~ høgskolen i oslo. Emne: Biokjemi. Emnekode: SO 461 K Faglig veileder: Ragnhild Augustson. Pruppe(r): 2K. Dato: Antall oppgaver: 4

Transkript

1 høgskolen i oslo Emne: Biokjemi Emnekode: SO 461 K Faglig veileder: Ragnhild Augustson Pruppe(r): 2K Eksamensoppgaven består av: Antall sider (inkl. forsiden): 3 Dato: Antall oppgaver: 4 Eksamenstid: Antall vedlegg: 3,Tillatte hjelpemidler: Kalkulator Kandidaten må selv kontrollere at oppgavesettet er fullstendig. Ved eventuelle uklarheter i oppgaveteksten skal du redegjøre for de forutsetninger du legger til grunn for løsningen. Avdeling for ingeniørutdanning. Cort Adelersgate Oslo. tlf: faks: 22 Jf;) iu@hio.no

2 Oppgave 1 a) Hvilken type organismer er definert som prokaryote celler? Hva er forskjellene på prokaryote og eukaryote celler? b) Bakterier klassifiseres gjeme som Gram negative eller Gram positive. Forklar hva Gram fargingsmetoden går ut på og hvorfor bakteriene kan identifiseres som Gram positive eller Gram negative etter denne metoden. c) Bakterier formerer seg ved todeling av cellen. Gi eksempler på metoder for å kontrollere celleveksten i en flytende bakteriekultur. Forklar også hvordan bakteriekulturens vekstkurve vil se ut dersom veksten følges fra bakteriene tilsettes det sterile mediet til bakteriekulturen dør. Oppgave 2 a) Proteiner er bygget opp av aminosyrer. Hvor i cellen foregår syntesen av proteinene, og hvilken type binding dannes mellom aminosyrene? Tegn et eksempel på en slik binding. b) Aminosyrene har flere ioniserbare grupper som vil påvirke proteinenes ladning. Hvilken nettoladning vil tetrapeptidet Gly-Ala-Lys-Asp ha ved henholdsvis ph 2 og ved ph 7 (se vedlegg l for detaljer om pk verdier) c) For en enzymkatalysert reaksjon har det vært gjort forsøk med økende substratkonsentrasjon og konstant enzymkonsentrasjon med og uten inhibitor tilstede. Reaksjonshastigheten, va, er målt spektrofotometrisk som mengde produkt dannet pr. tid. I tabellen under vises forsøksdataene for fem ulike substratkonsentrasjoner [8]. Vo er reaksjonshastigheten uten inhibitor tilstede, og VI er reaksjonshastigheten med inhibitor tilstede. Lag et Lineweaver-Burk plot for reaksjonsdataene med og uten inhibitor og avgjør ut fra disse om inhibitoren er konkurrerende eller ikke konkurrerende. Beregn V maks og KM for reaksjonen henholdsvis med og uten inhibitor. [8] (ov) Vo (oi/ml.min) 87.0 VI (mol/ml.min) Q S8 -.lo-.2& 16.1 Oppgave 3 a) Hvor foregår henholdsvis glykolysen, sitronsyresyklusen og elektrontransportkjeden i den eukaryote cellen? Hva er funksjonen til de tre reaksjonssporene nevnt over? 2

3 b) Definer hva fosforylering på substratniva er. og angi i hvilke reaksjoner slik fosforylering foregår i glykolysen og i sitronsyresyklusen (se vedlegg 2 og 3). c) Forklar hvordan energien fra elektrontransportkjeden overføres til syntese av ATP i den prosessen som kalles oksidativ fosforylering. Oppgave 4 a) Forklar følgende begreper: - sukker-fosfat ryggrad - Chargaffs regel - replikasjon - transkripsjon - pnmer - Okazaki fragment b) Beskriv de strukturelle ulikhetene mellom RNA og DNA. Hva slags funksjon har de tre ulike fonnene av RNA i cellen? Beskriv funksjonene til hver av de tre RNA fonnene. c) Hvilke tre faser består proteinsyntesen av? Beskriv kort hva som skjer i hver av de tre fasene. 3

4 Vedlegg 1 til eksamen biokjemi juni 2004 Tabell l. Verdier for de ioniserbare.. Aminosyre DK. pkr Generell struktur for fire utvalgte aminosyrer H I X' + H:JN- H O + I " HIoI- c -c-o-, ",)".3' Glycine Alanine Aspartate Lysine 4

5 Vedlegg 2 til eksamen i biokjemi juni 2004 Oversikt over glykolysen uten koenzymer og A TP Glukose l Glukose- 6-fosfat Glyseraldehyd-3-fosfat. t Glysersyre-l,3-bisfosfat. Glysersyre-3-fosfat., (;lysersyre-2-fosfat Fosofenolpyrodruesyre.. Pyrodruesyre Fruktose 1,6-bisfosfat... D ih ydro ksyaceto n f osf a t 1! Glyseraldehyd-3-fosfat, Glysersyre-l,3-bisfosfat -,. Glysersyre-3-fosfat.. Glysersyre-2-fosfat! Fosfoenolpyrodruesyre. Pyrodruesyre 5

6 Vedlegg 3 til eksamen biokjemi juni 2004 Oversikt over sitronsyresyklusen uten koenzymer og A TP Pyrodruesyre Fumarsyre H-t-!-O- Ravsyre..I c- 6 H O I Il H-<;:-C-O- H-C-H, C-S-COA n o 6