Preanalyse. Kurs i Molekylærpatologi Oslo, juni 2017
|
|
- Frithjof Amundsen
- 7 år siden
- Visninger:
Transkript
1 Preanalyse Kurs i Molekylærpatologi Oslo, juni 2017 Heidemarie Svendsen Bioingeniør Enhet for molekylærpatologi Avdeling for Patologi Oslo Universitetssykehus Innhold Prøvemateriale Preparering og forbehandling av prøvemateriale Ekstraheringsmetoden Prøvekvalitet Feilkilder Framtiden 1
2 Prøvemateriale FFPE Ferskt /frosset vev Blod/ benmarg Cellesuspensjon Kroppsvæsker Buccal swab Urin Plasma Preparering og forbehandling FFPE Begrenset tumorvev i blokk eller analysen krever en viss andel tumorceller Patolog merker HE snitt Merket område skrapes fra blokk eller ufarget parafinsnitt 2
3 Preparering og forbehandling FFPE Hele snitteflaten kan brukes 2-3 snitt à 10-20µm med sledemikrotom Unngå å snitte på vann pga fare for kontaminering! Hele ufargede snitt skrapes fra objektglass Preparering og forbehandling FFPE Materialet overføres til mikrorør Parafinen fjernes Deparafineringsløsning Smelting av parafin Materialet lyseres i buffer og fordøyes med proteinase-k ved 56 C Kryssbindinger med formalin brytes opp ved inkubasjon med høy temperatur over en viss tid DNA 90 o C, 1h RNA 80 o C, 15 min 3
4 Preparering og forbehandling ferskt frosset vev Snittes med frysemikrotom (2-3 snitt à 40µm) eller med skalpell (ca 5mg vev) Materialet overføres til mikrorør Tissue-tek fjernes med PBS DNA: Materialet lyseres i buffer og fordøyes med proteinase-k ved 56 C RNA: Materialet homogeniseres med tissue Rupter Preparering og forbehandling Blod/ benmarg RNA-analyser krever at erytrocyttene fjernes Materiale skal være på laboratorium innen 24h Leukocyttpellet (helst innen h) Lysering av røde blodceller med lysisbuffer pellet 1x10 7 celler MonoNukleæreCeller (ikke eldre en 24h og romtemarert) Fjerning av røde blodceller og granulocytter med lymfoprep plasma MNC Lysering av hvite blodceller for å frigjøre DNA og RNA erytrocytter, granulocytter 4
5 DNA/ RNA-ekstrahering Magnetkuler (automatisert) Kolonner (automatisert og manuell) EZ1 DNA Blood Handbook 04/2010 QIAsymphony DSP DNA Instructions for Use (Handbook) 08/2015 QIAamp DNA Mini and Blood Mini Handbook 05/2016 Ekstrahering av både DNA og RNA fra samme utgangsmateriale Kolonne (automatisert og manuell ) AllPrep DNA/RNA Mini Handbook 11/
6 Kvalitet DNA / RNA Måling av DNA /RNA konsentrasjon Spectrophotometer Fluorometer NanoDrop Kvalitetsanalyser Referanse gen som er sjeldent påvirket av tumor Qubit RIN ( RNA Integrity Number) RNA kvalitet RNA Integrity Number Intakt RNA Delvis degradert RNA Degradert RNA 6
7 DNA eller RNA? Analysene avgjør om DNA, RNA eller både DNA og RNA isoleres Enklere å isolere DNA DNA er mest stabil (degraderes lite) RNA degraderes fort og krever strengere krav i henhold til RNase RNase et uønsket enzym Enzym som degraderer og spalter RNA i mindre fragmenter Alle organismer danner RNase Arbeidsplassen og alt utstyr vaskes med RNase-away Større krav med hensyn til RNA Blod/ benmarg skal prepareres så fort som mulig Ferskt vev må fryses ned 7
8 Hvorfor RNA? Genuttrykk Gener som blir/ er transkribert er tilgjenglig når RNA isoleres. Translokasjoner / fusjonstranskripter DNA har store intron områder mens RNA kun har exon RNA kontaminert med DNA gdna ikke fjernet Referanse gen DNA Referanse gen RNA Kopier Kopier mean gdna fjernet Referanse gen DNA Referanse gen RNA Kopier Kopier mean 0,51 0,52 0,53 0,
9 Kvantitet = Kvalitet? FFPE vs ferskt vev RNA referanse gen DNA Size Ladder Kvantitet = Kvalitet? FFPE vs ferskt vev Kontroll DNA DNA kons. 100ng/µl Renhet[260:280]: 1,9 100 bp 200 bp 300 bp 400 bp 600 bp FFPE DNA kons. ng/µl: 173 Renhet[260:280]: 1,9 Kontroll DNA DNA kons. 100ng/µl Renhet[260:280]: 1,9 100 bp 200 bp 300 bp 400 bp 600 bp Ferskt vev DNA kons. ng/µl: 40 Renhet[260:280]: 1,9 9
10 Feilkilder / prøvekvalitet FFPE DNA Fragmentering kan påvirke PCR- reaksjoner Deaminering (Cytosin Uracil) falsk lesing av sekvens (C=T) konsekvenser for mutasjonsanalyser kryssbinding med formalin DNA er bundet RNA Fragmentering kan påvirke PCR- reaksjoner Dekalsinering RNA ødelegges av syre Lagring ved romtemperatur over lang tid RNA degraderes kryssbinding med formalin RNA er bundet FFPE eller ferskt vev Formalin fiksert Ferskt Fragmentert Degradering pga. fiksering Deaminering (Cytosin Uracil) Bedre DNA og RNA kvalitet Degradering pga. RNase 10
11 Gammelt Lang reisevei Koagulert Feilkilder / prøvekvalitet blod/ benmarg Materiale ikke tilstrekkelig blandet med antikoagulant Lysert Frostskader Feil prøverør Heparin som antikoagulant Hemmer PCR reaksjoner Framtiden? Optimalt prøvemateriale for enhver analyse Alternativ for formalin: PAXgene Tissue System Alternativ for ferskt vev: RNA- Later Alternativ for blod: PAXgene- rør 11
Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP
August 2015 QIAsymphony SPprotokollark Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP Dette dokumentet er Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP QIAsymphony SPprotokollark, R2, for settversjon 1. QIAsymphony
DetaljerQIAsymphony SP protokollark
QIAsymphony SP protokollark Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP Generell informasjon Til in vitro-diagnostisk bruk. Disse protokollene er for rensing av total DNA fra vev og formalinfikserte,
DetaljerYtelseskarakteristikker
Ytelseskarakteristikker QIAamp DSP DNA FFPE Tissue-sett, Versjon 1 60404 Versjonshåndtering Dette dokumentet er ytelsesegenskaper for QIAamp DSP DNA FFPE Tissue-sett, versjon 1, R3. Se etter nye elektroniske
DetaljerDette vil jeg si noe om
Diagnostisk klinikk Klinisk patologi Kvalitetssikring av molekylærgenetiske undersøkelser Ann Hilde Kalsaas Seksjon for Molekylær Patologi Universitetssykehuset Nord-Norge Dette vil jeg si noe om Litt
DetaljerQIAsymphony DSP DNA Kits
QIAsymphony DSP DNA Kits QIAsymphony DSP DNA Kits er beregnet til bruk kun i kombinasjon med QIAsymphony SP. QIAsymphony DSP DNA Mini Kits gir reagenser for automatisert rensing av totalt DNA fra humant
DetaljerQIAsymphony SP protokollark
QIAsymphony SP protokollark DNA_Buffy_Coat_200_V7_DSP-protokoll Generell informasjon Til in vitro-diagnostisk bruk. Denne protokollen brukes til rensing av totalt genomisk og mitokondrielt DNA fra frisk
DetaljerFremføring av histologiske preparater
Fremføring av histologiske preparater Preparatene ankommer histologisk seksjon med ferdig utfylt remisse Disse registreres i laboratoriets datasystem. Hver remisse får et unikt nummer som følger preparatet.
DetaljerHensikten med forsøket er å isolere eget DNA fra kinnceller, se hvordan det ser ut og hva det kan brukes til videre.
DNA HALSKJEDE Hensikt Hensikten med forsøket er å isolere eget DNA fra kinnceller, se hvordan det ser ut og hva det kan brukes til videre. Bakgrunn Det humane genomet består av omtrent 2.9 milliarder basepar.
DetaljerFiksering. Er det så nøye? Ida E. Tennfjord, bioingeniør, Avdeling for Patologi, AHUS
Fiksering. Er det så nøye? Ida E. Tennfjord, bioingeniør, Avdeling for Patologi, AHUS Parafininstøpt materiale 1 Fiksering 2 Dehydrering 3 Klaring 4 Parafininfiltrasjon 5 Parafininstøping FIKSERING ----hvorfor
DetaljerLaboratorieprotokoll for manuell rensing av DNA fra 0,5 ml prøve
Laboratorieprotokoll for manuell rensing av DNA fra 0,5 ml prøve For rensing av genomisk DNA fra innsamlingssett i seriene Oragene og ORAcollect. Du finner flere språk og protokoller på vårt nettsted,
DetaljerUTFORDRINGER OG MULIGHETER. Ingvild Koren Lobmaier Overlege avd. for Patologi OUS
DEKALSINERING UTFORDRINGER OG MULIGHETER 1 Ingvild Koren Lobmaier Overlege avd. for Patologi OUS UTREDNING AV PASIENTER HVA GJØR PATOLOGEN Ved spørsmål og kreft eller annen sykdom hos pasienter kan man
DetaljerQIAsymphony SP protokollark
Februar 2017 QIAsymphony SP protokollark circdna_2000_dsp_v1 og circdna_4000_dsp_v1 Dette dokumentet er QIAsymphony circdna_2000_dsp_v1 og circdna_4000_dsp_v1- protokollark, versjon 1, R1 Sample to Insight
DetaljerTissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP (brukervalidert for QIAsymphony DSP DNA Mini-sett)
August 2015 QIAsymphony SP-protokollark Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP (brukervalidert for QIAsymphony DSP DNA Mini-sett) Dette dokumentet er Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP
DetaljerNGS (Neste Generasjons Sekvensering) i diagnostikk, erfaringer og resultater
NGS (Neste Generasjons Sekvensering) i diagnostikk, erfaringer og resultater Emiel Janssen Seksjonsleder for Kvantitativ og Molekylær Patologi Daglig leder for laboratoriet for molekylær biologi Avdeling
DetaljerFiksering. Er det viktig?
Fiksering. Er det viktig? 2. Parafininnstøpt materiale 1 Fiksering 2 Dehydrering 3 Klaring 4 Parafininnfiltrasjon 5 Parafininnstøping FIKSERING ----hvorfor er dette trinnet så viktig? 3. Kjemisk fiksering
DetaljerEvaluering av ny metode for deteksjon av leukocytter i blodkomponenter
Evaluering av ny metode for deteksjon av leukocytter i blodkomponenter Spesialbioingeniør Maria Johansson Seksjon for komponentfremstilling Avdeling for immunologi og transfusjonsmedisin Oslo universitetssykehus,
DetaljerQIAsymphony DSP sirkulerende DNA-sett
QIAsymphony DSP sirkulerende DNA-sett Februar 2017 Ytelsesegenskaper 937556 Sample to Insight Innhold Ytelsesegenskaper... 4 Grunnleggende ytelse... 4 Kjøringspresisjon... 6 Tilsvarende ytelse av 2 ml
DetaljerMuligheter og utfordringer ved diagnostikk av lungekreft. Marius Lund-Iversen Avd. for patologi Oslo universitetssykehus
Muligheter og utfordringer ved diagnostikk av lungekreft Marius Lund-Iversen Avd. for patologi Oslo universitetssykehus Interessekonflikter Foredrag for Lilly Møte i regi av Roche Kurs i regi av MSD om
DetaljerStøping og sni+ng Teori og praksis med fokus på kvalitetssikring
Histoteknikerforeningen 20/3-15 Støping og sni+ng Teori og praksis med fokus på kvalitetssikring Berit W. Revå Kvalitetskoordinator Patologiavdelingen Sykehuset I VesHold HF Kinesisk ordspråk: Fortell
DetaljerQIAsymphony SP protokollark
QIAsymphony SP protokollark DNA_Blood_400_V6_DSP-protokoll Generell informasjon Til in vitro-diagnostisk bruk. Denne protokollen brukes til rensing av totalt genomisk og mitokondrielt DNA fra friskt eller
DetaljerAdnaTest ProstateCancerSelect
AdnaTest ProstateCancerSelect Anriking av tumorceller fra blodet fra pasienter med prostatakreft til genekspresjonsanalyser Til bruk i in vitro-diagnostikk Brukerhåndbok T-1-520 Innhold Bestillingsinformasjon...
DetaljerMolekylær patologi Amplifikasjonsmetoder
Molekylær patologi Amplifikasjonsmetoder Emiel Janssen Seksjonsleder for Kvantitativ og Molekylær Patologi Daglig leder for laboratoriet for molekylær biologi Avdeling for Patologi Stavanger Universitetssjukehus
DetaljerOncogenic Mutations Affecting Cell Proliferation
Oncogenic Mutations Affecting Cell Proliferation Fra RTK til Nucleus (Boka s.1070-74) Normalt kreves et vekst stimulerende signal ( growth factor eks. PDGF, EGF, NGF) for at celler skal gå inn i celledeling,
DetaljerFlervalgsoppgaver: proteinsyntese
Flervalgsoppgaver - proteinsyntese Hver oppgave har ett riktig svaralternativ. Proteinsyntese 1 Hva blir transkribert fra denne DNA sekvensen: 3'-C-C-G-A-A-T-G-T-C-5'? A) 3'-G-G-C-U-U-A-C-A-G-5' B) 3'-G-G-C-T-T-A-C-A-G-5'
DetaljerThermo. Shandon RAPID-CHROME Iron Stain and RAPID-CHROME Nuclear Fast Red Counterstain ELECTRON CORPORATION. Rev. 5, 09/03 P/N 238997
Shandon RAPID-CHROME Iron Stain and RAPID-CHROME Nuclear Fast Red Counterstain Thermo ELECTRON CORPORATION Anatomical Pathology USA Clinical Diagnostics 171 Industry Drive Pittsburgh, PA 15275, USA Tel:
DetaljerKYSTTORSK OG SKREI I LOFOTEN 2009
KYSTTORSK OG SKREI I LOFOTEN 2009 Resultater fra DNA-typing av torsk ved bruk av PCR metode Websaknr. 09/12473 Fiskeridirektoratet region Nordland Fiskerikontoret i Svolvær Mai 2009 Erun Thesen Bioingeniør/Inspektør
DetaljerLeucosep-rør LTK.615 PAKNINGSVEDLEGG. Brukes til in vitro-diagnostikk PI-LT.615-NO-V3
Leucosep-rør LTK.615 PAKNINGSVEDLEGG Brukes til in vitro-diagnostikk PI-LT.615-NO-V3 Bruksanvisning Bruksområde Leucosep-rørene er beregnet til bruk ved oppsamling og separasjon av mononukleære celler
DetaljerSYSMEX XS-1000i. Analyseprinsipper
SYSMEX XS-1000i Analyseprinsipper Prinsipper RBC Plt impedans måling Hb fotometrisk måling WBC 5 Diff fluorescens flowcytometri 2 Erytrocytter og trombocytter Telles i en egen kanal, impedans kanalen,
DetaljerPLASMA ELLER SERUM KVA SKAL VI VELGE?
PLASMA ELLER SERUM KVA SKAL VI VELGE? KRISTIN M AAKRE AVDELINGSOVERLEGE LABORATORIUM FOR KLINISK BIOKJEMI Plasma Tilset eit stoff til fullblod som hindrar koagulasjon EDTA og citrat: bind kalsiumioner
DetaljerRomtemperatur: 24 t Skal ikke fryses benmargsaspirat m Heparin. Kjøleskap 2-8 C: 48 t Romtemperatur: 48 t
Holdbarhet prøver til cytometri, immunologi og allergi Avdeling for immunologi og transfusjonsmedisin Cytometri Prøvene kan ikke tas på fredag og sendes i post Absolutt tall lymfocytter 12618 K2-EDTA fullblod
DetaljerNGS = Next generation sequencing Massiv parallell sekvensering (MPS) Dypsekvensering
NGS Sonja E. Steigen Overlege, Diagnostisk klinikk klinisk patologi, Universitetssykehuset Nord Norge Professor II, IMB, Uit Norges arktiske universitet 1 NGS = Next generation sequencing Massiv parallell
DetaljerML-208, generell informasjon
ML-208, generell informasjon Emnekode: ML-208 Emnenavn: Molekylærbiologi Dato:20.12.2017 Varighet:4 timer Tillatte hjelpemidler: Ingen Merknader:Lag gjerne tegninger og figurer for å illustrere og forklare
DetaljerMolekylære metoder i medisinsk mikrobiologi.
- 1 - Molekylære metoder i medisinsk mikrobiologi. Laboratorieøvelser tirsdag 17.mars. Øvelser: 1. Ekstraksjon av nukleinsyrer ved varmelysering (S. aureus) 2. DNA-isolering med Qiagen kolonne (to prøver:
DetaljerHPV DNA- tes,ng på cervikale celler innsamlet i SurePath konserveringsvæske (BD Diagnos,cs- TriPath) Ole Herman Ambur, PhD. Seksjon for Forsking og
HPV DNA- tes,ng på cervikale celler innsamlet i SurePath konserveringsvæske (BD Diagnos,cs- TriPath) Ole Herman Ambur, PhD. Seksjon for Forsking og utvikling Disposisjon Bakgrunn Mini- metodevurdering
DetaljerPraktisk gjennomføring av primærscreening HPV
Praktisk gjennomføring av primærscreening HPV Pia Moltu Fagbioingeniør, gynekologiske prøver Cytologiseksjonen og seksjon for kvantitativ og molekylær patologi Stavanger Universitetssykehus, SUS Primærscreening
DetaljerBrukes til preparering og isolering av rensede lymfocytter direkte fra helblod PAKNINGSVEDLEGG. Brukes til in vitro diagnostikk PI-TT.
Brukes til preparering og isolering av rensede lymfocytter direkte fra helblod PAKNINGSVEDLEGG Brukes til in vitro diagnostikk PI-TT.610-NO-V5 Brukerveiledning Bruksområde T-Cell Xtend-reagenset er beregnet
DetaljerFLERVALGSOPPGAVER BIOTEKNOLOGI
FLERVALGSOPPGAVER BIOTEKNOLOGI FLERVALGSOPPGAVER FRA EKSAMEN I BIOLOGI 2 V2008 - V2011 Disse flervalgsoppgavene er hentet fra eksamen i Biologi 2 del 1. Det er fire (eller fem) svaralternativer i hver
DetaljerBetydningen av LOH på 1p31 for celleproliferasjon i infiltrerende brystcarcinom.
Betydningen av LOH på 1p31 for celleproliferasjon i infiltrerende brystcarcinom. Irene Tveiterås Øvestad Masteroppgave i Natur-, helse- og miljøvern tilrettelagt for bioingeniører, 2005 Fordypningsområde:
DetaljerErfaringer fra mini-metodevurdering HPV DNA-testing på cervikale celler innsamlet i SurePath konserveringsvæske (BD Diagnostics-TriPath)
Erfaringer fra mini-metodevurdering HPV DNA-testing på cervikale celler innsamlet i SurePath konserveringsvæske (BD Diagnostics-TriPath) Ole Herman Ambur, PhD. Seksjon for Forsking og utvikling, Ahus Disposisjon
DetaljerAmplifikasjonsteknikker - andre metoder
Amplifikasjonsteknikker - andre metoder Svein Arne Nordbø TH-28973 17.03.15 Alternative amplifikasjonsmetoder Templat-amplifikasjons metoder Signal-amplifikasjonsmetoder Templat-amplifikasjons metoder
DetaljerMolekylær diagnostikk av Leishmaniasis og Malaria
Molekylær diagnostikk av Leishmaniasis og Malaria Bioingeniør Gunilla Løvgården Seksjon for utvikling, Ullevål Avdeling for mikrobiologi Oslo universitetssykehus Leishmaniasis forårsakes av parasitten
DetaljerML-208, generell informasjon
ML-208, generell informasjon Emnekode: ML-208 Emnenavn: Molekylærbiologi Dato:20.12.2017 Varighet:4 timer Tillatte hjelpemidler: Ingen Merknader:Lag gjerne tegninger og figurer for å illustrere og forklare
DetaljerGenotyping ved bruk av Loop-mediert Isotermal DNA-amplifisering (LAMP)
Genotyping ved bruk av Loop-mediert Isotermal DNA-amplifisering (LAMP) Hundhausen, T.; Hulsbeek, M.; Avreid, T.; Heggøy, M.; Lacsamana, N.; Tednes, U.; Slettan, A. Genotyping is the process of determining
DetaljerHvordan standardisere en metode for isolering av plasmid til syntese av diabetes antigener?
Hvordan standardisere en metode for isolering av plasmid til syntese av diabetes antigener? Ranveig Østrem, Bioingeniør Hormonlaboratoriet, Aker Oslo Universitetssykehus Bakgrunn for analysen Pasienter
DetaljerOppgavedeling mellom bioingeniør og patolog i OUS. Linn Buer Bioingeniør- patologiassistent OUS-Ullevål 16. September 2014
Oppgavedeling mellom bioingeniør og patolog i OUS Linn Buer Bioingeniør- patologiassistent OUS-Ullevål 16. September 2014 Patologi mer enn du tror Det nærmer seg påske og du ser påskekrim. Eller Det tredje
DetaljerMolekylære metoder i medisinsk mikrobiologi.
- 1 - Molekylære metoder i medisinsk mikrobiologi. Laboratorieøvelser onsdag 18.mars 2014. Øvelser: 5. Gelelektroforese på PCR produkt fra meca og nuc PCR fra dag 1 6. Mycobakterium genus FRET realtime
DetaljerLungekreft diagnostiske utfordringar i patologi
Lungekreft diagnostiske utfordringar i patologi Sissel G.F. Wahl Avd. for patologi, St Olavs Hospital Institutt for klinisk og molekylær medisin, DMF, NTNU Interessekonfliktar Foredrag for Pfizer & MSD
DetaljerTruSeq Custom Amplicon Dx FFPE QC Kit
TruSeq Custom Amplicon Dx FFPE QC Kit TIL IN VITRO-DIAGNOSTISK BRUK Katalognr. 20006259: 1 4 anvendelser, opptil 48 prøver Tiltenkt bruk Illumina TruSeq Custom Amplicon Dx FFPE QC Kit er et sett med reagenser
DetaljerCELLETYPER I PATOLOGIEN
IDENTIFISERING AV CELLETYPER I PATOLOGIEN Tumorbiologikursus 11.1.10 Ole Didrik ik Lærum Gades Institutt, seksjon for patologi, Universitetet i Bergen Hvordan stiller vi en diagnose Makroskopisk Lysmikroskopisk,
DetaljerIonekromatografi. Rolf D. Vogt & Hege Orefellen Kjemisk Institutt, Universitetet i Oslo. Bestemmelse av hovedioner i Naturlig vann ved bruk av
Bestemmelse av hovedioner i Naturlig vann ved bruk av Ionekromatografi Rolf D. Vogt & Hege Orefellen Kjemisk Institutt, Universitetet i Oslo Bakgrunn Miljøkjemigruppen Effektene av langtransporterte luftforurensninger
DetaljerMaxwell CSC RNA FFPE Kit
TEKNISK HÅNDBOK Maxwell CSC RNA FFPE Kit Bruksanvisning for produktet AS1360 Forsiktig: Håndter kassetter med forsiktighet, forseglingskantene kan være skarpe. BRUKANVISNING FOR PRODUKTET AS1360 2800 Woods
DetaljerBioingeniørens rolle innen molekylærpatologi
Bioingeniørens rolle innen molekylærpatologi - i Trondheim Tone Furre NITO, Kurs i Patologi Lillestrøm, 19. 10.18 Foto: St.Olavs Hospital Foto: St.Olavs Hospital Hva er molekylærpatologi? Den delen av
DetaljerGrunnleggende cellebiologi
Grunnleggende cellebiologi Ann Kristin Sjaastad Sert. yrkeshygieniker, Dr. Philos HMS-seksjonen, NTNU Tema Cellens oppbygning Transportmekanismer Arvestoff og proteinsyntese Mutasjoner og genotoksisitet
DetaljerKvan%ta%v sann%ds PCR %l diagnos%sk bruk. Sann%ds PCR. Prøvemateriale og prøvehåndtering
Kvan%ta%v sann%ds PCR %l diagnos%sk bruk Kvan%ta%v sann%ds PCR %l diagnos%sk bruk Økende bruk, men Mange kilder %l usikkerhet/variasjon Alle tester skal valideres/verifiseres før diagnos%sk bruk Fordel
DetaljerJobbglidning i patologifaget trussel eller mulighet? Erfaringer med patologiassistenter i OUS
Jobbglidning i patologifaget trussel eller mulighet? Erfaringer med patologiassistenter i OUS M.Sc. Lisa Yuen Løvold KDI Avdeling for Patologi Dagens Næringsliv april 2012 Dagbladet 1/5-2012 Krise! Krise!
DetaljerMaxwell CSC DNA FFPE Kit
TEKNISK HÅNDBOK Maxwell CSC DNA FFPE Kit Bruksanvisning for produktet AS1350 Forsiktig: Håndter kassetter med forsiktighet, forseglingskantene kan være skarpe. BRUKANVISNING FOR PRODUKTET AS1350 2800 Woods
DetaljerProgensa PCA3 Urine Specimen Transport Kit
Instruksjoner for legen Progensa PCA3 Urine Specimen Transport Kit Til in vitro diagnostisk bruk. Bare for eksport fra USA. Instruksjoner 1. Det kan være nyttig å be pasienten drikke mye vann (omtrent
DetaljerListe over analyser som utføres/evt. videresendes, Enhet for virologi og infeksjonsimmunologi (VIM)
Vedlegg til: 45161 Anbefalt prøvemateriale, volum og svartid for analyser - Enhet for virologi og Liste over analyser som utføres/evt. videresendes, Enhet for virologi og (VIM) Oppdatert 25.01.16tb Listen
DetaljerKapittel 14: Det eukaryote genom og dets uttrykksregulering
Kapittel 14: Det eukaryote genom og dets uttrykksregulering Innhold: 1. Det humane genom 2. Struktur av protein-kodende gener 3. RNA processering 4. Transkripsjonell kontroll 5. Posttranskripsjonell kontroll
DetaljerFølgeskjema PCR analyser
Følgeskjema PCR analyser LABORA AS Notveien 17, 8013 Bodø Telefon 75 56 63 00 E-post: firmapost@labora.no Analyselaboratorium og fiskehelsetjeneste Navn Adresse E-post Telefon Svar til Regning til Bestillingsreferanse:
DetaljerUtviklingen av antikoagulantia
Praktisk erfaring av Direkte perorale antikoagulantia (DOAK) i laboratoriet Bioingeniørkongressen torsdag 2. juni 2016 Nærmil Ghadani, spesialbioingeniør (Rutinekoagulasjonsanalyser og DOAK) Seksjon for
DetaljerMateriale/ Beskrivelse Metode Markør for MRD
Radiumhospitalet Analyse Aktuell ved/ Problemstilling Materiale/ Beskrivelse Metode Markør for MRD forsendelse AFF1-MLL AML (monocytisk), t(4;11)(q21;q23) pro-b-all, og ALL (MLL-AF4, MLLT2- hos spedbarn.
DetaljerVersjon 8: Nye rutiner ved prøvetaking og forsendelse av Renin, C peptid, Insulin, Proinsulin og PIIINP
Laboratoriedokument PS 11 Informasjon om prøvetaking og forsendelse, Hlab Laboratoriemedisin /Avd. medisinsk biokjemi /Hormonlaboratoriet/Prøvemottak Dokument ID: 30273 Versjon: 9 Status: Godkjent Dokumentansvarlig:
DetaljerBachelorutdanning i sykepleie. Nasjonal eksamen i Anatomi, fysiologi og biokjemi. 17. desember 2015 Bokmål
Bachelorutdanning i sykepleie Nasjonal eksamen i Anatomi, fysiologi og biokjemi 17. desember 2015 Bokmål Eksamenstid 4 timer Kl. 9.00 13.00 Klargjøring av spørreord som brukes i oppgavene: Hva, Hvilke,
DetaljerManuell trombocytt produksjon i SI
Manuell trombocytt produksjon i SI Komponentframstilling i blodbank 22.03.2017 Eilen Strand Rønning, fagbioingeniør Avd. for blodbank og medisinsk biokjemi Sykehuset Innlandet Oppstart våren 2014 Økt behov
DetaljerCytologisk og histologisk diagnostikk av lungetumor
Cytologisk og histologisk diagnostikk av lungetumor Jon Lømo, overlege dr med, Oslo universitetssykehus Prøvetyper (Ekspektorat) Bronkoskopi Børstecytologi Nålecytologi (TBNA) Skyllevæskecytologi (lavage)
DetaljerARBEIDSBESKRIVELSE Institutt for husdyr-og akvakulturvitenskap, NMBU
EIDSBESKRIVELSE Institutt for husdyr-og akvakulturvitenskap, NMBU Metodenavn: Vannløselig karbohydrater (WSC) BIOVIT-nr.: Arb1014 1. Prinsipp Prøvene ekstraheres i acetatbuffer i romtemperatur over natt,
DetaljerHematologi og tolkning av cytogrammer
Hematologi og tolkning av cytogrammer Stein Istre Thoresen Sentrallaboratoriet Norges veterinærhøgskole Hemogram 1. Systematisk tilnærming 2. Vurdering av de enkelte analysesvar 3. Se enkeltresultatene
DetaljerVæskebasert celleprøvetaking fordeler og utfordringer Fagdag Masseundersøkelsen mot livmorhalskreft 25. mars 2014
Væskebasert celleprøvetaking fordeler og utfordringer Fagdag Masseundersøkelsen mot livmorhalskreft 25. mars 2014 Maj Liv Eide, St. Olavs Hospital, Universitetssykehuset i Trondheim Screeningprogram mot
DetaljerMaxwell CSC RNA Blood Kit
TEKNISK HÅNDBOK Maxwell CSC RNA Blood Kit Bruksanvisning for produktet AS1410 Forsiktig: Håndter kassetter med forsiktighet, forseglingskantene kan være skarpe. BRUKANVISNING FOR PRODUKTET AS1410 2800
DetaljerFigurer kap 6: Menneskets immunforsvar Figur s. 156
Figurer kap 6: Menneskets immunforsvar Figur s. 156 kjemiske forbindelser bakterie røde blodceller fagocytt kapillæråre Huden blir skadet, og mikroorganismer kommer inn i kroppen. Mange fagocytter beveger
DetaljerFigurer kapittel 8: Bioteknologi Figur s
2 Figurer kapittel 8: Bioteknologi Figur s. 236 237 5' 3' 5' 3' DNA-primer 5' 3' DNA bit som skal kopieres Oppvarming 3' 5' 5' DNAprimer tilsettes 3' 3' 5' DNApolymerase Nytt DNA dannes Kopieringen gjentas
DetaljerLuftveisinfeksjoner - PCR-basert diagnostikk. Anne-Marte Bakken Kran Overlege, førsteamanuensis Mikrobiologisk avd. UOS Ullevål
Luftveisinfeksjoner - PCR-basert diagnostikk Anne-Marte Bakken Kran Overlege, førsteamanuensis Mikrobiologisk avd. UOS Ullevål Temaer PCR-basert mikrobiologisk diagnostikk Klinisk betydning av funn/fravær
DetaljerMaxwell CSC Blood DNA Kit
TEKNISK HÅNDBOK Maxwell CSC Blood DNA Kit Bruksanvisning for produktet AS1321 Forsiktig: Håndter kassetter med forsiktighet, forseglingskantene kan være skarpe. BRUKANVISNING FOR PRODUKTET AS1321 2800
Detaljer1. Innhold Analyser som krever spesiell prøvetaking og forsendelse
Dokument ID: 30273 Versjon: 3 Status: Godkjent Laboratoriedokument PS 11 Informasjon om prøvetaking og forsendelse, Hlab Diagnostikk og intervensjon / Dokumentansvarlig: Guro Strøm Clementz Utarbeidet
DetaljerMaxwell 16 Blood DNA Purification System
Teknisk håndbok Maxwell 16 Blood DNA Purification System Forsiktig - håndter kassettene med forsiktighet, forseglede kanter kan være skarpe. 2800 Woods Hollow Rd. Madison, WI USA In Vitro diagnostisk medisinsk
DetaljerEgil R Jensen Akershus universitetssykehus
Storvolumsautomater med tørrkjemi MIKRO SLIDE TEKNOLOGI Egil R Jensen Akershus universitetssykehus 1 Et feriebilde det du ser 2 Et feriebilde det du ikke ser! 3 Litt historikk. 1970-tallet Eastman Kodak
DetaljerFasit til oppgavene. K-skallet L-skallet M-skallet
Kapittel 1 1. Tegn atomet til grunnstoffet svovel (S), og få med antall protoner, nøytroner, elektroner, elektronskall og antall valenselektroner. K-skallet L-skallet M-skallet Svovel har, som vi kan se
DetaljerExamination paper for (BI 2015) (Molekylærbiologi, laboratoriekurs)
Department of (Biology) Examination paper for (BI 2015) (Molekylærbiologi, laboratoriekurs) Academic contact during examination: Thorsten Hamann Phone: 91825937 Examination date: 19.12.2016 Examination
DetaljerLISS/Coombs. Indirekte og direkte antiglobulin test. ID-Card. Norsk B Produkt Identifikasjon: 50531
LISS/Coombs ID-Card Indirekte og direkte antiglobulin test Produkt Identifikasjon: 50531 Introduksjon Polyspesifikt antihuman globulin (AHG) reagens brukes i rutinen til deteksjon og identifisering av
DetaljerIntroduksjon 1 INTRODUKSJON. Dok.nr. 1.0. Versjon nr. 1.1
Dok.nr. 1.0 Versjon nr. 1.1 Introduksjon 1 INTRODUKSJON Tarmens flora (mikrobiota) etableres tidlig i livet og er sannsynligvis av stor betydning for sykdom og helse. Mikrobiotaen varierer mye fra individ
DetaljerNasjonal holdbarhetsdatabase
Nasjonal holdbarhetsdatabase hvordan kan vi finne ut hvor lenge prøvene er holdbare? Preanalyse 10. 11.mai 2017 Nasjonalt prosjekt for standardisering av holdbarhetsforsøk Protokoll med beskrivelse av
DetaljerHematologisk kvalitetskontroll av blodkomponenter
Hematologisk kvalitetskontroll av blodkomponenter Kjersti Roen Eriksen Spesialbioingeniør Seksjon for komponentfremstilling Avdeling for immunologi og transfusjonsmedisin Oslo universitetssykehus, Ullevål
DetaljerPREANALYTISKE UTFORDRINGER VED HORMONANALYSER
PREANALYTISKE UTFORDRINGER VED HORMONANALYSER Astrid Torvestad, fagbioingeniør for automatiserte analyser og kvalitetsmedarbeider ved Hormonlaboratoriet, medlem av preanalytisk fagsenter Hormoner Læren
DetaljerPROGENSA PCA3 Urine Specimen Transport Kit
PROGENSA PCA3 Urine Specimen Transport Kit Instruksjoner for legen Til in vitro diagnostisk bruk. Bare for eksport fra USA. Instruksjoner 1. Det kan være nyttig å be pasienten drikke mye vann (omtrent
DetaljerPrøven tas på avkjølte EDTA glass. NB! Glasset fylles helt og blandes ved å snu det opp ned 8 10 ganger. Nødvendig prøvevolum = 0,5 ml plasma.
Laboratoriedokument PS 11 Informasjon om prøvetaking og forsendelse, Hlab Laboratoriemedisin / Avd. medisinsk biokjemi / Hormonlaboratoriet / Prøvemottak Dokument ID: 30273 Versjon: 6 Status: Godkjent
DetaljerSpesielle svulster. Makrobeskjæring av sarkomer. Dokumentasjon - bilder. VikPg makroarbeide Sarkomer er annerledes enn annen kreh
Spesielle svulster av sarkomer Ingvild Lobmaier Åsmund Nybøen Medya Salah OUS - Radiumhospitalet Sarkomer er annerledes enn annen kreh De er sjeldne, og krever ohest mer omfalende kirurgi fordi de er mer
DetaljerMikrobiologisk diagnostikk ved ebolainfeksjon
Mikrobiologisk diagnostikk ved ebolainfeksjon Susanne G. Dudman, overlege dr. med. Avdeling for virologi, FHI Ebola seminar, Oslo kongress senter 10. desember 2014 Filovirus Marburg (1967) Ebola (1976)
DetaljerUtvikling av molekylære metoder
Utvikling av molekylære metoder Gunhild Trøen Overingeniør Sivilingeniør, PhD Enhet for molekylærpatologi Avdeling for patologi OUS- Radiumhospitalet NITO-kurs: Molekylærpatologi, 7-8 juni 2017 Oversikt
DetaljerUønsket opptak av store molekyler i lever et problem som kan overkommes?
Uønsket opptak av store molekyler i lever et problem som kan overkommes? Bård Smedsrød Founder and CSO Blood clearance function of the liver: Fate of i.v. administered macromolecule ( 125 I-FSA) Blood
Detaljer... Proteiner og enzymer. kofaktor. polypeptid
30 Proteiner og enzymer Proteiner er bygd opp av rekker av aminosyrer som er kveilet sammen ved hjelp av bindinger på kryss og tvers, såkalte peptidbindinger. Slike oppkveilete rekker av aminosyrer kaller
DetaljerER EDTA-PLASMA ALLTID EGNET TIL ANALYSE AV HOMOCYSTEIN?
ER EDTA-PLASMA ALLTID EGNET TIL ANALYSE AV HOMOCYSTEIN? Preanalytiske og analytiske utfordringer med EDTA Verifisering av referanseområde og holdbarhet i Li-heparin Linda Fagerland Laboratorium for klinisk
DetaljerMåleprinsipper. Advia. 3 ulike prinsipper benyttes: Instrumentet har 5 kanaler. 2 flowceller benyttes til måling m
ADVIA 120 (Bayer) Måleprinsipper Advia 3 ulike prinsipper benyttes: Lysspredning Spesifikk farging Absorbansmåling Instrumentet har 5 kanaler RBC+PLT, Baso, Perox, Retic og Hb 2 flowceller benyttes til
DetaljerBakteriekontroll av trombocytter fallgruver Mirjana Grujic Arsenovic
Bakteriekontroll av trombocytter fallgruver Mirjana Grujic Arsenovic Jeg vil prate om: Septiske transfusjonsreaksjoner Forbyggende tiltak Status i Norge Hvordan gjør man det ved UNN (og hvorfor) Kliniske
DetaljerFigurer og tabeller kapittel 13 Immunforsvar, smittespredning og hygiene
Side 262 Øre med ørevoks Øye med tårer Munn med spytt og slimhinner Slimhinner med normalflora Flimmerhår og slim i luftveier Hud med normalflora Magesyre Slimhinner med normalflora i urinveier og skjede
DetaljerHva gjør vi på molekylærpatologisk laboratorium?
Bioingeniørkongressen 2016 Hva gjør vi på molekylærpatologisk laboratorium? Dag Andre Nymoen Ingeniør/stipendiat Patologen OUS Laboratorium for molekylærpatologi www.molpat.no Operasjon Biopsi Makrobeskjæring
DetaljerKYSTTORSK OG SKREI I LOFOTEN 2011
KYSTTORSK OG SKREI I LOFOTEN 2011 Resultater fra DNA-typing av torsk ved bruk av PCR metode Websaknr. 11/ Fiskeridirektoratet region Nordland Fiskerikontoret i Svolvær Mai 2011 Erun Thesen Bioingeniør/Seniorinspektør
DetaljerListe over laboratorieutstyr QIAsymphony DSP Virus/Pathogen-sett
Liste over laboratorieutstyr QIAsymphony DSP Virus/Pathogen-sett Prøve- og eluatrør/-stativer som kan brukes med QIAsymphony DSP Virys/Pathogen Mini- og Midi-sett og QIAsymphony SP (programvareversjon
DetaljerHvordan oppstår utbrudd av infeksiøs lakseanemi, når skal man mistenke sykdommen og hvordan stilles diagnosen?
KUNNSKAP OM FISKEHELSE I denne spalten vil Veterinærinstituttet i hvert nummer bidra med oppdatert kunnskap om fiskehelse. Ansvarlig for spalten er forsker Mona Gjessing mona.gjessing@vetinst.no Hvordan
DetaljerC V C. Bruksanvisning for Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02. revisjon 2. Juli 2014
DOT137v1 English. Instructions for Use Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02 Side 1 av 7 Bruksanvisning for Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02 revisjon 2 Juli 2014
Detaljer