Automasjon. Erfaringer med nytt utstyr på bakteriologisk enhet. Jaswinder Sandhu (Bioingeniør, Mikrobiologisk avd.)

Transkript

1 Automasjon Erfaringer med nytt utstyr på bakteriologisk enhet Jaswinder Sandhu (Bioingeniør, Mikrobiologisk avd.)

2 Mikrobiologisk avdeling (SiV) Årsverk 47,8 (2012) Avdelingssjef 1 Avdelingsoverlege 1 Seksjonsleder 1 Kvaliteteskoordinator 1 IKT- koordinator 1,5 Overlege 3 Lege i spesialisering (gr.2) 2 Genteknolog (Dr.scient) 1 Bioingeniør 28 Lab. Assistent 3 Helsesekretær 5,3 Antall undersøkelser (Bakteriologisk) i 2012: (6.7% økning fra 2011 til 2012)

3 Bakteriologisk enhet: Arbeidsflyt Utsed av nye prøver: - 1 bioingeniør utsedplass (Man.- Fre.) - 2 bioingeniører jobber fra kl til (Man.- Fre.) Instrumenter i Bakt. Seksjon: - Skålmerkemaskin (P.O.S 720)(2012) - Innova (Utsedsmaskin)(2011) - MALDI-TOF (ID)( 2011) - VITEK 2 x 2 (IDAST)(2011, 2013) - Bactec FX x 2( 2009) - Previ color Gram (farge maskin) (2011)

4 Bakteriologisk enhet: Arbeidsflyt Feces TB Blodkultur Urin GC Utsædsplass Utsæds instr. MRSA Eksp. Sopp Skål merke instr. PCR Prøve registrering Prøve registrering Vitek2 x2 Kjølerom (reagenser PREVI Color Gram BacTec dagens Kjølerom Inkubator-rom Prøve mottak Kontor prøver) (lager for ferdig registrert MALDI-TOF nye skåler) prøver Møterom Kontor ØNH Puss P Puss I Vaskerom Substrat Kontor Kontor Møterom

5 BD Innova - Utsedsmaskin Utsåing av prøver (bak) - HEPA-filter -Trenger kun strømtilførsel Datadel Karusell for skåler (foran) 5 Skuffer til prøver Elektronikkdel for service

6

7

8 Innova: Skåler før utsed Urin prøve: Blod, MacConkey og CNA Nye skåler

9 Innova: Ferdig sådd ut skåler Ferdig sådd ut Nye skåler

10 Bakteriologisk enhet: Innova (Urin prøver) - Rister, tar av korken, så ut, setter på korken, setter barkodeetikett på skålene - En type prøvebeholder lastes i hver skuff - 5 skuffer som åpnes, lastes og tømmes uavhengig av hverandre. - Plass til 30 skåler i hver stabel (total 6 stabler gir 180 skåler)

11 Bakteriologisk enhet: Innova - Plass til 20 prøver i hver skuff med prøveglass som vi bruker. - Kan kjøre fra 2 til 20 prøver i en skuff. - Bruker ca. 30 min. for å så ut 20 urin prøver (en skuff, og 3 skåler til hver prøve) - Metall øser som brennes av mellom hver skål

12 Bakteriologisk enhet: Innova Koblet Innova med MICLIS vha Epi senter: - Prøveglass (uriner) merkes med Miclis etiketter etter registrering. - Innova leser prøve nr. og henter pasientinformasjon fra Miclis. - Automatisk barkodemerking av skålene

13 Innova: Etikett Navn og f.dato Prøvetype Navn på skål Dato og kl. prøven sådd ut Lab. prøve nr.

14 Innova:Ferdig sådd ut M.Conkey skål

15 Skålmerkemaskin: P.O.S 720

16 Skålmerkemaskin: P.O.S 720 Miclis PC (LIS) Printer Nye skåler POS 720 PC Ferdig merket skåler definert etter arb.plass

17 Skålmerkemaskin: P.O.S stabler ( ca. 40skåler/stabel) Genitalia Puss Feces

18 Skålmerkemaskin: P.O.S 720 Etiketter til buljonger og sjelden brukte skåler

19 Skålmerkemaskin: P.O.S 720 Ferdig merket skåler på utsedsplass

20 P.O.S 720 Etikett Type undersøkelse Navn på buljong/skål Rekvirent kode Pr. nr. og dato pr. sådd ut Pasient navn. og f.dato

21 MALDI-TOF ID av bakterier og gjærsopp

22 MALDI-TOF MALDI (forkortelse av Matrix-assisted laser desorption-ionization TOF (time of flight) Materiale blandes med Matrix for å danne krystaller Ved hjelp av laser i elektrisk felt flytter dannende ioner til detektoren som måler TOF (time of flight).

23 MALDI TOF Process med Matrix Matrix med prøve materiale Posisjon

24 MALDI TOF Process med Matrix Matrix med prøvemateriale Target

25 MALDI-TOF mass spectrometry Matrix assisted laser desorption ionisation - time of flight mass spectrometry Electroden Detector Laser Desorption/Ionisation Time-of-Flight Intensity Modified from: Lottspeich, Zorbas, eds Bioanalytik, Spektrum Akademischer Verlag, 1998 m/z

26 MALDI-TOF MS: Identifikasjon av mikrorganismer MALDI Biotyper arbeidsflyt:? Velg koloni MALDI-TOF Identifikasjon Ukjent Mikrorganism Forbredelse av MALDI target plate Tid for å analysere 1prøve: ~ 10 min

27 MALDI-TOF: MST plate Applisering av prøve

28 MALDI-TOF MST Plate

29 MALDI-TOF: UTSKRIFT

30 Bakteriologisk enhet: MALDI-TOF Blodkultur: - Identifikasjon av vanlig GNST samme dag (etter 4-5t) og andre bakterier etter timer Feces: - Campylobakter Jejuni: MALDI-TOF fra CCDA skål - Yersinia: MALDI-TOF fra CIN skål og Agglutinasjon - Salmonella: Hajna forgjæring, MALDI-TOF, Agglutinasjon - Shigella: Ikke i database. Svar kommer ut som ECOLI Andre prøvetyper: - Identifikasjon av gjærsopp, aerobe, anaerobe bakterier etter 18-24t

31 Bakteriologisk enhet: MALDI-TOF Begrensninger av MALDI-TOF Shigella Streptococcus pneumoniae Stenotrophomonas maltophila Acinetobacter baumanii-calcoaceticus complex Enterobacter cloacae Pseudomonas putida Bordetella pertussis Achromobacter

32 SiV HF Bakt. enhet automasjon Automatisk overføring av resultater til MICLIS Innova urin VITEK 2 ID (alle ) AST (urin prøver) Skål merking(pos 720) Puss, ØNH, Fæces, Genitalia Besvares manuelt MALDI-TOF til Identifikasjon BacTec Positive Blodkultur flasker PREVI color Gram Negative besvares automatisk vha EPI senter Automatisk overføring av negative resultater til MICLIS

33 Poster Validering av MALDI-TOF (SiV, Tønsberg) "Rask og pålitelig identifikasjon av bakterier og gjærsopp

34