fra lokalitet i til lokalitet j 1 Konsentrasjon (ml/l) P = C 1 + C 2 ln (T/A) 0.2 T A Timer

33 Nettverk som representerer vannkontakt mellom alle lokaliteter i området site i site j

34 Forklaringskraft, passiv drift

35 Konklusjon: Vannstrøm forklarer spredning av PD bedre enn fysiske avstander => smitte ved passiv drift av smittestoff André taalstrøm, NIVA

36 Konklusjoner og fremtidige muligheter Våre studier peker på avstand til smitte som viktig risikofaktor passiv drift med mer. Fremover vil vi se utviklingen av simuleringsmodeller som kan teste effekten av tiltak på hyppighet av sykdomsutbrudd eller forekomst av lakselus sonebrakklegging vaksinebeskyttelse Jo bedre data jo bedre modeller. Her har norsk lakseoppdrett et stort konkurransefortrinn! Takk for oppmerksomheten!