Medisin stadium 1A Geir Slupphaug, IKM. Den eukaryote cellen II

Like dokumenter
Den eukaryote cellen II Animalsk celle. Endoplasmatisk retikulum

Den eukaryote cellen I. Prokaryote celler

Medisin stadium 1A Geir Slupphaug, IKM. Den eukaryote cellen I

Grunnleggende cellebiologi

... Proteiner og enzymer. kofaktor. polypeptid

FLERVALGSOPPGAVER - CELLEBIOLOGI

NORGES TEKNISK-NATURVITENSKAPELIG UNIVERSITET Side 1 av 5 INSTITUTT FOR FYSIKK. EKSAMEN I FAG CELLEBIOLOGI 1 august 1997 Tid: kl

Repetisjonsoppgaver samling 1 Cellen

NORGES TEKNISK-NATURVITENSKAPELIGE UNIVERSITET INSTITUTT FOR FYSIKK EKSAMEN I EMNE TFY4260 CELLEBIOLOGI OG CELLULÆR BIOFYSIKK

Cytoskjelettet. plasmamembran. Terje Espevik IKM. plasmamembran. Oversikt over Aktinfilamenter Mikrotubuli Intermediærfilamenter

BI 212- Protein Sorting - Kap. 17 Syntese og mål for mitokondrie- og kloroplast-proteiner (forts.)

LEKSJON 4: BIOTEKNOLOGI HVORDAN VI BRUKER NATURENS EGNE MEKANISMER TIL VÅR FORDEL, OG UTFORDRINGENE SOM FØLGER MED

MOLEKYLÆRBIOLOGISK DAG

TRANSPORT GJENNOM CELLEMEMBRANEN

Figurer kapittel 8: Bioteknologi Figur s

EKSAMEN I EMNE SIF4070 CELLEBIOLOGI Mandag 7. mai 2001 Tid: kl Ingen trykte eller håndskrevne hjelpemidler tillatt.

Kreftforskning.no/myklebost. Eva Wessel Pedersen. Cancer Stem Cell Innovation Centre

MOLEKYLÆRBIOLOGISK FAGDAG

Protein Sorting- Kap. 17

Tor-Henning Iversen, Plantebiosenteret (PBS),Botanisk institutt,ntnu

Kap. 5 - vår 2002(forts.) Del 5.4 Celleorganeller En typisk plantecelle

FYS 3710 Biofysikk og Medisinsk Fysikk, Cellebiologi. Einar Sagstuen, Fysisk institutt, UiO

Bioteknologi i dag muligheter for fremtiden

4260 Mikrobiologi. Midtprøveoppgaver. 02. oktober 2013

Genfeil i kreftsvulster nøkkelen til en mer persontilpasset behandling?

Flervalgsoppgaver: proteinsyntese

Kapittel 16 Utvikling: differensielt genuttrykk

EKSAMEN I EMNE SIF4070 CELLEBIOLOGI

c) Hvilke funksjoner har de tre ulike typene proteinfilamenter i cytoskjelettet? (3 poeng)

Flervalgsoppgaver: celleånding

Fasit til oppgavene. K-skallet L-skallet M-skallet

FLERVALGSOPPGAVER - CELLEMEMBRANEN

Hovedområde: Bioteknologi Eksamensoppgaver fra skriftlig eksamen Naturfag (NAT1002).

BIOS 1 Biologi

FLERVALGSOPPGAVER I NATURFAG

Proteiner og aminosyrer

Institutt for biologi Faglig kontaktperson under eksamen: Berit Johansen, EKSAMEN I: BI1001 Celle- og molekylærbiologi BOKMÅL

FYS 3710 Biofysikk og Medisinsk Fysikk, 2016

Essayoppgaver for konteeksamen høst i IAB Oppgave 1, 10 poeng Cellens oppbygning - hovedstrukturer og cytoskjelett (4 poeng) (3 poeng) c) (3 poeng)

Kosmos SF. Figurer kapittel 8 Den biologiske tidsalderen Figur s. 214 BIOTEKNOLOGI. Næringsmiddelindustri. Landbruk. Akvakultur

Reproduksjon av dyrevirus. Adsorpsjon Penetrasjon og avkledning Replikasjon og transkripsjon Syntese og samling (assembly) av viruskapsid Frigjøring

NORGES TEKNISK-NATURVITENSKAPELIGE UNIVERSITET INSTITUTT FOR FYSIKK EKSAMEN I EMNE SIF4070 CELLEBIOLOGI

Oppgave: MED1100-3_OPPGAVE2_H16_KONT

Besvarelse eksamen i TFY4260 Cellebiologi og cellulær biofysikk 20 mai 2011

Kloning og genforskning ingen vei tilbake.

Oppgavesett, Runde 1 Norsk Biologi-OL

Trening øker gjenvinning i celler Natur og miljø

Faglig kontaktperson under eksamen: Jens Rohloff (mob )

BIOS 2 Biologi

Metode for å kartlegge DNA-et og båndmønsteret det har. Brukes for å kartlegge slektskap eller identifisere individer innenfor rettsmedisin.

BI 212- Protein Sorting - Kap. 17 Post-translasjonell modifisering og kvalitetskontroll i r-er (Del 17.6)

Transport av ioner og næringsstoffer over cellemembranen

Hensikten med forsøket er å isolere eget DNA fra kinnceller, se hvordan det ser ut og hva det kan brukes til videre.

Naturfag for ungdomstrinnet

BI Celle- og molekylærbiologi

Samling 1 Cellebiologi

Viktige opplysninger: Oppgavesettet utgjør totalt 100 vekttall. Antall vekttall er vist i parentes ved hver spørsmålsgruppe.

Institutt for biologi Faglig kontaktperson under eksamen: Berit Johansen ( ) EKSAMEN I: BI1001 Celle- og molekylærbiologi BOKMÅL

Samling 1 Cellebiologi

Molekylære mekanismer ved Alzheimers sykdom (AD)

Skriftlig utsatt eksamen MD4011semester IAB kull 11

Kosmos SF. Figurer kapittel 8: Den bioteknologiske tidsalderen Figur s. 234 BIOTEKNOLOGI. Næringsmiddelindustri. Landbruk.

Kurs 1 Cellebiologi. Soneterapi og massasjeterapi

BIOS 1 Biologi

Så, hvordan lager man nye nerveceller?

2 Cellers ultrastruktur og funksjon

Reproduksjon av dyrevirus. Adsorpsjon Penetrasjon og avkledning Replikasjon og transkripsjon Syntese og samling (assembly) av viruskapsid Frigjøring

På de åpne spørsmålene (26-30) kan det oppnås maksimalt 5 poeng per oppgave.

Fra laboratorium til pasient - stamcelleforskningens muligheter, utfordringer og perspektiver

EKSAMENSOPPGAVE I BI1001 CELLE- OG MOLEKYLÆRBIOLOGI

Holder cytoplasmaet på plass. Regulerer transporten inn i og ut av cellen og har kontakt med naboceller.

CELLER OG ARV TELLUS 10 KAP 1

FLERVALGSOPPGAVER ENERGIOMSETNING

Eksamensoppgave i BI1001 Celle og Molekylærbiologi

Klipp og lim: Genredigering med CRISPR teknologi

LEHNINGER PRINCIPLES OF BIOCHEMISTRY

Hvor går stamcelleforskningen, og hvordan vil stamceller kunne bli brukt i behandling av pasienter

Oppgave 2b V1979 Hvor i cellen foregår proteinsyntesen, og hvordan virker DNA og RNA i cellen under proteinsyntesen?

Intracellulær proteinsortering, endocytose, eksocytose.. riktig protein på riktig sted i cellen.

Intracellulær proteinsortering, endocytose, eksocytose.. riktig protein på riktig sted i cellen.

Forelesninger i BI Cellebiologi. Denaturering og renaturering. Figure 3-13

Kapittel 7: Cellulære spor for høsting av kjemisk energi

Blod og Beinmarg. Bruk av oljeimmersjon. Legg preparatet på objektbordet Legg en LITEN oljedråpe på dekkglasse.

Kapittel 12: FRA DNA TIL PROTEIN:

TEKNOMAT ER DET SÅ ENKELT?

DNA-replikasjon. DNA-replikasjon. Viktige punkt (repetisjon) Replikasjon foregår i replikasjonsfabrikker. Vil bli gjennomgått: I løpet av cellens

1 J = cal = energi som trengs for å løfte 1 kg 1m mot en 1N kraft, eller 100 g 1meter mot tyngdekraften (10N) (ett eple en meter)

BIOKJEMI MED BIOTEKNOLOGI

Skriftlig utsatt eksamen MD4011semester IAB kull 11

DNA-replikasjon. DNA-replikasjon. Viktige punkt (repetisjon) Replikasjon foregår i replikasjonsfabrikker. Vil bli gjennomgått: I løpet av cellens

Norsk Biologiolympiade

Besvarelse SIF4070 Cellebiologi 31. mai 2002

Forelesninger i BI Cellebiologi Proteinrensing - Væskekromatografi. Figure 3-43 b

Besvarelse eksamen SIF4070 Cellebiologi 7. august 2003

Forelesninger i BI Cellebiologi. Protein struktur og funksjon - Kap. 3

EKSAMENSOPPGAVE I BI1001 CELLE- OG MOLEKYLÆRBIOLOGI

EKSAMEN I BI1001 CELLE OG MOLEKYLÆRBIOLOGI

Transkript:

Medisin stadium 1A Geir Slupphaug, IKM Den eukaryote cellen II

Cellens hovedstrukturer og -funksjoner Plasma membran Cellekjernen Lipider proteiner Kjernemembran Nukleoplasma Omslutter cellen Regulerer transport inn/ut Kontrollsentral Inneholder den I Animalsk celle Nukleolus ER genetiske informasjonen Syntese, transport, modifikasjon Organeller Golgi Lysosomer Modifikasjon, sortering Nedbrytning Peroksysomer Mitokondrier Fettomsetning mm. Energifabrikker II Cytoplasma Cytosol Cytoskjelettet Ribosomer Mekanisk struktur, bevegelse Proteinsyntese Molekyler Div. metabolske reaksjoner

Endoplasmatisk retikulum ER er cellens største organell, og kan utgjøre ca 10% av hele celleinnholdet Det er et kontinuerlig membrannettverk bestående av rør og utposninger (cisternae), hvor innsiden av systemet kalles lumen En viktig funksjon i SER (smooth ER) er syntese av lipider og steroider En hovedoppgave til RER (Rough ER) er å importere proteiner som lages på ribosomene på overflaten, og å modifisere disse og sende videre til Golgi-komplekset Denne forsendelsen foregår fra såkalte transitional elements hvor det dannes transportvesikler.

Golgi-komplekset Proteiner fra RER transporteres i små vesikler over til Golgi-komplekset Her tømmes innholdet, og proteinene modifiseres videre, sorteres, og sendes ut i vesikler til sine endelige bestemmelsested, f. eks. ut av cellen, til plasmamembranen, eller til lysosomer I tillegg syntetiseres bestemte lipider, som sphingolipider, i Golgi Eksokrine celler fra bukspyttkjertel har vært viktige i kartleggingen av transportmekanismene

Lysosomer Lysosomer finnes kun i animalske celler, og er cellenes nedbrytningssentraler. Materiale som blir nedbrutt omfatter makromolekyler som DNA, RNA, proteiner, lipider, karbohydrater. I tillegg kan interne organeller, samt bakterier og annet som er tatt opp utenfra, brytes ned

Lysosomer dannes ved avsnøring av vesikler fra Golgi-apparatet, og er omsluttet av en membran Disse vesiklene er fylt med nedbrytningsenzymer Inne i vesiklene er ph lav (ph ~5), og enzymene virker bare ved lav ph. Ellers i cellen er ph 7-7.4. Hvis lysosomene skulle bli ødelagt, vil derfor enzymene ikke begynne å bryte ned cellen ukontrollert

Molekyler kan tas opp i cellen som vesikler ved endocytose Disse vesiklene smelter sammen og kalles endosomer Vesikler fra Golgi fylt med nedbrytningsenzymer smelter sammen med endosomene, og tømmer innholdet sitt i disse. Resultatet kalles en lysosom Overgangen mellom early /late endosomer/lysosomer er glidende. Organellene skilles ofte fra hverandre i mikroskopet ved å farge med ulike antistoff mot proteiner som er karakteristiske for hver fase Lysosomer (Cathepsin) Tidlige endosomer (LDL/transport)

Hele cellulære organeller kan også brytes med på denne måten, noe som kalles autofagi (viktig krisemekanisme ved lav næringstilgang) Tilsvarende kan hele bakterier tas opp ved fagocytose Lysosomer som bryter ned slike store strukturer er betydelig større enn andre lysosomer, og kalles autofagosomer August 2010: Norske forskere oppdager første direkte link mellom autofagi, og induksjon av apoptose (programmert celledød) 4 trinn i autofagi

Mange sykdommer skyldes defekter i lysosomale nedbrytningsenzymer Lysosomer inneholder ca 50 ulike nedbrytningsenzym, som virker på ulike molekyler. Svikt i ett av disse enzymene (som kan skyldes en arvelig mutasjon), kan føre til en rekke ulike lysosomale lagringssykdommer En slik sykdom er Gaucher s sykdom, hvor en enzym som bryter ned glykolipider, er defekt. De fleste pasientene utvikler tidlig skader i lever og milt 1 av 100 er bærere av denne gendefekten, og sykdommen rammer ca 1 av 40 000 (US)

Peroksysomer De fleste humane celler inneholder ca. 500 peroksysomer. Disse er membranomsluttede organeller som inneholder >50 ulike enzymer. Peroksysomene deltar i en rekke metabolske prosesser, deriblant nedbrytning av fettsyrer, syntese av lipider og kolesterol. Mange av enzymene utfører oksydative reaksjoner bla. detoksifiseringsreaksjoner De kan formeres ved deling, men også nydannes ved knoppskyting fra ER En rekke sykdommer er forbundet med defekter i peroksysomale enzymer (bl. Refsums sykdom)

Mitokondrier Mitokondriene er cellenes energifabrikker. I celler som forbruker mye energi, kan derfor mitokondriene utgjøre hele 25% av volumet i cytoplasma. Som kjernen, er mitokondriene omsluttet av en dobbelmembran (hver med et fosfolipid-dobbellag). Den ytre, membranen består av ca 50% lipid og 50% protein, mens den indre membranen inneholder 20% lipid og hele 80% protein! Den indre membranen inneholder også mange folder, kalt christae, som gir den en stor overflate

Etter hvert som næringsmolekyler brytes ned i cellen, føres mellomprodukter inn i mitokondriene for å brytes helt ned til karbondioksyd og vann. Denne prosessen krever oksygen Energien som frigjøres i denne prosessen frigjøres i form av ATP, som kan brukes til å utføre arbeid og syntesereaksjoner i cellen ATP O 2

Mitokondriene inneholder også sitt eget genom. Dette er et sirkulært DNA-molekyl, som er mye mindre (20 000x) enn genomet i cellekjernen Dette arvematerialet koder for noen av proteinene og mange av RNA-molekylene som brukes i mitokondriene Resten av proteinene (>1000 ulike) må importeres fra cytosol) Det er kjent en rekke arvelige sykdommer som skyldes mutasjoner i mitokondrie-dna. Siden mitokondriene under befruktningen, kun overføres til avkommet via eggcellen, er slike sykdommer arvet via mor

Cytoskjelettet Cytoskjelettet består av et nettverk av proteinfilamenter som strekker seg ut over hele cellen Det utgjør et strukturelt rammeverk som avgjør cellens form og bevegelse, og spiller i tillegg en viktig rolle for bevegelse av molekyler og organeller i cellen Proteiner som inngår i cytoskjelettet danner også mer spesialiserte strukturer I cellen, som centrioler, som er med på å organisere spindelnettverket som trekker på kromosomene under celledelingen Eukaryote celler inneholder 3 typer proteinfilamenter I cytoskjelettet: Mikrofilamenter: 8-9 nm diameter. Polymer av aktinenheter Mikrotubuli: Hule rør, 24 nm diameter. Polymer av α- ogβ-tubulinenheter Intermediærfilamenter: Tau-like filamenter med 10 nm diameter. Kan være sammensatt av ulike proteinsubenheter I ulike kroppsvev. I overflateceller (epitelceller), f. eks i huden, består mange av disse filamentene av keratin

Centrosomer Mikrotubuli starter å vokse ut fra centrosomer, som er organisert like ved cellekjernen. Centrosomen inneholder to centrioler, som separeres like før celledelingen, og er med på å organisere spindelnettverket

Cytosol I tillegg til ribosomer og cytoskjelett-filamenter, består cytosol av en tyktflytende grunnsubstans som har en høy konsentrasjon av ulike ioner, små molekyler og makromolekyler Tettheten av disse molekylene er svært høy, spesielt proteiner, som kan ha en konsentrasjon på 200-400 mg/ml. Ved slike konsentrasjoner har proteinene en tendens til å danne aggregater og funksjonelle proteinkompleks Vann og ioner Metabolitter

En har i de senere år identifisert en rekke sykdommer hvor unormal aggregering av proteiner inne i cellene fører til celleskade og celledød Mange av disse sykdommene har også arvelige komponenter. Eksempler på slike sykdommer er Alzheimers sykdom og Parkinsons sykdom Aggregering av cellulære proteiner kan også skyldes såkalte prioner, og er årsaken til såkalt kugalskap ogcreuzfeld-jacobs sykdom.

Cellebiologisk forskning har gjennomgått en revolusjonerende utvikling de siste 20 år. Dette skyldes en rekke tekniske fremskritt innen flere områder Betydningen disse fremskrittene vil ha for medisinsk diagnose og behandling er enorm, og kan ikke overvurderes Mikroskopi (nye visualiseringsteknikker, høyere oppløsning) Genteknologi (genisolering, sekvensbestemmelse, rekombinant DNA mm) Cellefraksjonering (renisolering av ulike typer celler, celler i bestemte stadier i cellesyklus, og ulike celleorganeller) Strukturbiologi (tredimensjonal analyse av blant annet proteiner, røntgenkrystallografi, NMR) Enzymologi/proteinidentifikasjon (massespektrometri mm) Bioinformatikk (raskere computere, nye programmer, store databaser) Immunologi (tilgang på tusenvis av kommersielt tilgjengelige antistoff mm) Celledyrking in vitro Osv Cellebiologiske metoder

Mikroskopi Konvensjonell lysmikroskopi Fluorescensmikroskopi

Laser- Konfokalmikroskopi Elektronmikroskopi

Celledyrking På 50-tallet greide en for første gang å dyrke humane celler utenfor kroppen, i flasker med et næringsmedium som inneholdt en rekke næringsstoffer, salter og vekstfaktorer (hormoner etc). I dag har en utviklet spesialmedia for dyrking av en lang rekke ulike humane celler. Normale humane celler vil bare dele seg et visst antall ganger, før kulturen aldres og dør. Kreftceller vil imidlertid kunne dyrkes i flaske i det uendelige Celler som vokser på bunnen i dyrkingsflaske

Cellesortering Ved elektrostatisk cellesortering farges ulike celler i en blanding med ulike farger. Deretter sprøytes de ut gjennom en vibrerende spiss slik at det dannes dråper med én celle i hver. Alt etter fargen, får cellene en ladning. Deretter passerer cellene et elektrisk felt, hvor de separeres

Organellfraksjonerin g Hvis en vil studere egenskaper ved bestemte cellulære organeller, kan disse renses opp ved sentrifugering, etter at cellene først er åpnet ved homogenisering Organeller har forskjellig størrelse og tetthet, og disse kan skilles ved sentrifugering ved stadig økende hastigheter

Genteknologiske metoder En rekke ulike genteknologiske metoder er i daglig bruk i cellebiologisk forskning. En hyppig brukt metode for å visualisere hvordan ulike proteiner transporteres i cellen, er å modifisere selve genet som koder for detaktuelleproteinet, slikat proteinetsomlagesblir fluorescerende. Gen 1 YFP Gen 1 limes sammen med gen som koder for gult fluorescerende protein Gen 2 BFP Gen 2 limes sammen med gen som koder for blått fluorescerende protein Begge genene settes inn i levende celler, og de tilsvarende proteinene blir produsert (uttrykt) Cellene belyses med UV-lys og observeres i mikroskop

Hva er stamceller? De fleste cellene i kroppen vår er differensierte. Det vil si at de har nådd en høy grad av spesialisering, og kan ikke utvikle seg til noen andre typer celler. Stamceller er imidlertid ikke spesialiserte, og kan utvikle seg til mange celletyper (de er pluripotente).

Flere sykdommer kan behandles ved erstatning av døde kroppsceller med tilsvarende celler dyrket i laboratoriet. For å unngå immunologisk avstøtning bør disse ideellt stamme fra pasienten selv eller nær slektning (f. eks søsken) En mulighet er å bruke embryonale stamceller (ES-celler). Disse kan isoleres fra tidlige embryo dannet ved befruktning med kjønnsceller fra pasienten selv På grunn av de etiske spørmål dette reiser, pågår det derfor en intens forskning for å kunne isolere stamceller fra voksne personer Flere firma har rapportert at de har isolert stamceller fra beinmarg, som kan utvikle seg til hjerteceller. Hvis dette viser seg riktig, kan det bety en revolusjon innen behandling etter hjerteattakk. Andre mener at voksne stamceller må identifiseres og isoleres fra organet det eventuelt skal brukes i

Celledød, apoptose I løpet av et år, mister mennesket celler tilsvarende sin egen kroppsvekt, via en prosess som kalles apoptose Dette er en normal, og strengt regulert prosess som ender opp med fragmentering av cellene Fragmenteringen tiltrekker eteceller (makrofager) som tar opp cellefragmentene via fagocytose Normal celle Apoptotisk celle