ZOOLOGISK SERIE ',m;w* -7 .., . B-wmkpmeO. . b I '. ..., r- ,,,,,' l m,la?- -: I u... '. r, i -. >. I _ - - ", 4.

Transkript

1 ZOOLOGISK SERIE ',m;w* -7 -,...,. - I '..*,... B-wmkpmeO.. -r , b,,.,,..--.,:.... I '. r,. -- m.,,,,,' ,,.,.., l m,la?- -:--- -., -. >.., I _ ", I u '. r, i

2 C 5:- - - > i1 ',b.r,: %.. 3.' m 8...,i ".t,-.? n. - - b-,.... '.y, fd' L. -.t-, -1 I.,-. 1'.. t. 7, 1: v i C. g: + I -... i p4 *y r*. L '., d'*.',i$, ; : A...g... :.-p...i.-.i #a;:, l L... -,.i 4,&I. -P t ,-7. k.**. w, a;,.. _. b.: ' ,. 1- : d -'l.':.j.-t I -, q J -h*.' 4.., -.,.?,.-i :,',.,t l', -: - 8 L Pl :',g..., ".,.i :,;. : t;,:: 5... I'. ' :!t*y. k;

3 K. norske Vidensk. Selsk. Mus. Rapport Zool. Ser Brukerveiledning til fire datamaskinprogrammer for kvantitative zooplanktonundersøkelser Paul Lundquist og Tor Stramgren Universitetet i Trondheim Det Kgl. Norske Videnskabers Selskab, Museet Trondheim, mai 1975

4

5 REFERAT Lundquist, Paul og Tor StrØmgren Brukerveiledning til fire datamaskinprogrammer for kvantitative zooplanktonundersøkelser. K. norske Vidensk. Selsk. Mus. Rapport Ser Resipientundersdkelsen av Trondheimsfjorden som startet sommeren 1972 etter oppdrag fra MiljØverndeparte- mentet og og Nord-TrØndelag fylker, omfatter bl. a. en undersgkelse av fjordens zooplankton. De fire datamaskin- programmene hvis bruk er beskrevet i denne rapporten, ble utarbeidet for å behandle data fra denne zooplankton- undersøkelsen. Rapporten inneholder innledningsvis litt om koding og registrering av data. Deretter behandles bruken av hvert enkelt program med gjennomgåelse av nødvendige inn- data (parametre og "vanlige" data) til og resultater fra vedkommende program. Dessuten er vist en del figurer med eksempler på parameterkort, datakort og resultater for hvert enkelt program. Paul Lundquist og Tor StrØmgren, Universitetet i Trondheim, Det Kgl. Norske Videnskabers Selskab, Museet, Zoologisk avdeling, N-7000 Trondheim

6 ISBN

7 INNHOLDSFORTEGNELSE REFERAT 1 INNLEDNING BRUK AV EDB KODING AV DATA REGISTRERING AV DATA PROGRAMOVERSIKT RESULTATOVERSIKT PROGRAMMET PLANKTON~/NO-OF-IND INNDATA TIL PLANKTONl/NO-OF-IND PARAMETERKORT DATAKORT SORTERING DATAKORTFORMAT BEGRENSNINGER ANGIVELSE AV DYBDEINTERVALLER FEILMELDINGER BRUK AV EKSTERNT (YTRE) LAGER RESULTATER FRA PLANKTONl/NO-OF-IND PROGRAMMET PLANKTONl/DIVERSITY INNDATA TIL PLANKTONl/DIVERSITY BEGRENSNINGER RESULTATER FRA PLANKTONl/DIVERSITY PROGRAMMET PLANKTONl/V-DISTR+SP INNDATA TIL PLANKTONl/V-DISTR-SP BEGRENSNINGER RESULTATER FRA PLANKTONl/V-DISTR-SP PROGRAM.MET PLANKTONl/V-DISTR-STGE INNDATA TIL PLANKTONl/V-DISTR-STGE PARAMETERKORT DATAKORT BEGRENSNINGER FEILMELDINGER RESULTATER FRA PLANKTONl/V-DISTR-STGE LITTERATUR... 29

8 INNLEDNING ResipientundersØkelsen av Trondheimsfjorden som startet sommeren 1972 etter oppdrag fra og SØr- og Nord-TrØndelag fylker, omfatter b1.a. en undersøkelse av Trondheimsfjordens zooplankton. Det Kgl. Norske Videnskabers Selskab, Museet, Zoologisk avdeling står for innsamling og bearbeiding av data. I tidsrommet august 1972 til august 1974 er innsamling foretatt to ganger pr. måned i april og mai 1973 og 1974, ellers En gang pr. måned. Utenom resipient- undersgkelsen er innsamling foretatt ganske regelmessig siden 1963, og programmene som beskrives i denne rapporten er også kjgrt med de eldre data. Data innsamles ved håvtrekk på faste stasjoner over ett eller flere dybdeintervaller. De eldre data og de nyere er tildels registrert litt forskjellig når det gjelder dybdeintervaller, men de fire foreliggende programmene be- handler begge typer, dog ikke helt uten forbehold. Etter den "gamle metoden" benyttet en delintervaller som tilsammen dekket et større intervall: f.eks , m og m som tilsammen dekker intervallet 0-200m. Etter den "nyere metoden" benyttes intervaller som dekker hverandre:.eks m og 0-200m. BRUK AV EDB KODING AV DATA Når det gjelder å overføre data fra materialet til en form som egner seg for elektronisk databehandling, er det nødvendig i stor utstrekning å benytte koder for å angi opp- lysninger. Slike koder kan bygges opp på flere måter, f.eks. som en rent numerisk kode (sifferkode), en ren bokstavkode (alfabetisk kode), eller som en kombinasjon av numerisk og alfabetisk kode (alfanumerisk,kode). For å betegne en planktonart, har en i dette tilfelle valgt å benytte en alfabetisk kode (bokstavkode) på 6 tegn. Det er ikke lagt opp til noe bestemt system i kodingen. F.eks. kodes Calanus finmarchicus som.calfin, mens Centropages

9 hamatus kodes som CENTHA. Andre typer av koder kan selvsagt godt benyttes; imidlertid b4r kodene være slik at en utlisting av data er lesbar for den som arbeider med materialet. Stedet hvor materialet er samlet inn, kan gis en 4- tegns kode (betegnelse,.eks. TRFJ for - TRondheimsFJorden), - og stasjonen en kode på 3 tegn (f.eks. stasjon 1, 5, 8, 8AI 8B, 15, 20C osv.). Både steds- og stasjonskoden kan være alfabetisk, alfanumerisk eller numerisk. (Se for gvrig eks. på utfylt dataskjema i pkt ). REGISTRERING AV DATA ~ t at t materialet ~ ~ er samlet inn, blir det arts- bestemt og talt opp. Deretter føres antallet av hver art (evt. hvert stadium av arten) på et dataskjema sammen med bl. a. sted, stasjon, dato og dybdeintervall. Når materialet er ferdigbestemt og dataskjemaene utfylt, blir data punchet på hullkort (Det er ingenting prinsippielt i veien for å benytte andre dataregistrerings- medier). Deretter kan selve databehandlingen, dvs. kjøring av ett eller flere av programmene, foretas. PROGRAMOVERSIKT FØlgende programmer for behandling av zooplankton- data (el. liknende) foreligger: 1. PLANKTONl/NO-OF-IND 2. PLANKTONl/DIVERSITY 3. PLANKTONl/V-DISTR-SP 4. PLANKTONl/V-DISTR-STGE Programmene 1 og 4 benytter de samme data (original- data fra hullkort), mens programmene 2 og 3 benytter resul- tater fra program 1 (mellomlagret på eksternt lager) som data. Programmene 2 og 3 forutsetter med andre ord at program 1 er kjørt på forhånd. Alle programmene behandler data fra ett sted og En stasjon om gangen og skiller data på dato og dybdeintervall, slik at resultatene blir beregnet for data fra samme sted,

10 stasjon, dato og dyp. Alle programmene er skrevet i språket NU Algol (Norwegian University Algol) og kj@rt under operativsystemet Exec-8 på datamaskinen Univac 1108 ved RUNIT, Regnesentret ved Universitetet i Trondheim. RESULTATOVERSIKT Oversikt over resultater fra beregninger med data fra: Sanune sted, stasjon og dato: Program Samme sted og stasjon, alle datoer: Program For hvert dybdeintervall: - antall individer av en art P 1 - antall individer pr. m 2 P1 - antall individer pr. m 3 P1 - sum ant. ind. for de n første arter (n er parameter) P 1 - sum ant. ind. pr. m2 for de n første artene - sum ant. ind. pr. m3 for de n første artene - sum ant. ind. for de reste- rende artene - sum ant. ind. pr. m2 for de resterende artene - sum ant. ind. pr. m3 for de resterende artene - sum ant. ind. for alle arter P1 - sum ant. ind. pr. m2 for alle arter P1 - sum ant. ind. pr. m3 for alle arter P 1 - volum (hvis oppgitt) P 1 - evt. referansenr. Pl,P2,P3,P4 For evt. summer over flere dybde- intervaller: - som ovenfor unntatt ref. nr. For hvert dybdeintervall : - Simpson's diversitetsindeks for cope- poder P 2 - Simpson's diversitetsindeks for holo- plankton (Hvilke arter som tilherer de to gruppene oppgis i parameterkort) - % av arten (vertikal artsfordeling) - % av artens stadier (vertikal stadie- fordeling) For evt valler: - som ovenfor summer over flere dybdeinter- P2 P3 (P4 for arter uten stadier)

11 Kommentar til resultatoversikt: PI = PLANKTON~/NO-OF-IND P2 = PLANKTONl/DIVERSITY P3 = PLANKTONl/V-DISTR-SP p4 = PLANKTON~/V-DISTR-STGE Data registreres med dybdeintervaller på to måter,.eks. 0-Som, m, m og 0-100m, O-2OOm. I første tilfelle kan det være aktuelt å summere over følgende inter- valler: 0-100m, m og 0-200m. I andre tilfelle dekker intervallene hverandre, og det er ikke interessant å summere. PROGRAMMET PLANKTONl/NO-OF-IND Dette programmet var det første som ble utviklet i planktonserien, og det kan sies å være det viktigste ved at to av de andre programmene er avhengig av det. 5.0 INNDATA TIL PLANKTONl/NO-OF-IND PARAMETERKORT En del parameterkort er n8dvendig for å styre ut- førelsen av programmet. RekkefØlgen og formatet ("utseendet") til parameterkortene må være som vist nedenfor. NB. Alle tall er høyrejustert, dvs. at de må plasseres lengst mulig til høyre i de avsatte kolonnene på kortet. Kort Kolonne Antall nr. nr. kolonner Fo'rklaring Programmets navn el.1. til bruk i overskrift for hver ny side Stedskode Stas jonskode Antall arter som skal være med i første sum ( Antall arter m/stadier Totalt antall arter Skal inneholde et siffer (1,2 eller 3) for å avgjøre hvilken type kjøring som Ønskes:

12 Kort Kolonne Antall nr. nr. kolonner Forklaring = 1 MedfØrer at en får bare sjek- king av data. Programmet inne- holder en rutine som sjekker hvert datakort bl. a. ut fra hva som er oppgitt i parameter- kortene. = 2 MedfØrer at en får både sjek- king av data og beregninger på de data som ikke innehol- der feil. = 3 MedfØrer at en får bare bereg- ninger. Denne måten å kjøre programmet på forutsetter at data er sjekket på forhånd (f. eks. ved at programmet er kjørt med denne parameter lik 1 eller 2) at data fremdeles finnes på det eks- terne lager (dvs. datafilen med de riktige data er katalogisert). Nummer på dybdeintervallet som an- gir skille for summer over flere dybdeintervaller (se pkt for beskrivelse av lovlige dybdeintervaller). Angir om antallet av arten. (eller artens stadier) skal multipliseres med en faktor: = O el. i? Ikke multiplikasjon med faktor. = 1 el. T Multiplikasjon med fak- tor. Angir om utskrift av tabeller Ønskes: = O el. F Ikke utskrift.

13 Kort Kolonne Antall nr. nr. kolonner Forklaring = 1 el. T Utskrift av tabeller 3 Håvens areal i m2 (de to siste sifrene oppfattes som desimaler; et areal på 0.1 m2 skrives som 010 eller bare 10 h~yrejustert). Artskode for første art. Fullt navn for første art. Angir om arten er holoplankton: = H holoplankton = blank (# H) ikke holoplankton Angir om arten er copepode: copepode = blank (f C) ikke copepode Faktor som antallet av stadium 6 evt. skal multipliseres med (av- gjøres av innholdet i kol i parameterkort nr. 2). Faktor for stadium 9. Faktor for stadium V eller faktor for sammenslåtte stadier V-IV. Faktor for stadium IV eller faktor for antallet dersom arten ikke har stadier. Faktor for stadium I11 eller faktor for sammenslåtte stadier Faktor for stadium 11. Faktor for stadium I. Faktor for stadium N (nauplii). NB. For alle faktorene gjelder at siste siffer er desimal. Her følger så et antall kort til- svarende kort nr. 3 for de reste- rende artene. Etter disse kortene (og foran datakortene) må det vare - et VEOF (end of file) kort.

14 Eksempel på parameterkort for PLANKTONl/NO-OF-IND: DATAKORT SORTERING Det forutsettes at data er sortert etter bestemte kri- terier kjøring av PLANKTONl/NO-OF-IND. Programmet inne- holder derfor ingen sotteringsrutine, men leser og behandler data fortlgpende. Alle data i en kj@ring må ha samme steds- og stasjonskode. Data må være sortert på dato og dybdeinter- vall, samt evt. på artskode. UtskriftsrekkefØlgen bestemmes av artenes rekkefølge i parameterkortene. Når det gjelder sortering på dybdeintervaller, bør sorteringen foretas slik at data med eksempelvis 0-50m kommer foran data med m, som igjen kommer foran data med m, osv. for hver dato. Dersom dybdeintervallene dekker hverandre, som f. eks m og n,,, bør alle data med 0-100m komme foran data &ed ~1, osv. for hver dato.

15 Sorteringen bør altså foretas slik: - sorter fgrst på dato, - for hver dato sorteres på dybdeintervall som beskrevet ovenfor, - for hvert dybdeintervall sorteres evt. på artskode. For Univac 1108 kan f. eks. sorteringsrutinen SORT-08 benyttes DATAKORTFORMAT Programmene PLANKTONl/NO-OF-IND og PLANKTONl/V-DISTR- STGE benytter samme data, mens programmene PLANKTONl/ DIVERSITY og PLANKTONl/V-DISTR-SP benytter mellomlagrede resultater fra PLANKTONl/NO-OF-IND som data. Datakortformatet for de to førstnevnte programmene beskrives nedenfor. Noe av det som står på kortet, benyttes ikke av disse programmene og er merket med x. NB. Alle tall må være høyrejustert, dvs. plasseres lengst mulig til høyre i det avsatte feltet på kortet. 1 Kolonne Antall nr. kolonner Forklaring 1 1 Blank; det skal ikke stå noe i denne kol Skal inneholde stedskode Skal inneholde stasjonskode Skal inneholde dato; dag, måned og år som et 6-sifret tall (4. februar 1975 bør skrives som ) Skal inneholde dybdeintervall (Eks.: 0-50m punches med O hgyrejustert i kolon- nene 15-17, bindestrek i kol. 18 og 50 h~yrejustert i kol ). Brukes ikke av programmet. Brukes ikke av programmet. Evt. referansenummer. Brukes ikke av programmet. Skal inneholde artskode. Dersom prøvens volum er målt, kan det plasseres på kor- tet med "artskode" 'VOLUME' tilsvarende

16 Kolonne Antall nr. kolonner Forklaring en art uten stadier, (kol ). 'VOLUME' angis ikke i parameterkortene som artskode. Brukes ikke av programmet. Antall av artens stadium 8. Antall av artens stadium Q. Antall av artens stadium V eller sammen- slåtte stadier V-IV. Antall av artens stadium IV eller total- antallet dersom arten ikke har stadier. Antall av artens stadium I11 eller antal- let av sammenslåtte stadier Antall av artens stadium 11. Antall av artens stadium I. Antall av artens stadium N (nauplii). Brukes ikke av programmet. Eksempel på datakort:

17 Eksempel på utfylt dataskjema: STED NR DATO DYP SKAP ~l+l R ED- MASKE-REF V I DDF TELLE- I * IS " I Iilolil*l4~kl I bbl I I I I Bbk NAVN TEUE- FAKTm ANTALL NAVN TELLE FAKTC ANTALL NAV N TELLE- FAKTOR ANTAL L

18 BEGRENSNINGER Begrensningene ligger rent praktisk i at programmet ikke må bli så plasskrevende at datamaskinens arbeidslager "sprenges". Da en del tabeller i programmet erklæres (dekla- reres) dynamisk, dvs. at det blir avsatt plass til dem mens programmet kjeres, er det vanskelig å si noe på forhånd om programmets størrelse. De begrensningene som er gjort, er følgende: - totalt antall forskjellige arter i 150, 2 -. håvens areal 5 l. O m, - antall dybdeintervaller < 5. De to første begrensningene er meget enkle å for- andre, den tredje noe verre, da den bl. a. brukes til redigering av utskrift ANGIVELSE AV DYBDEINTERVALLER Det er som før nevnt to måter å angi dybdeintervaller på. Den ene er å angi intervaller som tilsammen dekker et større intervall: f. eks. dekker 0-50m, m og m intervallet 0-250m. Den andre er å angi intervaller som dekker hverandre: f. eks m og 0-250m. Det er ikke tillatt å blande de to metodene for data fra samme dato (en stasjon), men det er tillatt å benytte de to metodene om hverandre når bare datoene er forskjellig. Noen eksempler: > TILLATT > > > IKKE TILLATT > > > > TILLATT > >

19 Når dybdeintervallene angis etter den første metoden, kan maksimalt 5 intervaller benyttes for samme dato på en stasjon, når de angis etter den andre metoden, kan maksimalt 2 intervaller benyttes. Avhengig av antall forekommende dybdeintervaller og en parameter, fåes summer over flere intervaller. Parameteren angir nummeret på det siste intervallet som skal inngå i den fgrste summen. Noen eksempler skulle klargjøre: DYBDE I DY TER VAL LER : SUMMER : PARAMETER : 0-~0n~0-100~100-~08 : G-10bnSO-~O0tB-300 UTEN BETYDN* 0 ~ ~ 1 O O ~ ~ O O : O-qGI) UTEI.! BETYDN* : INGEN UTE11 BETYUN, 0-1OOiO-490 : INGEN UTEN BETYDN. 5.2 FEILMELDINGER Som nevnt i forklaringen av parameterkortene, kan en velge om en vil kjøre programmet med eller uten sjekking av data. Feilsjekkingsrutinen går gjennom feltene på datakortet fra venstre mot høyre. Sjekkingen av et kort stopper når første feil er oppdaget. Dersom det er flere enn den først funne feilen på et kort, må de Øvrige finnes på annen måte, men dersom en puncher hele kortet omigjen, vil sjansen for automatisk å få rettet de Øvrige være stor.

20 Feilmeldingen skrives ut sammen med det aktuelle kortets nr. og innhold. Til slutt skrives ut antall leste kort, antall feil kort og antall riktige kort. FØlgende feilmeldinger kan forekomme: Feilmelding Kommentar Feil sted i kort nr. --- Feil stasjon i kort nr. --- Feil dato i kort nr. --- Feil dyp i kort nr. --- FØrste dyp er større enn andre dyp i kort nr. --- Feil kode i kort nr. --- Feil stadium... i kort nr. --- Stedskoden på kortet stemmer ikke med stedskoden i første para- meterkort. Stasjonskoden på kortet stemmer ikke med stasjonskoden på farste parameterkort. Datoen er ikke numerisk. Start- og/eller slutt-dypet i dybdeintervallet er ikke numerisk. Dybdeintervallene skal angis med minste dyp først, altså f. eks og ikke Artskoden stemmer ikke med noen av de kodene som ble oppgitt i parameterkortene. Feltet for det aktuelle stadium er ikke numerisk. Det som oppgis i parameterkortene er også i en viss utstrek- ning utsatt for kontroll. FØlgende feilmeldinger kan forekomme: Feilmeldina Kommen'tar ForsØk på å spesifisere antall arter som skal være med i Ørste sum større enn det totale antall arter. Antall arter 1. sum: ---. Totalt antall arter: ---. Dersom en Ønsker å summere antall individer av en art, kan dette gjøres ved å oppgi antall arter som skal vare med i summen. Feil håvareal i parameter- ~åvarealet oppgitt mindre enn 0,O 2 kort eller st8rre enn 1,O m. Feil sumskille i para- Kan angi hvilket dybdeintervall meterkort. som skal skille summene over flere dybdeintervaller; dybdeintervall-

21 Feilmeldinq VEOF-kort mangler etter kortene med kode etc., eller det er flere kort med kode etc. enn oppgitt. KjØringen avbrutt. Det er færre kort med kode etc. enn oppgitt i parameterkortet. KjØringen avbrutt. Kommentar nummeret ligger utenfor de lovlige grenser (< 1 eller > 4). Etter de siste parameterkortene (mellom parameterkortene og datakortene skal det være et VEOFkort. Dette kortet mangler, eller antall kort med kode er flere enn oppgitt i parameterkortene. VEOF-kortet påtruffet før det oppgitte antall kort med kode etc. var lest. BRUK AV EKSTERNT (YTRE) LAGER Som nevnt i forklaringen til parameterkortene, kan programmet kjøres med eller uten sjekking av data. Dersom første kloring av programmet er uten sjekking, forutsettes at data på forhånd er skrevet (av et brukerprogram) som 80- tegns kortbilder til en fil 'DATA', og at filen 'DATA' frem- deles eksisterer. (I programmeringsspråket ALGOL kan det se slik ut: WRITE(FILE('DATA1),KORTBILDE); hvor KORTBILDE er deklarert som STRING KORTBILDE (80) ; ). Dersom første kjøring er bare med sjekking, skrives de riktige data til filen 'DATA'. Denne filen må da kata- logiseres av brukeren for å eksistere ved neste kjøring av programmet. KjØring av programmet bare med beregning forutset- ter altså at filen 'DATA' eksisterer og inneholder riktige kortbilder. Det er meget enkelt å forandre programmet slik at det kan kjøres uten filen- 'DATA'. Til bruk for andre programmer skrives en del "mellomresultater" ut på en fil '25'. Utskriften til filen skjer for hver ny dato og inneholder bl. a. steds- og stasjonskode, dato, de aktuelle dybdeintervaller, to tabel- ler med antallet og antallet pr. m3 av artene for hvert dybdeintervall.

22 Dersom det ikke er interessant å ta vare på det som skrives til filen '25' (f. eks. ved at ingen av de andre programmene skal kj$res), behøver filen '25' verken tilordnes eller katalogiseres, da operativsystemet selv vil tilordne en temporar fil med samme navn under programmets gang. Filen '25' må imidlertid katalogiseres dersom den skal eksistere mellom to kjøringer. Felles for de to nevnte filene er at navnene 'DATA' og '25' er interne filnavn (navn som brukeren definerer i sitt program). Det er imidlertid ingenting i veien for at filene kan katalogiseres med andre, eksterne navn, og at det interne filnavnet tilknyttes ved en spesiell styresetning: vuse DATA,<katalogisert filnavn17 og NB. Alt som er saqt om bruk av ekstern lager, filnavn, katalogisering og tilordning, gjelder for operativ- systemet Exec-8 for Univac RESULTATER FRA PLANKTONl/NO-OF-IND For at programmet skal virke etter hensikten, må data være sortert som forklart i pkt Data kan da leses og behandles fortlgpende. Utskrift til filen '25' skjer for hver ny dato. Dersom det gnskes utskrift til linjeskriver, skjer det ved at alt som er skrevet til filen '25' leses tilbake og skrives ut. Som nevnt i pkt. 5.3 må imidlertid filen være katalogisert for at den skal eksi- stere etter at programmet er kjørt. FØlgende resultater fåes: En tabell for hver dato som inneholder - antall individer av hver art for hvert dybdeintervall, samt for evt. summer over flere intervaller, samme som ovenfor, men pr. m og pr. m, - samme som ovenfor, men summert for et antall arter (antallet som skal være med i summen oppgis i parameterkort), - samme som ovenfor, men summert for resten av artene,

23 - samme som ovenfor, men summert for alle artene, dvs. summen av de to foregående, - volum for hvert dybdeintervall. Volumet angis som en vanlig art, men programmet skiller ved å teste spesielt på om artskoden er lik 'VOLUME', - evt. referansekode for hvert dybdeintervall. Utskriftseksempler for PLANKTONl/NO-OF-IND: STLD STASJON 0nrn THFJ l U2.04.h3 NAVN : O - 5UM i0-200 U ANTALL PR/M3 PH/M? ANT4LL PW/M.? PR/ME SIIM 0-20OM PNTALL PP/MJ Pu/M2 CALANUSFINMAHCHICOS : l : :: lb6 55 1Rhn: CALANUS HYPERBOREUS.. PAHEUCHAETA NORVEGICA : : 1 5 l 150:: : METRIDIA LONGA l lfl: :: : METHIOIA LUCENS.. METRIDIA SP : PSEUDOCALANUS ELONGATUS : qO: MICROCALANUS PUSILLUS : SCOLECITHRICELLA MINOR : : TEMOHA LONGICORNIS ACARTIA LONGIREMIS ACARTIA CLAUS1 ACARTIA SP PARAC-ALANUS PARVUS XANTHOCALANUS HOREALIS : THARYBDIS MACROPTALINA : EURYTE LONGICAUDA CYCLOPOIDA e CALANUS EGGS a CANDACIA NORVEGICA *. CANDACIA ARMATA.. CANDACIA SP :.. HETEROHABDUS NORVEGICUS : 20:: 2 20: CHIRIDUS ARMATUS 30: : OITHONA SIMILIS h 60: : OITHONA SPINIHOSTRIS : :.. ONCAEA BOREALIS. s ONCAEA BOREALIS IHANN) : :. COPEPODA HARPACTICOIDA : lo:: 1 in: MICROSTELLA M/EGG MICROSTELLA U/EGG.. n COPEPODA INOET : 2 20:: 5 1 sn: NAUPLII INDET A 2 RO: 5 50:: :... SUM : : :: n:... CLADOCERA POOON e CLADOCERA EVADNE EUPHAUSIACEA EGG EUPHAUSIACEA NAUPLII : EUPIIAUSIACEA CALYPTOPIS :.. EUPHAUSIACEA FURCILIA : a m.. AMPIIIPODA 40:: 4 40: OSTRACODA 40:: 4 40: CHAETOGNATA SAGITTA 1 180:: : CHAETOGNATA EUKROHNIA : COPELATA FRITILLARIA : COPELATA OIKOPLEURA.. POLYCHAETA 10: : l 10: COELENTERATA : : l : CIRRIPEDIA NAUPLI a CIRRIPEDIA CYPRIS POLYCIIAETA LARVAE.. BIVALVIA LARVAE ECHINODERMATA LARVAE : i. FISH EGG FISH LARVAE CYPHONAUTES ASCIDIA EGG m ASCIDIA LAHVAE DECAPOD LARVAE 1 10: 6 tn: CHUSTACEA LAHVAE.. MYSIDACEA,..ISOPODA BOSMINA q PIIORONIDA.. GASTROPODA l 10: 20:: 3 30 : SALPA FIISIFOHMIS..... SUM 1A 3!RO:?Y l 290:: u7 4 u7n: TOTAL SIM : 7417 uti : ~ s u i?~o:: n 4q0n: VOLUEnE 5 l 5fl: h b@: : Il : REF NR : - 1 -I. a m.

24 CALnI4US F INt4ARCt~ICUS CALAIJUS rlyperuoi(eus PAH~:UCHACTA NORVEuICA YrTRIbIA LONGA MtTKIiJIA LUCENS YETRIiIIA SP PbEUiJOCALANUS ELOitGATIiS MICROCALANUS PIISILLUS SLOLE,CITHRICELLA :4INOH T;MORA LONGIC~RNIS ACARTIA LONGIHEMIS ALARTIA CLAUS1 ACARTIA SP PARACALANUS PAHVUS CtNTROPAGES HAMATUS CtNTROPAGES TYPICUS CtNTROPhGES SP ONCAEA SIMILIS AETIDEUS ARMATUS ANOMALOCERA PATER5ONI RHINCALANUS NASUTUS XANTHOCILANUS UOR'LAL THAHYBOIS MACROPTALI EUHYTE LONGICAUDA CYCLOPOIDA CALANUS EGGS CANDACIA NORVEGICA CANDACII ARMATA CANDACIA SP noo:?nn : ino inoo: m o iu voo: Q7oO : 2n0 9 inoo: sno I uno 40 roooi uno : 210n : 1300 HETEROHABDUS NORVEGICUS : CHIHIDUS ARMATUS : : OITHONA SIMILIS : : : OITHONA SPINIHOSTKIS : : : ONCAEA BOREALIS : : 2hn hn00: ONCAEA BOREALIS (HANN) COPEPODA HAHPACTICOIDA : : MICROSTELLA M/EGG MICROSTELLA U/EGG COPEPODA INDET NAUPLII INDET... SUM : 130'40 130~ : nnoo: CLADOCERA PODON : : CLADOCERA EVADNE : : : EUPHAUSIACEA EGG EUPHAUSIACEA NAUPLII : EUPHAUSIACEA CALYPTOPIS : : EUPHAUSIACEA FURCILIA : AMPIIIPODA OSTRACODA : : : CtiAEToGNATA SAGITTA '40: CHAETOGNATA EUKHOHNIA : 1 110: COPELATA FRITILLANIA ; COPELATA OIKOPLEUHA GASTROPODA POLYCHAETA 20 I COELENTERATA CIHHIPEDIA NAUPLI CIRRIPEDIA CYPRIS : : PuLYCHAETA LARVAE : : : BIVALVIA LAHVAE ECHINODERMATA LARVAE : 500 : : : FISH EGG FIS11 LARVAE CYPHONAUTES : : ASCIDIA EGG ASCIDIA LARVAE DtCAPOD LARVAE CHUSTACEA LARVAE MYSIDACEA 10: I SOPODA BOSMINA PHOHONIUA SALPA FUSIFORMIS HYDHACNIDA MYSILH????? PASIFEA -----_--_ _ SUM : : ~ ~ I I I 7n... TOTAL SUM : I S E ~ ~ n0: 15.1~ 69n 1~1100:... VOLUME : If> 1 160:... ~~.~flo:

25 PROGRAMMET PLANKTONl/DIVERSITY Programmet beregner Simpson's diversitetsindeks (Simpson 1949) på resultatene fra programmet PLANKTONl/ NO-OF-IND og er altså avhengig av at sistnevnte program er kjørt på forhånd. formel : Simpson'.~ diversitetsindeks beregnes etter følgende hvor N er det totale antall individer av alle arter, og x i er antall individer av i'te art. Resultatene beregnes for data fra en stasjon om gangen, med alle datoer. INNDATA TIL PLANKTONl/DIVERSITY Programmet leser alle ngdvendige parametre og data fra filen '25' hvis innhold er dannet ved kjøring av programmet PLANKTONl/NO-OF-IND. Filen '25' er organisert på ffllgende måte: antall arter som er med i fmrste sum {I totalt antall arter dybdeint. nr. som angir skille ved l l summering tabell med innhold som angir om arten er copepode I I tabell med innhold som angir om arte er holoplankton (1 stedskode I I l stas jonskode I I dato tabell med dybdeintervaller tabell med referansenummer antall dybdeintervaller ant. summer over dybdeintervaller tabell med antall individer tabell med antall individer pr. m3 tilsvarer blokk 3 for 2. dato siste blokk (1 tilsvarer blokk 3 for siste dato I ( EOF-merke (end of file) 1

26 BEGRENSNINGER Da programmet bygger på og overtar resultater fra programmet planktonl/no-of-ind, gjelder i praksis de samme begrensninger automatisk hva angår antall arter, dybdeintervaller osv. (se pkt. 5.1). RESULTATER FRA PLANKTONl/DIVERSITY For at programmet skal virke etter hensikten, må filen '25' eksistere som et resultat av at programmet PLANKTONl/NO-OF-IND er kjflrt. Resultatene beregnes for data for en stasjon om gangen, med alle datoer. FØlgende resultater fåes: - en tabell for copepoder med Simpson's diversitets- indeks for hvert dybdeintervall, samt for evt. summer over flere intervaller. Beregningene glgres for alle datoer på vedkommende stasjon, - samme for holoplankton, Utskriftseksempler for PLANKTONl/DIVERSITY: STED STASJON DATO TRFJ l SE UNDER TABELLEN GJELDER : COPEPODA DYBDEINTERVALLER : DATO : l 2 SIUPSONS DIVFRSIETSIHDEKS FOR INTFRVALL LII STED STASJO14 DATO TRFJ I SE UNDER TABELLEN GJELDER : HOLOPLANKTON DYBDEINTERVALLER : DATO : SIMPSONS DIVCRSITETSINDEKS FOP INTERVALL NR Ji02.b3 l O- SOMi ~ O - I O O M ~ ~ ~ O - ~ O ~ M ~ S ~ O-1OOH. ~ - ~ ~ M~ ~ ~ ~ * ~ 0-200W) ~ - ~ * ~ M R L l Mi~~~-~~~M~0~0-000M~00~-~0IH~ 0-2DOqi808-8*8Uit*8-0..M JO.OU.~~ I D- son. so-~uo~.~oo-2oor.~r*-*~~~~o*o-~~~~~ o-ioor. so-zoou. n-2oon1 n n ub.b~ I o- 50u. so-~oo~.~oo-2oo~.~o~-o~*n~oo*-1~~~~ O-IOOU, ~~ n-200~) n.75~ l 0- SOM, Mi M~O~~-OO*U~*bw-800M~ 0-iOOM, Me n-200yi n.373

27 PROGRAMMET PLANKTONl/V-DISTR-SP Programmet beregner en vertikal artsfordeling ut fra resultatene fra programmet PLANKTONl/NO-OF-IND og er altså avhengig av at sistnevnte program er kjørt på forhånd. Beregningene foretas for en stasjon om gangen, med alle datoer. INNDATA TIL PLANKTONl/V-DISTR-SP Programmet leser alle nødvendige parametre og data fra filen '25' hvis innhold er dannet ved kjøring av programmet PLANKTONl/NO-OF-IND. Pkt. 6.0 inneholder en figur som viser hvordan filen '25' er organisert. BEGRENSNINGER Da programmet bygger på og overtar resultater fra programmet PLANKTONl/NO-OF-IND, gjelder de samme begrensninger automatisk hva angår antall arter, dybdeintervaller osv. (se pkt. 5.1). RESULTATER FRA PLANKTONl/V-DISTR-SP For at programmet skal virke etter hensikten må den foran nevnte filen '25' eksistere. Beregningene foretas for data fra en stasjon om gangen, med alle datoer. FØlgende resultater fåes: - en tabell med % av alle arter pr. dybdeintervall, samt for evt. summer over flere inter- valler. Tabellen består nærmest av "deltabeller" for hver dato. For hver ny dato skrives også evt. referansenummer ut. Utskriftseksempler for PLANKTONl/V-DISTR-SP: se neste side!

28 ZOOPLANKTON INVESTIGATIONSi VERTICAL DISTRIBUTION OF SPECIES OATE LOCATION STATION TRFJ l INTERVAL NUMBER : -- I m--- OATE 2J.OZ.b3 NAME CALANUS FINMARCHICUS CALANUS HYPERBOREUS PAREUCHAETA NORVEGICA METRIDIA LONGA PSEUDOCALANUS ELONGATUS SCOLECITHRICELLA MINOR ACARTIA LONGIREMIS HETEROHABOUS NORVEGICUS OITHONA SIMILIS COPEPODA HARPACTlCOlDA COPEPODA INDET OSTRACOOA CHAETOGNATA SAGITTA CHAETOGNATA EUKROHNIA POLYCHAETA COELENTERATA DECAPOD LARVAE CALANUS FINMARCHICUS PAREUCHAETA NORVEGICA METRIDIA LONGA PSEUOOCA'LANUS ELONGATUS SCOLECITHRICELL4 MINOR HETEROHABDUS NORVEGICUS CHIRIDUS ARMATUS OITHONA SIMILIS COPEPODA HARPACTICOIDA COPEPODA INDET NAUPLII INDET OSTRACODA CHAETOGNATA SAGITTA CHAETOGNATA EUKROHNIA POLYCHAETA COELENTERATA CIRRIPEOIA NAUPLI CRUSTACEA LARVAE :: REFERENCE : :: OEPTH INTERVALS : i.o- SOM, ~o-1o0~,~oo-2oo~~~oo-o~o~~***-ooo~:: :: O-lonu, 5n-200ut n-ionur REFERENCE : :: :: DEPTH IYTERVALS : i o- L OM, ~o-200wr~~~-o~~~,oo*-oo~~,~~~-~~o~:: o - ~ o n u. ~ ~ ~ - ~ ~ o ~, o ~ o LOCATION STATION TRFJ ----m L REFERENCE : DATE CALANUS FINMARCHICUS PAREUCHAETA NORVEGICA UETRIDIA LONGA PSEUDOCALANUS ELONGATUS MICROCALANUS PUSILLUS SCOLECITHRICELLA MINOR TEMORA LONGICORNIS ACARTIA LONGIREMIS ACARTIA SP CENTROPAGES HAMATUS OITHONA SIMILIS ONCAEA ROREALIS CLADOCERA POOON CHAETOGNATA SAGITTA CHAETOGNATA EUKROHNIA COPELATA FRITILLARIA GASTROPODA RIVALVIA LARVAE ECHINODERHATA LARVAE CYPHONAUTES * REFERENCE : e a a. DATE NAUE DEPTH INTERVALS : l o-lflo~, 0-~28~~~8r-**+~~~**-*o0~~~**-~*1~::oo*-ooo~~***-***~.. m CALANUS FINMARCHICUS PSEUOOCALbNUS ELONGATUS MICROCALANUS PUSILLUS TEMORA LONGICDRNlS ACARTIA-LONSIAEM~S ACARTIA SP PARACALANUS PARVUS CENTROPAGES HAMATUS CENTROPAGES SP OITHONA SIMILIS ONCAEA BOREALIS ONCAEA BOREALIS (HANN) CLADOCERA PODON EUPHAUSIACEA NAUPLII CHAETOGNATA SAGITTA CHAETOGNATA EUKROHNIA COPELATA OIKOPLEURA GASTROPOOA POLYCHAETA LARVAE BIVALVIA LARVAE ECHINODERMATA LARVAE CYPHONAUTES

29 PROGRAMMET PLANKTONl/V-DISTR-STGE Programmet beregner en vertikal stadiefordeling og benytter samme data som programmet PLANKTONl/NO-OF-IND. Grunnen til at programmet benytter "originaldata" og ikke de data som er skrevet på filen '25' (se evt. pkt. 6.0 om filens innhold)., er at data på filen bare inneholder totalt antall individer for hver art og ikke antall individer for hvert stadium av arten, noe som er helt nødvendig (!) for dette programmet. Beregningene gjøres for data fra en stasjon om gangen, med alle datoer. INNDATA TIL PLANKTONl/V-DISTR-STGE PARAMETERKORT.m;. En del parameterkort er nødvendig for å styre ut- Ørelsen av programmet. RekkefØlgen og formatet ("utseendet") til parameterkortene må være som vist nedenfor. NB. Alle tall må være høyrejustert, dvs. plassert lengst mu- til høyre i de aktuelle kolonnene på kortet. Kort Kolonne Antall nr. nr. kolonner Forklaring Totalt antall arter Antall arter m/stadier Nr. på arten som utgjør nedre qrense for arter ned sammenslåttex stadier. (Gant. arter m/stadier). Nr. på arten som utgjør Øvre grense for arter med sammenslåtte X stadier. (2nedre grense,,( ant. arter m/stadier). Nr. på dybdeintervallet som angir. skille for summer over flere intervaller. Artskode for første art Fullt navn for første art Mer felger så et antall kort tilsvarende kort nr. 2 for resten av artene, slik at det blir like

30 Kort Kolonne Antall nr. nr. kolonner Forklaring - mange kort med artskode og navn som parameteren 'totalt antall arter1 sier. X sammenslåtte stadier: se forklaring av datakortformat i pkt Eksempel på parameterkort for PLANKTONl/V-DISTR-STGE: 0 i DATAKORT Da programmet benytter samme data som programmet PLANKTONl/NO-OF-IND, henvises til pkt når det gjelder sortering og pkt når det gjelder datakortformatet.

31 8.1 BEGRENSNINGER Begrensningene ligger rent praktisk i at program- met ikke må bli større enn den tilgjengelige plass i data- maskinens arbeidslager. Da en del tabeller erklæres (dekla- reres) dynamisk, dvs. at det settes av plass til dem mens programmet utføres, er det vanskelig på forhånd å anslå pro- grammets størrelse. De begrensningene som gjelder, er føl- gende : - antall arter 4 100, - antall dybdeintervaller d 5. Begrensningen på antall arter er meget enkel å for- andre, mens det å forandre programmet slik at det kan be- handle flere dybdeintervaller, vil kreve en del arbeid. Når det gjelder begrensninger i angivelse av dybde- intervaller, henvises til pkt FEILMELDINGER Noen feilmeldinger med hensyn til innhold og rekkefølge av parameterkort og datakort kan forekomme og medfører at programutfflrelsen avbrytes. Programmet sjekker ikke datakortenes innhold. Dette må i tilfelle gjøres på andre måter, f. eks. ved å kjøre programmet PLANKTONl/NO-OF-IND med datasjekking. Feilmeldina FØrste parameterkort mangler, EOF-kort eller kontrollkort ble lest. Ulovlig(e) verdi(er) i første parameterkort. EOF-kort eller kontrol- kort ble lest foran eller blant kortene med arts- koder og navn. Kommentar KjØringen avbrytes da et EOF-kort eller et annet kontrollkort ble lest som første kort. KjØringen avbrytes ved at første parameterkort inneholder en eller flere ulovlige verdier (f. eks. flere arter enn lovlig max=100). Antall kort med artskoder og navn stemmer ikke med antallet oppgitt i Ørste parameterkort. KjØringen avbrutt.

32 Feilmelding Kommentar " For mange dybdeintervaller Flere enn 5 dybdeintervaller har har forekommet, max er 5. forekommet for en dato. Sist Siste leste kort: <kort- leste kortbilde skrives ut, og bilde > kjflringen avbrytes. RESULTATER FRA PLANKTONl/V-DISTR-STGE For at programmet skal virke etter hensikten, må data være fri for feil og sortert som forklart i pkt Data kan da leses og behandles fortlgpende. Bereg- ningene gjøres for data fra en stasjon om gangen, med alle datoer. FØlgende resultater fåes: - en tabell med % av hvert stadium av alle arter (som har stadier) for hvert dybdeintervall, samt for evt. summer over flere intervaller; alle datoer. Tabellen består nærmest av "deltabeller" for hver dato. For hver ny dato fåes også evt. referansenummer. Utskriftseksempler fra PLANKTONl/V-DISTR-STGE: LOCATION STATION TRFJ l...*... INTERVAL NUMBER : Q t: n -- :: DATE NAUE 8 STAGE CALANUS FINMARCHICUS CALANUS HIPERBOREUS PAREUCHAETA NORVEGICA UETHIOIA LONGA PSEUDOCALANUS ELONGATUS SCOLECITHRICELLA MINOR HETEROHABDUS NORVEGICUS OITHONA SIHILIS COPEPODA HARPACTICOIDA COPEPOOA INDET OSTRACODA CHAETOGNATA SAGITTA CHAETOGNATA EUKROHNIA POLYCHAETA COELENTERATA DECAPOD LARVAE REFERENCE : DEPTH INTERVALS :I n- SOM, 50-~non.~oo-~ooM M, M:: o-ionnr sn-znou, n-?onur $ 9 MALE FEMALE U FEMALE v v-iv v-iv REFERENCE : -1-1!: DATE NAME d STAGE DEPTH INTERVALS :I n- snu. ~~-~OOMI M~ Y M:: 9. o-zoomi m *> :: 02.OY.63 CALANUS FINLIARCHICUS MALE FEMALE v.. PAREUCHAETA NORVEGICA MET3IDIA LONGA PSEUDOCALANUS ELONGATUS SCOLECITHRICELLA MINOR HETEROHABDUS NORVEGICUS CnIRIous ARMATUS OITUONA SIMILIS COPEPODA HARPACTICOIDA COPFPOllA INOET NAUPLIl INOET OSTRACODA CHAETOGNATA SAGITTA CHAETOGNATA EUKROHNIA POLYCHAETA MALE FEMALE v MALE FEHALE v-iv v-iv

33 LOCATION STAT101 TRFJ IHTERVAL MUMIER CALANUS FINWARCHICUS V I Y PAREUCMAETA NORVEiICA ~EWALC METRIOIA LONGA FEM ALE PSCUDOCALANUS KLONGATUS V-IV MICROCALANUS PUSILLUS V-IV SCOLECllHRlCELLA MIMOR V-IV Illil CHIRIDUS ARMATLI OITHONA SIMILIS OIlMOhA SPlhlROSTRIS ONCAKA IOREALIS AMPHiPODA OSIRACODA CHACTOCNAlA SA6111A DATE NAME b STAGC 11.01i74 CALAHUS finmarctllcus MALE fe*all v I V PAREUCHACTA NORVE61CA NAUILII PSCUDOCALANUS CLON6ATUS V-IV CHIRIDUS ARMAIUS loo ;00 :I OITUOHA SIMILIS IDO.00 I I ONCAEA IOREALIS IOOiOO ; I OSTRACOOA IOO.00 I I CwhZlOGNATA SAGITTA i00 ;I CHICTOGHATA EUKROHHIA IDO.00.. POLYCHALTA : i MYS1DACEA 100iOO ;I _- -_---_-_ * * DATE NAME b STA6C 11i01,7* CALANUS finmarculcu5 MALE FEMALC v I I LITTERATUR Simpson, E.H Measurement of diversity. Nature 163: 688. StrØmgren, T Zooplankton investigations in Borgen-...., fjorden ' K. n'o'r'ske Vidensk.' Selsk. Mus. Miscellanea (9): a. Zooplankton and hydrography in Trondheimsfjorden on the west coast of Norway. K. norske Vidensk. Selsk. Mus. Miscellanea (17): b. Zooplankton investigations in Skjomen Astarte 7, 1-15.

34

35

36