Årsrapport Kompetansesenter for påvisning av antibiotikaresistens Påvisning av antibiotikaresistens

Transkript

1 Årsrapport Kompetansesenter for påvisning av antibiotikaresistens Påvisning av antibiotikaresistens BESKRIVELSE Nasjonal kompetansetjeneste innen fenotypiske og molekylære analyser for påvisning og karakterisering av antibiotikaresistente bakterier. Referansefunksjon for norske mikrobiologiske avdelinger. BESKRIVELSE AV AKTIVITETEN I 2011 Kompetansesenteret (K-res) er en egen seksjon ved Avdeling for mikrobiologi og smittevern, UNN. K-res har siden oppstart i hatt fokus på nasjonal nettverksbygging og kompetansesperedning i forståelse med vårt oppdrag og tilbakemeldinger fra årlige evalueringsmøter med referansegruppen. Kompetansespredningen er primært rettet mot norske diagnostiske mikrobiologiske laboratorier (spesialisthelsetjenesten) gjennom et tett metodesamarbeid med Arbeidsgruppen for antibiotikaspørsmål (AFA)/Helsedirektoratet (Hdir) og etablering av nasjonale faglige retningslinjer, nasjonale nettverksstudier og publikasjoner med Norsk overvåkning av resistente mikrober (NORM)/Folkehelseinstituttet (FHI), samt ansvar for og deltakelse i nasjonale kurs for leger og bioingeniører, egne nyhetsbrev/webside, medforfatterskap i nasjonale antibiotikaveiledere, hospitering og veiledning av bioingeniører, leger under spesialisering og doktorgradskandidater i egen og andre helseregioner. K-res har følgende hovedoppgaver: (i) Påvisning og karakterisering av antibiotikaresistente bakterier som en referansefunksjon for norske mikrobiologiske avdelinger. (ii) Nasjonal kompetansespredning, kurs- og formidlingsvirksomhet om antibiotikaresistens. (iii) Forskning på et høyt internasjonalt nivå på utvalgte områder og i samarbeid med andre regionale fagmiljøer. AKTIVITET Referansefunksjon: Prøvevolum i 2011 (n=353) har økt siden 2010 (n=257), noe som hovedsakelig skyldes en økning i Gram-negative bakterier med spesielle resistensmekanismer, men også vankomycinresistente enterokokker og andre sporadiske resistensproblemer. 2. Nasjonal kompetansespredning gjennom: (a) Individuelle svar på referanseundersøkelser med tolkning og henvisning til relevant litteratur (n=353). (b) Egne elektroniske nyhets- /informasjonsskriv (n=13) med ~175 abonnenter nasjonalt. (c) Egne websider ( (d) Foredrag på nasjonale konferanser. (e) Prosjektsamarbeid med norske laboratorier i nasjonale nettverksstudier og veiledning av doktorgradskandidater (Helse Vest, n=1/sørøst n=3). (f) Medarrangør av AFAs nasjonale kurs i resistensbestemmelse for norske laboratorier. (g) Sekretæriatsfunksjon for ivaretakelse av AFAs hjemmesider. (h) Vertskap for hospitering av bioingeniører, leger og forskere fra andre laboratorier. (i) Levering av kontroll/referansestammer for resistensbestemmelse til norske laboratorium også gjennom Ringtester utsendt av FHI. (j) Molekylære epidemiologiske analyser og skriftlige innlegg i NORM-rapporten. 3. Kurs og konferanseaktivitet: (i) Medarrangør av nasjonalt teoretisk og praktisk kurs i resistensbestemmelse arrangert av AFA med ca 45 deltakere. (ii) Deltatt i

2 arrangementskomiteen for nordisk resistenskurs (NordicAST) i Gøteborg. (iii) Norsk representant i styret i Nordic Society of Clinical Microbiology and Infectious Disease. 4. Deltakelse i nasjonale arbeidsgrupper og komiteer: Medisinsk faglig leder ved K-res er leder for AFA og medlem av FHIs nasjonale antibiotikakomite. AFA utarbeider nasjonale retningslinjer/metoder for resistensbestemmelse. Flere av disse metodene har vært utarbeidet i nært samarbeid med K-res og basert på K-res initierte metodeevalueringer og forskningsprosjekter. Medlem av vitenskapelig rådgivende råd i Joint Programme Initiative on antimicrobial resistance i EU og har gjennom denne funksjonen dialog med HOD og FHI om norsk rolle og deltakelse. Bioingeniør ved K-res er medlem av rådgivende utvalg i mikrobiologi (Rufmik) i Bioingeniørfaglig institutt, Nito. Videre har K-res ansatte har vært medforfattere i utarbeidelse av nasjonale veiledere for bruk av antibiotika i primær- og spesialisthelsetjenesten. 5. Forskning: Forskningsaktiviteten har hovedfokus på molekylær epidemiologiske studier av klinisk viktige resistensmekanismer og evaluering/utprøving av diagnostiske tester for påvisning av antibiotikaresistens. Det henvises til publikasjonsliste for 2011 som illustrerer vårt nasjonale nettverk og samarbeid med andre helseregioner og pågående forskningsprosjekter med ekstern finansiering (EU, NFR og Helse Nord). Totalt var den vitenskapelige produksjonen meget solid for Referansegruppe: K-res har siden 2002 hatt en faglig referansegruppe med representanter for alle helseregioner. De ga i sitt årlige novembermøte meget tilfredsstillende tilbakemeldinger på K-res faglige aktiviteter. Årsrapporten for 2011 gjennomgås av referansegruppen før den oversendes Departementet via Helse Nord. AKTIVITET OG NØKKELTALL I 2011 Senteret er en kompetansetjeneste i laboratoriemedisin Undervisnings- og informasjonsvirksomhet: Utdanning helsepersonell Etterutdanning av helsepersonell: 37 timer Grunnutdanning av helsepersonell: 4 timer Spesialisthelsetjenesten Infeksjonsforum, Konferanse Media Flere kommentarer i norske medier knyttet til antibiotikaresistente bakterier, Intervjuer/oppslag i media Etablerte kvalitetsverktøy Faglig retningslinje AFAs anbefalte metoder i resistenbestemmelser, samarbeid, 2011 AFAs kliniske brytningspunkter, samarbeid, 2011 Forskningsproduksjon Vitenskapelige artikler Giske C G, Gezelius L, Samuelsen Ø, Warner M, Sundsfjord A, Woodford N A sensitive and specific phenotypic assay for detection of metallo-ß-lactamases and KPC in Klebsiella pneumoniae with the use of meropenem disks supplemented with aminophenylboronic acid, dipicolinic acid and cloxacillin. Clin Microbiol Infect 2011 Apr;17(4):552-6.

3 Vading M, Samuelsen Ø, Haldorsen B, Sundsfjord A S, Giske C G Comparison of disk diffusion, Etest and VITEK2 for detection of carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae with the EUCAST and CLSI breakpoint systems. Clin Microbiol Infect 2011 May;17(5): Werner Guido, Freitas Ana R, Coque Teresa M, Sollid Johanna E, Lester Camilla, Hammerum Anette M, Garcia-Migura Lourdes, Jensen Lars B, Francia Maria V, Witte Wolfgang, Willems R J, Sundsfjord Arnfinn Host range of enterococcal vana plasmids among Gram-positive intestinal bacteria. J Antimicrob Chemother 2011 Feb;66(2): Karah Nabil, Haldorsen Bjørg, Hermansen Nils O, Tveten Yngvar, Ragnhildstveit Eivind, Skutlaberg Dag H, Tofteland Ståle, Sundsfjord Arnfinn, Samuelsen Ørjan Emergence of OXA-carbapenemase- and 16S rrna methylase-producing international clones of Acinetobacter baumannii in Norway. J Med Microbiol 2011 Apr;60(Pt 4): Samuelsen Ørjan, Thilesen Carina M, Heggelund Lars, Vada Anne N, Kümmel Angela, Sundsfjord Arnfinn Identification of NDM-1-producing Enterobacteriaceae in Norway. J Antimicrob Chemother 2011 Mar;66(3): Seki Liliane M, Pereira Polyana S, de Souza Maria da Penha A H, Conceição Magda de S, Marques Elizabeth A, Porto Carlos Oliveira, Colnago Elvira Maria L, Alves Carlene de F M, Gomes Deize, Assef Ana Paula D A Carvalho, Samuelsen Ørjan, Asensi Marise D Molecular epidemiology of KPC-2- producing Klebsiella pneumoniae isolates in Brazil: the predominance of sequence type 437. Diagn Microbiol Infect Dis 2011 Jun;70(2): Tveten Yngvar, Sarjomaa Marjut Anneli, Skaare Dagfinn, Grude Nils, Samuelsen Ørjan [How to stop multiresistant bacteria?]. Tidsskr Nor Laegeforen 2011 Apr;131(7): Johnsen P J, Townsend J P, Bøhn T, Simonsen G S, Sundsfjord A, Nielsen K M Retrospective evidence for a biological cost of vancomycin resistance determinants in the absence of glycopeptide selective pressures. J Antimicrob Chemother 2011 Mar;66(3): Naseer Umaer, Sundsfjord Arnfinn The CTX-M conundrum: dissemination of plasmids and Escherichia coli clones. Microb Drug Resist 2011 Mar;17(1): Epub 2011 jan 31 PMID: Karah Nabil, Haldorsen Bjørg, Hegstad Kristin, Simonsen Gunnar Skov, Sundsfjord Arnfinn, Samuelsen Ørjan. Species identification and molecular characterization of Acinetobacter spp. blood culture isolates from Norway. J Antimicrob Chemother 2011 Apr;66(4): Bjørkeng Eva, Rasmussen Gunlög, Sundsfjord Arnfinn, Sjöberg Lennart, Hegstad Kristin, Söderquist Bo. Clustering of polyclonal VanB-type vancomycin-resistant Enterococcus faecium in a low-endemic area was associated with CC17-genogroup strains harbouring transferable vanb2-tn5382 and prum-like repa containing plasmids with axe-txe plasmid addiction systems. APMIS 2011 Apr;119(4-5): Samuelsen Ø, Toleman M A, Hasseltvedt V, Fuursted K, Leegaard T M, Walsh T R, Sundsfjord A, Giske C G. Molecular characterization of VIM-producing Klebsiella pneumoniae from Scandinavia reveals genetic relatedness with international clonal complexes encoding transferable multidrug resistance. Clin Microbiol Infect 2011 Dec;17(12): Borra Pardha Saradhi, Leiros Hanna-Kirsti S, Ahmad Rafi, Spencer James, Leiros Ingar, Walsh Timothy R, Sundsfjord Arnfinn, Samuelsen Ørjan. Structural and computational investigations of VIM-7: insights into the substrate specificity of VIM metallo-ßlactamases. J Mol Biol 2011 Aug;411(1): Sun J, Sundsfjord A, Song X. Enterococcus faecalis from patients with chronic periodontitis: virulence and antimicrobial resistance traits and determinants. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2011 Jun. Epub 2011 jun 10 Karah Nabil, Giske Christian G, Sundsfjord Arnfinn, Samuelsen Orjan.

4 A Diversity of OXA-Carbapenemases and Class 1 Integrons Among Carbapenem-Resistant Acinetobacter baumannii Clinical Isolates from Sweden Belonging to Different International Clonal Lineages. Microb Drug Resist 2011 Dec;17(4): Andre forskningspublikasjoner Langnes B, Sundsfjord A, Pedersen T The Ω-ε-ζ and axe-txe toxin-antitoxin loci in Enterococcus faecium: expression and regulation studies. 4th FEMS Congress of European Microbiologists, Geneva, Switzerland Sivertsen A, Lundblad EW, Wisell KT, Liljequist B, Billström H, Ullberg M, Heimer D, Sjögren I, Aasnæs B, Sundsfjord A, Hegstad K. The widespread VRE outbreak in Swedish hospitals was associated with clonal E. faecium CC17 genogroup strains harbouring 21st European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases/27th International Congress of Pedersen T, Langnes B, Hegstad K, Rosvoll TC, Aasnæs A, Hammerum AM, Lester C, Simonsen GS, Sundsfjord A. Increased prevalence of high-level gentamicin resistance in invasive Enterococcus faecium strains in Norway is associated with h 21st European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases/27th International Congress of Karah N, Smyth R, Haldorsen B, Sundsfjord A, Samuelsen Ø. Comparison of Vitek2, BD Phoenix, and MALDI-TOF for the identification of Acinetobacter species. 21st European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases/27th International Congress of Haldorsen B, Hegstad K, Simonsen GS, Sundsfjord A, Samuelsen Ø Phenotypic and genotypic characterisation of aminoglycoside resistance in Norwegian clinical isolates of Escherichia coli and Klebsiella spp. 21st European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases/27th International Congress of Karah N, Giske C, Sundsfjord A, Samuelsen Ø. OXA-carbapenemase-producing multidrug-resistant Acinetobacter baumannii isolates from Sweden. 21st European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases/27th International Congress of Wolden R, Haldorsen B, Sundsfjord A, Samuelsen Ø. Evaluation of ROSCO disks for the detection of increased AmpC expression in Escherichia coli. 28th Annual meeting of the Scandinavian Society for Antimicrobial Chemotherapy, Reykjavik, Iceland Haldorsen B, Hegstad K, Simonsen GS, Sundsfjord A, Samuelsen Ø. The first report of the 16S rrna methylases rmtb and rmtd in clinical Gram-negative bacteria in Norway. 28th Annual meeting of the Scandinavian Society for Antimicrobial Chemotherapy, Reykjavik, Iceland Saule M, Samuelsen Ø, Dumpis U, Sundsfjord A, Karlsone A, Balode A, Miklasevics E, Karah N. Molecular epidemiology of invasive carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii isolates from Latvia. 51st Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Chigago, USA Doktorgrader Nabil Karah. Identification, molecular epidemiology, and antibiotic resistance characterization of Acinetobacter spp. clinical isolates Disputert: September 2011 Hovedveileder: Ørjan Samuelsen

5 Forskningsprosjekter Ørjan Samuelsen og Arnfinn Sundsfjord, UNN HF Investigation of treatment options for infections caused by multidrug-resistent β-lactamaseproducing Enterobacteriaceae. Prosjektperiode: Arnfinn Sundsfjord og Knut Øymar, Nasjonal institusjon Multiresistent Klebsiella pneumoniae hos nyfødte. Prosjektperiode: Deltakende helseregion: HV HN Pål Jenum, Nasjonal institusjon Extended spectrum β-lactamases - carriage, environmental dissemination and population epidemiology. Prosjektperiode: HSØ Dagfinn Skaare, Nasjonal institusjon Nedsatt følsomhet for ampicillin hos Haemophilus influenzae - mekanismer, påvisning og moleklær epidemiologi. Prosjektperiode: HSØ Torunn Pedersen og Arnfinn Sundsfjord, UNN HF Toksin-antitoksin systemer som stabiliserer resistensplasmider Prosjektperiode: Arnfinn Sundsfjord og Ørjan Samuelsen, UNN HF Påvisning av og mekanismer for nedsatt følsomhet for oxyimino-cefalosporiner hos Enterobacteriaceae Prosjektperiode: Deltakende helseregion: HV HN HSØ Johanna E Sollid og Anne Sofie Furberg, Universitetet i Tromsø The Tromsø Skin and Staph Study (TSSS) Prosjektperiode: Ørjan Samuelsen, UNN HF Strukturoppklaring av metallobetalaktamser og utvikling av inhibitorer. Prosjektperiode: Kristin Hegstad og Torunn Pedersen, UNN HF Persistence and spread of vancomycin resistance determinants in Enterococcus faecium in Scandinavia. Prosjektperiode:

6 Kristin Hegstad og Eirik W Lundblad, UNN HF Hemming av bakteriers genuttrykk som antimikrobiall strategi Prosjektperiode: EGENEVALUERING Antibiotikaresistens er definert som et folkehelseproblem globalt og nasjonalt. Mikrobiologisk kompetanse er en forutsetning for korrekt diagnostikk og målrettet smittevern/terapi. K-res har i et mangeårig forsknings- og utviklingsarbeid opparbeidet et høyt internasjonalt nivå dokumentert ved eksterne evalueringer, publikasjoner, eksterne forskningsmidler, ansvar for nasjonale kurs i legers og bioingeniørers videre-/etterutdannelse, og deltakelse i nasjonalt planarbeid (Antibiotikakomiteen/FHI og AFA/Hdir). Samarbeidet med AFA gir grunnlag for nasjonale faglige retningslinjer og metoder. Gjennom nasjonale kurs og studiegrupper, referanseundersøkelser, nyhetsbrev og egne websider, foredrag og vitenskapelige arbeider arbeider K-res systematisk med nasjonal kompetansespredning. Dette er et dynamisk fagfelt som krever kontinuerlig oppdatering jfr foreslåtte endringer i MSIS fra 2012 med meldeplikt for bærerskap/infeksjoner med Gram-negative bakterier med spesielle resistensegenskaper. Vurdering av bemanning Basis bevilgningen fra HOD har i 2011 finansiert 2 teknikerstillinger, 1 PhD-student (tidsbegrenset), 1 forsker (daglig leder) og en 20% overlegestilling (Professor i hovedstilling). Gjennom ekstern finanisering (NFR, Helse Nord og EU) og Universitetsavdelingen har det i 2011 i tillegg vært ansatt 2 prosjektingeniører, 2 PhD, 1 forsker og 2 postdoktorer. Forskningsprosjektene har en god balanse med seniorforskere og yngre kolleger. Rekruttering av fagpersonell har vært tilfredsstillende. FORANKRING Rapporten er forelagt ledelsen ved UNN, ved Avdelingssjef Gunnar Skov Simonsen. Referansegruppen har i 2011 bestått av Trond Jakobsen (Helse Midt-Norge RHF), Tone Tønjum (Annen tilhørighet), Martin Steinbakk (Annen tilhørighet), Gunnar Skov Simonsen (Helse Nord RHF), Ørjan Olsvik (Annen tilhørighet), Dagfinn Skaare (Helse Sør-Øst RHF), Dag Harald Skutlaberg (Helse Vest RHF).