NOTAT Til Leverandører og IT-personell Fra Annebeth Askevold, KITH Dato 15.09.2004 Tema Eksempelmeldinger på mikrobiologisvar Eksempler på mikrobiologi Notatet inneholder noen eksempler på mikrobiologisvar, og hvordan disse eksemplene representeres i XML-meldingen. Eksemplene forutsetter versjon 1.1 av svarmeldingen (svar-v11.xsd). 1. Testcase For at mottager skal kunne avgjøre hvilke data som hører til resistensbestemmelse på en enkel måte er det lagt inn type tekstsvar med kodeverdi LR for alt som skal i svardelen. Resistensbestemmelser ligger sortert under den enkelte bakterie, men type tekstsvar har kodeverdi RSB (Resistensbestemmelse). Dette er gjort for at mottager skal kunne sortere ut resistensbestemmelsene for å kunne presentere disse i en tabell. Spørsmål fra KITH: Tieto Enator bruker betegelsen Stamme A, B, C etc. Steria benytter Identifikasjon 1, 2, 3 etc. Bør dette navngis individuelt eller kan man enes om en felles betegnelse? I eksemplene er det benyttet Identifikasjon, og de har fått nummer eller bokstav etter seg når de er fulgt videre med resistensbestemmelse. Mulig at dette bør løses på en annen måte. Når vi har fått svar/synspunkter fra dere vil vi ta dette opp med primærlegeleverandørene også. Spørsmål fra KITH: Vi har vi kalt undersøkelsen funn når det ikke gjøres dyrkning videre - dette kan endres hvis ønskelig. Spørsmål fra KITH: Vi er usikre på plasseringen av kommentarer om S=Sensitiv, I=, R=... Vi har foreløpig plassert den på første forekomst av resistensbestemmelse. Vi må ha en gjennomgang sammen med primærlegeleverandørene i forhold til hvordan svarene skal tolkes. 1.1. Case 1 Besvarelse av bakt. Us, enkel resistenspakke 1.1.1.1 Tjeneste 1.1.1.1.1 Mikrobiologi 1.1.1.2 Pasient Roland Gndersen Fødselsnummer: 150765 00565 1
Adresse: Åssiden 31 3008 Drammen 1.1.1.3 Rekvirent Navn legesenter: Kattskinnet legesenter Organisasjonsnr: 971 318 864 Navn fastlege: August September HPR-nr: 009144897 HER-id: 369.767 E-postadresse: katskin@noline.no 1.1.1.4 Tjenesteyter: Haukeland Universitetssykehus Org. nr: 974744570 Lokal prøveid: 20040515-#1-MBIO-Urin tatt dato: 15.05.2004 mottatt dato: 15.05.2004 Type materiale: Urin 1.1.1.4.1 Status: Endelig Kommentar til hele svarrapporten: Alle undersøkelser på denne prøven er nå besvart Undersøkelse Svar Kommentar Svardato Urin dyrkning Vekst Vekst av mer enn en bakterie indikerer mulig forurensning Identifikasjon #A Stamme A: 18.05.2004 Enterococcus Faecalis Mengde > 100 000 / ml Ampicillin S Doxycyclin S Nitrofurantoin S Identifikasjon Alfahemolytiske 18.05.2004 streptokokker Mengde > 100 000 / ml Kommentar: Alle undersøkelsene spesifiseres i henhold til lokale kodeverk såfremt det ikke fines nasjonale kodeverk som undersøkelsen kan oppgis under (f.eks. NPU-kode, Snomed-kode, Norakokode). Lokale kodeverk oppgis med Uspesifisert laboratoriekodeverk med oid=2.16.578.1.12.4.1.1.8212 Lokale koder oppgis i attributtet OT (se eksempelmelding) 2
3
Case 2 - Besvarelse av bakt. Us med mange funn, enkel resistens og lokasjon 1.1.1.5 Tjeneste 1.1.1.5.1 Mikrobiologi 1.1.1.6 Pasient Roland Gndersen Fødselsnummer: 150765 00565 Adresse: Åssiden 31 3008 Drammen 1.1.1.7 Rekvirent Navn legesenter: Kattskinnet legesenter Organisasjonsnr: 971 318 864 Navn fastlege: August September HPR-nr: 009144897 HER-id: 369.767 E-postadresse: katskin@noline.no 1.1.1.8 Tjenesteyter: Haukeland Universitetssykehus Org. nr: 974744570 Avdelingsnr. 8500 Lokal prøveid: 20040519-#2-MBIO-sekret tatt dato: 19.05.2004 Type materiale: Sårsekret Anatomiisk lokasjon: Legg 1.1.1.8.1 Status: Endelig Kommentar til hele svarrapporten: Alle undersøkelser på denne prøven er nå besvart Undersøkelse Svar Kommentar Svardato Aerob dyrkning Vekst Identifikasjon Streptococcus Milleri Abscessogen Rikelig vekst 21.05.2004 mikrobe Identifikasjon #A: Stamme A: ASTAPHYLOCOCCUS Rikelig vekst 21.05.2004 AUREUS, BETALAKTAMASEPRODUSERENDE Clindamycin S Erytromycin S Fucidin S Kloksacillin/Diklo S Penicillin G R Identifikasjon BETAHEMOLYTISKE STREPTOKOKKER Gr. B Rikelig vekst 21.05.2004 4
Identifikasjon Pseudomonas Aeruginosa Rikelig vekst 21.05.2004 1.2. Case 3 Bakt. Us, fæcesprøve med flere us. Tjeneste Mikrobiologi Pasient Gry Telokk Fødselsnummer: 12057900499 Adresse: Lungegaardsbakken 13 5020 Bergen 1.2.1.1 Rekvirent Navn legesenter: Kattskinnet legesenter Organisasjonsnr: 971 318 864 Navn fastlege: Rita Lin HPR-nr: 009144897 HER-id: 369.767 E-postadresse: katskin@noline.no 1.2.1.2 Tjenesteyter: Lokal prøveid: 20040525-#3-MBIO-Fæces tatt dato: 25.05.2004 mottatt dato: 25.05.2004 Type materiale: Fæces 1.2.1.2.1 Status: Endelig Kommentar til hele svarrapporten: Disse us svares siden: Treponema EIAIg Undersøkelse Svar Kommentar Svardato Ansvarlig Salmonella dyrkning Negativ 29.05.2004 May Blomst Shigella dyrkning Negativ 29.05.2004 May Blomst Camplybakter dyrkning Negativ 29.05.2004 May Blomst Yersina durkning Negativ Rikelig vekst av PROTEUS SPECIES, Uttrykk for forstyrret tarmflora 29.05.2004 May Blomst 5
CL. Difficile Toxin A/B ELISA Positiv Funnet må vurderes opp mot klinikken. Asymptom.bærertilstand av toxin A/B prod.stammer forekommer. 28.05.2004 Inge Lab I dette eksempelet er det oppgitt navn på medisinsk ansvarlig for analyseresultatet. Det er mulig å oppgi mer detaljerte opplysninger for medisinsk ansvarlig hvis dette er ønskelig (stillingsbetegnelse, HPR-nr. etc). 1.3. Case 4- Serologi us. uten parallell Tjeneste 1.3.1.1.1 Mikrobiologi 1.3.1.2 Pasient Roland Gndersen Fødselsnummer: 150765 00565 Adresse: Åssiden 31 3008 Drammen 1.3.1.3 Rekvirent Avdeling/Post: Ortopedisk operasjonsavdeling Id: 1000 1.3.1.4 Tjenesteyter: Lokal prøveid: 20040525-#4-MBIO-Serum tatt dato: 25.05.2004 mottatt dato: 25.05.2004 Type materiale: Serum Kommentar: Kopi, n er innsendt av ort.- sengepost A2, 1.3.1.4.1 Status: Endelig Kommentar til hele svarrapporten: Disse us svares siden: Treponema EIAIg Undersøkelse Svar Kommentar Svardato Utførende Hepatitt B S - antigen Negativ 29.05.2004 May Blomst Hepatitt Bcore antistoff Negativ 29.05.2004 May Blomst total Hepatitt B S - antistoff Negativ 29.05.2004 May Blomst Hepatitt C - antistoff Negativ 29.05.2004 May Blomst 6
Cytomegalovirus IgM - ELISA Cytomegalovirus IgG - ELISA Negativ Positiv Tidligere gjennomgått infeksjon 31.05.2004 Inge Lab 31.05.2004 Inge Lab I dette eksempelet er det oppgitt navn på medisinsk ansvarlig for analyseresultatet. Det er mulig å oppgi mer detaljerte opplysninger for medisinsk ansvarlig hvis dette er ønskelig (stillingsbetegnelse, HPR-nr. etc). 1.4. Case 5 Bakt us, enkel besvarelse urindyrkning 1.4.1.1 Tjeneste 1.4.1.1.1 Mikrobiologi 1.4.1.2 Pasient Gry Telokk Fødselsnummer: 12057900499 Adresse: Lungegaardsbakken 13 5020 Bergen 1.4.1.3 Rekvirent Avdeling: Kirurgisk sengepost A4 Avdelingsnr (lokal): 1000 1.4.1.4 Tjenesteyter: Lokal prøveid: 20040612-#3-MBIO-Urin tatt dato: 12.06.2004 mottatt dato: 12.06.2004 Type materiale: Urin 1.4.1.4.1 Status: Endelig Kommentar til hele svarrapporten: Alle undersøkelser på denne prøven er nå besvart Undersøkelse Svar Kommentar Svardato Ansvarlig Urin dyrkning Ingen vekst 14.06.2004 May Blomst 7
1.5. Case 6 - Besvarelse av bakt. Us, Urinprøve, 2 mikrober, kommentarer på prøve, til rekvirent, og på prøvemateriale Tjeneste Mikrobiologi Pasient Test Test Fødselsnummer: 000000 0test Adresse: Gimleveien 44 5052 Bergen Rekvirent Navn legesenter: Kir. avd. Post 1V Organisasjonsnr: 0001010 Navn lege: Asbjørn Digranes HPR-nr: 2077132 HER-id: 369.767 E-postadresse: Kopi til Navn Legesenter: Legesenteret i Loddefjord Organisasjonsnr. 8000182 Navn Lege: Gaute Christensen HPS-nr: 2157985 Tjenesteyter: Haukeland Universitetssykehus Org. nr: 974744570 Avdeling: Avd. for mikrobiologi og immunologi Seksjon: Bakteriologisk Seksjon Rekvisisjonsnummer: 1104178 Lokal prøveid: 1104178 1 tatt dato/kl: 13.07.2004, 11:30 mottatt dato: 14.07.2004 Type materiale: Urin Status: Endelig kommentar til rekvirenten: Til vanlig bakt.us. av urin bruk borsyreglass/dyppekultur. Undersøkelse Svar Kommentar Dato/MVAL Dyrkning: Aerobt: Vekst 14.07.04/OKOM Identifikasjon #1 Escherichia coli 14.07.04/OKOM Mengde > 100 000 / ml 14.07.04/OKOM Ampicillin S 14.07.04/OKOM Mecillinam S 14.07.04/OKOM 8
Trimetoprim S 14.07.04/OKOM Trimetoprim sulfa R 14.07.04/OKOM Nitrofurantoin S 14.07.04/OKOM Identifikasjon #2 Klebsiella pneumoniae 14.07.04/OKOM Mengde > 100 000 / ml 14.07.04/OKOM Ampicillin R 14.07.04/OKOM Mecillinam R 14.07.04/OKOM Trimetoprim S 14.07.04/OKOM Trimetoprim sulfa S 14.07.04/OKOM Nitrofurantoin S 14.07.04/OKOM Kommentar til prøven Alle I tillegg oppvekst av andre mikrober i mindre mengde. Disse oppfattes som forurensing. Dette er kommentar som gjelder hele prøven. 14.07.04/OKOM Kommentar: Analysen Mengde er akkreditert. Dato/MVAL er dato for når analysen er medisinsk validert, samt opplysninger om personen som har medisinsk validert analysen. 2. Eksempelmeldinger testcase 2.1. Filnavn på eksempelmeldinger #1-MBIO-Bakt-us-enkel resistenspakke.xml #2-MBIO-Bakt-us-mangeFunn-enkelResistens-Lokasjon.xml #3-MBIO-Bakt-us-fæsesprøve-flere-us.xml #4-MBIO-serologi-us-uten-parallell.xml #5-MBIO-Bakt-us-enkelBesvarelse-urindyrkning.xml #6-MBIO-Bakt-us-urin-toMikrober-dobbelResistens-kommentarer-klinsikeOppl.xml 9