Årsmelding Studere lære forstå. Vi utdanner for fremtiden! Fakultet for biovitenskap og akvakultur. 1

Transkript

1 Årsmelding 2012 Fakultet for biovitenskap og akvakultur Vi utdanner for fremtiden! Studere lære forstå 1

2 2012: Ny strategi, forandring og vekst! Fakultetsdirektør Nina Ellingsen Høiskar og dekan Reid Hole. Som del av eit universitet har Fakultet for biovitenskap og akvakultur (FBA) tre viktige samfunnsoppgåver; å bidra med forsking, formidling og forskingsbasert undervising. Nordland fylkeskommune og DA Bodø har vore aktive partnarar for å gjera både universitetet generelt og fakultetet spesielt i stand til å oppfylla desse viktige oppgåvene. FBA fekk som eit døme 9 millionar kroner til ei ytterlegare styrking av forsking innan marin genomikk i Organisasjonsutvikling FBA starta året med å implementera strategien som var vedteken av styret i november Første del var å organisera forskarane i tre strategiske forskingsgrupper, Akvakultur, Marin økologi og Marin genomikk. Vi avslutta året med å reorganisera teknisk stab. Teknikarane høyrer med dette anten inn under fakultetet sin forskingsstasjon i Mørkvedbukta eller ei av dei tre strategiske forskingsgruppene. For begge disse reorganiseringane var det viktig å få klarlagd kvar folk høyrer til, kva ansvar den einskilde har og kven som kan bestilla oppgåver frå den einskilde. Reorganiseringa var eitt av fleire tiltak med fokus på å skapa eit stadig betre arbeidsmiljø. Vi har også arrangert allmøte og kvartalsvise strategimøte der alle tilsette var inviterte til å delta. Leiargruppa ved fakultetet har hatt møte annankvar veke og er sentral i arbeidet med utvikling og leiing av fakultet. Mennesket ved FBA er vår viktigaste ressurs, og vi investerer i mennesket ved å ha samlingspunkt der vi steg for steg byggjer ein felles kultur grunnlagt på klare verdiar. Vi har også tilsett mange nye, dyktige medarbeidarar i løpet av året, eit viktig steg for å stimulera nytenking og framgang. Vekst i studenttal og poengproduksjon Fakultetet auka produksjonen av studiepoeng per heiltidsekvivalent frå 37.9 i 2011 til 43.7 i Dette er vi svært nøgde med og vil takke alle som gjorde sitt for dette gode resultatet. Vi såg også i 2012 ein solid auke i talet på studentar samanlikna med Auken er kombinert med at vi har det høgaste karaktersnittet for opptekne studentar ved UiN. Det lovar godt for framtidig studiepoengproduksjon! Det var difor ekstra hyggeleg at Fiskeri- og kystminister Lisbeth Berg-Hansen deltok i opning av studieåret ved FBA i 2012, og formidla viktig- 2

3 heta av kunnskap for utviklinga av havbruksnæringa for studentane våre. Vi har gjennom året hatt mange studentar som har vore gode ambassadørar for UiN, FBA og for våre ulike studietilbod. Fornøgde studentar er vår viktigaste rekrutteringsverktøy og essensielt for å vera eit attraktivt fakultet for talentfulle studentar. Vitskapleg integritet og næringssamarbeid FBA skal vera eit næringsretta fakultet tufta på akademiske verdiar og vitskapleg integritet. Representantar frå ulike deler av organisasjonen har vore ute i både offentleg sektor og i privat næringsliv for å forstå kva behov dei har både for kandidatar og for oppgåver som kan få ei forskingsbasert løysing. Dette har ført til at vi fekk inn store industriprosjekt. Spesielt må nemnast innsatsen til tilsette innan marin økologi der industrifinansierte prosjekt er ei ny erfaring. Men tilsette frå fakultetet har også kome med løysingar knytt til korleis vi kan betra velferda til laks i oppdrett, noko eitt selskap implementerte straks og auka overlevinga på smolt frå ca 85 % til 98 %! Eit anna døme er arbeidet med å produsera steril fisk, som det er søkt patent på. Dette er to dømer av eit utal, eitt for direkte implementering, og eitt som treng langvarig forsking. Men fellesnemnaren for begge er at dei treng ein solid porsjon grunnleggjande forsking, noko som i det eine tilfellet kunne nyttast for å gi betydeleg økonomisk gevinst. vi nå begge måla. For å nå måla, må vi bli meir synlege i det norske landskapet innan kjerneområda våre. FBA har som ein del av vårt profilerings- og formidlingsarbeid i ei årrekke arrangert Åpen Bukt, eit arrangment som tiltrekkjer seg rundt 1000 Bodøværingar kvar haust. Arrangementetet er ein del av dei nasjonale forskingsdagane. Hausten 2012 fekk fakultetet UiN sin formidlingspris for dette konseptet. Dette er ein viktig del av FBA sitt arbeid for å stimulere til interesse for biologiske fag. Internasjonalt ansvar Noreg har ei leiande rolle internasjonalt både innan økologi og akvakultur, to satsingsområde ved FBA. Tilsette i overnasjonale organ som FAO peikar på at Noreg har ei internasjonal plikt til å bidra med kompetanse innan global akvakultur for å utvikla næringa frå ekstensiv til intensiv basert på moderne, bærekraftige prinsipp. Her kan både FBA, men også dei andre fakulteta ved UiN bidra. Vi må i langt større grad enn tidlegare bryta ned silotenkinga internt ved FBA, men også mellom fakulteta ved UiN. Dei framtidige, bærekraftige løysingane krev at spørsmål blir vurderte frå ein biologisk, økonomisk og samfunnsvitskapleg forskingsvinkel. I tillegg til at vi må ha gode lærarar som motiverer ungdom til studium som er relevante for det nye samfunnet studenter i 2020! Men kva er ein organisasjon utan store mål? Målet om 1000 studentar i 2020 står fast, likeeins at minimum 40% av aktiviteten vår skal finansierast gjennom eksterne prosjekt. Vi har ein veg å gå, men med felles innsats skal Reid Hole Dekan Nina Ellingsen Høiskar Fakultetsdirektør Ledergruppa ved FBA 2012: Dekan Fakultetsdirektør Akvakultur Marin økologi Marin genomikk Administrasjon Reid Hole Nina E. Høiskar Kiron Viswanath (prodekan) Ørjan Hagen Ketil Eiane (visedekan) Galice Hoarau Jorge Fernandes Truls Moum Wenche Bergheim-Evensen/ Hillgrun Aune Åpning av studieåret 2012/2013 med Fiskeri- og kystminister Lisbeth Berg-Hansen som hovedtaler. Robert Eliassen 3

4 Fakultetets visjon FBA bidrar i utviklingen av en bærekraftig kunnskapsbasert bioøkonomi. Veien til visjonen Være et ledende senter for utdanning og forskning innen biovitenskap i nordområdene Identifisere og arbeide mer integrert med miljø som vil investere i vår kompetanse Skape målbare verdier for våre studenter og interessenter Kontinuerlig utvikle den akademiske dannelse og vitenskapelige integritet i nært samarbeid med våre interessenter Fakultetsstyret FBA ( ) Fakultetsstyret er fakultetets øverste organ og har ansvar for å fastsette overordnede mål, prioriteringer og strategier for FBA. Fakultetetsstyret har i 2012 avholdt fem styremøter og behandlet strategisk viktige saker, både når det gjelder strategi, økonomi og organisasjon. Styret ledes av Frank Larsen (55), bioteknolog og dr. philos i biomedisin fra UiO. Larsen er seriegründer og har jobbet internasjonalt med bioteknologi i selskapene Qiagen, Dynal, GenoVision og Mole. Larsen har de senere årene arbeidet med innovasjon basert på kompetanse fra kunnskapsintensive miljø. Han bygget opp kommersialiseringsselskapet Birkeland for UiO, og er nå leder av Hedmark Kunnskapspark. Fakultetsstyrets sammensetning i 2012 har vært som følger: Eksterne medlemmer, oppnevnt av styret ved UiN Varamedlem: Frank Larsen (styreleder) Stig Falk-Petersen Edel Anne Norderhus (nestleder) Medlemmer valgt blant fast ansatte i undervisnings- og forskningsstilling Monica Brinchmann Ørjan Hagen Igor Babiak Medlem valgt blant midlertidig ansatte i undervisnings- og forskerstilling (funksjonstid ) Alexander Jüterbock Medlem valgt blant teknisk/administrativt personale Roald Jakobsen Medlemmer fra studentene (funksjonstid ) Tina Reppe Lars Berg-Hansen Varamedlem: Marit Bjørnevik Varamedlem: Sünnje L. Basedow Varamedlem: Ellen Sirnes (permisjon) Randi Restad Sjøvik Varamedlem: April Snøfrid Kleppe Vebjørn H. Henni 4

5 Økonomi Bevilgningen til Fakultet for biovitenskap og akvakultur fra Kunnskapsdepartementet inneholder en basiskomponent og en resultatbasert komponent. Den resultatbaserte komponenten blir gitt på grunnlag av produserte studiepoeng, poenggivende vitenskapelige publikasjoner, uteksaminerte doktorgradskandidater og FoU-virksomhet finansiert av EU og Norges Forskningsråd. studiepoengsproduksjonen med 17 %. Økningen skyldes høyere studenttall og økning i studiepoengsproduksjon per student. Hovedutfordringen er fortsatt å rekruttere flere studenter til grunn- og bachelorstudier som rekrutterer videre til fakultetets master- og ph.d-program. Karaktersnittet blant fakultetets førsteprioritetssøkere er det høyeste ved UiN. FBA økte sine inntekter med 8.7 millioner kroner fra 2011 til Den ordinøre budsjettrammen økte med 3,6 mill. koner, mens bidrags- og oppdragsfinansiert virksomhet hadde en økning på 5,1 mill.kr i samme perioden. For å beholde rammebetingelsene også for de kommende år, har fakultetet fokus på å rekruttere nye studenter og tiltak som bedrer studiekvaliteten og derigjennom studiepoengsproduksjonen. Fra 2011 til 2012 økte Det ble uteksaminert totalt fem ph.d.-studenter, noe som utgjør 1/3 av UiN s totale produksjon i FBA har 15 ph.d.-studenter, hvorav 13 er eksternfinansiert. FBA hadde to post doctor-stillinger tilknyttet eksternt finansierte prosjekt. Tabellen nedenfor inkluderer inntekter og kostnader tilknyttet FBA s ordinære og eksternt finansierte virksomhet (tall i 1000 NOK): Regnskap 2012 Regnskap 2011 Endring Bevilgning fra KD Salgs og leieinntekter Bidrags- og oppdragsfinansiert aktivitet Interne inntekter Sum driftsinntekt Lønnskostnader Investeringer Andre driftskostnader Indirekte kostnader Sum driftskostnad Interne transaksjoner Endring avsetning Resultat fra bidragsprosjekt Resultat oppdragsprosjekt Balanseposter ( - gjeld/+ fordring) Avsatt bevilgning til senere perioder Gjeld NFR Prosjektfordring/-gjeld Virksomhetskapital (fri) Stipendmidler

6 Studier Doktorgrad I 2012 startet fakultetet arbeidet med en redefinering av ph.d.-graden i akvakultur. Redefineringen er reflekterert gjennom det nye navnet på graden, ph.d. i akvatisk biovitenskap som vil bli gjort gjeldende fra Doktorgradsutdanningen i akvatisk biovitenskap har som formål å utvikle kunnskap og utdanne høyt kompetente personer til verdikjedene knyttet til akvakultur og biovitenskap. I den redefinerte graden kan studenter også spesialisere seg innen marin økologi og marin genomikk, men der grunnleggende kunnskap innen akvakultur inngår. Gjennom avhandlingen skal ph.d.-kandidaten dokumentere forskningskompetanse innenfor fagområdet på høyt vitenskapelig nivå. Doktorgraden omfatter studiet av struktur, funksjon og adferd hos levende organismer i akvatiske økosystem, hovedsakelig knyttet til den marine sektor. Studiet vil kvalifisere kandidater til stillinger innen forskning og undervisning ved høgskoler og universiteter, til forskning og utviklingsarbeid ved forskningsinstitusjoner, og til stillinger innen marin sektor og akvakulturnæringen i Norge og i utlandet. Master i havbruk Den raskt voksende og kunnskapsintensive havbruksnæringen har økende behov for personer med høy kompetanse. Som masterstudent i havbruk blir studentene en del av et internasjonalt forskningsmiljø med mulighet for spennende masteroppgaver innenfor fiskehelse og -velferd, sjømatkvalitet, marin genomikk eller reproduksjonsbiologi. Masteroppgaver gjennomføres ofte i samarbeid med næringslivet eller offentlig sektor, og kan tas på heltid eller deltid. Master i marin økologi Studiet er for studenter som lurer på hvordan gener er satt sammen og fungerer, eller vil ha dypere innsikt i hvordan klimaendringene og havbruksnæringen påvirker økosystemet langs kysten. Som masterstudent blir studentene en del av et internasjonalt forskningsmiljø med mulighet for å skrive spennende masteroppgaver innenfor marin økologi og marin genomikk. Bachelor i havbruksdrift og ledelse, inklusiv Y-vei Bachelor i havbruksdrift og ledelse gir studentene en tverrfaglig, næringsrettet utdannelse med praksis i havbruksnæringen som en del av studiet. Havbruk er en av fremtidens mest spennende næringer. Det er behov for høy og allsidig kompetanse hos de som skal drive oppdrett, foredle og markedsføre produktene, delta i oppdrettsnæringens ulike organisasjoner eller arbeide innen forvaltningen. Y-vei: Studiet kommer også i en tilrettelagt versjon for de som har fagbrev i akvakultur, industriell matproduksjon, sjømathandlerfaget eller sjømatproduksjon, og som ønsker å skaffe seg økt formalkompetanse gjennom en bachelorgrad. Studentportrett Lars Berg-Hansen (23) studerer havbruk og ledelse ved Universitet i Nordland. Tre grunner til hvorfor du valgte å studere havbrukdsdrift og ledelse? 1. Med utsikter til en seksdobling av sjømatproduksjonen innen år 2050, trenger du ikke være rakettforsker for å forstå at dette er en næring med en spennende fremtid og karrieremuligheter! 2. Jeg ønsker muligheten til å ha ulike typer jobber, enten jeg vil jobbe i by eller bygd, på kontor eller ute i det fri. Dette er en mangfoldig næring. 3. Jeg har et ønske om å bidra til å utvikle en næring i vekst. Tre grunner til hvorfor du har valgt å studere i Bodø? 1. Bodø er best på havbruk grunnet fagmiljøet 2. Det er billig å bo bra i Bodø 3. Her er det trivelige folk med åpent, nordnorsk lynne Foto: Sven Arnt Eriksen, UiN 6

7 Bachelor i eksportmarkedsføring Fiskeri- og havbruksnæringa er Norges tredje største eksportnæring etter olje og gass., og emner innen sjømat og havbruk gir kunnskap om denne viktige eksportbransjen. Bachelor i eksportmarkedsføring gir solide kunnskaper innen generell markedsføring, salg og markedskommunikasjon. Bedriftsøkonomi, logistikk og språk inngår også som sentrale elementer i studiet. Med Bachelor i eksportmarkedsføring er studenter kvalifisert til å jobbe med salg og markedsføring innen et vidt spekter av bransjer og markeder. Bachelor i biologi Biologer undersøker hvordan organismer er satt sammen og fungerer, hvordan bestander utvikler seg i samspillet med sitt miljø og hvordan økosystemet varierer i struktur og funksjon. Bachelor i biologi gir studentene kunnskap om levende organismer, fra de miste molekyl som utgjør cellenes byggesteiner, til store økosystemer. Bachelorstudentene får innføring i et bredt fagfelt, som forener studier av blant annet molekyler, celler, fysiologi, evolusjon, biodiversitet og økologi. Joint Bachelor Degree in Animal Science Bachelor i Animal Science er en fellesgrad innen veterinærmedisin mellom Universitetet i Nordland og University of Veterinary Medicine and Pharmacy (UVMP), Kosice, Slovakia. Studentene tar de første tre semestrene (1,5 år) ved UiN og de tre siste semestrene (1,5 år) ved UVMP i Kosice. Studiet gir en grunnleggende biologisk utdanning og en innføring i veterinærmedisin. Studiet tilsvarer de første tre årene av veterinærstudiet, og UiN studentene er garantert overgang til det EU-godkjente veterinærstudiet ved UVMP etter fullført bachelorgrad. Årsstudium i biologi og kjemi Studiet gir studenter en smakebit på naturfaglige studier, og tilsvarer første året på Bachelor i biologi. Årsstudiet gir grunnleggende kunnskaper i blant annet biologi, kjemi og matematikk, og kvalifiserer studenter til direkte overgang til andre året på Bachelor i biologi. Grunnstudium Studiet for studenter som mangler de nødvendige realfagene for å begynne på naturvitenskapelige studier. Studiet består av en realfagdel som gir kvalifikasjoner tilsvarende matematikk R1 og kjemi 2 fra videregående skole. Den andre delen av studiet består av emnene examen philosophicum, biologi, norsk samt valgemner. 7

8 Forskning Menneskeheten sin avhengighet av havet øker jo flere innbyggere det blir på jorden. Dette vil kreve stor forskningsinnsats for å sikre en bærekraftig utvikling. Innenfor marin forskning har Fakultet for biovitenskap og akvakultur (FBA) strategisk valgt ut tre relativt brede satsningsområder: Akvakultur, Marin økologi og Marin genomikk. Innen hver av disse strategiske forskningsgruppene har vi en faglig satsning innen de områdene som framkommer av figuren over. Vår strategi er å bruke genomikk som et unikt redskap i den forskningen som gjennomføres knyttet til akvakultur og økologi. Fakultet samarbeider i utstrakt grad med industrielle partnere for å sikre relevansen av vårt arbeid. Akvakultur FBA sine akvakulturforskere arbeider med tre fagområder: fiskehelse, reproduksjonsbiologi og sjømatkvalitet. Målet er å sikre bærekraftig produksjon av trygg og næringsrik sjømat. Som eksempel kan det nevnes at våre fagfolk innen genomikk og akvakultur samarbeider internt, men også mot nasjonale og internasjonale forskningsmiljøer for å utnytte potensialet som mikroalger representerer som unike og bærekraftige produksjonssystemer for mat og fôr. Innen forskningsområdet fiskehelse arbeider fakultet med sykdomsresistens, kartlegging av fiskehelse og fiskevelferd. Bærekraftig produksjon av sjømat innebærer god kontroll med selve reproduksjonen og forståelse av dens biologi. Her arbeides det for eksempel med hvordan både egg- og melkekvalitet påvirker levedyktigheten hos fiskeyngel. Sjømatkvalitet påvirkes av mange faktorer, slik som fôringredienser, tilsetningsstoffer, fiskevelferd og -helse, områder som våre forskere arbeider med for å bidra til god kvalitet på norsk sjømat. Marin genomikk FBA sine forskere innen marin genomikk arbeider med problemstillinger knyttet til akvakulturgenomikk og evolusjonsgenomikk. Molekylærbiologi og bioinformatikk benyttes i studiet av struktur, funksjon og utvikling av gener og genomer relatert til havbruk og marin økologi. Forskningen omfatter blant annet forholdet mellom gener som kontrollerer immunitet og vekst i arter som blir oppdrettet og hvordan ytre faktorer påvirker genuttrykket. Vi ser også på om det er gener hos marine organismer, slik som koraller og ulike fiskearter, som er knyttet til spesifikke miljøtilpasninger og atferd. Fakultet har investert i et laboratorium for genomikk med et høyteknologisk instrument for DNA-sekvensering av typen SOLiD, det første i sitt slag i Norge. Her kan vi blant annet utføre sekvensering av komplette genomer og transkriptomer, samt profilering av regulatorisk RNA. 8

9 Marin økologi FBA sine forskere innen marin økologi har fokus på tre fagfelt: bentosøkologi, biofysiske interaksjoner og marin molekylær økologi. Forskningsgruppen har et høyt kunnskapsnivå om marine miljøer i fjordene, langs kontinentalsokkelen og ute i det åpne havet. Fakultetet investerer i tverrfaglig forskning der vi vektlegger bruk av ny teknologi for å øke forståelsen av inngrep, tiltak som iverksettes og hvilke endringer som skjer i miljøet. Genomikk benyttes for å supplere de økologiske feltdata som samles inn i forbindelse med vår forskning. Aktuelle tema innen marin økologi er klima og menneskeskapte effekter, kommersielle fiskearter og andre viktige pelagiske og bunnlevende arter, problemstillinger knyttet til episodiske hendelser i havet, slik som destruktivt beite, parasittutbrudd, nedbeiting av tareskogen og påfølgende tap av det biologiske mangfoldet blant bunnlevende organismer. Førsteamanuensis Monica Fengsrud Brinchmann og ph.d.-student Amod Kulkarni. 9

10 God fiskevelferd - forskingsbasert verdiskaping! Med bakgrunn i varierende resultater fra tidligere års smoltproduksjon i Mainstream Norway AS sine fire settefiskanlegg i Nordland, startet UiN og Mainstream et forskningsprosjekt for å se på løsninger for økt fiskevelferd. Smoltproduksjon innebærer ofte store problemer med ulike produksjonslidelser som sår og finneskader, med etterfølgende lav overlevelse og høy sykdomsutvikling etter utsett i sjø. Ulike stressreduserende tiltak ved anleggene har lyktes, og man har redusert stressnivåene på smolten i 2010 og 2011 med ca. 66 % og tilsvarende økt overlevelsen med 75 % sammenliknet med resultater fra Disse endringene i stressnivå og økt overlevelse etter utsett er mot trenden i resten av oppdretts- Norge, hvor tapene etter utsett holder seg stabilt på ca. 17 %. Den økte overlevelsen tilsvarer en førstehåndsverdi på smolt på henholdsvis 6.9 mill. nok (2010) og 6.2 mill. nok (2011), og kan gi en mulig fortjeneste i 2010 kroner på henholdsvis 34 mill. (2010) og 30.7 mill. (2011). Genomikk-laboratoriet ved FBA Genomikk-laboratoriet ved FBA ble etablert i 2010 og er under stadig utvikling. DNA-sekvensering har vært sentralt innenfor biologien i mer en 30 år, men har vært langsom og kostbar. Ny teknologi for DNA-sekvensering betyr at vi nå tar del i en faglig revolusjon med vidtrekkende betydning for en rekke biologiske fagområder. Den nye teknologien bygger på massiv parallell sekvensering, også kalt dybdesekvensering, dvs. at man produserer flere millioner sekvenser samtidig. DNA-sekvensene blir så satt sammen og analysert ved hjelp av kraftige datamaskiner. Dette krever store ressurser og spesialisert ekspertise innenfor IT. Med finansiering fra NFK og DA Bodø vil FBA styrke staben med to fulle prosjektstillinger innenfor genomikk i Sentralt i utviklingen av en kunnskapsbasert bioøkonomi står forskning relatert til økologi og akvakultur. De tre strategiske forskningsgruppene ved fakultetet benytter seg av genomikk-laboratoriet i stadig flere av sine prosjekter på marine organismers biologi. Miljøendringer relatert til klima og forurensing er i dag et sentralt tema. Genomikken åpner helt nye muligheter for å studere miljøtilpasninger og sårbarhet og det forskes på et spekter av ulike organismer som spenner fra tang, via koraller og sjøanemoner, til dyreplankton, fisk og sjøfugl. Genomikk-laboratoriet bidro til karakteriseringen av torskens genom i 2011 og i kjølvannet av dette forskes det bl.a. på torskens immunsystem, utviklingsbiologi, kjønnsmodning og bestandsstruktur. Genomikken er sentral i FBA s forskning relatert til akvakultur, bl.a. på avlsegenskaper, egg- og larvekvalitet, sykdomsresistens og tarmflora hos laks, kveite og torsk. 10 Prof. Jorge Fernandes, leder av Strategisk forskningsgruppe marin økologi

11 Disputaser 2012 Jareeporn Ruangsri (Thailand) Characterization of antimicrobial peptides in Atlantic cod Hovedveileder: Prof. Jorge Manuel de Oliveira Fernandes Muhammad Naveed Yousaf (Pakistan) Characterization of the cardiac pacemaker and pathological responses to cardiac diseases in Atlantic salmon (Salmo salar L.) Hovedveileder: Prof. Mark D. Powell Carlos Frederico Ceccon Lanes (Brasil) Comparative Studies on the Quality of Eggs and Larvae from Broodstocks of Farmed and Wild Atlantic cod Hovedveileder: Prof. Igor Babiak Arvind Sundaram (India) Understanding the specificity of the Innate Immune Response in Teleosts: Characterisation and Differential Expression of Teleost-spcific Toll-like Receptors and MicroRNAs Hovedveileder: Prof. Jorge Manuel de Oliveira Fernandes Teshome Tilahun Bizuayehu (Etiopia) Characterization of microrna during early ontogeny and sexual development of Atlantic halibut (Hippoglossus hippoglossus L.) Hovedveileder: Prof. Igor Babiak Nøkkeltall 2012 Fakultet for biovitenskap og akvakultur blir målt på grunnlag av produserte studiepoeng, publikasjonspoeng, uteksaminerte doktorgradskandidater og FoU-virksomhet finansiert av EU og Norges Forskningsråd (NFR). Tabellen viser en oversikt over våre nøkkeltall for 2012 sammenlignet med Studiepoengsproduksjon (ant. heltidsekv.) 176,9 151,6 Publikasjonspoeng 36,75 36 Opptak av ph.d.-studenter 4 1 Fullførte ph.d.-studenter 5 1 Antall reg. ph.d.-studenter Prosjektmidler: EU-prosjekt 0,9 mill 1,0 mill NFR-prosjekt 6,6 mill 7,9 mill Fakultetet har ca 22,4 mill i eksternt finansiert virksomhet i I tillegg til EU og Norges forskningsråd kommer andre FOU-prosjektmidler: Nordland Fylkeskommune 2,6 mill, Mabit 1,5 mill, organisasjoner 1,4 mill, næringsliv inkl. Sparebanken Nord-Norge 3,9 mill. Etter- og videreutdanningsprosjekter utgjør ca 2 millioner kroner. 11

12 Forskningsstasjonen Foto: Chris André Johnsen FBA sin forskningsstasjon ligger i Mørkvedbukta, en naturskjønn perle bare en mil fra Bodø sentrum, og rundt 15 minutters gange fra Campus. Fra etableringen som en feltstasjon i 1988, kan forskningsstasjonen i dag tilby moderne fasiliteter fordelt på 3 uteavdelinger, 6 forsøkshaller og flere klimastyrte rom. Med rikelig tilgang på rent sjøvann fra Saltenfjorden, både fra 10m, 15m og 250m dyp, og flere muligheter for oppvarming og nedkjøling av vann, kan vi tilpasse vannkvalitet og miljøbetingelser for en rekke marine arter. I tillegg kan vi tilby mindre oppsett for bruk av ferskvann med ønsket vanntemperatur. Med støtte fra forskningsstasjonens ansatte, som har høy, variert og relevant biologisk og teknisk kompetanse, løses de fleste utfordringer for fakultetets vitenskapelige ansatte. Fakultetet opprettholder et aktivt forsknings- og kompetansemiljø, der våre oppdragsgivere får utført sine prosjekter og forsøk etter høy standard. Miljøet er dynamisk og internasjonalt. Dette gir grunnlag for utveksling og utvikling av kunnskap innen mange fagfelt. I 2012 har forsøkene omfattet arter som rognkjeks, berggylt, torsk, laks, kveite og stingsild, fordelt på 27 prosjekter ved fakultetet. Noen av temaene for de gjennomførte forsøkene har vært: effekt av temperatur, triploidisering, probiotika, startfôring, pigmenter og effekt av lys. Under ledelse av fakultetets forskere har forskningsstasjonen bidratt i 10 bedriftsprosjekter og 17 mindre eksterne oppdrag i løpet av året. Prosjekter og aktiviteter med fokus på produksjon av laks har innbefattet fiskevelferd, vaksinering, slakting, lysmiljø i anlegg, temperaturtoleranse og ulike analyser. Forskningsfartøyet Tanteyen, en Viksund 1030, er en viktig del av infrastrukturen ved fakultetet. Denne blir hyppig benyttet til tokt både for prosjekter og undervisning i vårt nærområde. Ved behov leies det i tillegg inn større, havgående fartøyer. Mannskapet har lang erfaring med prøvetaking og innsamling av data. FBAs forskningsfartøy Tanteyen på tokt Fra arrangementet Åpen bukt 12

13 Senter for etter- og videreutdanning i havbruk Fakultetet for biovitenskap og akvakultur (FBA) etablerte i 2009 Senter for etter- og videreutdanning i havbruk (SEVH), og har blitt en ledende leverandør av etter- og videreutdanning til sjømatnæringen. Fakultetets etablering av senteret ble støttet av NCE Aquaculture og Nordland fylkeskommune. Etter prosjektperioden besluttet fakultetet å gjøre senteret permanent for å sikre kontinuerlig leveranse av kurs til næringen, og driften finansieres i dag av fakultetet. Rådgiver Viktor Solbakken er fakultetets kontaktperson for etter- og videreutdanningsstudier (EVU). I dag tilbyr fakultetet to årsstudium: Årsstudium i havbruksdrift og Årsstudium i kvalitetsledelse i sjømatproduksjon. Begge studier består av seks emner (á 10 studiepoeng), totalt 60 studiepoeng som oppnås over tre år. Studiet i havbruksdrift er rettet mot kandidater på alle nivå i havbruksbedriftene, mens studiet i kvalitetsledelse i sjømatproduksjon er rettet mot personer som jobber innen slakteri/foredlingsleddet. Det gis også et halvårsstudium i havbruksdrift bestående av tre emner som gir 30 studiepoeng. UiN ved FBA har ambisjoner om å videreutvikle SEVH som et sterkt redskap som bidrar til kompetansebasert bærekraftig og sunn næringsutvikling. Fra samling med EVU-studenter. Amanuensis Grete Lysfjord til venstre. Studentforeningen Studentforeninga Universitetet i Nordland Fakultet for biovitenskap og akvakultur Nugla er studentforeningen for alle som studerer ved Fakultet for biovitenskap og akvakultur (FBA). Studentforeningen skal representere og ivareta studentenes interesser, først og fremst overfor fakultetsledelsen og de faglig ansatte. Nugla er representert i Studenttinget som er det høyeste demokratiske organet for studentene ved Universitet i Nordland. vil etablerte studenter ved FBA legge til rette for at nye studenter blir kjent med universitetet, studiene, medstudenter og byen. Leder for Nugla i 2012 er Marthe Austad som tar Bachelor i biologi. Foruten å ivareta de demokratiske og faglige interessene til studentene, er studentforeningen drivkraften bak det sosiale livet ved institusjonen. Nugla har tradisjonsrike arrangementer gjennom året som inkluderer Rekeaften, Bacalaoaften, Nyttårstur og ikke minst årets høydepunkt Havets Aften! Studentforeningen arrangerer fadderperioden hver høst ved semesterstart. Gjennom tre uker Fra Havets aften - et lite utvalg av de mange rettene som serveres! 13

14 Fagfellevurderte vitenskapelige publikasjoner 2012 Poenggivende vitenskapelig produksjon, inkludert Online-First artikler. 14 STRATEGISK FORSKINGSGRUPPE AKVAKULTUR (totalt 37 publikasjoner) Amar, Edgar C.; Viswanath, Kiron; Tetsuya, Akutsu; Satoh, Shuichi; Watanabe, Takeshi. Resistance of rainbow trout Oncorhynchus mykiss to infectious hematopoietic necrosis virus (IHNV) experimental infection following ingestion of natural and synthetic carotenoids. Aquaculture 2012; Volum 330. s Babiak, Igor; Marschhauser, Vegard; Ottesen, Oddvar; Rudolfsen, Geir; Eggen, Bjørnar; Babiak, Joanna. Effects of extender, storage and sperm-to-egg ratio on cryopreservation success of Atlantic cod (Gadus morhua L.) sperm. Journal of Applied Ichthyology 2012; Volum 28. (6) s Babiak, Joanna; Babiak, Igor; van Nes, Solveig; Harboe, Torstein; Haugen, Trine; Norberg, Birgitta. Induced sex reversal using an aromatase inhibitor, Fadrozole, in Atlantic halibut (Hippoglossus hippoglossus L.). Aquaculture 2012; Volum s Bizuayehu, Teshome; Babiak, Joanna; Norberg, Birgitta; Fernandes, Jorge; Johansen, Steinar; Babiak, Igor. Sexbiased mirna expression in Atlantic halibut (Hippoglossus hippoglossus) brain and gonads. Sexual Development 2012; Volum 6.(5) s Bizuayehu, Teshome; Lanes, Carlos Fredrico Ceccon; Furmanek, Tomasz; Karlsen, Bård Ove; Fernandes, Jorge; Johansen, Steinar; Babiak, Igor. Differential expression patterns of conserved mirnas and isomirs during Atlantic halibut development. BMC Genomics 2012; Volum 13. s. - Caipang, Christopher. Expression of genes involved in the early immune response at the distal segment of the gut in Atlantic cod, Gadus morhua L. after vaccination with a bacterial antigen. Aquaculture International 2012 s. - Caipang, Christopher; Lazado, Carlo Cabacang; Brinchmann, Monica; Viswanath, Kiron. Transcription of selected immunerelated genes in spleen cells of cod, Gadus morhua following incubation with alginic acid and beta-glucan. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology 2012; Volum s D Arcy, Jack; Dunaevskaya, Evgenia; Treasurer, J.W.; Ottesen, Oddvar; Maguire, Julie; Zhuravleva, Nonna; Karlsen, Åsbjørn; Rebours, Celine; Fitzgerald, Richard. Embryonic development in ballan wrasse Labrus bergylta. Journal of Fish Biology 2012; Volum 81. (3) s Dhanasiri, Anusha; Fernandes, Jorge; Viswanath, Kiron. Glutamine synthetase activity and the expression of three glul paralogues in zebrafish during transport. Comparative Biochemistry and Physiology - Part B: Biochemistry & Molecular Biology 2012; Volum 163.(3-4) s Ghigliotti, Laura; Fevolden, Svein-Erik; Cheng, C.-H. C; Babiak, Igor; Dettai, A.; Pisano, Eva. Karyotyping and cytogenetic mapping of Atlantic cod (Gadus morhua Linnaeus, 1758). Animal Genetics 2012; Volum 43.(6) s Hanssen, Henriette; Imsland, Albert; Foss, Atle; Vikingstad, Erik; Bjørnevik, Marit; Solberg, Christel; Roth, Bjørn; Norberg, Birgitta; Powell, Mark Darryn. Effect of different feeding regimes on growth in juvenile Atlantic cod, Gadus morhua L.. Aquaculture 2012; Volum s Hernandez, Adrian; Satoh, Shuichi; Viswanath, Kiron. Supplementation of Citric Acid and Amino Acid Chelated Trace Elements in Low-Fish Meal Diet for Rainbow Trout Affect Growth and Phosphorus Utilization. Journal of the World Aquaculture Society 2012; Volum 43.(5) s Iversen, Martin Haugmo; Økland, Finn; Thorstad, Eva Bonsak; Finstad, Bengt. The efficacy of Aqui-S vet. (iso-eugenol) and metomidate as anaesthetics in European eel (Anguilla anguilla L.), and their effects on animal welfare and primary and secondary stress responses. Aquaculture Research 2012 Johnsen, Chris André; Hagen, Ørjan; Solberg, Christel; Björnsson, Björn Thrandur; Jönsson, Elisabeth; Johansen, Sten Johan Sverre; Bendiksen, Eldar Åsgard. Seasonal changes in muscle structure and flesh quality of 0+ and 1+ Atlantic salmon (Salmo salar L.): impact of feeding regime and possible roles of ghrelin. Aquaculture Nutrition 2013 ;Volum 19.(1) s Korsnes, Kjetil; Karlsbakk, Egil; Nylund, Are; Nerland, Audun H. Horizontal transmission of nervous necrosis virus between turbot Scophthalmus maximus and Atlantic cod Gadus morhua using cohabitation challenge. Diseases of Aquatic Organisms 2012; Volum 99.(1) s Kulkarni, Amod; Rombout, Jan H. W. M.; Singh, I. S. B.; Sudheer, N. S.; Vlak, J. M.; Caipang, Christopher; Brinchmann, Monica; Viswanath, Kiron. Truncated VP28 as oral vaccine candidate against WSSV infection in shrimp:an uptake and processing study in the midgut of Penaeus monodon. Fish and Shellfish Immunology 2013 ;Volum 34.(1) s Lanes, Carlos Frederico Ceccon; Fernandes, Jorge; Viswanath, Kiron; Babiak, Igor. Profiling of key apoptotic, stress, and immune-related transcripts during embryonic and postembryonic development of Atlantic cod (Gadus morhua L.). Theriogenology 2012; Volum 78.(7) s Lanes, Carlos Fredrico Ceccon; Bizuayehu, Teshome; Bolla, Sylvie; Camila, Martins; Fernandes, Jorge; Adalto, Bianchini; Viswanath, Kiron; Babiak, Igor. Biochemical composition and performance of Atlantic cod (Gadus morhua L.) eggs and larvae obtained from farmed and wild broodstocks. Aquaculture 2012; Volum 324. s Lanes, Carlos Fredrico Ceccon; Bolla, Sylvie; Fernandes, Jorge; Nicolaisen, Ove; Viswanath, Kiron; Babiak, Igor. Nucleotide Enrichment of Live Feed: A Promising Protocol for Rearing of Atlantic Cod Gadus morhua Larvae. Marine Biotechnology 2012; Volum 14.(5) s Lazado, Carlo Cabacang; Caipang, Christopher. Activation of intestinal epithelial cells in Atlantic cod, Gadus morhua, induced by algal derivatives. Aquaculture Research 2012; Volum 43.(8) s Lazado, Carlo Cabacang; Caipang, Christopher; Viswanath, Kiron. Enzymes from the gut bacteria of Atlantic cod, Gadus morhua and their influence on intestinal enzyme activity. Aquaculture Nutrition 2012; Volum 18.(4) s Lokesh, Jep; Fernandes, Jorge; Korsnes, Kjetil; Bergh, Øivind; Brinchmann, Monica Fengsrud; Viswanath, Kiron. Transcriptional regulation of cytokines in the intestine of Atlantic cod fed yeast derived mannan oligosaccharide or beta-glucan and challenged with Vibrio anguillarum. Fish and Shellfish Immunology 2012; Volum 33.(3) s Ottesen, Oddvar; Dunaevskaya, Evgenia; D Arcy, Jack. Development of Labrus Bergylta (Ascanius 1767) Larvae from Hatching to Metamorphosis. Journal of Aquaculture Research & Development 2012; Volum 3.(127) Ottesen, Oddvar; Marschhauser, Vegard; Babiak, Igor. Effects of Cryopreservation on Morphology and Viability of Sperm and Larvae of Atlantic Cod, Gadus morhua L.. Journal of the World Aquaculture Society 2012; Volum 43.(3) s Phromkunthong, Wutiporn; Nuntapong, Nutt; Boonyaratpalin, Mali; Viswanath, Kiron. Toxicity of melamine, an adulterant in fish feeds: experimental assessment on its effects on tilapia. Journal of Fish Diseases 2012 s. - Powell, Mark Darryn; Burke, Melissa; Dahle, Dalia. Cardiac remodelling of Atlantic halibut Hippoglossus hippoglossus induced by experimental anaemia with phenylhydrazine. Journal of Fish Biology 2012; Volum 81.(1) s Presslauer, Christopher; Nagasawa, Kazue; Fernandes, Jorge; Babiak, Igor. Expression of vasa and nanos3 during primordial germ cell formation and migration in Atlantic cod (Gadus morhua L.). Theriogenology 2012; Volum 78.(6) s Ruangsri, Jareeporn; Fernandes, Jorge; Rombout, Jan H. W. M.; Brinchmann, Monica F; Viswanath, Kiron. Ubiquitous presence of piscidin-1 in Atlantic cod as evidenced by immunolocalisation. BMC Veterinary Research 2012; Volum 8.

15 Ruangsri, Jareeporn; Salger, Scott; Caipang, Christopher; Viswanath, Kiron; Fernandes, Jorge. Differential expression and biological activity of two piscidin paralogues and a novel splice variant in Atlantic cod (Gadus morhua L.). Fish and Shellfish Immunology 2012; Volum 32.(3) s Torrecillas, S; Makol, A; Caballero, MJ; Montero, D; Dhanasiri, Anusha; Sweetman, J; Izquierdo, M. Effects on mortality and stress response in European sea bass, Dicentrarchus labrax (L.), fed mannan oligosaccharides (MOS) after Vibrio anguillarum exposure. Journal of Fish Diseases 2012; Volum 35.(8) s Torrissen, Ole; Glover, Kevin; Haug, tore; Misund, Ole Arve; Skaug, Hans J.; Kaiser, Matthias. Good ethics or political and cultural censoring in science?. ICES Journal of Marine Science 2012; Volum 69.(4) s Viswanath, Kiron. Fish immune system and its nutritional modulation for preventive health care. Animal Feed Science and Technology 2012; Volum 173.(1-2) s Viswanath, Kiron; Phromkunthong, Wutiporn; Huntley, Mark; Archibald, Ian; de Scheemaker, Gabe. Marine microalgae from biorefinery as a potential feed protein source for Atlantic salmon, common carp and whiteleg shrimp. Aquaculture Nutrition 2012; Volum 18.(5) s Yousaf, Muhammed; Amin, Anil; Koppang, Erling Olaf; Vuolteenaho, Olli; Powell, Mark Darryn. Localization of natriuretic peptides in the cardiac pacemaker of Atlantic salmon (Salmo salar L.). Acta Histochemica 2012; Volum 114.(8) s Yousaf, Muhammed; Koppang, Erling Olaf; Skjødt, Karsten; Hordvik, Ivar; Zou, Jun; Secombes, Chris; Powell, Mark Darryn. Comparative cardiac pathological changes of Atlantic salmon (Salmo salar L.) affected with heart and skeletal muscle inflammation (HSMI), cardiomyopathy syndrome (CMS) and pancreas disease (PD). Veterinary Immunology and Immunopathology 2013 ;Volum 151.(1-2) s Yousaf, Muhammed; Koppang, Erling Olaf; Skjødt, Karsten; Köllner, Bernd; Hordvik, Ivar; Zou, Jun; Secombes, Chris; Powell, Mark Darryn. Cardiac pathological changes of Atlantic salmon (Salmo salar L.) affected with heart and skeletal muscle inflammation (HSMI). Fish and Shellfish Immunology 2012; Volum 33.(2) s Yousaf, Muhammed; Powell, Mark Darryn. The Effects of Heart and Skeletal Muscle Inflammation and Cardiomyopathy Syndrome on Creatine Kinase and Lactate Dehydrogenase Levels in Atlantic Salmon (Salmo salar L.). Scientific World Journal 2012; Volum s. - STRATEGISK FORSKINGSGRUPPE MARIN GENOMIKK (totalt 11 publikasjoner) Campos, Catarina; Valente, Luisa M.P.; Fernandes, Jorge. Molecular evolution of zebrafish dnmt3 genes and thermal plasticity of their expression during embryonic development. Gene 2012; Volum 500.(1) s Emblem, Åse; Karlsen, Bård Ove; Evertsen, Jussi; Miller, DJ; Moum, Truls Borg; Johansen, Steinar. Mitogenome polymorphism in a single branch sample revealed by SOLiD deep sequencing of the Lophelia pertusa coral genome. Gene 2012; Volum 506.(2) s Heino, Mikko Petteri; Svåsand, Terje; Nordeide, Jarle Tryti; Otterå, Håkon Magne. Seasonal dynamics of growth and mortality suggest contrasting population structure and ecology for cod, pollack and saithe in a Norwegian fjord. ICES Journal of Marine Science 2012; Volum 69.(4) s Kristensen, Ditte Lyngbo; Erikstad, Kjell E; Reiertsen, Tone Kristin; Moum, Truls Borg; Barrett, Robert T; Jenni-Eiermann, Susanne. Are female offspring from a single-egg seabird more costly to raise? Behavioral Ecology 2013 ;Volum 24.(1) s Micallef, Giulia; Bickerdike, Ralph; Reiff, Caroline; Fernandes, Jorge; Bowman, Alan S.; Martin, Samuel A.M.. Exploring the Transcriptome of Atlantic Salmon (Salmo salar) Skin, a Major Defense Organ. Marine Biotechnology 2012; Volum 14.(5) s Nagasawa, Kazue; Lazado, Carlo Cabacang; Fernandes, Jorge. Validation of endogenous reference genes for qpcr quantification of muscle transcripts in Atlantic cod subjected to different photoperiod regimes. I: Aquaculture. INTECH 2012 ISBN s Nagasawa, Kazue; Gianetto, Alessia; Fernandes, Jorge. Photoperiod Influences Growth and mll (Mixed-Lineage Leukaemia) Expression in Atlantic Cod. PLoS ONE 2012; Volum 7.(5) Sonne, Christian; Bustnes, Jan Ove; Herzke, Dorte; Jaspers, VLB; Covaci, Adrian; Eulaers, Igor; Halley, Duncan John; Moum, Truls Borg; Ballesteros, Manuel; Eens, Marcel; Ims, Rolf Anker; Hanssen, Sveinn Are; Erikstad, Kjell E; Johnsen, Trond Vidar; Rigét, Frank F.; Jensen, Asger Lundorff; Kjelgaard- Hansen, Mads. Blood plasma clinical chemical parameters as biomarker endpoints for organohalogen contaminant exposure in Norwegian raptor nestlings. Ecotoxicology and Environmental Safety 2012; Volum 80. s Sundaram, Arvind; Consuegra, S; Viswanath, Kiron; Fernandes, Jorge. Positive selection pressure within teleost toll-like receptors tlr21 and tlr22 subfamilies and their response to temperature stress and microbial components in zebrafish. Molecular Biology Reports 2012; Volum 39.(9) s Sundaram, Arvind; Viswanath, Kiron; Dopazo, Joaquin; Fernandes, Jorge. Diversification of the expanded teleostspecific toll-like receptor family in Atlantic cod, Gadus morhua.. BMC Evolutionary Biology 2012; Volum 12.(1) s. - Urbarova, Ilona; Karlsen, Bård Ove; Okkenhaug, Siri; Seternes, Ole Morten; Johansen, Steinar; Emblem, Åse. Digital Marine Bioprospecting: Mining New Neurotoxin Drug Candidates from the Transcriptomes of Cold-Water Sea Anemones. Marine Drugs 2012 ;Volum 10.(10) s STRATEGISK FORSKINGSGRUPPE MARIN ØKOLOGI (totalt 8 publikasjoner) Basedow, Sünnje; Tande, Kurt; Norrbin, Fredrika; Kristiansen, Stian Andre. Capturing quantitative zooplankton information in the sea: Performance test of laser optical plankton counter and video plankton recorder in a Calanus finmarchicus dominated summer situation. Progress in Oceanography 2012 ;Volum 108. s Katsanevakis, Stelios; Smit, Anke Weber; Pipitone, Carlo; Leopold, Mardik; Cronin, Michelle; Scheidat, Meike; Doyle, Thomas K.; Buhl-Mortensen, Lene; Buhl-Mortensen, Pål; D Anna, Giovanni; de Boois, Ingeborg; Dalpadado, Padmini; Damalas, Dimitrios; Fiorentino, Fabio; Garofalo, Germana; Giacalone, Vincenzo Maximiliano; Hawley, Kate; Issaris, Yiannis; Jansen, Jeroen; Rosten, Carolyn; Knittweis, Leyla; Kröncke, Ingrid; Mirto, Simone; Muxika, Iñigo; Reiss, Henning; Skjoldal, Hein Rune; Vöge, Sandra. Monitoring marine populations and communities: methods dealing with imperfect detectability. Aquatic Biology 2012; Volum 16.(1) s Kim, Kywong Mi; Hoarau, Galice; Boo, Sung Min. Genetic structure and distribution of Gelidium elegans (Gelidiales, Rhodophyta) in Korea based on mitochondrial cox1 sequence data. Aquatic Botany 2012; Volum 98.(1) s Neumann, Hermann; Reiss, Henning; Ehrich, Siegfried; Sell, Anne; Panten, Kay; Kloppmann, Matthias; Wilhelms, Ingo; Kröncke, Ingrid. Benthos and demersal fish habitats in the German Exclusive Economic Zone (EEZ) of the North Sea. Helgoland Marine Research 2012 Nordeide, Jarle Tryti; Kekäläinen, Jukka; Janhunen, Matti; Kortet, Raine. Female ornaments revisited are they correlated with offspring quality? Journal of Animal Ecology 2013 ;Volum 82.(1) s Schückel, Sabine; Sell, Anne F.; Kröncke, Ingrid; Reiss, Henning. Diet overlap among flatfish species in the southern North Sea. Journal of Fish Biology 2012; Volum 80.(7) s Schückel, Sabine; Sell, Anne; Kihara, Terue C.; Koeppen, Annemarie; Kröncke, Ingrid; Reiss, Henning. Meiofauna as food source for small-sized demersal fish in the southern North Sea. Helgoland Marine Research 2012 Våge, Selina; Basedow, Sünnje; Tande, Kurt; Zhou, Meng. Physical structure of the Barents Sea Polar Front near Storbanken in August Journal of Marine Systems

16 8049 Bodø Tlf: