Global Biodiversity Information Facility (GBIF) Seminar: Forvaltning av naturdata

Transkript

1 Fylkesmannen i Oslo og Akershus Seminar ved KLIF konferansesenter på Helsfyr i Oslo Global Biodiversity Information Facility (GBIF) Seminar: Forvaltning av naturdata Dag Endresen GBIF Norge, Naturhistorisk museum, Universitetet i Oslo (NHM-UiO) Global Biodiversity Information Facility (GBIF) 5. juni 2013

2 Hva er GBIF? Internasjonale partnere Darwin Core terminologi GBIF data portal Norske samlingsportaler Stabile ID-nøkler 2

3 GBIF arbeider for fri og åpen tilgang til biodiversitetsdata online. Vi er et internasjonalt og statlig initiert og finansiert nettverk med fokus på å bidra til at biodiversitetsdata er tilgjengelig for alle og enhver, for vitenskapelig forskning, bevaring og bærekraftig utvikling. Status data-portal juni

4 4

5 5 Norge ble medlem i februar 2004.

6 6

7 FNs Millennium Ecosystem Assessment (2005) viste at menneskelige handlinger ofte leder til irreversible tap innen det biologiske mangfoldet, og at disse tap har vært større i de siste 50 årene enn noen gang før i menneskehetens historie. Biologisk mangfold er nøkkelen til en bærekraftig fremtid og evnen av naturlige og sosiale systemer for å tilpasse seg endringer, er avgjørende for nesten alle aspekter av menneskets velvære. Fordi menneskeskapte trusler mot biologisk mangfold oppstår over brede romlige og tidsmessige skalaer, biologisk mangfold og økosystem overvåkning, varsling, og risikovurderinger krever data som er organisert i en globalt og lett-tilgjengelig, integrert infrastruktur. GBIF s Data Portal leverer denne infrastruktur. 7

8 8

9 GBIF og GEO Intergovernmental group on earth observations Biodiversity observation network Data Integration & Interoperability 9 GBIF bygger infrastrukturen for å levere artsdata.

10 Global Invasive Alien Species Information Partnership GBIF bygger infrastrukturen for å levere artsdata. Lansert under CBD COP11, 10 oktober 2012, Hyderabad, India. 10

11 GBIF og IPBES (Naturpanelet) Intergovernmental Science-Policy Platform on Biodiversity and Ecosystem Services (IPBES) 11

12 1. Informasjonsinfrastruktur en Internet-basert indeks for et globalt distribuert nettverk av databaser som inneholder primær biodiversitetsdata. 2. Programvare, standarder og protokoller verktøy som dataleverandører behøver for å formattere og publisere data. 3. Opplæring og kurs tilgang til et globalt nettverk med eksperter. 12

13 Darwin Core terminologi, vokabulær Wieczorek J, Bloom D, Guralnick R, Blum S, Döring M, De Giovanni R, Robertson T, and Vieglais D (2012) Darwin Core: An Evolving Community-Developed Biodiversity Data Standard. PLoS ONE 7(1): e (doi: /journal.pone )

14 Integrert tilgang for artsobservasjoner for alle arter: Hva? Når? Hvor? Bevis og dokumentasjon? Dataeier? Lenke til originaldata Forekomst av art

15 Integrert tilgang for artsobservasjoner for alle arter: Hva? Når? Hvor? Bevis og dokumentasjon? Dataeier? Lenke til originaldata Forekomst av arter Utvidelser kompatibel med Darwin Core standarden, pluss: Hvilke arter er funnet sammen? Hvilke datasett er direkte sammenlignbare? Hvilke arter er mest tallrike på ulike lokaliteter? Forekomst og fravær av arter

16 Darwin Core Arkiv (DwC-A) Publiseringsformat for Darwin Core termer inkludert flere standardiserte utvidelser. Enkelt tekstbasert format. Zip-komprimert filarkiv. Germplasm.txt 16

17

18 Samlingen med fiskepreparater ved NHM fikk longitude og latitude kolonner forvekslet Indexed by GBIF 14 January 2013 Oppdaget og korrigert i april. 18 Indexed by GBIF 3 May 2013

19 19

20 13,0 millioner artsdata fra lokaliteter i Norge GBIF globalt: 13,0 millioner artsobservasjoner og objekter (11,8 millioner med koordinater) i Norge. 12,2 millioner artsobservasjoner og objekter er publisert FRA norske dataleverandører.

21 12,2 millioner artsdata fra dataeiere i Norge. 12,2 millioner artsobservasjoner og objekter er publisert FRA norske dataleverandører. GBIF globalt: 12,9 millioner artsobservasjoner og objekter fra lokaliteter i Norge.

22 Danmark Finland Norge Sverige Island

23 23 GBIF leverer data for artsobservasjoner og museumsobjekter til Artskart.

24 24 GBIF Norge har en enkel dataportal for de norske datasettene.

25 25 Nye dataportaler for norske samlinger. Oppgradering til Darwin Core arkiv i Norge. Stabile ID-nøkler (UUID, QR-kode). Datasett metadata (data manuskript). GIS server for miljødata.

26 26

27 27

28 28

29 Muligheter med Darwin Core: UiB Artskart UiT GBIF Portal Darwin Core Arkiv NTNU Portal for kommune eller landsdel??

30

31 31

32 Hensikten med ID-nøkler Er å gi navn til ting, slik at det blir mulig å referere til dem. Hva er en ID-nøkkel: An association between a string and a thing (Kunze 2003). Each identifier refers to one and only one thing (Coyle 2006). A stated association between a symbol and a thing; that the symbol may be used to unambiguously refer to the thing within a given context (Campbell 2007). 32

33 QR-kode for alle samlingsobjekter ved NHM-UiO vil gi: Maskin-lesbar ved hjelp av en ordinær mobiltelefon (eller en barkodeleser). Nye og effektive rutiner for arbeid og vedlikehold av samlingene. Implementasjon av stabile ID-nøkler egnet for data-nettverk (og GBIF). 33 Note! UUID: c37e3f9b-bcaf eb7-3346a2db2373 only for DEMO!

34 Catalog number: O-L , 34

35 35

36 36

37 37

38 Node medarbeidere Dag Endresen, Nodeleder Christian Svindseth, Overingeniør Fridtjof Mehlum, Forskningssjef Einar Timdal, Førsteamanuensis Vegar Bakkestuen, Forsker Geir Søli, Førsteamanuensis Nært samarbeide med Artsdatabanken Nils Valland 38

39 Takk for oppmerksomheten! GBIF Norge Dag Endresen