Forskning ved Institutt for basalfag og akvamedisin (BasAm)

Transkript

1 Forskning ved Institutt for basalfag og akvamedisin (BasAm) Mona Aleksandersen 18. november 2010

2 Fakta om instituttet Omsetning mill 105 ansatte 26 faste vitenskapelige 8 postdoktor/forsker 35 stipendiater ca 30 TA-ansatte Inndelt i 5 fagseksjoner: Akvamedisin og ernæring Anatomi og patologi Biokjemi og fysiologi Genetikk Klinisk patologi

3 Undervisning og diagnostikk Undervisning av veterinær- og dyrepleierstudenter Ved Basam undervises i: akvamedisin anatomi biokjemi cellebiologi (klinisk) ernæring fysiologi genetikk, klinisk patologi patologi Integrert og kontekstavhengig undervisning Diagnostikk er en omfattende aktivitet i noen fag

4 Forskning ved BasAm Ekstern finansiering utgjør omlag 50 % av omsetningen Totalt 60 prosjekter: 6 EU-prosjekter 40 NFR-prosjekter Forskningssamarbeid internasjonalt og nasjonalt Viktige forskningstema er: Akvamedisin Medisinsk genetikk og funksjonell genomforskning Ernæring og helse hos fisk og husdyr Immunbiologi Prionsykdom

5 Forskergrupper BasAm Forskergruppe Biodiversity and horse genomics Medisinsk genetikk Host-pathogen interaction in infection and immunity in fish Leder Knut Røed professor Frode Lingaas professor Øystein Evensen professor Nutrition and health of domestic animals Zebrafish models in functional genomics Defense mechanisms and genetics Prion Aldring Nevrodegenerasjon (PAN) Immunobiology of production animals Centre of reproduction and reproductive toxicology, ProdMed Åshild Krogdahl professor Peter Alestrøm professor Erling Olaf Koppang førsteamanuensis Michael Tranulis professor Charles Press professor Erik Ropstad professor

6 Forskergruppe: Host-pathogen interaction in infection and immunity in fish

7 PHARMAQ og Norges veterinærhøgskole har påvist viruset som forårsaker CMS hos laks Et forskningssamarbeid mellom PHARMAQ og Norges veterinærhøgskole har ført til påvisningen av viruset som forårsaker CMS (hjertesprekk) hos atlantisk laks. Det at et spesifikt agens er påvist som årsak til CMS gjør at det åpner seg nye muligheter for å kontrollere og begrense sykdommen. PHARMAQ vil fremover kartlegge mulighetene for å utvikle vaksiner mot CMS som forårsaker store tap hos opprettsnæringen.

8 IPN virus Vi har arbeidet med å karakterisere virus fra alle deler av produksjonssyklus Hovedfokus: virusets sykdomsframkallende egenskaper (virulens)

9 Sykdomsframkallende egenskaper hos IPN virus Gjennom mange forsøk har vi vist at IPN viruset forekommer i mange forkledninger Det finnes milde varianter som ikke gir sykdom Det forekommer mellomformer som gir lav til moderat dødelighet Stammer gir høy dødelighet (nesten all fisk dør som følge av smitte) Santi N, Vakharia VN, Evensen Ø (2004). Identification of putative motifs involved in the virulence of infectious pancreatic necrosis virus. Virology 322: Santi N, Song H, Vakharia VN, Evensen Ø (2005). Infectious pancreatic necrosis virus VP5 is dispensable for virulence and persistence. Journal of Virology 79: , Santi N, Sandtrø A, Sindre H, Song H, Hong JR, Thu B, Wu JL, Vakharia VN, Evensen Ø (2005). Infectious pancreatic necrosis virus induces apoptosis in vitro and in vivo independent of VP5. Virology 342: Song H, Santi N, Evensen Ø, Vakharia VN (2005). Molecular determinants of infectious pancreatic necrosis virus virulence and cell culture adaptation. Journal of Virology, 79:

10 De ulike variantene av IPN virus T 247 har sitt eget fingeravtrykk T 217 A 221 PTA TAT Ved et sykdomsutbrudd kan vi påvise fingeravtrykket og avsløre hvem som er synderen

11 Hva kan vi så bruke denne informasjonen til? For sykdomskontroll i det enkelte fiskeoppdrettsanlegg Forhindre spredning av sinte varianter av IPN virus Det har betydning for vaksinasjon Utvikling av vaksiner og valg av virusstammer i vaksinene, noe som i sin tur gir bedre vaksiner og mindre sykdom i alle deler av produksjonen

12 Genom-forskning på hest Genkartlegging Wade et al Science 326: Biodiversitet Genetiske mekanismer og assosiasjonsstudier til leddlidelser (osteochondrose) Samarbeid med klinikken + internasjonalt konsortium Røntgenundersøkelser + SNP-chip analyser 400 hester SNP s Lykkjen et al Animal Genetics 41:

13 Genetiske studier på reinsdyr Reproduksjonssuksess hos rein Utbredt samarbeid NVH-UMB Produksjonsmessig effekter av ulik bukkestruktur Evolusjon/historikk til tamrein og villrein Opprinnelse og spredning av den tidlige reindrifta Opprinnelse og utvikling av villreinstammer

14 Forskergruppe medisinsk genetikk Et viktig mål med forskningen er bedre helse - dyrevelferd Fysisk helse Psykisk helse

15 Hund en unik genetisk modell Alle hunderaser har noe Arvelige sykdommer Høyrisiko raser Høy prevalens av spesifikke sykdommer Hundegenomet sekvensert- alt moderne verktøy tilgjengelig Lite genetisk variasjon innenfor rase, linjeavl: Menneske: En sykdom 10 ulike gener I én hunderase: en sykdom ett gen - > Lettere å finne!! Utfordring: diagnostikk og innsamling av materiale Viktig med effektiv innsamling Biobank viktig

16 Mange raser- mange spesifikke arvelige egenskaper (UNIK MODELL) Arvelige sykdommer Atferdsegenskaper varierer mellom raser og gener som styrer disse kan lettere finnes enn hos menneske u u u u Aggressivitet manisk depresjon Frykt-angst OCD, obscessive compulsive disorder-schizophreni Jaktegenskaper-gjeteregenskaper-rasepersonalitet Kreft Størrelse, hastighet, konformasjon (boxer-mynde)

17 Arvelige sykdommer med kompleks arvegang 100 affiserte og 100 ikke-affiserte nok ved 5x økt risiko i en rase => 97% power Dette er verifisert i flere studier Altså: Også for komplekse sykdommer med arvelig bakgrunn kan det lett identifiseres gener hos hund. Dette er svært vanskelig hos menneske Bilde til høyre: Kloløsning hos Gordon setter eksempel på en kompleks sykdom hos hund der vi har funnet en slik assosiasjon Lignede sykdommer i negl hos menneske

18 Komplekst arvelige sykdommer Store forskjeller i risiko mellom raser Diabetes

19 Genetisk forskning på hund gir resultater Det fins ingen art som har en nærmere tilknytning til mennesker Det er et betydelig antall arvelige problemstillinger å ta fatt i Det fins ingen art der det er lettere å finne årsaken til arvelige sykdommer Stor internasjonal aktivitet Mange viktige resultater, nye gentester hver uke, høyt renommerte tidsskrifter Noen sykdommer der vi har identifisert mutasjoner i Norge: Arvelig nyre-og hudkreft Ceroid lipofuscinose Dagblindhet

20 Ernæring ved NVH: Forskning Norsk Fiskeoppdrett 2000 J Fish Dis 2007 Fish Shellfish Immunol 09

21 Immunbiologi Fokus på reaksjoner i vev: Immunapparat (Peyerpletter) Ontogenese Infeksjoner Patotoksikologi Sykdomsmekanismer

22 Noen utfordringer Ekstern finansiering Tematikk Produktivitet Innovasjon