Foreleser: Eivind Coward, kontor 5. etg. Datablokken. Gruppeleder: Harald Barsnes
|
|
- Karen Isaksen
- 7 år siden
- Visninger:
Transkript
1 Foreleser: Eivind Coward, kontor 5. etg. Datablokken. Gruppeleder: Harald Barsnes Forelesninger: tirsdag og fredag rom 2104 Øvinger: fredag rom 2143 Gi en innføring i noen sentrale problemer i bioinformatikk Informatikk-synsvinkel: generelle algoritmer og metoder med anvendelse også utenom bioinformatikk Interessant for informatikk-studenter, også for dem som ikke går videre med bioinformatikk Gi grunnlag for videre studier i bioinformatikk (kursene INF380, INF381 og mastergrad) All informasjon finnes på (lenke fra Studentportalen) 1 2 Strengmatchingsalgoritmer Strengsammenstilling, dynamisk programmering Heuristisk matching, databasesøk Generelt søk Maskinlæring Konseptlæring Avgjørelsestrær Kunstige nevrale nettverk Har valgt å plukke stoff fra flere ulike bøker. Strengsammenstilling og -søk: Ingvar Eidhammer, Inge Jonassen, William R. Taylor: Protein Bioinformatics An Algorithmic Approach to Sequence and Structure Analysis, J. Wiley 2004 Generelt om søking: Utdelt materiale Maskinlæring: Tom M. Mitchell: Machine learning, McGraw Hill, 1997 I tillegg øvelser. 3 4!"# Uke Generelt søk Maskinlæring Plan Introduksjon til molekylærbiologi Strengsammenstilling, dynamisk programmering, databasesøk Eidhammer, Jonassen & Taylor Eidhammer, Jonassen & Taylor Mitchell Bok Forsøk på definisjon: Anvendelse av informatikk i molekylærbiologi Problemstillinger fra (motivert av) biologi, teknikker fra informatikk og andre vitenskaper Tverrfaglighet: Biologi, informatikk, matematikk, statistikk Repetisjon, oppsummering Ca. 10 øvinger, hvorav 2 3 obligatoriske innleveringer 5 6 1
2 $!"# EMBL database growth: Total # nucleotides in gigabases 7 Kilde: EMBL, status pr %"" Molekylærbiologi Bakgrunn - motivasjon for problemene vi forsøker å løse Generell interesse Bioinformatikk Litt om hvordan informatikk bidrar til fremskritt i molekylærbiologi Bakgrunn - sammenheng for teknikkene vi går gjennom & Egenskaper overføres fra en generasjon til neste Trenger sikkert lagringsmedium mulighet for å skape variasjon/endring/utvikling mekanisme for å implementere egenskaper
3 '& Forkortelse for deoksyribonukleinsyre (DeoxyriboNucleic Acid) Inneholder arvematerialet til alle levende organismer Består av en lang kjede av baser/nukleotider. 4 forskjellige baser: A, T, G, C. ggccttaaag cttttagaga actctttttg cagtaaaaag cacaaggcgt atgacacgct 60 caaagcctta cgcattacaa aaaacctaaa ttgataactc gtttatgcca tagcaacaat 120 tacgagtgcg tcgtgcttgc acgtagcaca tcaacaacaa tatgtcatat gccaatgcaa 180 tggaaatcaa caacaaaaaa atcaaaagaa agaaaatcaa tcaaatcgtt gacatacaaa 240 aaaaaatcat tataatagaa agcattaagg gtagcgacac taaatcacgc ttaaacaaga 300 aaggttcaaa aatgaaaaaa tatatcaatt attagtaatc gtagattacc aagaaaaaca 360 agaaatacac actctacacg ttggtccaaa acaccaatgt gtagcagttc aattattagc 420 gaaaaacacc tcaaaaaaaa tatattccaa aagaaggcaa aagttcaata taaaataaaa 480 aaaaatagaa gaggtcaaat aaatgaaaac aaatgttcaa ttaatccaaa caagaaacga 540 agtaaaaaaa taaagaaact ggcgaaacaa aaagatatac aagcttgcat taacataggt 600 aacagatacg tggacgtgcc tatacgccca gtgtctgttg ccgacccaga tacaccaaaa 660 gaaacaaaag aagataaaga gaaaggatgc cattttagaa atggaataca ttgaaatcac 720 tgtcaataaa tcacaacact ttgtgaatac agaccaaata tataatatgc tctggagttc '& Struktur - oppdaget av Watson & Crick 1953 Dobbel heliks To kjeder binder hverandre ved at det lages parvise bindinger mellom baser i de to kjedene A binder T, G binder C De to kjedene inneholder samme informasjon Ta bort en kjede kan reprodusere denne fra den andre kjeden Kjedene sies å være komplementære
4 $( Kromosom: Lang DNA-heliks (to komplementære kjeder) Mennesket har 23 kromosom-par Samlet kalles dette menneskets genom Menneskets genom inneholder tilsammen rundt 3 milliarder baser ) Utfører mye av arbeidet i cellene/kroppen stoffskifte signalsending/behandling... Byggesteiner Kjede av aminosyrer (20 forskjellige) Folder (krøller) seg opp i en kompakt 3-dimensjonal struktur som gjør at det kan utføre jobben/være del av strukturen '& DNA: arvestoffet, kokebok kjede av 4 forskjellige baser Protein: byggesteiner og cellemaskineri kjede av 20 forskjellige aminosyrer Gen: Et stykke DNA som koder for ett protein (vanligvis) Menneskets genom inneholder ca gener
5 ' * * * +, -& Forkortelse for ribonukleinsyre (RiboNucleic Acid) Ligner DNA Kjede av baser I DNA var basene A, T, G og C. I RNA er de A, U, G og C (uracil erstatter thymin). Stukturen litt ulik DNA. Forekommer ikke som dobbel-heliks Brukes til melding fra genom til oversettelse-maskineri (mrna) funksjonelle/strukturelle oppgaver * * DNA DNA A T T A C G G C Utføres av enzymet DNA-polymerase Kopierer arvestoffet ved celledeling DNA RNA A U T A C G G C Utføres av enzymet RNA-polymerase Overføring av informasjon (mrna = messenger RNA) som skal oversettes til et protein /% '&/ -&%0 '-&%-& +-&,1 0" "-&/ 2*2%3 -& * 0. 3 " 0 4* / 3209:8 0 '
6 . 3 0' % +, 0 / % 0' 0 ) Primærstruktur rekkefølgen av aminosyrer langs kjeden bestemmes av rekkefølgen av baser/nukleotider i genet og den genetiske koden (som er universell/konstant) Sekundærstruktur sammenhengende biter (segmenter) av kjeden danner alfa-helikser beta-tråder (beta-strands) stabiliserende for lokal struktur Tertiærstruktur plasseringen i rommet (x,y,z-koordinater) til alle atomer i en kjede Kvartærstuktur plasseringen i rommet av flere kjeder i proteinet (hvis det har flere kjeder) ) Rekkefølgen av aminosyrer langs kjeden Bestemmes av rekkefølgen av baser/nukleotider i genet og den genetiske koden (som er universell/konstant) ' * Ribosomer (komplekser av protein og RNA) leser en mrna-sekvens (nukleotider) og genererer en aminosyresekvens
7 sammenhengende biter (segment) av kjeden danner alpha-helikser beta-tråder (ligger ofte sammen i beta-flak (sheets) stabiliserende for lokal struktur 37 3((;;;0"20<0 (2(773(2("2(03 38!" plasseringen i rommet (x,y,zkoordinater) til alle atom i en kjede #!$!! %!! $ 3((;;;0"30 (*(=3%( dimensjonal struktur energetisk gunstig kan bestemmes eksperimentelt for en del protein røntgen-krystallografi nukleær-magnetisk resonans (NMR) kostbart og vanskelig Funksjon proteinets rolle i cellen (alanin syntetisering) binder protein X binder ligand Y, omdanner til Z+T kostbart å bestemme eksperimentelt >%+?, Maskineri finner start av gen. Skiller tråder/kjeder i DNA fra hverandre ( glidelås ) Lager RNA-tråd komplementær til den ene DNA tråden (transkripsjon) samme informasjon RNA transporteres til maskineri (ribosomer) for oversetting til protein (translasjon)
8 )% % )% To hovedtyper av celler/organismer: Prokaryoter har ingen cellekjerne Eukaryoter har cellekjerne avgrenset av membran Har ingen cellekjerne Ett kromosom (ofte sirkulært), flyter fritt i cellen Alle prokaryoter er encellede organismer Omfatter bakterier og archea % 2 % Har cellekjerne Genomet ligger i cellekjernen, pakket kompakt sammen som et antall kromosomer Organismene kan være encellede (gjær, alger,...) eller flercellede (planter, dyr,...) Genene består av vekselvis kodende og ikke-kodende deler kalt exons og introns Intronene fjernes fra mrna før translasjonen DNA chains of nucleotides, double helix stores genetic information Gene region on a DNA molecule a gen codes for one protein in eukaryote organisms; consists of exons and introns RNA chains of nucleotides carrier of information from DNA to translation machinery for generation of proteins may have other functions Protein chain of amino acids, folds up in three dimensional structures building blocks, important functions amino acid sequence determined by a gene + the genetic code 47 determines 3D structure. Variation Individuals do not have identical genetic material mutations changes in the base sequence in DNA May be caused by mistakes in replication or damage (e.g., due to radiation) cross-over Selection Individuals with mutations that give none-functional proteins, may die positiv/negative selective value 48 8
9 32A 423% Can determine the sequence (the sequence (order) of nucleotides/bases of a DNA molecule Find the location of genes Computationally - prediciton Experimentally sequence mrna (cdna) Deduce protein sequence (gene location, coding parts, genetic code) Determine the protein s properties structure Computationally prediciton Experimentally X-ray/magnetic resonance function Computationally prediction Experimentally tailored experiments Kloning // / DNA promoter 1 gene 1 promoter 2 gene 2 promoter 3 gene 3 promoter 4 gene 4 transcription prim-transcript mrna splicing translation, folding proteins regulation 51 &*2 Determine the sequence of bases along the chromosomes Difficult since today s technology allows only to determine short pieces (less than 1000 bases) at a time Need to put the pieces together a giant puzzle! Find where the genes are Gene prediction what features are characteristic for a gene? - a machine learning problem difficult for eukaryotes Find translation to protein order of amino acids Predict properties of the proteins Structure prediciton Function prediction Predict network metabolic and regulatory 52 &'# &! ' #( =!4) Organize and store data. Ca 3 billion bases (A,G,T,C) Finished in 2003 Approx genes (surprisingly few!) What now? Find the function of the genes How they work together Relations to disease, phenotypical properties etc
10 =!4) Organize and store data. Find sequences that overlap and put the genome back together (assembly) =!4) Organize and store data. Find sequences that overlap and put the genome back together (assembly) Identify genes and propose function =!4) Organize and store data. Find sequences that overlap and put the genome back together (assembly) Identify genes and propose function Make models of how the proteins work together &% 2% Not all genes are required In every cell At every time Measure the activity of each gene mrna level Protein level Find genes behaving similarly explain %:'&23 Measure the activity (mrna) of each gene in a cell at a certain point in time For thousands of genes in parallel Useful to understand Gene function Relations between genes Gene 1 Gene 2 Gene n condition 1 condition m
11 '"23 Protein sequences that resemble each other may be related they can be traced back to the same ancestral protein and are said to be homologous If a new protein sequence has a certain degree of similarity to a protein with known properties, we can assume that the new protein has similar properties 2 B"2 String search, comparison/alignment of strings, database search find similar (homologe) genes predct forutsi protein structure and function General search methods search for a good solution to a problem (e.g., assembly of sequence fragments) Machine learningmake model of relationship between protein seequence and structure (structure prediction), predicting genes,
INF280 Søking og maskinlæring
INF280 Søking og maskinlæring Foreleser: Eivind Coward, kontor 5. etg. Datablokken. coward@ii.uib.no Gruppeleder: Harald Barsnes Forelesninger: tirsdag og fredag 12 14 rom 2104 Øvinger: fredag 10 12 rom
DetaljerForeleser: Eivind Coward, kontor 5. etg. Datablokken. coward@ii.uib.no Gruppeleder: Harald Barsnes
Foreleser: Eivind Coward, kontor 5. etg. Datablokken. coward@ii.uib.no Gruppeleder: Harald Barsnes Forelesninger: tirsdag og fredag 12 14 rom 2104 Øvinger: fredag 10 12 rom 2143 Gi en innføring i noen
DetaljerDynamic Programming Longest Common Subsequence. Class 27
Dynamic Programming Longest Common Subsequence Class 27 Protein a protein is a complex molecule composed of long single-strand chains of amino acid molecules there are 20 amino acids that make up proteins
DetaljerUNIVERSITETET I OSLO
UNIVERSITETET I OSLO Det matematisk-naturvitenskapelige fakultet Eksamen i: KJB 492 Bioinformatikk Eksamensdag: Fredag 14. desember 2001 Tid for eksamen: Kl.: 9.00 13.00 Oppgavesettet er på 7 sider. Vedlegg:
DetaljerEKSAMENSOPPGAVE I BI2014 MOLEKYLÆRBIOLOGI
Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet Institutt for biologi EKSAMENSOPPGAVE I BI014 MOLEKYLÆRBIOLOGI Faglig kontakt under eksamen: Ralph Kissen Tlf.: 41344134 (mobil) - Eksamensdato: 11. desember
Detaljer5 E Lesson: Solving Monohybrid Punnett Squares with Coding
5 E Lesson: Solving Monohybrid Punnett Squares with Coding Genetics Fill in the Brown colour Blank Options Hair texture A field of biology that studies heredity, or the passing of traits from parents to
DetaljerFYS 3710 Biofysikk og Medisinsk Fysikk, DNA, RNA, Translasjon, Transkripsjon Proteinsyntese, Cellesyklus
FYS 3710 Biofysikk og Medisinsk Fysikk, 2017 7 DNA, RNA, Translasjon, Transkripsjon Proteinsyntese, Cellesyklus Einar Sagstuen, Fysisk institutt, UiO 18.09.2017 1 DNA A / C / G / T 2 -deoxyribose monofosfate
DetaljerUNIVERSITETET I OSLO
UNIVERSITETET I OSLO Det matematisk-naturvitenskapelige fakultet Eksamen i : INF2300 Grunnkurs i bioinformatikk Eksamensdag : Tirsdag 15. juni 2004 Tid for eksamen : 09.00 12.00 Oppgavesettet er på : 13
DetaljerFlervalgsoppgaver: proteinsyntese
Flervalgsoppgaver - proteinsyntese Hver oppgave har ett riktig svaralternativ. Proteinsyntese 1 Hva blir transkribert fra denne DNA sekvensen: 3'-C-C-G-A-A-T-G-T-C-5'? A) 3'-G-G-C-U-U-A-C-A-G-5' B) 3'-G-G-C-T-T-A-C-A-G-5'
DetaljerUnit Relational Algebra 1 1. Relational Algebra 1. Unit 3.3
Relational Algebra 1 Unit 3.3 Unit 3.3 - Relational Algebra 1 1 Relational Algebra Relational Algebra is : the formal description of how a relational database operates the mathematics which underpin SQL
DetaljerBioteknologi i dag muligheter for fremtiden
Bioteknologi i dag muligheter for fremtiden Arvestoff Genetisk materiale, DNA. Baser En del av et nukleotid som betegnes med bokstavene A, C, G og T. Med disse fire bokstavene skriver DNAtrådene sine beskjeder
DetaljerKapittel 12: FRA DNA TIL PROTEIN:
Kapittel 12: FRA DNA TIL PROTEIN: fra genotype til fenotype 1. Gener og polypeptider 2. DNA, RNA og informasjonsflow 3. Transkripsjon: DNA-dirigert RNA-syntese 4. Den genetiske kode 5. Aktører i Translasjon
DetaljerIntroduksjon til Biokjemi. Ingar Leiros, Institutt for Kjemi, UiT
Introduksjon til Biokjemi Ingar Leiros, Institutt for Kjemi, UiT Biokjemi Biokjemi (Wikipedia): -Studien av de kjemiske prosesser i levende organismer, eller sagt på en annen måte; det molekylære grunnlaget
DetaljerExamination paper for (BI 2015) (Molekylærbiologi, laboratoriekurs)
Department of (Biology) Examination paper for (BI 2015) (Molekylærbiologi, laboratoriekurs) Academic contact during examination: Thorsten Hamann Phone: 91825937 Examination date: 19.12.2016 Examination
DetaljerGrunnleggende cellebiologi
Grunnleggende cellebiologi Ann Kristin Sjaastad Sert. yrkeshygieniker, Dr. Philos HMS-seksjonen, NTNU Tema Cellens oppbygning Transportmekanismer Arvestoff og proteinsyntese Mutasjoner og genotoksisitet
DetaljerUNIVERSITETET I OSLO Det matematisk-naturvitenskapelige fakultet BIOKJEMISK INSTITUTT
UNIVERSITETET I OSLO Det matematisk-naturvitenskapelige fakultet BIOKJEMISK INSTITUTT Eksamen i: KJB492 - Bioinformatikk, 3 vekttall Eksamensdag: Onsdag 13.november 2000 Tid for eksamen: kl. 09.00-13.00
DetaljerSlope-Intercept Formula
LESSON 7 Slope Intercept Formula LESSON 7 Slope-Intercept Formula Here are two new words that describe lines slope and intercept. The slope is given by m (a mountain has slope and starts with m), and intercept
DetaljerForelesninger i BI Cellebiologi. Protein struktur og funksjon - Kap. 3
Forelesninger i BI 212 - Cellebiologi Protein struktur og funksjon - Kap. 3 Tor-Henning Iversen, Plantebiosenteret (PBS),Botanisk institutt,ntnu e-mail : Tor-Henning.Iversen@chembio.ntnu.no Tlf. 73 59
DetaljerDNA - kroppens byggestener
DNA - kroppens byggestener Nina Baltzersen 22. september 2011 Enten man har slått seg, er forkjølet, støl etter trening eller rett og slett bare har en vanlig dag, så arbeider kroppen for fullt med å reparere
Detaljer... Proteiner og enzymer. kofaktor. polypeptid
30 Proteiner og enzymer Proteiner er bygd opp av rekker av aminosyrer som er kveilet sammen ved hjelp av bindinger på kryss og tvers, såkalte peptidbindinger. Slike oppkveilete rekker av aminosyrer kaller
DetaljerMolare forsterkningsbetingelser
Molare forsterkningsbetingelser Hva er mekanismen(e) bak forsterkning? Hvor langt opp eller ned skal man skru mikroskopet for å se godt nok? Kjetil Viken 1 2 ARBEIDSDAG sitte ved pc formelle samtaler møter
DetaljerDatabases 1. Extended Relational Algebra
Databases 1 Extended Relational Algebra Relational Algebra What is an Algebra? Mathematical system consisting of: Operands --- variables or values from which new values can be constructed. Operators ---
DetaljerUNIVERSITETET I OSLO ØKONOMISK INSTITUTT
1 UNIVERSITETET I OSLO ØKONOMISK INSTITUTT BOKMÅL Utsatt eksamen i: ECON2915 Vekst og næringsstruktur Eksamensdag: 07.12.2012 Tid for eksamen: kl. 09:00-12:00 Oppgavesettet er på 5 sider Tillatte hjelpemidler:
DetaljerTrigonometric Substitution
Trigonometric Substitution Alvin Lin Calculus II: August 06 - December 06 Trigonometric Substitution sin 4 (x) cos (x) dx When you have a product of sin and cos of different powers, you have three different
DetaljerUNIVERSITY OF OSLO DEPARTMENT OF ECONOMICS
UNIVERSITY OF OSLO DEPARTMENT OF ECONOMICS Postponed exam: ECON420 Mathematics 2: Calculus and linear algebra Date of exam: Tuesday, June 8, 203 Time for exam: 09:00 a.m. 2:00 noon The problem set covers
DetaljerEKSAMENSOPPGAVE I BI3013 EKSPERIMENTELL CELLEBIOLOGI
Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet Institutt for biologi EKSAMENSOPPGAVE I BI3013 EKSPERIMENTELL CELLEBIOLOGI Faglig kontakt under eksamen: Tor-Henning Iversen (stedfortreder for Jens Rohloff)
DetaljerDen komplette DNA sekvens fra en organisme.
Definisjoner: Hva er et genom? Den komplette DNA sekvens fra en organisme. Den komplette samlingen av gener som koder for alle proteiner, pluss ribosomalt RNA, trna, snrna (involvert i mrna spleising)
DetaljerDen som gjør godt, er av Gud (Multilingual Edition)
Den som gjør godt, er av Gud (Multilingual Edition) Arne Jordly Click here if your download doesn"t start automatically Den som gjør godt, er av Gud (Multilingual Edition) Arne Jordly Den som gjør godt,
DetaljerOppgave 2b V1979 Hvor i cellen foregår proteinsyntesen, og hvordan virker DNA og RNA i cellen under proteinsyntesen?
Bi2 «Genetikk» [3B] Målet for opplæringa er at elevane skal kunne gjere greie for transkripsjon og translasjon av gen og forklare korleis regulering av gen kan styre biologiske prosessar. Oppgave 2b V1979
DetaljerPATIENCE TÅLMODIGHET. Is the ability to wait for something. Det trenger vi når vi må vente på noe
CARING OMSORG Is when we show that we care about others by our actions or our words Det er når vi viser at vi bryr oss om andre med det vi sier eller gjør PATIENCE TÅLMODIGHET Is the ability to wait for
DetaljerEstimating Peer Similarity using. Yuval Shavitt, Ela Weinsberg, Udi Weinsberg Tel-Aviv University
Estimating Peer Similarity using Distance of Shared Files Yuval Shavitt, Ela Weinsberg, Udi Weinsberg Tel-Aviv University Problem Setting Peer-to-Peer (p2p) networks are used by millions for sharing content
DetaljerExercise 1: Phase Splitter DC Operation
Exercise 1: DC Operation When you have completed this exercise, you will be able to measure dc operating voltages and currents by using a typical transistor phase splitter circuit. You will verify your
DetaljerUNIVERSITETET I OSLO
UNIVERSITETET I OSLO Det matematisk-naturvitenskapelige fakultet Eksamen i MAT2400 Analyse 1. Eksamensdag: Onsdag 15. juni 2011. Tid for eksamen: 09.00 13.00 Oppgavesettet er på 6 sider. Vedlegg: Tillatte
DetaljerKROPPEN LEDER STRØM. Sett en finger på hvert av kontaktpunktene på modellen. Da får du et lydsignal.
KROPPEN LEDER STRØM Sett en finger på hvert av kontaktpunktene på modellen. Da får du et lydsignal. Hva forteller dette signalet? Gå flere sammen. Ta hverandre i hendene, og la de to ytterste personene
DetaljerUNIVERSITETET I OSLO
UNIVERSITETET I OSLO Det matematisk-naturvitenskapelige fakultet Eksamen i: MBV3070 Eksamensdag: 10. juni 2005 Tid for eksamen: 9:00 12:00 Oppgavesettet er på 3 side(r) Vedlegg: Ingen Tillatte hjelpemidler:
DetaljerLEKSJON 4: BIOTEKNOLOGI HVORDAN VI BRUKER NATURENS EGNE MEKANISMER TIL VÅR FORDEL, OG UTFORDRINGENE SOM FØLGER MED
LEKSJON 4: BIOTEKNOLOGI HVORDAN VI BRUKER NATURENS EGNE MEKANISMER TIL VÅR FORDEL, OG UTFORDRINGENE SOM FØLGER MED KOMPETANSEMÅL Forklarebegrepene krysning og genmodifisering, og hvordan bioteknologi brukes
DetaljerGenfeil i kreftsvulster nøkkelen til en mer persontilpasset behandling?
Genfeil i kreftsvulster nøkkelen til en mer persontilpasset behandling? Hege G. Russnes Forsker ved Avd. For Genetikk, Institutt for Kreftforskning og overlege ved Avd. For Patologi Oslo Universitetssykehus
DetaljerIssues and challenges in compilation of activity accounts
1 Issues and challenges in compilation of activity accounts London Group on environmental accounting 21st meeting 2-4 November 2015 Statistics Netherlands The Hague Kristine E. Kolshus kre@ssb.no Statistics
DetaljerMoving Objects. We need to move our objects in 3D space.
Transformations Moving Objects We need to move our objects in 3D space. Moving Objects We need to move our objects in 3D space. An object/model (box, car, building, character,... ) is defined in one position
DetaljerNeural Network. Sensors Sorter
CSC 302 1.5 Neural Networks Simple Neural Nets for Pattern Recognition 1 Apple-Banana Sorter Neural Network Sensors Sorter Apples Bananas 2 Prototype Vectors Measurement vector p = [shape, texture, weight]
DetaljerEndelig ikke-røyker for Kvinner! (Norwegian Edition)
Endelig ikke-røyker for Kvinner! (Norwegian Edition) Allen Carr Click here if your download doesn"t start automatically Endelig ikke-røyker for Kvinner! (Norwegian Edition) Allen Carr Endelig ikke-røyker
DetaljerOppgave 1a Definer følgende begreper: Nøkkel, supernøkkel og funksjonell avhengighet.
TDT445 Øving 4 Oppgave a Definer følgende begreper: Nøkkel, supernøkkel og funksjonell avhengighet. Nøkkel: Supernøkkel: Funksjonell avhengighet: Data i en database som kan unikt identifisere (et sett
DetaljerØvingsforelesning 2. Mengdelære, funksjoner, rekurrenser, osv. TMA4140 Diskret Matematikk. 10. og 12. september 2018
Mengdelære, funksjoner, rekurrenser, osv. Øvingsforelesning 2 TMA4140 Diskret Matematikk 10. og 12. september 2018 Dagens øvingsforelesning Spørsmål til emnene i forrige uke Oppgaver fra midtsemesterprøver
DetaljerKapittel 14: Det eukaryote genom og dets uttrykksregulering
Kapittel 14: Det eukaryote genom og dets uttrykksregulering Innhold: 1. Det humane genom 2. Struktur av protein-kodende gener 3. RNA processering 4. Transkripsjonell kontroll 5. Posttranskripsjonell kontroll
DetaljerUNIVERSITETET I OSLO ØKONOMISK INSTITUTT
UNIVERSITETET I OSLO ØKONOMISK INSTITUTT Eksamen i: ECON20/420 Matematikk 2: Matematisk analyse og lineær algebra Exam: ECON20/420 Mathematics 2: Calculus and Linear Algebra Eksamensdag: Fredag 2. mai
DetaljerUNIVERSITY OF OSLO. Make sure that your copy of this examination paperis complete before answering.
UNIVERSITY OF OSLO Faculty of Mathematics and Natural Sciences Exam in BIO4200 Molecular Evolution Day of exam: Wednesday December 17th Exam hours: 14.30 17.30 This examination paper consists of 2 pages.
DetaljerReproduksjon av dyrevirus. Adsorpsjon Penetrasjon og avkledning Replikasjon og transkripsjon Syntese og samling (assembly) av viruskapsid Frigjøring
Reproduksjon av dyrevirus Adsorpsjon Penetrasjon og avkledning Replikasjon og transkripsjon Syntese og samling (assembly) av viruskapsid Frigjøring ATTACHMENT Click after each step to view process PENETRATION
DetaljerReproduksjon av dyrevirus. Adsorpsjon Penetrasjon og avkledning Replikasjon og transkripsjon Syntese og samling (assembly) av viruskapsid Frigjøring
Reproduksjon av dyrevirus Adsorpsjon Penetrasjon og avkledning Replikasjon og transkripsjon Syntese og samling (assembly) av viruskapsid Frigjøring ATTACHMENT Click after each step to view process PENETRATION
DetaljerML-208, generell informasjon
ML-208, generell informasjon Emnekode: ML-208 Emnenavn: Molekylærbiologi Dato:20.12.2017 Varighet:4 timer Tillatte hjelpemidler: Ingen Merknader:Lag gjerne tegninger og figurer for å illustrere og forklare
DetaljerMOL204 Anvendt bioinformatikk I
Universitetet i Bergen Molekylærbiologisk institutt Matematisk-naturvitenskapelig Embetseksamen MOL204 Anvendt bioinformatikk I bokmål / nynorsk / english Mandag 15. desember 2008, 4 timer, kl 9:00-13:00
DetaljerBasepar i DNA. TFY4215 Innføring i kvantefysikk Øving 13 Molekylfysikk
TFY4215 Innføring i kvantefysikk Øving 13 Molekylfysikk Basepar i DNA. Innledning DNA, deoxyribonucleic acid er molekylene som inneholder biologiske cellers genetiske informasjon. DNA er en såkalt biopolymer
DetaljerFYS3710 Molekylærbiologi
1 2 I en eukaryot celle er kromosomene festet i en indre membran som omgir en kjerne. Proteinene produseres i cellens cytoplasma. 3 I en prokaryot celle (for eksempel en bakteriecelle) er det ett kromosom.
DetaljerTFY4170 Fysikk 2 Justin Wells
TFY4170 Fysikk 2 Justin Wells Forelesning 5: Wave Physics Interference, Diffraction, Young s double slit, many slits. Mansfield & O Sullivan: 12.6, 12.7, 19.4,19.5 Waves! Wave phenomena! Wave equation
DetaljerIN2010: Algoritmer og Datastrukturer Series 2
Universitetet i Oslo Institutt for Informatikk S.M. Storleer, S. Kittilsen IN2010: Algoritmer og Datastrukturer Series 2 Tema: Grafteori 1 Publisert: 02. 09. 2019 Utvalgte løsningsforslag Oppgave 1 (Fra
DetaljerDagens tema: Eksempel Klisjéer (mønstre) Tommelfingerregler
UNIVERSITETET I OSLO INF1300 Introduksjon til databaser Dagens tema: Eksempel Klisjéer (mønstre) Tommelfingerregler Institutt for informatikk Dumitru Roman 1 Eksempel (1) 1. The system shall give an overview
DetaljerHan Ola of Han Per: A Norwegian-American Comic Strip/En Norsk-amerikansk tegneserie (Skrifter. Serie B, LXIX)
Han Ola of Han Per: A Norwegian-American Comic Strip/En Norsk-amerikansk tegneserie (Skrifter. Serie B, LXIX) Peter J. Rosendahl Click here if your download doesn"t start automatically Han Ola of Han Per:
DetaljerUNIVERSITETET I OSLO ØKONOMISK INSTITUTT
UNIVERSITETET I OSLO ØKONOMISK INSTITUTT Eksamen i: ECON1910 Poverty and distribution in developing countries Exam: ECON1910 Poverty and distribution in developing countries Eksamensdag: 1. juni 2011 Sensur
DetaljerGraphs similar to strongly regular graphs
Joint work with Martin Ma aj 5th June 2014 Degree/diameter problem Denition The degree/diameter problem is the problem of nding the largest possible graph with given diameter d and given maximum degree
DetaljerGEOV219. Hvilket semester er du på? Hva er ditt kjønn? Er du...? Er du...? - Annet postbachelor phd
GEOV219 Hvilket semester er du på? Hva er ditt kjønn? Er du...? Er du...? - Annet postbachelor phd Mener du at de anbefalte forkunnskaper var nødvendig? Er det forkunnskaper du har savnet? Er det forkunnskaper
DetaljerML-208, generell informasjon
ML-208, generell informasjon Emnekode: ML-208 Emnenavn: Molekylærbiologi Dato:20.12.2017 Varighet:4 timer Tillatte hjelpemidler: Ingen Merknader:Lag gjerne tegninger og figurer for å illustrere og forklare
DetaljerExam in Quantum Mechanics (phys201), 2010, Allowed: Calculator, standard formula book and up to 5 pages of own handwritten notes.
Exam in Quantum Mechanics (phys01), 010, There are 3 problems, 1 3. Each problem has several sub problems. The number of points for each subproblem is marked. Allowed: Calculator, standard formula book
DetaljerHvor mye teoretisk kunnskap har du tilegnet deg på dette emnet? (1 = ingen, 5 = mye)
INF283, HØST 16 Er du? Er du? - Annet Hvor mye teoretisk kunnskap har du tilegnet deg på dette emnet? (1 = ingen, 5 = mye) Hvor mye praktisk kunnskap har du tilegnet deg på dette emnet? (1 = ingen, 5 =
DetaljerVelkommen til BIOS1100
Velkommen til BIOS1100 Innføring i beregningsmodeller for biovitenskap 21. August 2017 Lex Nederbragt https://www.youtube.com/watch?v=nerytl8o- 0Y Aftenposten 16. august 2017 Software Carpentry
DetaljerHva er bioinformatikk? Introduksjon til bioinformatikk. Summary. Menneskets genom. Prokaryoter og eukaryoter. Lars O. Baumbusch
Introduksjon til bioinformatikk Summary Hva er bioinformatikk? Bruk av informatikk og statistikk til å trekke biologisk forståelse ut av molekylære data fra levende organismer Lars O. Baumbusch Senter
DetaljerEn praktisk innføring i team-basert læring
En praktisk innføring i team-basert læring Børge Lillebo borge.lillebo@ntnu.no Frank Alexander Kraemer kraemer@item.ntnu.no Teambasert Læring utviklet av Larry K. Michaelsen i USA aktiv læring flipped
DetaljerHONSEL process monitoring
6 DMSD has stood for process monitoring in fastening technology for more than 25 years. HONSEL re- rivet processing back in 990. DMSD 2G has been continuously improved and optimised since this time. All
DetaljerSemmelweis University. Genetic and epigenetic regulation of. Dept. GCI. the immune response. András Falus. November
Genetic and epigenetic regulation of the immune response András Falus Do-Re-Mi November 5. 2013. Semmelweis University Dept. GCI Encyclopedy of DNA elements of human genome released: April, 2012 The human
DetaljerEKSAMENSOPPGAVE I SØK 1002 INNFØRING I MIKROØKONOMISK ANALYSE
Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet Institutt for samfunnsøkonomi EKSAMENSOPPGAVE I SØK 1002 INNFØRING I MIKROØKONOMISK ANALYSE Faglig kontakt under eksamen: Hans Bonesrønning Tlf.: 9 17 64
DetaljerExamination paper for Bi2014 Molecular Biology
Department of Biology Examination paper for Bi2014 Molecular Biology Academic contact during examination: Professor Atle M. Bones Phone: (+47-)91897237 Examination date/eksamensdag: 8. December 2017 Examination
DetaljerGensøk. Oppsummering. Typer av sammenstillinger. Sammenstilling av sekvenser. To prinsipper for søking etter gener i DNA:
Oppsummering Gensøk Oppsummeringen som gis her omfatter bare de temaer som er forelest av Ole Christian, og er ikke ment å være komplett. I korte trekk gjelder for denne delen av pensum som for de øvrige:
DetaljerUNIVERSITETET I BERGEN Det matematisk-naturvitenskapelige fakultet
Skriftlig eksamen/written Examination Emne/Course: MOL204 Anvendt bioinformatikk I / Applied bioinformatics I Dato/Date: 16. desember/16 December Tillatte hjelpemidler (i samsvar med emnebeskrivelsen)/permitted
DetaljerHvor mye praktisk kunnskap har du tilegnet deg på dette emnet? (1 = ingen, 5 = mye)
INF234 Er du? Er du? - Annet Årsstudent Hvor mye teoretisk kunnskap har du tilegnet deg på dette emnet? (1 = ingen, 5 = mye) Hvor mye praktisk kunnskap har du tilegnet deg på dette emnet? (1 = ingen, 5
DetaljerFIRST LEGO League. Härnösand 2012
FIRST LEGO League Härnösand 2012 Presentasjon av laget IES Dragons Vi kommer fra Härnosänd Snittalderen på våre deltakere er 11 år Laget består av 4 jenter og 4 gutter. Vi representerer IES i Sundsvall
DetaljerHva er fakta og hva er spekulasjon i forbindelse med moderne genforskning?
Hva er fakta og hva er spekulasjon i forbindelse med moderne genforskning? Av Erling Skår, Høgskolen i Volda Sagen kort Man gør ofte meget ud af at mennesket har genmateriale fælles med andre pattedyr,
DetaljerHovedområde: Bioteknologi Eksamensoppgaver fra skriftlig eksamen Naturfag (NAT1002).
Hovedområde: Bioteknologi Eksamensoppgaver fra skriftlig eksamen Naturfag (NAT1002). Oppgave 26 V2008 Et eksempel på godkjent bruk av bioteknologi i Norge er A) gentesting for arvelige sykdommer B) genterapi
DetaljerEmnedesign for læring: Et systemperspektiv
1 Emnedesign for læring: Et systemperspektiv v. professor, dr. philos. Vidar Gynnild Om du ønsker, kan du sette inn navn, tittel på foredraget, o.l. her. 2 In its briefest form, the paradigm that has governed
DetaljerHvor mye teoretisk kunnskap har du tilegnet deg på dette emnet? (1 = ingen, 5 = mye)
INF234 Er du? Er du? - Annet Hvor mye teoretisk kunnskap har du tilegnet deg på dette emnet? (1 = ingen, 5 = mye) Hvor mye praktisk kunnskap har du tilegnet deg på dette emnet? (1 = ingen, 5 = mye) Hvor
DetaljerNaturfag for ungdomstrinnet
Naturfag for ungdomstrinnet Arv Illustrasjoner: Ingrid Brennhagen 1 Vi skal lære om arvestoffet, DNA celledeling genetisk variasjon arv 2 DNA Arvestoffet kalles DNA. DNA er kjempestore molekyler som inneholder
DetaljerFYSMEK1110 Eksamensverksted 23. Mai :15-18:00 Oppgave 1 (maks. 45 minutt)
FYSMEK1110 Eksamensverksted 23. Mai 2018 14:15-18:00 Oppgave 1 (maks. 45 minutt) Page 1 of 9 Svar, eksempler, diskusjon og gode råd fra studenter (30 min) Hva får dere poeng for? Gode råd fra forelesere
DetaljerHva viser genanalyser av muskulatur hos laks med mørke flekker. Aleksei Krasnov, Hooman Moghadam Nofima, Ås
Hva viser genanalyser av muskulatur hos laks med mørke flekker Aleksei Krasnov, Hooman Moghadam Nofima, Ås Spørsmål Har mørke flekker lik eller ulik profil? Vevsskade og nydannelse av vev? Type betennelse?
DetaljerEpigenetikk; arvesynden i ny innpakning? Dag O. Hessen University of Oslo, Dept. Biology Center of Ecological and Evolutionary Synthesis (CEES)
Epigenetikk; arvesynden i ny innpakning? Dag O. Hessen University of Oslo, Dept. Biology Center of Ecological and Evolutionary Synthesis (CEES) Den genetiske kode Oppnøstingen av den genetiske kode foregikk
DetaljerAndrew Gendreau, Olga Rosenbaum, Anthony Taylor, Kenneth Wong, Karl Dusen
Andrew Gendreau, Olga Rosenbaum, Anthony Taylor, Kenneth Wong, Karl Dusen The Process Goal Definition Data Collection Data Preprocessing EDA Choice of Variables Choice of Method(s) Performance Evaluation
DetaljerPlan. Pensum i bioinformatikk. Hva er bioinformatikk?
Bioinformatikk - et interessant forskningsfelt for statistikere? Mette Langaas Hva er bioinformatikk? Plan Bakgrunn i biologi (gen, genom). Forskningsområder innen bioinformatikk. Funksjonell genomikk:
DetaljerFlervalgsoppgaver: Arvestoffet
Flervalgsoppgaver - Arvestoffet ver oppgave har ett riktig svaralternativ Arvestoffet 1 va er komponentene i et DNA-nukleotid? A) et par komplementære baser B) en dobbelthelix som holdes sammen av hydrogenbindinger
DetaljerAdministrasjon av postnummersystemet i Norge Post code administration in Norway. Frode Wold, Norway Post Nordic Address Forum, Iceland 5-6.
Administrasjon av postnummersystemet i Norge Frode Wold, Norway Post Nordic Address Forum, Iceland 5-6. may 2015 Postnumrene i Norge ble opprettet 18.3.1968 The postal codes in Norway was established in
DetaljerMannen min heter Ingar. Han er også lege. Han er privatpraktiserende lege og har et kontor på Grünerløkka sammen med en kollega.
Kapittel 2 2.1.1 Familien min Hei, jeg heter Martine Hansen. Nå bor jeg i Åsenveien 14 i Oslo, men jeg kommer fra Bø i Telemark. Jeg bor i ei leilighet i ei blokk sammen med familien min. For tiden jobber
DetaljerHvor mye teoretisk kunnskap har du tilegnet deg på dette emnet? (1 = ingen, 5 = mye)
INF102, HØST 16 Er du? Er du? - Annet Hvor mye teoretisk kunnskap har du tilegnet deg på dette emnet? (1 = ingen, 5 = mye) Hvor mye praktisk kunnskap har du tilegnet deg på dette emnet? (1 = ingen, 5 =
DetaljerUNIVERSITETET I OSLO ØKONOMISK INSTITUTT
UNIVERSITETET I OSLO ØKONOMISK INSTITUTT BOKMÅL Eksamen i: ECON1210 - Forbruker, bedrift og marked Eksamensdag: 26.11.2013 Sensur kunngjøres: 18.12.2013 Tid for eksamen: kl. 14:30-17:30 Oppgavesettet er
DetaljerPublic roadmap for information management, governance and exchange. 2015-09-15 SINTEF david.norheim@brreg.no
Public roadmap for information management, governance and exchange 2015-09-15 SINTEF david.norheim@brreg.no Skate Skate (governance and coordination of services in egovernment) is a strategic cooperation
DetaljerTEKSTER PH.D.-KANDIDATER FREMDRIFTSRAPPORTERING
TEKSTER PH.D.-KANDIDATER FREMDRIFTSRAPPORTERING DISTRIBUSJONS-E-POST TIL ALLE KANDIDATER: (Fornavn, etternavn) Den årlige fremdriftsrapporteringen er et viktig tiltak som gjør instituttene og fakultetene
DetaljerNORSI Kappe workshop - introduction
NORSI Kappe workshop - introduction Aim of workshop Main aim: Kick-starting the work of the dissertation «kappe» Other aims: Learn from each other Test a modell for an intensive workshop Discussion feedback
DetaljerDialogkveld 03. mars 2016. Mobbing i barnehagen
Dialogkveld 03. mars 2016 Mobbing i barnehagen Discussion evening March 3rd 2016 Bullying at kindergarten Mobbing i barnehagen Kan vi si at det eksisterer mobbing i barnehagen? Er barnehagebarn i stand
DetaljerMedisin stadium 1A Geir Slupphaug, IKM. Den eukaryote cellen I
Medisin stadium 1A Geir Slupphaug, IKM Den eukaryote cellen I Celler finnes i utallige varianter Prokaryote celler Prokaryote celler deles inn i archaebakterier og eubakterier. De er relativt små (1-5
DetaljerCall function of two parameters
Call function of two parameters APPLYUSER USER x fµ 1 x 2 eµ x 1 x 2 distinct e 1 0 0 v 1 1 1 e 2 1 1 v 2 2 2 2 e x 1 v 1 x 2 v 2 v APPLY f e 1 e 2 0 v 2 0 µ Evaluating function application The math demands
DetaljerDen eukaryote cellen I. Prokaryote celler
Medisin stadium 1A Geir Slupphaug, IKM Celler finnes i utallige varianter Den eukaryote cellen I Prokaryote celler deles inn i archaebakterier og eubakterier. De er relativt små (1-5 μm) og har en enkel
DetaljerFASMED. Tirsdag 21.april 2015
FASMED Tirsdag 21.april 2015 SCHEDULE TUESDAY APRIL 21 2015 0830-0915 Redesign of microorganism lesson for use at Strindheim (cont.) 0915-1000 Ideas for redesign of lessons round 2. 1000-1015 Break 1015-1045
Detaljer3/1/2011. I dag. Recursive descent parser. Problem for RD-parser: Top Down Space. Jan Tore Lønning & Stephan Oepen
INF2820 Datalingvistikk V2011 TABELLPARSING Jan Tore Lønning & Stephan Oepen 1. mars 2011 2 I dag Oppsummering fra sist: Recursive-descent og Shift-reduce parser Svakheter med disse Tabellparsing: Dynamisk
DetaljerHva er syntetisk liv? Svein Valla Institutt for bioteknologi NTNU
Hva er syntetisk liv? Svein Valla Institutt for bioteknologi NTNU Syntetisk liv, ifølge Wikipedia: The creation of synthetic life is a goal of scientists working in the fields of synthetic biology or exploring
DetaljerFYS 3710 Biofysikk og Medisinsk Fysikk, Aminosyrer, Polypeptider, Proteiner
FYS 3710 Biofysikk og Medisinsk Fysikk, 2016 5 Aminosyrer, Polypeptider, Proteiner Einar Sagstuen, Fysisk institutt, UiO 06.09.2016 1 sp n -hybridisering: for hovedkvantetall N=2 er de fire valensorbitalene
Detaljer