UNIVERSITETET I OSLO Biologisk institutt Grunnkurs i biologi BIO 1000 Informasjon til studentene August 2003
1. Innledning BIO 1000 er et introduksjonsemne i biologi som tar sikte på å gi en innføring i livet på jorda og de prosesser som former (og har formet) dette. De sentrale emnene i BIO 1000 er evolusjon, populasjonsgenetikk, botanikk, zoologi og økologi. Evolusjonsaspektet binder sammen alle de ulike fagområdene som undervises. Likeledes legges det vekt på at studentene skal få innsikt i grunnleggende botanisk og zoologisk systematikk. Forståelse av evolusjon krever en viss innsikt i genetikk. BIO 1000 tar derfor opp de grunnleggende prinsipper i klassisk genetikk og gir en innføring i populasjonsgenetikk. En mer omfattende gjennomgang av genetikken, herunder molekylær genetikk, gis i det påfølgende kurs BIO 1010. Du lærer om hovedgruppene liv på jorda om prinsippene innen mendelsk genetikk om populasjonsgenetikk prinsippene i Darwinistisk evolusjon om opprinnelsen til livet på jorda hvordan evolusjonen frembringer nye arter om populasjonsbiologi om prinsippene innen systematikk om evolusjon og systematikk hos planter om evolusjon og systematikk hos dyr om samspillet i naturen og økologiske prinsipper om biodiversitet om opphavet til det moderne mennesket 2
2. Emneområder Emneområdene følger de enkelte kapitlene i læreboka. Uke 34: Kapittel 14 (Mendel and the Gene idea) s247-260 (human genetikk undervises i BIO 1010) Uke 35: Kapittel 22 (Decent with modifications: a Darwinian view of life) s117-135 Uke 36: Kapittel 23 (The evolution of populations) Uke 37: Kapittel 24 (The origin of species) Uke 38: Kapittel 25 (Phylogeny and systematics) Uke 39: Kapittel 26 (Early earth and the origin of life) Uke 40: Kapittel 27 (Prokaryotes and the origins of metabolic diversity) Uke 41: Kapittel 28 (The origins of eukaryotic diversity) Uke 42: Kapittel 50 (An introduction to ecology and the biosphere) og 52 (Population biology) Uke 43: Kapittel 53 (Community ecology) og 54 (Ecosystems) Uke 44: Kapittel 29 (Plant diversity I: how plants colonized land) Uke 45: Kapittel 30 (Plant diversity II: the evolution of seed plants) Uke 46: Kapittel 31 (Fungi) Uke 47: Kapittel 32 (Introduction to animal evolution) Uke 48: Kapittel 33 (Invertebrates) Uke 49: Kapittel 34 (Vertebrate evolution and diversity) Uke 50: Kapittel 34 (Primates and the evolution of Homo sapiens) Avsluttende eksamen torsdag 18 desember (uke 51) 3
3. Undervisningsformer Klasseundervisning og gruppearbeid er en viktig undervisningsform i dette emnet. Kullet vil bli delt inn i klasser på maksimum 40 stykker ved kursstart. Klassene vil være de samme både i lab, og klasseundervisning - og også ved ekskursjoner i den grad det er behov for det. Innen klassen vil det bli organisert i grupper på ca 6-7 personer. Hver gruppe har en veileder som følger dem gjennom hele kurset. 5-6 grupper vil være i samme klasserom og dele en veileder. Et gruppearbeid går normalt over 2-3 dager. Dere vil få utdelt en oppgave eller et sett med oppgaver hver uke som hører til de ulike emneområdene. Noen oppgaver vil være av typen spørsmål/svar hvor hver og en skal svare på spørsmålene, andre oppgaver er typiske gruppeoppgaver hvor en problemstilling skal formuleres og drøftes. Noen av de innleverte oppgavene vil telle med i karakteren på kurset (vil bli gitt nærmere beskjed om; se også side.. i informasjonsheftet. Det vil også være innlevering av 4-5 eksamensforberedende oppgaver (om tema innen a)genetikk/evolusjon, b) planter, c) dyr, d) evolusjon, e) human/primat evolusjon) som hver og en må skrive. Disse oppgavene har en form som tilsvarer den type oppgaver man blir stilt overfor på avsluttende eksamen. Hver tirsdag 10.15-12.00 vil det bli holdt 2 forelesninger i Auditorium 1 Georg Sverdrups hus. Forelesningene blir delt ut enten som handouts eller kopier av powerpointfiler med 4-6 bilder på hvert ark (legges også ut på nettsidene til BIO 1000). Hvert emneområde blir derfor først behandlet på forelesning. Laber er samme dag (tirsdag) etter forelesningene. I noen tilfeller er lab erstattet med ekskursjon. Det vil bli holdt to ekskursjoner en til de Naturhistoriske museum på Tøyen, og en til Voksenkollen. I klasseundervisningen (torsdag 2 timer) arbeides det videre i grupper med spørsmål og problemstillinger knytte opp til temaene på forelesningen. Mange av oppgavene vil være av typen som det er mulig å besvare og levere inn etter endt klasse. Av og til vil klasseundervisningen bli brukt til mer fordypende gjennomgang (i plenum) av utvalgte deler (vil bli gitt beskjed om). Frammøte er ikke obligatorisk på forelesninger, men det anbefales sterkt å følge forelesningene. Frammøte i klasse/gruppeundervisning og på laber er obligatorisk. Likeledes er ekskursjoner obligatoriske. Gruppeveilederne tar opp manntall på hvert klasse/gruppemøte. Kan man ikke møte (gyldig grunn) må man levere individuelle, skriftlige oppgaver (som skal godkjennes) knyttet til emneområdene for å få godkjent kurset. 4
4. Anbefalt litteratur Campbell and Reece Biology 6th edition 2002. En CD ROM følger læreboka. Dere kan også gå inn på nettstedet www.campbellbiology.com. Tjenesten der er gratis når dere har kjøpt læreboka. Det er sterkt anbefalt at dere bruker CD ROMen og nettstedet. Særlig vil vi anbefale at dere følger med på læringsmålene (objectives) og oppgavene (quizzes) som følger hvert kapittel. Dersom dere går inn på nettsidene, kan dere svare på spørsmål og få svarene evaluert. Forelesninger og evt tilleggsinformsjon vil bli delt ut (evt lagt ut på nettsiden). Laboratoriebeskrivelser og lab-journaler er en del av pensum. 5. Vurderingsform. Avsluttende skriftlig eksamen (3 timer) teller 60% av karakteren. Innleverte oppgaver teller 20% Laboratoriejournalene teller 20% Bokstavkarakterer. 5
6. Forelesere og veiledere Kursansvarlige: Kjetill S Jakobsen (kjetill.jakobsen@bio.uio.no) foreleser fra uke 34 til og med uke 40. Klaus Høiland (klaus.hoiland@bio.uio.no) foreleser fra uke 41 til og med uke 49. Treffetid: mandag kl 12-13. Øvrige forelesere: Asbjørn Vøllestad (asbjørn.vøllestad@bio.uio.no) foreleser fra uke 47-49 Reidun Sirevåg (reidun.sirevag@bio.uio.no) foreleser i mikrobiologi og livets opprinnelse Erika Hagelberg (erika.hagelberg@bio.uio.no) foreleser i primatenes og menneskets evolusjon Klasse/Gruppeveiledere: Eli K Rueness e.k.rueness@bio.uio.no (genetikk, pop. genetikk, evolusjon) Øystein Flagstad oystein.flagstad@bio.uio.no (genetikk, pop. genetikk, evolusjon) Kamran Shalchian-Tabrizi kamran@bio.uio.no (fylogeni, mikrobiologi, protister) Anna Skog anna.skog@bio.uio.no (genetikk, pop genetikk, fylogeni, evolusjon, zoologi) Wenche Eikrem wenche.eikrem@bio.uio.no (mikrobiologi og protister) Aurelien Chamarier aurelien.chamarier@bio.uio.no Eirik Rindal (eirik.rindal@nhm.uio.no) (fylogeni) Trude Vrålstad trude.vralstad@bio.uio.no (botanikk+ økolog) Håvard Kauserud haavard.kauserud@bio.uio.no (botanikk +økologi) Thomas Marcussen thomas.marcussen@bio.uio.no (botanikk+ økologi) Jorun Nyléhn jorun.nylehn@bio.uio.no (botanikk + økologi) Johannes Holmen johannes.holmen@bio.uio.no (zool + pop genetikk, økologi) Thor Klevjer t.a.klevjer@bio.uio.no (zool +økologi) Kathrine Hoset kathrine.hoset@bio.uio.no (zool + økologi) Leif Stige l.c.stige@bio.uio.no (zool) Hjelpelærere (i klassen og på laboratoriekurset): Emmanuel Cleuvenot (evolusjon, fylogeni, popgenetikk, human evolusjon, zoologi) Marwa Jalal (genetikk, evolusjon, mikrobiol) Marte Avranden Kjær (genetikk, mikrobiol) Jens Ådne Rekkedal (genetikk, evolusjon, fylogeni, popgen, økologi) Kjetil Røberg (prokaryoter, protister) Thrond Haugen (pop genetikk) Marco Venzi (prokaryoter, protister) Ingeborg W Finstad (Zoologi +økologi + ekskursjon) Thomas Owens Svennungsen (Zoologi + økologi + ekskursjon) Snorre Hagen (mendelsk genetikk, pop gen, zoologi Terje Laskemoen (økologi, zoologi) Anne Maria Eikeset (økologi, zoologi) Anne Cath S Sandnes (Botanikk + sopp + ekskursjon) 6
Cecilie Mathiesen (Botanikk + sopp + ekskursjon) Anette Edvardsen (Botanikk + sopp + ekskursjon) Anne Lise Bekken Linda Sivertsen 7: Forelesningene og klasser. 19 august: Presentasjon av emnet, innledning. Kjetill S Jakobsen, Klaus Høiland, Asbjørn Vøllestad samt klasselærere 21 august: Mendelsk genetikk Kjetill S Jakobsen 26 august: Introduksjon til evolusjon Klaus Høiland 28 august: Klasse Mendelsk genetikk 2 september: Populasjonsgenetikk Kjetill S Jakobsen 4 september: Klasse - Populasjonsgenetikk 9 september: Artenes opprinnelse Klaus Høiland og Kjetill S Jakobsen 11 september: Klasse - Artsdannelse 16 september: Fylogeni og systematikk Klaus Høiland og Kjetill S Jakobsen 18 september: Klasse: Fylogeni 23 september: Biologisk diversitet gjennom jordas geologiske historie og livets opprinnelse Kjetill S Jakobsen Reidun Sirevåg 25 september: Klasse : Livets opprinnelse 30 september: Prokaryoter og utviklingen av metabolsk diversitet Reidun Sirevåg 2 oktober: Klasse - Prokaryoter 7 oktober: Protister og opprinnelsen av eukaryot diversitet Kjetill S Jakobsen 9 oktober: Klasse - Protister 14 oktober: Økologi I Klaus Høiland 16 oktober: Klasse: Økologi 21 oktober: Økologi II Klaus Høiland 23 oktober: Klasse Økologi II 28 oktober: Planter I Klaus Høiland 30 oktober: Klasse Planter I 4 november: Planter II Klaus Høiland 6 november: Klasse Planter II 11 november: Sopp Klaus Høiland 13 november: Klasse - Sopp 7
18 november: Introduksjon til evolusjonen av dyr Asbjørn Vøllestad 20 november: Klasse Dyr I 25 november: Invertebrater Asbjørn Vøllestad 27 november: Klasse Dyr II 2 desember: Vertebrat evolusjon og diversitet Asbjørn Vøllestad 4 desember: Klasse - Vertebrater 9 desember: Primater og menneskets evolusjon Erika Hagelberg 11desember: Klasse Menneskets evolusjon 8
7. Klasser og grupper Deltagerne deles inn i totalt 8 klasser på hver maksimum 40 deltagere. I klassen vil dere bli inndelt i grupper av 6-7 studenter dvs 6-7 grupper pr klasse. Hver klassen og de tilhørende gruppene har en klasselærer (de vil være forskjellige klasselærerne for hvert hovedfelt) og to hjelpelærere. Klassene er hver torsdag (kl 8.15 10.00; klasse 5-8 og kl 10.15-12.00 klasse 1-4. Rom er oppgitt på kursets hjemmeside; http://www.biologi.uio.no/studie/db02-aktuelt/internet/html/nr000004.php) Klasselærere og hjelpelærere 1) Mendelsk Genetikk (28 august): Klasselærere - Øystein Flagstad, Eli Rueness, Anna Skog, Johannes Holmen. Hjelpelærere - Marwa Jalal, Marte Avranden Kjær, Snorre Hagen, Thomas Owens Svennungsen 2) Populasjonsgenetikk (4 september) : Klasselærere - Øystein Flagstad, Eli Rueness, Anna Skog, Johannes Holmen. Hjelpelærere Jens Ådne Rekkedal, Emmanuel Cleuvenot, Thrond Haugen, Thomas O Svennungsen) 3) Artsdannelse (11 sept): Klasselærere - Øystein Flagstad, Eli Rueness, Anna Skog, Thrond Haugen. Hjelpelærere Emmanuel Cleuvenot, Jens Ådne Rekkedal, Marwa Jalal, Marte A Kjær 4) Fylogeni (18 sept): Klasselærere - Kamran Shalchian-Tabrizi, Anna Skog, Øystein Flagstad, Eirik Rindal. Hjelpelærere Emmanuel Cleuvenot, Jens Ådne Rekkedal, Marte A Kjær, Kjetil Røberg, Marco Venzi, KSJ 5) Livets opprinnelse (25 sept): Klasselærere - Kamran S-T, Øystein F, Reidun Sirevåg, KSJ. Hjelpelærere Thomas O Svennungsen, Emmanuel Cleuvenot, Marwa Jalal, Marte A Kjær, Kjetil Røberg 6) Prokaryoter (2 okt): Klasselærere - Kamran S-T, Wenche Eikrem, Reidun S, KSJ. Hjelpelærere Kjetil Røberg, Marco Venzi, Marte A Kjær, Linda Sivertsen 7) Protister (9 okt): Klasselærere - Kamran S-T, Wenche E, Reidun S, KSJ. Hjelpelærere Kjetil Røberg, Thor Klevjer, Marco Venzi, Marte A Kjær, Anne Lise Bekken 8) Økologi I (16 okt): Klasselærere - Thor Klevjer, Kathrine Hoset, Trude Vrålstad, Thomas Marcussen. Hjelpelærere Ingeborg W Finstad, Thomas O Svennungsen, Snorre Hagen, Jens Ådne Rekkedal 9) Økologi (23 okt): Klasselærere - Jorun Nylehn, Håvard Kauserud, Kathrine H, Leif Stige. Hjelpelærere - Ingeborg W Finstad, Thomas O Svennungsen, Jens Ådne Rekkedal, Terje Laskemoen 10) Planter I (30 okt): Klasselærere - Trude V, Håvard K, Jorun N, Thomas M. Hjelpelærere Anne Cath Sandnes, Cecilie Mathiesen, Anette Edvardsen, Klaus Høiland, Emmanuel Cleuvenot, Linda Sivertsen 11) Planter II (6 nov): Klasselærere - Trude V, Håvard K, Jorun N, Thomas M. Hjelpelærere - Anne Cath Sandnes, Cecilie Mathiesen, 9
Anette Edvardsen, Klaus Høiland, Emmanuel Cleuvenot, Anne Lise Bekken 12) Sopp (13 nov): Klasselærere - Trude V, Håvard K, Jorun N, Thomas M. Hjelpelærere - Anne Cath Sandnes, Cecilie Mathiesen, Anette Edvardsen, Klaus Høiland, Emmanuel Cleuvenot 13) Dyr I (20 nov): Klasselærere - Johannes H, Thor K, Kathrine H, Leif S, Asbjørn Vøllestad, Sigurd H Espeland. Hjelpelærere - Ingeborg W Finstad, Thomas O Svennungsen, Emmanuel Cleuvenot, Anne Maria Eikeset 14) Dyr II (27 nov): Klasselærere Leif S, Thor K, Kathrine H, Anna S. Asbjørn Vøllestad, Sigurd H. Espeland Hjelpelærere - Ingeborg W Finstad, Thomas O Svennungsen, Anne Maria Eikeset, Emmanuel Cleuvenot 15) Vertebrater (4 des): Klasselærere - Johannes H, Thor K, Kathrine H, Leif S, Asbjørn Vøllestad, Sigurd H Espeland. Hjelpelærere - Ingeborg W Finstad, Thomas O Svennungsen, Emmanuel Cleuvenot, Anne Maria Eikset 16) Menneskets evolusjon (11 des): Klasselærere Erika Hagelberg, Aurelien Chamarier, Anna Skog, Eli Rueness. Hjelpelærere Emmanuel Cleuvenot, Ingeborg W Finstad, Thomas O Svennungsen, Jostein Starrfelt 10
8) Program for laboratoriekurset, feltkurs/ekskursjoner Parti 1 og 2: 12.15 14.00 Parti 7 og 8: 18.15 20.00 Tirsdag 2. september 1. Mendelsk genetikk Lærere Øystein Flagstad, Eli Rueness, Johannes Holmen, Anna Skog Hjelpelærere Marwa Jalal, Jens Ådne Rekkedal, Thomas O Svennungsen, Marte A Kjær Parti 1 og 2: 12.15 14.00 Parti 7 og 8: 18.15 20.00 Tirsdag 9. september 2. Populasjonsgenetikk Lærere : Eli Rueness, Øystein Flagstad, Johannes Holmen, Anna Skog Hjelpelærere: Jens Ådne Rekkedal, Thrond Haugen, Snorre Hagen Emmanuel Cleuvenot Parti 1 og 2: 12.15 14.00 Parti 7 og 8: 18.15 20.00 Tirsdag 16. september Ingen lab - ekskursjon lil Tøyen Lærere: Klaus Høiland, NN Hjelpelærere: Jostein Starrfelt,Thomas Owens Svennungsen, Linda Sivertsen, Anne Lise Bekken, Anne Cath S Sandnes, Cecilie Mathiesen, Anette Edvardsen, Eirik Rindal 11
Parti 1 og 2: 12.15 14.00 Parti 7 og 8: 18.15 20.00 Parti 1 og 2: 12.15 14.00 Parti 7 og 8: 18.15 20.00 Tirsdag 30. september 3. Prokaryoter Lærere: Reidun Sirevåg Kamran Shalchian-Tabrizi Wenche Eikrem, NN Hjelpelærere: Marwa Jalal, Marte A Kjær, Marco Venzi, Thomas O Svennungsen, Kjetil Røberg, Jostein Starrfelt Tirsdag 7. oktober 4. Protister Lærere :Wenche Eikrem, Kamran Shalchian- Tabrizi, Kjetill S Jakobsen, NN Hjelpelærere: Marwa Jalal, Marte A Kjær, Thor Klevjer, Marco Venzi, Kjetil Røberg, Linda Siverstsen, Anne Lise Bekken, Jostein Starrfelt Parti 1 og 2: 12.15 14.00 Parti 7 og 8: 18.15 20.00 Tirsdag 14. oktober Ingen lab Ekskursjon til Voksenkollen Lærere: Klaus Høiland, Asbjørn Vøllestad Hjelpelærere: Ingeborg W Finstad,Thomas Owens Svennungsen, Linda Sivertsen, Anne Lise Bekken, Anne Cath S Sandnes, Cecilie Mathiesen, Anette Edvardsen, Terje Laskemoen 12
Parti 1 og 2: 12.15 14.00 Parti 7 og 8: 18.15 20.00 Tirsdag 28 oktober 5. Plantenes evolusjon Lærere: Trude Vrålstad, Håvard Kauserud, Thomas Marcussen, Jorun Nylehn Hjelpelærere: Anne Cath S Sandnes, Cecilie Mathiesen, Anette Edvardsen, Emmanuel Cleuvenot Linda Sivertsen, Anne Lise Bekken Parti 1 og 2: 12.15 14.00 Parti76 og 8: 18.15 20.00 Tirsdag 11 november 6. Sopp Lærere: Trude Vrålstad, Håvard Kauserud, Thomas Marcussen, Jorun Nylehn Hjelpelærere: Anne Cath S Sandnes, Cecilie Mathiesen, Anette Edvardsen, Emmanuel Cleuvenot, Linda Sivertsen, Anne Lise Bekken Parti 1 og 2: 12.15 14.00 Parti76 og 8: 18.15 20.00 Tirsdag 18 november 7. Dyr I Lærere: Johannes Holmen, Thor Klevjer, Kathrine Hoset, Leif Stige Hjelpelærere: Ingeborg W Finstad, Terje Laskemoen, Thomas Owens Svennungsen, Anne Maria Eikeset 13
Parti 1 og 2: 12.15 14.00 Parti76 og 8: 18.15 20.00 Tirsdag 25 november 8. Dyr II Lærere: Johannes Holmen, Thor Klevjer, Kathrine Hoset, Leif Stige Hjelpelærere: Ingeborg W Finstad, Anne Maria Eikeset, Thomas Owens Svennungsen, Terje Laskemoen 9. Kollokvier Det vil bli holdt kollokvier basert på oppgaver som gis på forelesninger (evt lab). Det anbefales at dere jobber i de samme gruppene som dere er organisert i klassene. Kollokvier er ikke obligatorisk, og dere kan i prinsippet ha kollokvier når som helst. Imidlertid vil dere kunne få hjelp og veiledning av foreleser, klasselærer, hjelpelærer på kun et gitt tidspunkt tirsdag, når dere ikke har lab (fra 12.30 15.30). Det kan derfor være en ide å legge kollokviene til dette tidspunkt. 10. Oppgaver for innlevering I forbindelse med klasser (og evt med forelesninger) vil det bli gitt oppgaver hvorav noen av essay-form (4-5) som skal innleveres og settes karakter på. En av hensiktene med slike oppgaver (i tillegg til at de hjelper oss å sette karakter), er at de skal være til hjelp i eksamensforberedelsen. Med andre ord; de vil ha en form som likner på de spørsmål og oppgaver dere vil få til eksamen. Til sammen vil det være en 8-9 oppgaver inkludert essays som skal innleveres og settes karakter på. Dere vil få nærmere beskjed om når disse oppgavene blir gitt. Oppgavene vil bli diskutert og gitt råd omkring i klassene. Innleveringsfrist av oppgaver er satt til tirsdag morgen kl 10.00. 11. PROBLEMBASERT LÆRING (gjelder særlig noen oppgaver i klassene, men ikke alle) DE SYV TRINN Trinn 1: Klargjør terminologi og begreper dere ikke forstår. Trinn 2: Definer problem/delproblemer. Hvilke fenomener vil dere belyse? Bestem hvilke problemer dere vil bearbeide videre. 14
Trinn 3: Lag en fortegnelse over gruppens oppfattninger og ideer rundt problemet. Bearbeid et problem av gangen. Benytt ca 5-10 minutter på "brainstorming" på hvert problem. (Dvs.: Noter alle forslag, ideer og assosiasjoner som kommer frem i gruppen. Ikke krev forklaring eller kritisk granskning.) Trinn 4: Systematiser fortegnelsen. Gransk alle forslagene. Prøv å sette dem i system, vurder og sorter ut de som synes irrelevante. Trinn 5: Formuler innlæringsmål. Noter dere det dere ikke forstår eller ikke kan forklare. Formuler spørsmål og konkretiser hva dere bør lære ut fra analysen dere gjorde i trinn 4. Trinn 6: Innhent kunnskap i relasjon til innlæringsbehovene. Hvert gruppemedlem bør få finne ut hvilken kunnskap han/hun bør skaffe seg. Det kan arbeides i gruppe eller individuelt. Trinn 7: Syntetiser de nyervervete kunnskapene. Den nyervervete kunnskapen skal så granskes i gruppen og diskuteres i forhold til problemene. Kunnskapen skal gi forutsetninger for belysning av problemet og eventuelt besvare spørsmål som er stilt. 15