Elucigene CF-EU2v1 Bruksanvisning

Størrelse: px
Begynne med side:

Download "Elucigene CF-EU2v1 Bruksanvisning"

Transkript

1 Elucigene CF-EU2v1 Bruksanvisning Kat.kode: CF2EUB2 50 tester CF2EUBX 10 tester Til in vitro-diagnostisk bruk Fremstilt av: Elucigene Diagnostics Greenheys House Pencroft Way Manchester Science Park Manchester M15 6JJ Salg, kundetjeneste og teknisk støtte: T: +44 (0) F: +44 (0) E: E: Elucigene Diagnostics is the trading name of Delta Diagnostics (UK) Limited., a company registered in England and Wales, registration number CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 1 av 23

2 Elucigene CF-EU2v1 Beregnet bruk Til samtidig in vitro kvalitativ påvisning av følgende human cystisk fibrose trans-membran konduktansregulator (Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator, CFTR) genemutasjoner i DNA ekstrahert fra helblod (EDTA-konservert) og tørket blodprøver (DBS-prøver): Tradisjonell I henhold til HGVS-retningslinjer * cdna name Protein name CFTRdele2,3 c _ del Protein (c _ del21080) name E60X c.178g>t p.glu60x P67L c.200c>t p.pro67leu G85E c.254g>a p.gly85glu 394delTT c.262_263del (c.262_263deltt) p.leu88ilefsx22 444delA c.313del (c.313dela) p.ile105serfsx2 R117C c.349c>t p.arg117cys R117H c.350g>a p.arg117his Y122X c.366t>a p.tyr122x 621+1G>T c.489+1g>t 711+1G>T c.579+1g>t L206W c.617t>g p.leu206trp 1078delT c.948del(c.948delt) p.phe316leufsx12 R334W c.1000c>t p.arg334trp R347P c.1040g>c p.arg347pro R347H c.1040g>a p.arg347his A455E c.1364c>a p.ala455glu I507del c.1519_1521del (c.1519_1521delatc) p.ile507del F508del c.1521_1523del (c.1521_1523delctt) p.phe508del 1677delTA c.1545_1546del (c.1545_1546delta) p.tyr515x V520F c.1558g>t p.val 520Phe G>A c g>a G542X c.1624g>t p.gly542x S549R(T>G) c.1647t>g p.ser549arg S549N c.1646g>a p.ser549asn G551D c.1652g>a p.gly551asp R553X c.1657c>t p.arg553x R560T c.1679g>c p.arg560thr kbA>G c a>g G>A c g>a 2143delT c.2012del (c.2012delt) p.leu671x 2184delA c.2052del (c.2052dela) p.lys684asnfsx delG c.2215del (c.2215delg) p.val739tyrfsx16 W846X c.2538g>a p.trp846x G>A c g>a Q890X c.2668c>t p.gln890x G>A c g>a CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 2 av 23

3 Tradisjonell I henhold til HGVS-retningslinjer * cdna name Protein name A>G c A>G Protein name R1066C c.3196c>t p.arg1066cys Y1092X(C>A) c.3276c>a p.tyr1092x M1101K c.3302t>a p.met1101lys D1152H c.3454g>c p.asp1152his R1158X c.3472c>t p.arg1158x R1162X c.3484c>t p.arg1162x 3659delC c.3528del (c.3528delc) p.lys1177serfsx kbC>T c c>t S1251N c.3752g>a p.ser1251asn 3905insT c.3773dup (c.3773dupt) p.leu1258phefsx7 W1282X c.3846g>a p.trp1282x N1303K c.3909c>g p.asn1303lys * with reference to Mutation Nomenclature in Practice: Findings and Recommendations from the Cystic Fibrosis External Quality Assessment Scheme. Berwouts S, Morris M, Girodon G, Schwarz M, Stuhrmann M and Dequeker E. Human Mutation, Vol.00, No. 0, 1-7 (2011) CF-EU2v1 kan skjelne mellom personer som er heterozygotiske og homozygotiske for alle ovennevnte mutasjoner og varianter, med unntak av S549R(T>G) se avsnittet om kryssreaktivitet i dette dokumentet. Oppsummering og forklaring Cystisk fibrose (CF) er den mest vanlige livsbegrensende autosomale recessive lidelsen i den hvite befolkningen. Sykdomsinsidensen er 1:3200 levendefødte i den hvite befolkningen (1). I den hvite befolkningen er frekvensen for heterozygotiske omtrent 1:25. Cystisk fibrose innvirker på epitelet i flere organer. Dette resulterer i en komplisert sykdom i flere systemer, inkludert eksokrine bukspyttkjertel, tarmer, luftveier, mannlig genitalkanal, hepatobiliære system og eksokrine svettekjertler. Sykdomsbildet varierer etter alvorlighetsgraden ved CFTR-mutasjoner (2), genetiske modifikatorer (3) og miljøfaktorer (4). Rekkevidden strekker seg fra tidlig barndomsdød som et resultat av progressiv obstruktiv lungesykdom med bronkiektasi, til bukspyttkjertelinsuffisiens med gradvis progressiv obstruktiv lungesykdom i ungdommen og økende sykehusinnleggelsesfrekvens for lungesykdom i tidlig voksen alder, til tilbakevendende sinusitt og bronkitt eller mannlig infertilitet i ung voksen alder. Som oftest er diagnosen cystisk fibrose etablert i personer med en eller flere karakteristiske fenotypiske funksjoner av CF, pluss tegn på en abnormalitet i CFTR-funksjonen, basert på én av de to følgende: nærvær av to sykdomsfremkallende mutasjoner i CFTR-genet eller to abnormale kvantitative pilokarp-iontoforese svettekloridverdier (>60 meq/l) eller transepitelial nasal potensialforskjell (NPD) målinger som er karakteristiske for CF. CFTR mutasjonspåvisningsfrekvensen varierer etter testmetode og etnisk bakgrunn. Hos enkelte symptomatiske personer, er bare én eller ingen sykdomsfremkallende mutasjon påvisbar. Hos enkelte bærere er sykdomsfremkallende mutasjoner ikke påvisbare. CFTR-relaterte sykdommer er arvelige på en autosomal recessiv måte. Søsken til en proband med cystisk fibrose har 25 % sjanse for å bli angrepet, 50 % sjanse for å være asymptomatiske bærere og en 25 % sjanse for å være upåvirket og ikke bærere. Molekylær genetisk testing for sykdomsfremkallende mutasjon (en) i CFTR genet brukes til påvisning av bærer i populasjonsscreeningsprogrammer. Prenatal testing er tilgjengelig for graviditeter som har økt risiko for CFTR-relaterte sykdommer hvis sykdomsfremkallende mutasjoner i familien er kjente. Siden oppdagelsen av CFTR-genet i 1989 (5), har over 1700 mutasjoner og varianter i genet blitt beskrevet (6). Mange av disse mutasjonene er private, og har bare blitt beskrevet i én pasient og/eller familie. Rutinetesting for alle mulige mutasjoner er verken gjennomførbart eller kostnadseffektivt, og er derfor CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 3 av 23

4 begrenset til testing for de mest vanlige mutasjonene. CF-EU2v1 er et cystisk fibrose-testsett, utformet spesielt for de mest vanlige mutasjonene som finnes i populasjoner av europeisk opprinnelse. Analysen identifiserer 50 mutasjoner totalt, og analyserer også intron 9 poly-t-kanal med nøyaktige mål for den tilliggende TG-repetisjonen. Den polymorfe tymidinkanalen ved overgangen mellom intron 9 og ekson 10 har innflytelse på transkripsjonen. Antallet restkonsentrasjoner av tymidin (5T, 7T eller 9T) innvirker på spleisingseffektiviteten i ekson 10. Hvis 5T-allelener tilstede, vil en del av ekson 10-transkriptene være fraværende og resultere i ufunksjonelt protein og variable CF-symptomer. Det er rapportert at antallet TG repeterer 5 (5 henviser til basis på enden til PCR-primeren) til polytymidkanalen kan også influere på spleising av ekson 10 (7). Hvis tilstede på samme allele som 5T-varianten jo lenger antallet TG repeteres, jo høyere er delen av CFTRtranskripter som mangler ekson 10. Antallet TG-repetisjoner kan bestemmes ved bruk av CF-EU2v1, og bestemme størrelsen på 5T-amplikontoppene. Prinsipper for prosedyren Metoden som brukes av Elucigene CF-EU2v1-settet bruker fluorescent ARMS (Amplification Refractory Mutation System) allelespesifikk amplifkasjonsteknologi, som påviser punktmutasjoner, insersjoner eller delesjoner i deoxyribonukleinsyre (DNA) (8). ARMS-prinsippet består i at oligonucleotider med 3 ulik restkonsentrasjon, ikke vil fungere som primere for polymerasekjedereaksjon (PCR) under spesifiserte forhold. Valg av passende oligonukleotider gjør det mulig for spesifikke mutanter eller normale DNA-sekvenser å bli amplifisert og påvist. Amplifiserte sekvenser (amplikoner) blir atskilt med kapillærelektroforese ved bruk av et genetisk analyseinstrument fra Applied Biosystems. Analyseprogramvaren gjør det mulig å identifisere og merke amplikonene i henhold til størrelse og farge. Elucigene CF-EU2v1 er en høyt multipleks analyse, bestående av to PCR-reaksjoner (A og B). Femti mutantsekvenser i CFTR-genet oppdages i A-blandingen og visualiseres som blå amplikontopper. Tilsvarende ikke-muterte normale sekvenser (villtype) blir påvist i B-blandingen og visualiseres som grønne amplikontopper. A-blandingen påviser også normal sekvens for den mest vanlige observerte mutasjonen som forårsaker cystisk fibrose i den hvite befolkningen, kalt F508del, og visualiseres som en grønn amplikontopp. Flere polyt-gjentatte sekvenser påvises i A-blandingen og visualiseres som svarte amplikontopper. Interne amplifikasjonskontrollmarkører (ikke-cystisk fibrose) er inkludert både i A- og B-blandingen for å overvåke effektiviteten ved prøveamplifiseringen og visualiseres som røde amplikontopper. CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 4 av 23

5 Advarsler og forholdsregler 1. DNA-kontrollen som følger med dette settet er av human opprinnelse og har blitt testet uavhengig i en PCR-basert analyse og funnet å være negativ for hepatitt B-virus (HBV), hepatitt C-virus (HCV) og Human Immundefekt Virus 1 (HIV1). 2. Vær forsiktig ved håndtering av materiale av human opprinnelse. Alle prøver skal anses å være infeksiøse. Ingen testemetoder kan gi full garanti for at HBV, HCV, HIV 1 eller andre infeksiøse agenser er fraværende. 3. Håndtering av prøver og testkomponenter, samt bruk, oppbevaring og avhendig av disse, skal gjøres i samsvar med fremgangsmåtene som fremgår av gjeldende nasjonale retningslinjene eller regler for biologisk sikkerhet. 4. I overensstemmelse med gjeldende god laboratoriepraksis, skal laboratoriene behandle sine egne interne kvalitetskontrollprøver av kjent genotype i hver analyse, slik at validiteten av prosedyren kan vurderes. 5. Hvis esken med settet er skadet, kan det finnes skade på innholdet. Ikke bruk settet. Kontakt kundeservice. CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 5 av 23

6 Symboler brukt på etiketter Symbolene brukt på alle etiketter og emballasje oppfyller den harmoniserte standardarden ISO15223 Produsent Antall tester Se bruksanvisningen X C Oppbevares under angitt temperatur Brukes før angitt dato Katalogkode Parti- eller batchnummer In vitro-diagnostisk medisinsk anordning CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 6 av 23

7 Vedlagte materialer Reagensene skal oppbevares på et sted som er fritt for kontaminerende DNA- eller PCR-produkter. Alle reagenser som leveres er klar til bruk. Oppbevares uåpnet, og åpnede reagenser oppbevares ved -20 C. Åpnede reagenser kan oppbevares i opp til 3 måneder. Tilstrekkelig materiale for 50 (10) tester er levert: 2 x 120µl (50µl) hetteglass med CF-EU2v1 A primerblanding som inneholder primere til amplifisering av følgende mutantalleler R347H, R347P, G>A, G>A, 711+1G>T, R334W, I507del, F508del, kbC>T, 1677delTA, 1078delT, V520F, L206W, W1282X, R560T, 2347delG, Q890X, R553X, G551D, S549N, M1101K, G542X, 3905insT, Y1092X(C>A), S1251N, 444delA, kbA>G, G>A, R117H, R117C, N1303K, Y122X, 394delTT, G85E, R1066C, G>A, W846X, 2184delA, D1152H, CFTRdele2,3, P67L, 2143delT, E60X, 3659delC, A>G, 621+1G>T, A455E, R1162X og R1158X. Denne blandingen inneholder også villtypeprimere til påvisning av normal F508del-allele, primere til påvisning av polytymidinvarianter, IVS8-5T, IVS8-7T, IVS8-9T og primere til identifikasjon av 2 hypervariable STR-markører (450043). 2 x 120µl (50µl) hetteglass med CF-EU2v1 B primerblanding som inneholder villtypeprimere til amplifisering av de normale allelene fra mutantene som er amplifisert av A-primerblandingen, med unntak av F508del, den normale allelen som er amplifisert av primere inkludert i A-primerblandingen. Denne blandingen inneholder også primere til identifikasjon av 2 hypervariable STR-markører (450044). 2 x 400µl (75 l) hetteglass med PCR hovedblanding som inneholder HotStart Taq DNA polymerase og deoxynukleotide trifosfater i buffer (450045). 1 x 50 µl hetteglass DNA-kontroll på 6 ng/µl normalt for mutasjoner påvist av Elucigene CF-EU2v Nødvendigematerialer som ikke leveres Forbruksvarer for laboratoriet hansker, mikrofugerør med skrulokk, 0,2 ml PCR-hetteglass eller mikrotiterplater, anbefalt av produsenten av den termale variatoren som brukes, pipettespisser. DNA-klargjøring QIAamp DNA Mini Kit (Qiagen GmbH, Cat No 51304/51306) eller tilsvarende. Kapillærelektroforese GeneScan 600 LIZ standard størrelse (ABI Cat No ), GeneScan 600v2 LIZ standard størrelse (ABI Cat No ), Multikapillær DS-33 (fargesett G5) matrisestandard (ABI Cat No ), POP-7-polymer (ABI Cat No ), 10x buffer for genetisk analysator (ABI Cat No ) og Hi-Di-formamid (ABI Cat No ). Merknad: Sørg for at alle materialer som brukes ligger innenfor produsentens stabilitetsdatering. Nødvendig utstyr Laboratorieutstyr presisjonspipetter (2 sett: 1 til håndtering av preamplifisering og 1 til postamplifisering), verneklær, vorteksblander, mikrofuge, sentrifuge for 96-brønners mikrotiterplate. PCR-amplifikasjon termisk variator som rommer 96-brønners mikrotiterplater, eller 0,2 ml hetteglass med en minimum temperaturnøyaktighet på +/- 1 C mellom 33 C and 100 C og statisk temperaturensartethet på +/- 1 C. Merknad: Termisk variatorutstyr skal vedlikeholdes regelmessig i samsvar med produsentens instruksjoner, samt kalibreres for å sikre nøyaktig PCR-syklus og optimal ytelse. Elucigene CF-EU2v1-analysen ble utviklet på 9700 termiske variatorer fra Applied Biosystems. Andre merker og modeller skal være fullstendig testet og evaluert for optimal ytelse av brukeren før resultatene rapporteres med CF-EU2v1. Kapillærelektroforese ABI 3130/3500 genetisk analysator (med GeneMapper programvare for fragmentanalyse), 36 cm eller 50 cm (ABI 3500) kapillærarray, 96-brønners optiske plater, 96-brønners septa, 96-brønners kassetter. Merknad: Kapillærelektroforeseutstyr skal vedlikeholdes regelmessig i samsvar med produsentens instruksjoner, samt kalibreres for å sikre optimal ytelse. CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 7 av 23

8 Prøvetaking og -oppbevaring Fullblodsprøver (EDTA) og tørre blodflekker har blitt evaluert og funnet kompatible med denne testen. Prøveoppsamlingsanordninger har sporadisk vært rapportert å være skadelige for integriteten ved visse analytter og kan innvirke på enkelte metodeteknologier (9). Det anbefales at hver bruker påser at den valgte anordningen brukes i samsvar med produsentens instruksjoner og at prøveoppsamlingsanordningene er kompatible med denne testen. Blodprøver skal oppbevares ved -20 C før DNA klargjøring. Unngå gjentatt frysing og tining. Klargjøring av DNA fra fullblodsprøver (EDTA) Resultatene blir konsekvent innhentet med DNA ekstrahert ved bruk av QIAamp 96 DNA Blod testsettet (eller QIAamp DNA Mini Kit ved bruk av proteinase K) i henhold til protokollen slik det beskrives i QIAamphåndboken, og begynner med 200 µl flytende fullblod og eluert i 200 µl vann av molekylærbiologi-klasse. Klargjøring av DNA fratørkede blodflekker Resultatene blir konsekvent innhentet med DNA ekstrahert ved bruk av QIAamp DNA Mini Kit i henhold til protokollen slik det beskrives i QIAamp-håndboken, men begynner med 2 x 3 mm plater fra en tørket blodflekk og eluert i 100 µl vann av molekylærbiologisk klasse. Det anbefales at det brukes alternative DNA-ekstraksjonsmetoder og at prøvetypene blir grundig evaluert med Elucigene CF-EU2v1-testen før resultatene brukes til diagnostiseringsformål. Viktige hensyn DNA-mengde Under optimale PCR-forhold, og bruk av anbefalte prøveinjeksjonsinnstillinger (se merknad i avsnittet Kapillærelektroforese), gitt i kapillærkolonnens kjøringsmoduler, harakseptable resultater rutinemessig blitt oppnådd fra DNA ekstrahert med ovennevnte metoder i konsentrasjoner mellom 1,5 ng/µl og 25 ng/µl. Kvantifiseringen av DNA er svært viktig, konsentrasjonen av hver DNA-prøve som skal testes, skal måles for å sikre optimale resultater. Teknikker, for eksempel PicoGreen-fluorescens eller UV-absorbans er akseptable. På grunn av variasjonene i DNA-kvantifiseringsteknikker, skal brukeren vurdere følgende veiledning: Innsetting av svært høye DNA-mengder vil øke sannsynligheten for at bakgrunnstoppene blir merket av analyseprogramvaren. Følgende trinn kan tas for å redusere sannsynligheten for at bakgrunnstoppene blir merket. Fortynn DNA og amplifiser på nytt Reduser injeksjonstiden se avsnittet Kapillærelektroforese Øke minimum toppamplitudeterskel se Elucigene CF-EU2v1 veiledning om analyseprogramvare Innsetting av lave DNA-mengder vil øke sannsynligheten for at diagnostikktoppene blir svake og ikke merket av analyseprogramvaren. Følgende trinn kan tas for å øke signalet. Øke injeksjonstiden til 36 sekunder (anbefales sterkt for blodflekkekstraksjoner) se avsnittet Kapillærelektroforese Ekstraher blodflekkprøven på nytt og vask ut i redusert vannvolum (50 µl) Øk antallet blodflekker for ekstraksjon til 4 x 3 mm skiver Viktige hensyn DNA-kvalitet CF-EU2v1 er en høyt multiplekset analyse og krever effektiv PCR-amplifikasjon for å fungere optimalt. DNAkvaliteten kan bestemme effektiviteten ved PCR-prosessen Inhibitorer som er ko-ekstrahert med DNA-prøven kan resultere i en suboptimal amplifikasjon, som fører til svake og dårlig balanserte topper. Elucigene Diagnostics har validert bruken av QIAamp 96 DNA-blodsettet og QIAamp DNA-minisettet (QIAGEN GmbH) med CF-EU2v1-settet. Andre DNA-ekstraksjonssett eller metoder skal valideres og optimaliseres for bruk med CF-EU2v1. Merknad: Se feilsøkingsveiledningen for CF-EU2v1 for å finne mer informasjon. CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 8 av 23

9 Testprotokoll Kontroll av PCR-kontaminasjon PCR-prosessen genererer et stort antall amplifiserte produkter (amplikoner) og innebærer en høy risiko for kontaminering, som kan føre til falske resultater. Kontaminering kan oppstå fra to kilder: Krysskontaminering kontaminering av prøven med uamplifisert materiale fra omgivelsene, eller andre prøver som inneholder målsekvensen. Sluttproduktkontaminering kontaminering av prøven med amplikoner fra tidligere PCRer som fører til amplifikasjon av både mål- og kontaminantamplikoner. Laboratoriene som utfører PCR bør være oppmerksom på disse kontamineringskildene og ha prosedyrer på plass som gir betydelig reduksjon av risikoen for kontaminering. Metoder for kontamineringskontroll er godt dokumentert (10) og inkluderer den fysiske utforming av laboratorier, arbeidsflyt, prøvehåndteringsprosedyrer og kjemiske og enzymatiske metoder. Veldefinerte og gode laboratorieprosedyrer er vesentlige for å kontrollere PCR-kontaminering og skal iverksettes før kliniske prøver blir testet. Amplifikasjonsprosedyre Merknad: Trinn 3-5 skal utføres på et sted fritt for PCR-produkter, slik at risikoen for kontaminasjon minimeres, fortrinnsvis i et laminær flyt-kabinett. 1. Programmer den termiske variatoren for ett enkelt syklustrinn for å aktivere HotStart Taq ved 94 C i 20 minutter, forbundet til et amplifikasjonssyklusprogram på 1 minutt ved 94 C (denaturering), 2 minutter ved 58 C (annealing) og 1 minutt ved 72 C (forlengelse) i 30 sykler. Dette bør forbindes til en 20 minutters tidsforsinkelsesfil ved 72 C (forlengelse) i den siste syklusen. 2. En negativ kontroll skal inkluderes i hver PCR-kjøring. 3. Tin primerblandingene og PCR-hovedblandingen og sentrifuger i kort tid slik at innholdet samles på bunnen av hetteglassene. Bland forsiktig ved å vorteksere og sentrifugere hetteglassene igjen en kort tid. Tilbered tilstrekkelig reaksjonsblanding til antallet prøver og kontroller som skal testes (Tabell 1). Merknad: PCR-hovedblandingen er viskøs og det må påses at riktige mengder blir håndtert. Det anbefales å tilsette PCR-hovedblandingen til de tidligere dispenserte primerblandingene for derved å sørge for at all væske er dispensert fra pipetten og inn i primerblandingen. Merknad: Ikke bruk forskjellige blandinger eller komponenter fra forskjellige partier i CF-EU2v1-settet. Enzymaktiveri ng Sykling Endelig forlengelse 94 C 94 C 20 min. 1 min. 72 C 72 C 58 C 1 min. 20 min. Omgivelsestemperatur 2 min. 30 sykler CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 9 av 23

10 Tabell 1: Reaksjonsblandingsformel Antall prøver som skal testes Primerblanding (μl) 4, ,5 225 PCR-hovedblanding (μl) 7, ,5 375 Totalt (μl) Pipetter 10 μl av hver reaksjonsblanding inn på bunnen av de riktig etiketterte 0,2 ml PCR-hetteglassene eller platene. 5. Bruk separate pipettespisser og tilsett 2,5 μl test-dna-prøve til hvert av hetteglassene og sett på hettene. DNA skal ikke tilsettes hetteglasset for negativ kontroll, erstatt med 2,5 µl sterilt avionisert vann. 6. Sentrifuger PCR-hetteglassene i kort tid slik at innholdet samles på bunnen av hetteglassene. 7. Sett hetteglassene fast på plass i blokken på den termiske variatoren. Start enkelttrinnssyklusen på 94 C, fulgt av amplifiseringssyklusprogrammet. 8. Når amplifiseringssyklusprogrammet er ferdig, kan prøvene oppbevares i romtemperatur over natten, eller ved 2-8 C i opp til 7 dager i mørke omgivelser før de analyseres med kapillærelektroforese. Kapillærelektroforese Det anbefales at hver bruker påser at det valgte kapillærelektroforeseutstyret brukes i henhold til produsentens instruksjoner, og er kompatibelt med testen. I denne sammenhengen er nøkkelparametrene polymeret og kapillærarrayet. Optimale resultater kan oppnås med følgende forhold for kapillærelektroforesen: 1. Bland 6,8 μl av GS600v2 LIZ standardsstørrelse med 250 μl Hi-Di formamid og bland grundig (tilstrekkelig blanding til 16 brønner). Fordel 15 μl av blandingen i hver brønn på en 96-brønners PCRplate. 2. Tilsett 3 µl PCR-produkt fra hver av A- og B-blandingsamplifikasjonene i separate brønner som inneholder standard størrelse/formamidblanding (fra trinn 1) som allerede er dispensert inn på platen. 3. Denaturer PCR-produktet som er fordelt på den optiske platen på en termisk variator med følgende parametre: 94 C i 3 minutter forbundet med 4 C i 30 sekunder. 4. Sentrifuger platen i kort tid slik at innholdet samles på bunnen av hetteglassene og for å fjerne eventuelle bobler i brønnene og sett dem straks på den genetiske analysatoren. Merknad: Innstillingene for prøveinjeksjon kan endres slik at de tilpasses mengden amplikon som produseres under PCR, som kan variere på grunn av mengden av genomisk DNA som tilsettes. Mindre amplikon kan brukes i kolonnen til analyse ved å redusere enten tiden eller spenningen ved injeksjonen. Omvendt kan mer amplikon brukes i kolonnen til analyse ved å øke enten tiden eller spenningen ved injeksjonen. Tidligere amplifiserte prøver kan injiseres på nytt flere ganger for ny analyse se feilsøkingsveiledningen for Elucigene CF-EU2v1 hvis du vil ha mer informasjon. CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 10 av 23

11 ABI 3130-instrumenter: Det er nødvendig å opprette en CF-EU2-kjøringsmodul og protokoll, som kan brukes til hver CF-EU2-kjøring. Opprett CF-EU2-modulen i Module Manager (Kjøringsmodulstyring) i programvaren for 3130 dataoppsamling. Påse at følgende er valgt: Type: Regular (Vanlig) Template (Mal): FragmentAnalysis36_POP7 Oppfør innstillingene vist i tabellen nedenfor: 36 cm kapillærmodul # Parameternavn Verdi Verdiområde 1 Oven Temperature 60 int C (Ovnstemperatur) 2 Poly_Fill_Vol trinn (Poly Fyll Vol.) 3 Current Stability 5,0 int ua (Strømstabilitet) 4 PreRun_Voltage 15, kv (Prekjøringsspenning) 5 Pre_Run_Time s (Prekjøringstid) 6 Injection_Voltage 3, kv (Injeksjonsspenning) 7 Injection_Time 12,0** s (Injeksjonstid) 8 Voltage_Number_Of_Steps nk (Spenning_Antall_Trinn) 9 Voltage_Step_Interval s (Spenningstrinnintervall) 10 Data_Delay_Time s (Dataforsinkelsestsid) 11 Run_Voltage 15, kv (Kjøringsspenning) 12 Run_Time (Kjøringstid) s **Øke injeksjonstiden til 36 sekunder for analyse av DNA som er ekstrahert fra blodflekker Merknad: Påkrevd kjøringstid vil variere, avhengig av omgivelsestemperaturen på steder der den genetiske analysatoren er installert. For mer informasjon om opprettelse av kjøringsmoduler, se brukerhåndboken for den genetiske analysatoren fra Applied Biosystems Opprett CF-EU2-protokollen i Protocol Manager (Protokollstyringen) og sørg for at følgende er valgt: Type: Regular (Vanlig) Run Module (Kjøringsmodul): CF-EU2 (se kjøringsmodul ovenfor) Dye Set (Fargesett): G5 Opprett et prøveark med Plate Manager (Platestyringen) for å kjøre prøvene, og sørg for at riktig protokoll for CF-EU2v1 har blitt valgt for instrumentprotokollen (se ovenfor). Merknad: Det finnes mer informasjon om instrumentoppsett, betjening og feilsøking i brukerhåndboken for den genetiske analysatoren fra Applied Biosystems CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 11 av 23

12 ABI 3500-instrumenter: Det er nødvendig å opprette en CF-EU2 Instrument Protocol (Instrumentprotokoll) som kan brukes ved hver CF-EU2v1-kjøring. Opprett CF-EU2 Instrument Protocol (Instrumentprotokoll) via 3500 Instrumentprotokoll-biblioteket. Påse at følgende er valgt: Run Module (Kjøringsmodul): FragmentAnalysis50_POP7 Før opp innstillingene beskrevet i bildet nedenfor: ** **Øke injeksjonstiden til 36 sekunder for analyse av DNA som er ekstrahert fra blodflekker. Prøvene kjøres ved å opprette en prøveplate ved å klikke på Create Plate from Template (Opprett plate fra mal) i Dashboard (Instrumentbord), og sørg for at riktig instrumentprotokoll for CF-EU2v1 har blitt tilordnet (se ovenfor). Prøvearkoppsett for GeneMarker: Programvaren for GeneMarker muliggjør direkte sammenligning mellom A- og B-data fra samme person. For å gjøre dette mulig er det viktig at navnet på FSA-filen er den samme i alle prøver og blandinger. Prøvearket skal inneholde det unike prøvenavnet for hver prøve som blir testet, enten med suffikset _A eller _B, avhengig av hvilken blanding som testes. Hvis plate-iden skal inkluderes i FSA-navnet, skal det brukes et fast format hver gang, for eksempel CFEU2 DDMMÅÅÅÅ. På 3130 Results Destination (Resultatdestinasjon) skal parametrene innstilles slik at prøvenavnet er inkludert i FSA-filnavnet, for eksempel CFEU2 DDMMÅÅÅÅ_1234,5_A_A01. CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 12 av 23

13 På 3500 skal filnavnkonvensjonen stilles inn slik at prøvenavnet er inkludert i FSA-filnavnet, for eksempel CFEU2 DDMMÅÅÅÅ_1234,5_A_A01. Tolking av resultater Under dataoppsamlingen, blir PCR-fragmentene observert som enten blå (mutant) eller grønne (villtype) topper på elektroferogrammet for rådata. Et menneske har to kopier av CFTR-genet. Der disse kopiene har samme sekvens for et gitt sted, blir personen beskrevet som homozygotisk for dette stedet. Hvis kopiene er forskjellige i sekvens på et gitt sted, blir personen beskrevet som heterozygotisk for dette stedet. Når dataoppsamlingen er ferdig, skal CF-EU2v1 PCR-fragmentenes størrelse sammenlignes med GS600v2 LIZ standardstørrelse ved bruk av programvaren for fragmentanalyse. CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 13 av 23

14 Dokumentet Elucigene CF-EU2v1 Veiledning for analyseprogramvaren har flere detaljerte retningslinjer for programvareinnstillinger, analyse og tolking. Prosedyrene i Veiledning for analyseprogramvaren er tilgjengelig for GeneMapper- og GeneMarker-programvaren fra Elucigene Diagnostics nettsted: Resultater fra A-blandingen (mutant) bestemmer hvorvidt en person bærer en mutasjon og vises med en blå topp. Mutantblandingen inneholder også primere for den normale F508-allelen. Denne blandingen kan derfor bestemme om en person er normal for F508del (bare grønn topp), homozygotisk for F508del (bare blå topp), eller heterozygotisk for F508del (blå og grønn topp). Hvis en annen mutasjon observeres, kan resultatene fra B-blandingen (villtype) analyseres for å bestemme homozygotisk eller heterozygotisk status. Hvis en grønn topp vises for den spesielle allelen i villtypeblandingen, angir dette at personen er heterozygotisk, og fravær av grønn topp angir at personen er homozygotisk for den spesielle mutasjonen. Hypervariable STR-markører (røde) er inkludert i begge blandingene. Dette muliggjør sammenligning mellom den amplifiserte prøven med mutantblandingen og prøven som er amplifisert med villtypeblandingen slik at muligheten for prøveforveksling reduseres. Forskjellig STR-profil i hver av de to blandingene angir prøveforveksling. Fravær av disse STR-markørene angir at prøven er mislykket. Nærvær av STR-markører ved svært lav RFUS angir en svak prøve, som bør analyseres med forsiktighet. Merknad: Se feilsøkingsveiledningen for mer informasjon. CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 14 av 23

15 Påviste markører Tabellen nedenfor oppsummerer markørene påvist med CF-EU2v1-blanding. Markørene er oppført i henhold til størrelsesområdet for PCR-produktet som observeres. Markør (Topp nr.) Påviste markører Markør Produktets bp størrelsesområde (3130/POP7 data) 01 R347H R347P G>A G>A G>T R334W I507del F508del KbC>T delTA delT V520F L206W W1282X R560T delG Q890X R553X G551D S549R(T>G)* S549N M1101K G542X insT Y1092X(C>A) S1251N delA kbA>G G>A R117H R117C N1303K Y122X delTT G85E R1066C G>A W846X delA D1152H CFTRdel2, P67L delT E60X delC A>G G>T CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 15 av 23

16 Markørnummer (3130/POP7 data) Markør Produktets bp størrelsesområde 48 A455E R1162X R1158X T** IVS8-5T T IVS8-7T T IVS8-9T *S549R(T>G) Topp 20 er bare tilstede i A-blandingen. ** 5T allelestørrelser Produktets bp Markør størrelsesområde (3130/POP7 data) 5T (9) T (10) T (11) T (12) T (13) MERK: Markørstørrelsene kan variere, avhengig av instrumentet og polymeret som brukes. Eksempler på tolking I507del På grunn av plasseringen av I507del-delesjonen i CFTR-genet er det mulig å påvise nærvær av denne markøren gjennom et 3 bp-forskyvning i størrelsen på F508del-toppen, i tillegg til en I507del mutantspesifikk topp. Hvis en enkel I507del mutantallele er tilstede, blir I507del mutanttopp observert som en blå topp ved omtrent 159 bp. En villtypetopp for F508del blir observert som nærværende, men ved omtrent halve topphøyden blir den vanligvis assosiert med en homozygotisk genotype av villtypen. Dette vises som en grønn topp på omtrent 167 bp. Det vil også være en ekstra grønn topp observert ved omtrent 164 bp. I507del heterozygot-prøve En I507del/F508del-prøve vil gi en forskjøvet grønn F508del WT-topp ved omtrent 164 bp (3 bp mindre enn normalt), en blå F508del M-topp ved 166 bp og en blå I507del M-topp ved omtrent 159 bp. En I507del/I507del-prøve gir en blå topp ved omtrent 159 bp og en enkel grønn topp ved omtrent 164 bp (3 bp mindre enn den normale F508del-toppen som observeres når I507del ikke er tilstede. CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 16 av 23

17 F508del Nærvær av en F508del-mutasjon forhindrer I507del WT-primeren i å fungere. En person som er homozygotisk for nærvær av en F508del-mutasjon, forhindrer derfor I507del WT (se nedenfor). En redusert høyde I507del WT-topp og 2 topper med 3 bp mellomrom i posisjon 10 og 12 i WT-blandingen (se nedenfor) vil bli observert i B-blandingsresultatene fra en person som er heterozygotisk for F508del. Innsettinger og delesjoner På grunn av utformingen av CF-EU2v1-settet, vil nærværet av innsettinger eller delesjoner mellom to motsatte primere resultere i størrelsesendringer for alle amplikonen produsert mellom disse to primerne. I tillegg til de 50 mutasjonene, påvist av CF-EU2v1-settet, vil derfor eventuelle innsettinger og delesjoner i de amplifiserte målsekvensene, bli påvist av endringen i forventet amplikonstørrelse i B-blandingen (villtype). Disse har blitt tabulert og er tilgjengelige i et separat dokument fra Elucigene Diagnostics nettsted: Eksempler på innsettinger og delesjoner, påvist av settet og innvirkningen de har på B-blandingsprofilen vises nedenfor: F508del/1677delTA To topper med 1 bp mellomrom ved posisjon 12 (V520F WT) vil bli observert i B-blandingsresultatene fra en heterozygotisk person for F508del/1677delTA-mutasjonene. CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 17 av 23

18 V520F En villtypetopp med redusert høyde ved posisjon 10 (1677delTA WT) vil bli observert i B-blandingsresultatene fra en heterozygotisk person for V520F-mutasjon, fordi dette forhindrer at 1677delTA WT-primeren i å fungere. Topp 10 og 12 faller ut i resultatet for en person som er homozygotisk for V520Fmutasjonen. 394delTT To topper med 2 bp mellomrom ved posisjon 35 (G85E WT), 42 (P67L WT) og 44 (E60X WT), vil bli observert i B-blandingsresultatene fra en person som er heterozygotisk for 394delTTmutasjonen. Topp 34 faller ut og toppene 35, 42 og 44, vil ha forventet høyde, men forskjøvet til 2 bp mindre enn forventet størrelse i resultatene fra en person som er homozygotisk for 394delTT-mutasjonen. F508del/CFTRdele2,3 Reduserte topphøyder i posisjonene 34 (394delTT), 35 (G85E WT), 41 (CFTRdele2,3 WT), 42 (P67L WT) og 44 (E60X WT), blir observert i B-blandingsresultatene fra en person som er heterozygotisk for CFTRdele2,3- mutasjonen. Toppene 34, 35, 41, 42 og 44 faller ut i resultater fra en person som er homozygotisk for CFTRdele2,3-mutasjon. CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 18 av 23

19 444delA To topper med 1 bp mellomrom i posisjon 30 (R117H WT), 31 (R117C WT), 33 (Y122X WT) og 47 (621+1 WT), vil bli observert i B-blandingsresultatene fra en person som er heterozygotisk for 444delA -mutasjonen. Topp 27 faller ut og toppene 30, 31, 33 og 47, vil ha forventet høyde, men forskjøvet til 1 bp mindre enn forventet størrelse i resultatene fra en person som er homozygotisk for 444delA-mutasjonen. 2347delG To topper med 1 bp mellomrom i posisjon 39 (2184delA WT) og 43 (2143delT WT), vil bli observert i B- blandingsresultatene fra en person som er heterozygotisk for 2347delG-mutasjonen. Topp 16 faller ut og toppene 39 og 43 vil ha forventet høyde, men forskjøvet til 1 bp mindre enn forventet størrelse i resultatene fra en person som er homozygotisk for 2347delG-mutasjonen. 3905insT To topper med 1 bp mellomrom i posisjon 26 (S1251N WT), vil bli observert i B-blandingsresultatene fra en person som er heterozygotisk for 3905insT-mutasjonen. Topp 24 faller ut og topp 26 vil ha forventet høyde, men forskjøvet med 1 bp større enn forventet størrelse i resultatene fra en person som er homozygotisk for 3905insT-mutasjonen. CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 19 av 23

20 R1158X Redusert topphøyde i posisjon 49 (R1162X WT) vil bli observert i B-blandingsresultatene fra en person som er heterozygotisk for R1158X-mutasjonen. Topp 49 faller ut i resultater fra en person som er homozygotisk for R1158X-mutasjonen. Polymorfisme rs (delat) i intron 22 To topper med 2 bp mellomrom i posisjon 45 (3659delC WT), 49 (R1162X WT) og 50 (R1158X WT) vil bli observert i B-blandingsresultater fra en person som er heterozygotisk for polymorfismen rs (delesjon av AT) i intron 22. Topp 45, 49 og 50 vil ha forventet høyde, men forskjøvet til 2 bp mindre enn forventet størrelse i resultatene fra en person som er homozygotisk for polymorfismen rs Andre observasjoner V520F Polymorfisme 1584G>A i exon G>A polymorfisme har blitt funnet som interfererer med amplifikasjonen av V520F mutanten og villtypesekvensen. Redusert topphøyde i posisjon 12 (V520F) vil bli påvist i B-blandingen i en person som er heterozytgotisk for 1584G>A polymorfisme. Topp 12 vil falle ut av B-blandingen hos en person som er homozygotisk for 1584G>A polymorfisme. En person som er heterozygotisk for F508del-mutasjonen og også heterozygotisk for 1584G>A-mutasjonen, vil vise bare én topp 12 i B-blandingen i stedet for de forventede to toppene i posisjon 12 som vanligvis ses i en F508del-heteozygote se eksempel nedenfor. Topp 12 vil falle ut av A-blandingen hos en person som er heterozygotisk for V520F-mutasjonen og 1584G>A polymorfisme på samme allele. Et slikt resultat har ikke blitt observert til dato, og er sannsynligvis en sjelden kombinasjon. CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 20 av 23

21 Kryssreaktivitet Vi gjorde alt vi kunne under testutviklingen for å unngå interferens i testefunksjonen ved nærvær av andre rapporterte polymorfismer og mutasjoner i CFTR-genet. Den sjeldne mutasjonen R1283M har blitt evaluert for kryssreaktivitet, og ble ikke påvist av Elucigene CF-EU2v1-settet. Dessuten ble følgende polymorfismer ikke påvist av testen: 1655T/G (F508C), 1651A/G. Evaluering av kjente mutasjoner og polymorfismer i CFTR-genet har fremhevet følgende virkninger på resultatene fra Elucigene CF-EU2v1-settet: 1. G551D-mutantprimeren i A-blandingen vil også påvise S549RT>G-mutasjonen. Programvaren vil merke dette som topp 20. Det vil ikke være noen tilsvarende villtypetopp i B-blandingen delA mutantprimeren i A-blandingen vil kryssreagere med 2183AA>G-mutant DNA-sekvensen og resultere i en mutanttopp i 2184delA-posisjonen delT mutantprimeren i A-blandingen vil kryssreagere med F316L-mutant DNA-sekvensen og resultere i en mutanttopp i 1078delT-posisjonen. 4. R347P mutantprimeren i A-blandingen vil kryssreagere med R347H mutant DNA-sekvensen og resultere i en mutanttopp i R347P-posisjonen med redusert høyde, sammenlignet med en reell R347P-topp. 5. Nærværet av F508C (1655T>G) polymorfismen vil resultere i reduksjon i høyden på I507del-toppen i CF- EU2v1 B-blandingen. 6. Nærværet av R117H vil resultere i reduksjon i høyden på R117C-toppen i CF-EU2v1 B-blandingen. I en prøve som er homozygotisk for R117H vil R117C-toppen være fraværende. 7. Nærværet av G85E vil resultere i reduksjon i høyden på 394delTT-toppen i CF-EU2v1 B-blandingen. I en prøve som er homozygotisk for G85E vil 394delTT-toppen være fraværende. 8. En svært liten artefakttopp i I507del-posisjonen kan iblant observeres i resultatene fra en F508del heterozygot og spesielt i en F508del homozygotisk prøve. 9. Følgende mutasjoner, som ikke har blitt kontrollert for mulig kryssreaktivitet på grunn av utilgjengelige relevante prøver, og kan interferere med testfunksjonen: R117P, R117L, A>G, 621+2T>C, 621+2T>G, R553G, R553Q, R347L, I506T, I506S, I506V og den sjeldne kombinasjonen I507del med polymorfismen 1651A/G. Ytelseskarakteristikker Ett hundre og ti DNA-prøver ekstrahert fra væskefullblod (EDTA) ble blindtestet med Elucigene CF-EU2v1. Fem prøver mislyktes etter PCR som korrelerte med lav DNA-konsentrasjon (mindre enn 1,5 ng/μl). Av de som ga fortolkbare resultater, var 96 normale, 5 var heterozygotiske for F508del, 1 var heterozygotisk for G>A, 1 var heterozygotisk for G551D, 1 var heterozygotisk for 621+1G>T, 1 var heterozygotisk for G542X og 1 var en sammensetning heterozygotisk for G542X/F508del. Nittien DNA-prøver ekstrahert fra tørkede blodflekker ble blindtestet med Elucigene CF-EU2v1. Amplifisering av fem prøver mislyktes. Av de prøvene som faktisk amplifiserte, mislyktes 20 prøver i å oppfylle analysekriteriene for tolking etter en 12-sekunders injeksjon på en 3500 genetisk analysator. Alle mislykte prøver korrelerte med lav DNA-konsentrasjon (under 1,5 ng/μl). De 20 mislykkede prøvene ble injisert på nytt i 36 sekunder på 3500 genetisk analysator og analysert, 7 prøver oppfylte ikke analysekriteriene for tolking. Av de 79 prøvene som ga fortolkbare resultater, var 38 normale, 5 var heterozygotiske for F508del, 3 var heterozygotiske for G551D, 3 var heterozygotiske for W1282X, 2 var heterozygotiske for D1152H og 2 var heterozygotiske for G542X. Fire sammensatte heterozygoter, G>A/F508del, R117H/F508del, R1162X/F508del og R553X/F508del ble også bestemt. Dessuten ble hver av følgende heterozygotiske prøver påvist ved én enkel anledning, E60X, G85E, 394delTT, Y122X, CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 21 av 23

22 621+1G>T, 1078delT, R334W, R347P, A455E, I507del, G>A, R553X, kbA>G, G>A, 2184delA, W846X, A>G, Y1092X, 3659delC, kbC>T, S1251N og N1303K. Førtiseks DNA-prøver, som representerte alle 50 mutasjoner påvist av CF-EU2v1-settet, ble amplifisert ved fem separate anledninger. Alle prøvene ga de forventede resultatene uten falske negative eller falske positive resultater, som viste 100 % klinisk spesifisitet og sensitivitet. Feilsøking Disse bruksinstruksjonene er vedlagt for å sikre optimal ytelse av analysen. Brukere skal ikke avvike fra de vedlagte prosedyrene. Eventuelle avvik kan resultere i suboptimal ytelse som gir dårlig datakvalitet. En feilsøkingsveiledning er tilgjengelig fra Elucigene Diagnostics på forespørsel, og gir eksempler og løsninger på noen av de vanligste påvisningene utført av Elucigene CF-EU2v1. Disse inkluderer: Ingen diagnostiske eller STR-topper Svake diagnostiske eller STR-topper For store gjennombrudd /bakgrunnstopper Umerkede topper Svake FAM-topper (mutant) Ubalansert A-blandingsprofil Ubalansert B-blandingsprofil Splittede topper i B-blandingsprofil For å få et eksemplar av feilsøkingsveiledningen for Elucigene CF-EU2v1, ta kontakt med vår teknisk støttegruppe: T: +44 (0) F: +44 (0) E: enquiries@elucigene.com E: techsupport@elucigene.com Begrensninger ved prosedyren 1. Resultatene innsamlet fra denne eller eventuelle andre diagnostiske tester skal brukes og tolkes bare i sammenheng med det generelle kliniske bildet. Elucigene Diagnostics er ikke ansvarlig for eventuelle kliniske avgjørelser som tas. 2. Fravær av mutasjoner, påvist med dette settet, er ingen garanti for at andre mutasjoner i CFTR-genet ikke er tilstede. Andre mutasjoner er mulige, og blir ikke påvist av dette settet. 3. Mutasjonene varierer i frekvens mellom ulike populasjoner. Data fra populasjoners mutasjonsfrekvens er tilgjengelig fra The Cystic Fibrosis Genetic Analysis Consortium (6). Brukeren av dette settet skal legge vekt på disse punktene når resultatene blir rapportert til den kliniske/genetiske rådgiveren som foretar diagnosen. Ansvarsfraskrivelse Resultatene fra denne eller andre diagnostiske analyser skal tolkes i sammenheng med andre laboratorie- og kliniske data som er tilgjengelig for klinikeren. Disse Elucigene-reagensene leveres for in vitro-diagnostisk testing. Ytterligere detaljer for datatolking er tilgjengelig i Elucigene CF-EU2v1 Veiledning for prosedyrer i analyseprogramvaren: CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 22 av 23

23 Referanser 1. Rosenstein BJ, Cutting GR. The diagnosis of cystic fibrosis: a consensus statement. Cystic Fibrosis Foundation Consensus Panel. J Pediatr. 1998;132: De Braekeleer M, Allard C, Leblanc JP, Simard F, Aubin G. Genotype-phenotype correlation in cystic fibrosis patients compound heterozygous for the A455E mutation. Hum Genet. 1997;101: Drumm ML, Konstan MW, Schluchter MD, Handler A, Pace R, Zou F, Zariwala M, Fargo D, Xu A, Dunn JM, Darrah RJ, Dorfman R, Sandford AJ, Corey M, Zielenski J, Durie P, Goddard K, Yankaskas JR, Wright FA, Knowles MR. Genetic modifiers of lung disease in cystic fibrosis. N Engl J Med. 2005;353: Goss CH, Newsom SA, Schildcrout JS, Sheppard L, Kaufman JD. Effect of ambient air pollution on pulmonary exacerbations and lung function in cystic fibrosis. Am J Respir Crit Care Med. 2004;169: Kerem B, Rommens JM, Buchanan JA, Markiewicz D, Cox TK, Chakravarti A, Buchwald M, and Tsui LC. Identification of the Cystic Fibrosis Gene: Genetic Analysis. Science 1989; 245 (4922): Cystic Fibrosis Mutation Database, 7. Joshua D. Groman et al. Variation in a Repeat Sequence Determines Whether a Common Variant of the Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator Gene Is Pathogenic or Benign. Am J Hum Genet. 2004; 74(1): Newton CR et al. Analysis of any point mutation in DNA. The Amplification Refractory Mutation System (ARMS). Nucleic Acid Res 17: (1989). 9. Satsangi J et al. Effect of heparin on polymerase chain reaction. Lancet 343: (1994). 10. PCR Primer: A Laboratory Manual, 2 nd edition. ColdSpring Harbour Laboratory Press: Section 1 ELUCIGENE is a trademark of Delta Diagnostics (UK) Ltd. ARMS er et varemerke for AstraZeneca UK Ltd. QIAAMPer et varemerke for Qiagen GmbH. PICOGREENer et varemerke for Molecular Probes Inc. GENEMARKER er et varemerke for SoftGenetics Corporation. GENEMAPPER, NED, VIC, PET, POP-7, LIZ og HI-DI er varemerker for Life Technologies Corporation. MELDING TIL KJØPER: BEGRENSET LISENS Polynukleotider merket med VIC, NED og PET farger og/eller bruk av disse kan være dekket av en eller flere patenter som eies av Life Technologies Corp. Kjøpesummen for dette produktet inkluderer begrensede, uoverførbare rettigheter under visse krav i visse patenter tilhørende Life Technologies Corp. om å bruke kun denne produktmengden kun for kjøperens aktiviteter i forbindelse med påvisning av mål innen human diagnostikk-feltet. Ingen andre rettigheter er overført. Mer informasjon om kjøp av lisenser i forbindelse med fargene nevnt ovenfor, kan fås ved å kontakte Director of Licensing, outlicensing@lifetech.com. Copyright 2014 Delta Diagnostics (UK) Ltd. CF2EUBYNO 002 Sep-2014 Side 23 av 23

Elucigene CF-EU2v1 Veiledning til analyseprogramvaren

Elucigene CF-EU2v1 Veiledning til analyseprogramvaren Elucigene CF-EU2v1 Veiledning til analyseprogramvaren Fremstilt av: Gen-Probe Life Sciences Ltd. Heron House Oaks Business Park Crewe Road Wythenshawe Manchester M23 9HZ Salg, kundetjeneste og teknisk

Detaljer

MiSeqDx 139-variantanalyse for cystisk fibrose

MiSeqDx 139-variantanalyse for cystisk fibrose MiSeqDx 139-variantanalyse for cystisk fibrose TIL IN VITRO-DIAGNOSTISK BRUK Katalognr. DX-102-1004: 2 kjøringer, opptil 96 per sett Katalognr. DX-102-1003: 20 kjøringer, opptil 960 per sett Tiltenkt bruk

Detaljer

Legens vedlegg: MiSeqDx Cystisk fibrose 139 variantanalyse

Legens vedlegg: MiSeqDx Cystisk fibrose 139 variantanalyse Legens vedlegg: MiSeqDx Cystisk fibrose 139 variantanalyse TIL IN VITRO-DIAGNOSTISK BRUK Genetisk testing og cystisk fibrose Cystisk fibrose (CF) er en kronisk sykdom som rammer flere organsystemer, spesielt

Detaljer

Hva er nytt? Fagdag Norsk forening for CF 21. April 2012. Olav-Trond Storrøsten. Norsk senter for cystisk fibrose

Hva er nytt? Fagdag Norsk forening for CF 21. April 2012. Olav-Trond Storrøsten. Norsk senter for cystisk fibrose Hva er nytt? Fagdag Norsk forening for CF 21. April 2012 Olav-Trond Storrøsten Norsk senter for cystisk fibrose Nasjonale kompetansetjenester for sjeldne diagnoser og funksjonshemninger Kvinne- og barneklinikken

Detaljer

Elucigene QST*R-21 Euplex Bruksanvisning

Elucigene QST*R-21 Euplex Bruksanvisning Elucigene QST*R-21 Euplex Bruksanvisning Produkt Størrelse Katalogkode Elucigene QST*R-21 Euplex 10 tester ANE21BX Til in vitro-diagnostisk bruk Fremstilt av: Elucigene Diagnostics Citylabs Nelson Street

Detaljer

Ytelseskarakteristikker

Ytelseskarakteristikker Ytelseskarakteristikker QIAamp DSP DNA FFPE Tissue-sett, Versjon 1 60404 Versjonshåndtering Dette dokumentet er ytelsesegenskaper for QIAamp DSP DNA FFPE Tissue-sett, versjon 1, R3. Se etter nye elektroniske

Detaljer

QIAsymphony SP protokollark

QIAsymphony SP protokollark QIAsymphony SP protokollark PC_AXpH_HC2_V1_DSP-protokoll Tilsiktet bruk Til in vitro-diagnostisk bruk. Denne protokollen ble utviklet til bruk med cervikalprøver som lagres i PreservCyt -løsning ved bruk

Detaljer

Elucigene QST*R -produkter Bruksanvisning

Elucigene QST*R -produkter Bruksanvisning Elucigene QST*R -produkter Bruksanvisning Produkt Størrelse Katalogkode Elucigene QST*Rplusv2 50 tester AN0PLB2 Elucigene QST*R 50 tester AN003B2 Elucigene QST*R-XYv2 50 tester AN0XYB2 Elucigene QST*R-13

Detaljer

Utarbeidet av Egil Bakkeheim, Overlege Ph.D og Olav Trond Storrøsten, Seksjonsleder.

Utarbeidet av Egil Bakkeheim, Overlege Ph.D og Olav Trond Storrøsten, Seksjonsleder. Norsk senter for cystisk fibrose Nasjonale kompetansetjenester for sjeldne diagnoser og funksjonshemninger Evaluering og oppfølging av individer som etter nyfødt-screening for cystisk fibrose har testet

Detaljer

MiSeqDx Cystisk fibrose 139-variantanalyse

MiSeqDx Cystisk fibrose 139-variantanalyse TIL IN VITRO-DIAGNOSTISK BRUK Katalognr. DX-102-1004: 2 kjøringer, opp til 96 prøver per sett Katalognr. DX-102-1003: 20 kjøringer, opp til 960 prøver per sett Tiltenkt bruk Illumina MiSeqDx Cystisk fibrose

Detaljer

Brukes til preparering og isolering av rensede lymfocytter direkte fra helblod PAKNINGSVEDLEGG. Brukes til in vitro diagnostikk PI-TT.

Brukes til preparering og isolering av rensede lymfocytter direkte fra helblod PAKNINGSVEDLEGG. Brukes til in vitro diagnostikk PI-TT. Brukes til preparering og isolering av rensede lymfocytter direkte fra helblod PAKNINGSVEDLEGG Brukes til in vitro diagnostikk PI-TT.610-NO-V5 Brukerveiledning Bruksområde T-Cell Xtend-reagenset er beregnet

Detaljer

Ny behandling for cystisk fibrose. Olav Trond Storrøsten Norsk senter for cystisk fibrose

Ny behandling for cystisk fibrose. Olav Trond Storrøsten Norsk senter for cystisk fibrose Ny behandling for cystisk fibrose Olav Trond Storrøsten Norsk senter for cystisk fibrose Persontilpasset medisin Nasjonal strategi for persontilpasset medisin i helsetjenesten Ulemper ved forsinket diagnose

Detaljer

Laboratorieprotokoll for manuell rensing av DNA fra 0,5 ml prøve

Laboratorieprotokoll for manuell rensing av DNA fra 0,5 ml prøve Laboratorieprotokoll for manuell rensing av DNA fra 0,5 ml prøve For rensing av genomisk DNA fra innsamlingssett i seriene Oragene og ORAcollect. Du finner flere språk og protokoller på vårt nettsted,

Detaljer

Oversikt over kap. 11. Kap. 11 Den direkte påvisning av genotype skiller individuelle genomer. Fire klasser av DNA polymorfismer.

Oversikt over kap. 11. Kap. 11 Den direkte påvisning av genotype skiller individuelle genomer. Fire klasser av DNA polymorfismer. Kap. 11 Den direkte påvisning av genotype skiller individuelle genomer Oversikt over kap. 11 Fire klasser av DNA variasjon til direkte påvisning av genotype. Metoder som bruker hybridisering, elektroforese,

Detaljer

Progensa PCA3 Urine Specimen Transport Kit

Progensa PCA3 Urine Specimen Transport Kit Instruksjoner for legen Progensa PCA3 Urine Specimen Transport Kit Til in vitro diagnostisk bruk. Bare for eksport fra USA. Instruksjoner 1. Det kan være nyttig å be pasienten drikke mye vann (omtrent

Detaljer

Klinisk molekylærmedisin (4): Indirekte diagnostikk ved koblingsanalyser

Klinisk molekylærmedisin (4): Indirekte diagnostikk ved koblingsanalyser PEDENDO_SISTE_slutt.qxd 18.12.2003 21:34 Side 32 Pediatrisk Endokrinologi 2003;17: 34-38 Klinisk molekylærmedisin (4): Indirekte diagnostikk ved koblingsanalyser Pål Rasmus Njølstad 1,2,3,Jørn V. Sagen

Detaljer

Amplifikasjonsteknikker - andre metoder

Amplifikasjonsteknikker - andre metoder Amplifikasjonsteknikker - andre metoder Svein Arne Nordbø TH-28973 17.03.15 Alternative amplifikasjonsmetoder Templat-amplifikasjons metoder Signal-amplifikasjonsmetoder Templat-amplifikasjons metoder

Detaljer

Se etter nye elektroniske etikettoppdateringer på www.qiagen.com/products/artushcvrgpcrkitce.aspx før testen utføres.

Se etter nye elektroniske etikettoppdateringer på www.qiagen.com/products/artushcvrgpcrkitce.aspx før testen utføres. artus HCV QS-RGQ Kit Ytelsesegenskaper artus HCV QS-RGQ Kit, versjon 1, 4518363, 4518366 Versjonstyring Dette dokumentet er artus HCV QS-RGQ-sett ytelsesegenskaper, versjon 1, R3. Se etter nye elektroniske

Detaljer

bruksanvisninger Introduksjon Advarsel Slik virker FertilCount For produktet FertilCount

bruksanvisninger Introduksjon Advarsel Slik virker FertilCount For produktet FertilCount bruksanvisninger For produktet FertilCount Les instruksjonen nøye før bruk. Hvis du har spørsmål, kan du sende mail til post@fertil.no. Introduksjon FertilCount tester din sædcellekonsentrasjon. Testen

Detaljer

PROGENSA PCA3 Urine Specimen Transport Kit

PROGENSA PCA3 Urine Specimen Transport Kit PROGENSA PCA3 Urine Specimen Transport Kit Instruksjoner for legen Til in vitro diagnostisk bruk. Bare for eksport fra USA. Instruksjoner 1. Det kan være nyttig å be pasienten drikke mye vann (omtrent

Detaljer

MSI erfaringer fra Tromsø

MSI erfaringer fra Tromsø Diagnostisk klinikk Klinisk patologi MSI erfaringer fra Tromsø Kristin Åberg Molekylærpatologisk laboratorium (Sivilingeniør bioteknologi) Disposisjon Lynch Syndrom Mismatch reparasjonssystemet (MMR) Nasjonale

Detaljer

Genotyping ved bruk av Loop-mediert Isotermal DNA-amplifisering (LAMP)

Genotyping ved bruk av Loop-mediert Isotermal DNA-amplifisering (LAMP) Genotyping ved bruk av Loop-mediert Isotermal DNA-amplifisering (LAMP) Hundhausen, T.; Hulsbeek, M.; Avreid, T.; Heggøy, M.; Lacsamana, N.; Tednes, U.; Slettan, A. Genotyping is the process of determining

Detaljer

Laboratorium for medisinsk biokjemi og blodbank. www.helse-forde.no/lmbb

Laboratorium for medisinsk biokjemi og blodbank. www.helse-forde.no/lmbb Laboratorium for medisinsk biokjemi og blodbank. www.helse-forde.no/lmbb LAB- nytt nr 1-2008 INNHALD: Endring av metode for analyse av s-folat Gentest ved utredning av laktoseintoleranse Vurdering av glomerulær

Detaljer

Leucosep-rør LTK.615 PAKNINGSVEDLEGG. Brukes til in vitro-diagnostikk PI-LT.615-NO-V3

Leucosep-rør LTK.615 PAKNINGSVEDLEGG. Brukes til in vitro-diagnostikk PI-LT.615-NO-V3 Leucosep-rør LTK.615 PAKNINGSVEDLEGG Brukes til in vitro-diagnostikk PI-LT.615-NO-V3 Bruksanvisning Bruksområde Leucosep-rørene er beregnet til bruk ved oppsamling og separasjon av mononukleære celler

Detaljer

Thermo. Shandon Cytospin Collection Fluid ELECTRON CORPORATION. Rev. 3, 09/03 P/N 238422

Thermo. Shandon Cytospin Collection Fluid ELECTRON CORPORATION. Rev. 3, 09/03 P/N 238422 Shandon Cytospin Collection Fluid Thermo ELECTRON CORPORATION Anatomical Pathology USA Clinical Diagnostics 171 Industry Drive Pittsburgh, PA 15275, USA Tel: 1-800-547-7429 +1 412 788 1133 Fax: +1 412

Detaljer

HVEM HAR ETTERLATT DNA?

HVEM HAR ETTERLATT DNA? HVEM HAR ETTERLATT DNA? Hensikt Hensikten med forsøket er å utvikle en grunnleggende forståelse for DNA fingeravtrykksanalyser basert på restriksjonsenzymer og deres bruk i rettsmedisinske undersøkelser.

Detaljer

Klinisk molekylærmedisin (5): Eksempler på funksjonelle analyser

Klinisk molekylærmedisin (5): Eksempler på funksjonelle analyser Pediatrisk Endokrinologi 2003;17: 64-69 Klinisk molekylærmedisin (5): Eksempler på funksjonelle analyser Pål Rasmus Njølstad 1,2,3, Lise Bjørkhaug 1 1 Seksjon for pediatri, Institutt for klinisk medisin

Detaljer

Dialog. Fagdag Norsk forening for CF 21. April 2012. Olav-Trond Storrøsten. Norsk senter for cystisk fibrose

Dialog. Fagdag Norsk forening for CF 21. April 2012. Olav-Trond Storrøsten. Norsk senter for cystisk fibrose Dialog Fagdag Norsk forening for CF 21. April 2012 Olav-Trond Storrøsten Norsk senter for cystisk fibrose Nasjonale kompetansetjenester for sjeldne diagnoser og funksjonshemninger Kvinne- og barneklinikken

Detaljer

Hurtigveiledning for RAS Extension Pyro Plug-in

Hurtigveiledning for RAS Extension Pyro Plug-in Februar 2017 Hurtigveiledning for RAS Extension Pyro Plug-in Til installasjon og bruk med PyroMark Q24- instrumenter og PyroMark Q24-programvaren, versjon 2.0 Sample to Insight Om RAS Extension Pyro Plug-in

Detaljer

TEST AV SÆDKVALITET. Resultatvindu. Kontrollvindu. Testbrønn HJEMMETEST. Glidelokk

TEST AV SÆDKVALITET. Resultatvindu. Kontrollvindu. Testbrønn HJEMMETEST. Glidelokk TEST AV SÆDKVALITET Resultatvindu Kontrollvindu Testbrønn Glidelokk HJEMMETEST ! Før du tar testen, bør du: Når kan du teste sædkvaliteten? Lese bruksanvisningen nøye Sørge for at pakkens innhold har romtemperatur

Detaljer

Molekylære metoder i medisinsk mikrobiologi.

Molekylære metoder i medisinsk mikrobiologi. - 1 - Molekylære metoder i medisinsk mikrobiologi. Laboratorieøvelser tirsdag 17.mars. Øvelser: 1. Ekstraksjon av nukleinsyrer ved varmelysering (S. aureus) 2. DNA-isolering med Qiagen kolonne (to prøver:

Detaljer

Molekylær patologi Amplifikasjonsmetoder

Molekylær patologi Amplifikasjonsmetoder Molekylær patologi Amplifikasjonsmetoder Emiel Janssen Seksjonsleder for Kvantitativ og Molekylær Patologi Daglig leder for laboratoriet for molekylær biologi Avdeling for Patologi Stavanger Universitetssjukehus

Detaljer

3M Food Safety 3M Molecular Detection System. Patogentesting. Enkelt og greit

3M Food Safety 3M Molecular Detection System. Patogentesting. Enkelt og greit 3M Food Safety 3M Molecular Detection System Patogentesting Enkelt og greit Matproduksjon er ditt fagfelt Matsikkerhet er vårt Forbrukerne stoler på at ditt firma leverer mat av trygg kvalitet hver dag.

Detaljer

Hurtigtesten som utføres per i dag. Åpent møte 7 januar 2008 Gentesting ved bryst- og eggstokkreft

Hurtigtesten som utføres per i dag. Åpent møte 7 januar 2008 Gentesting ved bryst- og eggstokkreft Hurtigtest egnet for formålet? Åpent møte 7 januar 2008 Gentesting ved bryst- og eggstokkreft Overlege dr philos Torunn Fiskerstrand Haukeland Universitetssykehus Hurtigtesten som utføres per i dag 23

Detaljer

H5i -desinfiseringsveiledning

H5i -desinfiseringsveiledning H5i -desinfiseringsveiledning Norsk Denne desinfiseringsveiledningen skal følges når H5i brukes av flere pasienter på søvnlaboratorium, klinikk, sykehus eller hos helsepersonell. Hvis du bruker H5i hjemme

Detaljer

Brukerveiledning. www.med-kjemi.no. firmapost@med-kjemi.no

Brukerveiledning. www.med-kjemi.no. firmapost@med-kjemi.no Brukerveiledning S www.med-kjemi.no firmapost@med-kjemi.no 1 HEMOSURE Hemosure er en ett-trinns immunologisk hurtigtest for påvisning av skjult blod i fæces. Denne type tester er også referert til som

Detaljer

Hurtigveiledning for BRAF Pyro Plug-in

Hurtigveiledning for BRAF Pyro Plug-in Hurtigveiledning for BRAF Pyro Plug-in Februar 2017 Til installasjon og bruk med PyroMark Q24- instrumenter og PyroMark Q24-programvaren, versjon 2.0 Sample to Insight Om BRAF Pyro Plug-in BRAF Pyro Plug-in-pakken

Detaljer

Kvalitetssikring av HPV-testing i Norge

Kvalitetssikring av HPV-testing i Norge Kvalitetssikring av HPV-testing i Norge HPV-referanselaboratoriets rolle i Masseundersøkelsen mot livmorhalskreft Irene Kraus Christiansen Nasjonalt referanselaboratorium for humant papillomavirus Fagdag,

Detaljer

TheraScreen : K-RAS Mutation Kit for deteksjon av 7 mutasjoner i K-RAS-genet

TheraScreen : K-RAS Mutation Kit for deteksjon av 7 mutasjoner i K-RAS-genet TheraScreen : K-RAS Mutation Kit for deteksjon av 7 mutasjoner i K-RAS-genet Til bruk på Roche LightCycler 480 Real-Time PCR-system (instrument II) (katalognr.: 05015278001) og Applied BioSystems 7500

Detaljer

NeuroBloc Botulinumtoksin type B injeksjonsvæske, oppløsning 5000 E/ml

NeuroBloc Botulinumtoksin type B injeksjonsvæske, oppløsning 5000 E/ml NeuroBloc Botulinumtoksin type B injeksjonsvæske, oppløsning 5000 E/ml NeuroBloc-veiledning for leger, utgave 1, august 2014 1 Viktig sikkerhetsinformasjon for leger Hensikten med denne håndboken er å

Detaljer

Selvtestverktøy. Servicehåndbok Instrumenter fra VITAL DIAGNOSTICS Rørversjon 60 mm

Selvtestverktøy. Servicehåndbok Instrumenter fra VITAL DIAGNOSTICS Rørversjon 60 mm Selvtestverktøy Servicehåndbok Instrumenter fra VITAL DIAGNOSTICS Rørversjon 60 mm Håndbokskode MAN-012 Revisjon 05 Revisjonsdato: 29. desember, 2010 SELVTESTVERKTØY SERVICEHÅNDBOK Vital Diagnostic SELVTESTVERKTØY

Detaljer

FACTOR II (PROTHROMBIN) G20210A KIT

FACTOR II (PROTHROMBIN) G20210A KIT FACTOR II (PROTHROMBIN) G20210A KIT REF til bruk sammen med LightCycler 1.2-instrumentet (I EU: serienummer 2021 til 5602) 03 610 195 001 Kit til 32 reaksjoner for maksimalt 30 prøver Til bruk i in vitro-diagnostikk.

Detaljer

1. VETERINÆRPREPARATETS NAVN. AviPro THYMOVAC Lyofilisat til bruk i drikkevann 2. KVALITATIV OG KVANTITATIV SAMMENSETNING

1. VETERINÆRPREPARATETS NAVN. AviPro THYMOVAC Lyofilisat til bruk i drikkevann 2. KVALITATIV OG KVANTITATIV SAMMENSETNING 1. VETERINÆRPREPARATETS NAVN AviPro THYMOVAC Lyofilisat til bruk i drikkevann 2. KVALITATIV OG KVANTITATIV SAMMENSETNING 1 dose inneholder: Virkestoff: levende kyllinganemivirus (CAV*), stamme Cux-1: 10

Detaljer

C V C. Bruksanvisning for Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02. revisjon 2. Juli 2014

C V C. Bruksanvisning for Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02. revisjon 2. Juli 2014 DOT137v1 English. Instructions for Use Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02 Side 1 av 7 Bruksanvisning for Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02 revisjon 2 Juli 2014

Detaljer

BRUKSINSTRUKSJONER PARASITE SUSPENSIONS. n Parasite Suspensions i formalin TILTENKT BRUK OPPSUMMERING OG FORKLARING PRINSIPPER KOMPOSISJON

BRUKSINSTRUKSJONER PARASITE SUSPENSIONS. n Parasite Suspensions i formalin TILTENKT BRUK OPPSUMMERING OG FORKLARING PRINSIPPER KOMPOSISJON BRUKSINSTRUKSJONER n Parasite Suspensions i formalin TILTENKT BRUK Microbiologics Parasite Suspensions støtter kvalitetssikringsprogrammer ved å fungere som kvalitetskontrollutfordringer som inneholder

Detaljer

ACCESS Immunoassay System. HIV combo QC4 & QC5. For å overvåke systemytelse for Access HIV combo-analysen. B71115A - [NO] - 2015/01

ACCESS Immunoassay System. HIV combo QC4 & QC5. For å overvåke systemytelse for Access HIV combo-analysen. B71115A - [NO] - 2015/01 ACCESS Immunoassay System HIV combo QC4 & QC5 B22822 For å overvåke systemytelse for Access HIV combo-analysen. - [NO] - 2015/01 Access HIV combo QC4 & QC5 Innholdsfortegnelse 1 Anvendelsesområde... 3

Detaljer

Nr. 9/60 EØS-tillegget til Den europeiske unions tidende KOMMISJONSVEDTAK. av 21. februar 2002

Nr. 9/60 EØS-tillegget til Den europeiske unions tidende KOMMISJONSVEDTAK. av 21. februar 2002 Nr. 9/60 EØS-tillegget til Den europeiske unions tidende 24.2.2005 KOMMISJONSVEDTAK 2005/EØS/9/09 av 21. februar 2002 om endring av vedlegg D til rådsdirektiv 90/426/EØF med hensyn til diagnostiske prøver

Detaljer

artus EBV QS-RGQ Kit Ytelsesegenskaper Mai 2012 Sample & Assay Technologies Analytisk følsomhet plasma artus EBV QS-RGQ Kit, Version 1,

artus EBV QS-RGQ Kit Ytelsesegenskaper Mai 2012 Sample & Assay Technologies Analytisk følsomhet plasma artus EBV QS-RGQ Kit, Version 1, artus EBV QS-RGQ Kit Ytelsesegenskaper artus EBV QS-RGQ Kit, Version 1, 4501363 Se etter nye elektroniske etikettoppdateringer på www.qiagen.com/products/artuscmvpcrkitce.aspx før testen utføres. Gjeldende

Detaljer

Bruksanvisning IVD Matrix HCCA-portioned

Bruksanvisning IVD Matrix HCCA-portioned Bruksanvisning IVD Matrix HCCA-portioned Renset matriksstoff til massespektrometri med matriksassistert laserdesorpsjonsionisasjonflytid (MALDI-TOF-MS). CARE- produkter er beregnet på å forsyne våre internasjonale

Detaljer

NGS (Neste Generasjons Sekvensering) i diagnostikk, erfaringer og resultater

NGS (Neste Generasjons Sekvensering) i diagnostikk, erfaringer og resultater NGS (Neste Generasjons Sekvensering) i diagnostikk, erfaringer og resultater Emiel Janssen Seksjonsleder for Kvantitativ og Molekylær Patologi Daglig leder for laboratoriet for molekylær biologi Avdeling

Detaljer

Madeleine Fannemel Avd for medisinsk genetikk

Madeleine Fannemel Avd for medisinsk genetikk Madeleine Fannemel Avd for medisinsk genetikk www.genetikkportalen.no/ Norsk portal for medisinsk-genetiske analyser. Oversikt over hvilke laboratorier som gjør de ulike analyser. Avd for medisinsk genetikk

Detaljer

SpeedSonic.dk. www.speedsonic.dk START / STOP RESET / EL NEXT / SAVE MODE / SET

SpeedSonic.dk. www.speedsonic.dk START / STOP RESET / EL NEXT / SAVE MODE / SET RAW SpeedSonic.dk RESET / EL START / STOP MODE / SET NEXT / SAVE Gratulerer med den nye Speed Sonic-sportsklokken! Speed Sonic-klokken er utviklet for å motivere deg og vise deg veien til bedre resultater.

Detaljer

Molekylære metoder i medisinsk mikrobiologi.

Molekylære metoder i medisinsk mikrobiologi. - 1 - Molekylære metoder i medisinsk mikrobiologi. Laboratorieøvelser onsdag 18.mars 2014. Øvelser: 5. Gelelektroforese på PCR produkt fra meca og nuc PCR fra dag 1 6. Mycobakterium genus FRET realtime

Detaljer

Pasientnær analysering innen medisinsk mikrobiologi

Pasientnær analysering innen medisinsk mikrobiologi Pasientnær analysering innen medisinsk mikrobiologi Marie Elisabeth Vad Fagbioingeniør/ Medlem av RUFMIK Seksjon for Utvikling Avdeling for Mikrobiologi Ullevål,OUS Hva mener vi med pasientnær analysering(pna)?

Detaljer

NGS = Next generation sequencing Massiv parallell sekvensering (MPS) Dypsekvensering

NGS = Next generation sequencing Massiv parallell sekvensering (MPS) Dypsekvensering NGS Sonja E. Steigen Overlege, Diagnostisk klinikk klinisk patologi, Universitetssykehuset Nord Norge Professor II, IMB, Uit Norges arktiske universitet 1 NGS = Next generation sequencing Massiv parallell

Detaljer

cobas 4800 BRAF V600 Mutation Test BRAF

cobas 4800 BRAF V600 Mutation Test BRAF cobas 4800 BRAF V600 Mutation Test FOR BRUK TIL IN VITRO-DIAGNOSTIKK. cobas DNA Sample Preparation Kit DNA SP 24 Tests P/N: 05985536190 cobas 4800 BRAF V600 Mutation Test BRAF 24 Tests P/N: 05985595190

Detaljer

Obligatorisk innlevering 3kb vår 2004

Obligatorisk innlevering 3kb vår 2004 Obligatorisk innlevering 3kb vår 2004 1 I marsvin er mørk pels farge (F) dominant over albino (f), og hår (K) dominant over langt hår (k). Genene for disse to egenskapene følger prinsippet om uavhengig

Detaljer

Bruksanvisning. Melkeskummer 423008. NO Bruksanvisning og sikkerhetsbestemmelser. Les bruksanvisningen nøye. Kun for husholdsbruk.

Bruksanvisning. Melkeskummer 423008. NO Bruksanvisning og sikkerhetsbestemmelser. Les bruksanvisningen nøye. Kun for husholdsbruk. Bruksanvisning Melkeskummer 423008 NO Bruksanvisning og sikkerhetsbestemmelser. Les bruksanvisningen nøye. Kun for husholdsbruk. SIKKERHETSRÅD Les denne veiledningen, da den inneholder viktig informasjon

Detaljer

Inaktiverte hele bakterieceller av Haemophilus parasuis serotype 5, stamme 4800: 0,05 mg total nitrogen, induserer 9,1 ELISA enheter *.

Inaktiverte hele bakterieceller av Haemophilus parasuis serotype 5, stamme 4800: 0,05 mg total nitrogen, induserer 9,1 ELISA enheter *. 1. VETERINÆRPREPARATETS NAVN Porcilis Glässer Vet. injeksjonsvæske, suspensjon til gris 2. KVALITATIV OG KVANTITATIV SAMMENSETNING 1 dose (2 ml) inneholder: Virkestoff(er): Inaktiverte hele bakterieceller

Detaljer

Nr. 46/108 EØS-tillegget til De Europeiske Fellesskaps Tidende KOMMISJONSDIREKTIV 1999/76/EF. av 23. juli 1999

Nr. 46/108 EØS-tillegget til De Europeiske Fellesskaps Tidende KOMMISJONSDIREKTIV 1999/76/EF. av 23. juli 1999 Nr. 46/108 EØS-tillegget til De Europeiske Fellesskaps Tidende KOMMISJONEN FOR DE EUROPEISKE FELLESSKAP HAR under henvisning til traktaten om opprettelse av Det europeiske fellesskap, under henvisning

Detaljer

Mevalonate Kinase Mangel (MKD) ( Hyper IgD syndrom)

Mevalonate Kinase Mangel (MKD) ( Hyper IgD syndrom) www.printo.it/pediatric-rheumatology/no/intro Mevalonate Kinase Mangel (MKD) ( Hyper IgD syndrom) Versjon av 2016 1. HVA ER MKD 1.1 Hva er det? Mevalonat kinase-mangel er en genetisk sykdom. Det er en

Detaljer

Testing av øreproppens passform har aldri vært enklere

Testing av øreproppens passform har aldri vært enklere Testing av øreproppens passform har aldri vært enklere DOC2475 NO En personlig opplæring i bruk av ørepropper som hørselsvern inkluderer test av brukerens egne øreproppers passform, samt tilbyr et utvalg

Detaljer

Undersøkelse av biologiske spor

Undersøkelse av biologiske spor Undersøkelse av biologiske spor Bente Mevåg Avd.dir. Avdeling for biologiske spor Divisjon for rettsmedisinske fag Rettsmedisin, rettspatologi og rettsgenetikk, er bruk av biomedisinsk fagkunnskap i rettssamfunnets

Detaljer

A New Approach for the Detection of the Seven Most Common α-thalassemia Deletions

A New Approach for the Detection of the Seven Most Common α-thalassemia Deletions A New Approach for the Detection of the Seven Most Common α-thalassemia Deletions Catherine B. Herrera, Lamya Garabet, Hege Smith Tunsjø and Tor-Arne Hagve Unit of Gene Technology, Multidisciplinary Laboratory

Detaljer

Oppgave 2b V1979 Hvor i cellen foregår proteinsyntesen, og hvordan virker DNA og RNA i cellen under proteinsyntesen?

Oppgave 2b V1979 Hvor i cellen foregår proteinsyntesen, og hvordan virker DNA og RNA i cellen under proteinsyntesen? Bi2 «Genetikk» [3B] Målet for opplæringa er at elevane skal kunne gjere greie for transkripsjon og translasjon av gen og forklare korleis regulering av gen kan styre biologiske prosessar. Oppgave 2b V1979

Detaljer

Aptima Multitest Swab Specimen Collection Kit

Aptima Multitest Swab Specimen Collection Kit Multitest Swab Specimen Collection Kit Aptima Bruksområder Aptima Multitest Swab Specimen Collection Kit (prøvetakingssett for vattpinneprøver) skal brukes til Aptima-analyser. Aptima Multitest Swab Specimen

Detaljer

MiSeqDx Reagent Kit v3

MiSeqDx Reagent Kit v3 TIL IN VITRO-DIAGNOSTISK BRUK Katalognr. 20012552: 1 kjøring Tiltenkt bruk Illumina MiSeqDx Reagent Kit v3 er et sett med reagenser og forbruksvarer beregnet for sekvensering av prøvebiblioteker når de

Detaljer

STERIL KUN TIL ENGANGSBRUK IKKE-PYROGEN

STERIL KUN TIL ENGANGSBRUK IKKE-PYROGEN 0086 TM Leveringssystem for legemidler til embolisering BRUKSANVISNING DC Bead Leveringssystem for legemidler til embolisering STERIL KUN TIL ENGANGSBRUK IKKE-PYROGEN Norsk BRUKSANVISNING DC Bead Leveringssystem

Detaljer

QIAsymphony DSP sirkulerende DNA-sett

QIAsymphony DSP sirkulerende DNA-sett QIAsymphony DSP sirkulerende DNA-sett Februar 2017 Ytelsesegenskaper 937556 Sample to Insight Innhold Ytelsesegenskaper... 4 Grunnleggende ytelse... 4 Kjøringspresisjon... 6 Tilsvarende ytelse av 2 ml

Detaljer

PNA ISH Detection Kit

PNA ISH Detection Kit PNA ISH Detection Kit Kode nr. K5201 8. utgave Til in situ-hybridisering ved bruk av fluorescein-konjugerte PNA-prøver. Settet inneholder reagenser til minst 40 tester*. * Antall tester basert på bruk

Detaljer

Genetikk og nyfødtscreening. Trine Prescott Avdeling for medisinsk genetikk, OUS September 2011

Genetikk og nyfødtscreening. Trine Prescott Avdeling for medisinsk genetikk, OUS September 2011 Genetikk og nyfødtscreening Trine Prescott Avdeling for medisinsk genetikk, OUS September 2011 Far 1 gen Genfeil = Autosomal recessiv arv kromosompar Mor Kjønnsceller Barn Syk 25% Frisk bærer Frisk bærer

Detaljer

HMS-DATABLAD. Del 1: Identifikasjon av stoffet/blandingen og selskapet/foretaket. Del 2: Fareidentifikasjon

HMS-DATABLAD. Del 1: Identifikasjon av stoffet/blandingen og selskapet/foretaket. Del 2: Fareidentifikasjon ifølge EF-direktiv 1907/2006 Side: 1 Utarbeidelsesdato: 16.08.2010 Revisjonsdato: 15.03.2013 Revidert utgave nr.: 3 Del 1: Identifikasjon av stoffet/blandingen og selskapet/foretaket 1.1. Produktidentifikator

Detaljer

Høringsnotat. Forskrift om farmakogenetiske undersøkelser

Høringsnotat. Forskrift om farmakogenetiske undersøkelser Høringsnotat Helse- og omsorgsdepartementet Forskrift om farmakogenetiske undersøkelser Side 1 av 7 1 Hovedinnhold Helse- og omsorgsdepartementet foreslår i dette høringsnotatet en ny forskrift som skal

Detaljer

www.printo.it/pediatric-rheumatology/no/intro

www.printo.it/pediatric-rheumatology/no/intro www.printo.it/pediatric-rheumatology/no/intro DIRA Versjon av 2016 1. Hva er DIRA 1.1 Hva er det? DIRA er en sjelden genetisk sykdom. Sykdommen gir betennelse i hud og knokler. Andre organer, som eksempelvis

Detaljer

YTELSESERKLÆRING (Declaration of Performance) Sikafloor - 2530 W

YTELSESERKLÆRING (Declaration of Performance) Sikafloor - 2530 W EN 1504-2:2004 13 0921 EN 13813:2002 YTELSESERKLÆRING () Sikafloor - 2530 W 02 08 01 02 024 0 000001 1008 1. Produkttypens unike identifikasjonskode: I h.t. NS-EN 13813 SR-B2,0-AR1-IR4 som gulvmaling innendørs.

Detaljer

Preanalytiske forhold ved analyse av glukose

Preanalytiske forhold ved analyse av glukose Preanalytiske forhold ved analyse av glukose Kristin Moberg Aakre Norsk Klinisk-kjemisk kvalitetssikring Haukeland universitetsjukehus 45 (46) laboratorier besvarte undersøkelsen 43 laboratorier hadde

Detaljer

Tilfeldige bildefunn i nyrene hvorfor bry seg?

Tilfeldige bildefunn i nyrene hvorfor bry seg? Høstmøtet 2014, NFAR-sesjonen Tilfeldige bildefunn i nyrene hvorfor bry seg? Jarl Åsbjörn Jakobsen, dr.med., MHA. Overlege, Enhet for abdominal radiologi - Rikshospitalet, Avdeling for radiologi og nukleærmedisin,

Detaljer

Blau Syndrom/ Juvenil Sarkoidose

Blau Syndrom/ Juvenil Sarkoidose www.printo.it/pediatric-rheumatology/no/intro Blau Syndrom/ Juvenil Sarkoidose Versjon av 2016 1. HVA ER BLAU SYNDROM/ JUVENIL SARKOIDOSE 1.1 Hva er det? Blau syndrom er en genetisk sykdom. Sykdommen gir

Detaljer

R Opphavet til rømt smolt i Oltesvikbekken i Ryfylke våren 2008 A P P O R T. Rådgivende Biologer AS 1168

R Opphavet til rømt smolt i Oltesvikbekken i Ryfylke våren 2008 A P P O R T. Rådgivende Biologer AS 1168 R Opphavet til rømt smolt i Oltesvikbekken i Ryfylke våren 2008 A P P O R T Rådgivende Biologer AS 1168 Rådgivende Biologer AS RAPPORT TITTEL: Opphavet til rømt laksesmolt i Oltesvikbekken i Ryfylke våren

Detaljer

PÅ JAKT ETTER SIGDCELLEANEMI

PÅ JAKT ETTER SIGDCELLEANEMI PÅ JAKT ETTER SIGDCELLEANEMI Hensikt Hensikten med forsøket er å utvikle en grunnleggende forståelse av mutasjoner i DNA og hvordan slike mutasjoner kan lede til genetiske sykdommer, samt å se hvordan

Detaljer

INNLEDNING. Nar du slar pa forstmeren, pumper. Det er viktig at du leser disse anvisningene

INNLEDNING. Nar du slar pa forstmeren, pumper. Det er viktig at du leser disse anvisningene Brukerhand -bok INNLEDNING Det er viktig at du leser disse anvisningene far bruk. Takk for at du har gatt til av forstiaveren Go m. Enkelte medisinske tilstander, for eksempel astma, KOLS (kronisk lungesykdom)

Detaljer

LTK.615 PAKNINGSVEDLEGG

LTK.615 PAKNINGSVEDLEGG LTK.615 PAKNINGSVEDLEGG For in vitro-diagnostisk bruk PI-LT.615-NO-V4 Instruktiv informasjon Tilsiktet bruk Leucosep-rør er beregnet på innsamling og separasjon av perifere mononukleære blodceller (PBMC

Detaljer

Bluetooth-paring. Brukerhåndbok

Bluetooth-paring. Brukerhåndbok Bluetooth-paring Brukerhåndbok Copyright 2012, 2016 HP Development Company, L.P. Microsoft, Windows og Windows Vista er registrerte varemerker for Microsoft Corporation i USA. Bluetooth-varemerket eies

Detaljer

Ace binax. Bruksanvisning. www.siemens.no/hearing. Livet høres fantastisk ut.

Ace binax. Bruksanvisning. www.siemens.no/hearing. Livet høres fantastisk ut. Ace binax Bruksanvisning www.siemens.no/hearing Livet høres fantastisk ut. Innhold Velkommen 4 Høreapparatene dine 5 Type apparat 5 Bli kjent med høreapparatene dine 5 Komponenter og navn 6 Kontroller

Detaljer

ML-208, generell informasjon

ML-208, generell informasjon ML-208, generell informasjon Emnekode: ML-208 Emnenavn: Molekylærbiologi Dato:20.12.2017 Varighet:4 timer Tillatte hjelpemidler: Ingen Merknader:Lag gjerne tegninger og figurer for å illustrere og forklare

Detaljer

CR System. Bruksanvisning 4400B NO

CR System. Bruksanvisning 4400B NO CR System Bruksanvisning 0413 Ingen del av dette dokumentet må gjengis, kopieres, tilpasses eller videreformidles i noen som helst form eller på noen som helst måte uten skriftlig tillatelse fra Agfa HealthCare

Detaljer

Bruk av genteknologiske analyser ved diagnostikk av luftveisinfeksjoner. Gardermoen 27.02.08. Svein Arne Nordbø

Bruk av genteknologiske analyser ved diagnostikk av luftveisinfeksjoner. Gardermoen 27.02.08. Svein Arne Nordbø Bruk av genteknologiske analyser ved diagnostikk av luftveisinfeksjoner Gardermoen 27.2.8 Svein Arne Nordbø Aktuelle genteknologiske metoder Hybridiseringsmetoder Ampifikasjonsmetoder PCR Konvensjonell

Detaljer

Status i forskning: Demens og arvelighet. Arvid Rongve Psykiatrisk Klinikk Helse Fonna

Status i forskning: Demens og arvelighet. Arvid Rongve Psykiatrisk Klinikk Helse Fonna Status i forskning: Demens og arvelighet Arvid Rongve Psykiatrisk Klinikk Helse Fonna Arvelighet og genetiske metoder Alzheimers sykdom og arvelighet Hva kan vi lære av de nye genene? Betydning for behandling

Detaljer

Monosed SR Vakuumrør BRUKERVEILEDNING

Monosed SR Vakuumrør BRUKERVEILEDNING Monosed SR Vakuumrør BRUKERVEILEDNING Manual kode MAN-133-nb Revisjon 01 Revidert dato: November 2015 Bruksanvisning for in vitro diagnostiske instrumenter for profesjonell bruk PRODUKTNAVN PRODUKTET DELENUMMER

Detaljer

TruSeq Custom Amplicon Dx FFPE QC Kit

TruSeq Custom Amplicon Dx FFPE QC Kit TruSeq Custom Amplicon Dx FFPE QC Kit TIL IN VITRO-DIAGNOSTISK BRUK Katalognr. 20006259: 1 4 anvendelser, opptil 48 prøver Tiltenkt bruk Illumina TruSeq Custom Amplicon Dx FFPE QC Kit er et sett med reagenser

Detaljer

Artikkel: 08095891 Versjon: 01.01

Artikkel: 08095891 Versjon: 01.01 Artikkel: 0809891 Versjon: 01.01 12 09891.Devireg27.NO.indd 12 1/11/06 1:21:2 NO Devireg TM 27 Installasjons- og brukerveiledning 1 09891.Devireg27.NO.indd 1 1/11/06 1:21:26 Gratulerer med nytt DEVI gulvvarmesystem

Detaljer

Digital promille tester CA2010. Brukerveiledning. TT Micro AS Side 1

Digital promille tester CA2010. Brukerveiledning. TT Micro AS Side 1 Digital promille tester CA2010 Brukerveiledning TT Micro AS Side 1 ... 32 Innholdsfortegnelse Innhold i pakken Produkt Forholdsregler... oversikt Skjerm... informasjon Brukerveiledning 4 Feilmeldinger

Detaljer

Sikkerhetskopiering og gjenoppretting Brukerhåndbok

Sikkerhetskopiering og gjenoppretting Brukerhåndbok Sikkerhetskopiering og gjenoppretting Brukerhåndbok Copyright 2007-2009 Hewlett-Packard Development Company, L.P. Windows er et registrert varemerke for Microsoft Corporation i USA. Informasjonen i dette

Detaljer

PREPARATOMTALE 1. VETERINÆRPREPARATETS NAVN. Nobivac DHP vet. 2. KVALITATIV OG KVANTITATIV SAMMENSETNING. Virkestoff(er):

PREPARATOMTALE 1. VETERINÆRPREPARATETS NAVN. Nobivac DHP vet. 2. KVALITATIV OG KVANTITATIV SAMMENSETNING. Virkestoff(er): PREPARATOMTALE 1. VETERINÆRPREPARATETS NAVN Nobivac DHP vet. 2. KVALITATIV OG KVANTITATIV SAMMENSETNING Virkestoff(er): En dose (1 ml) rekonstituert vaksine inneholder: Valpesykevirus, stamme Onderstepoort

Detaljer

Januar 2012 Produktinformasjon GRS Deltron matt klarlakksystem

Januar 2012 Produktinformasjon GRS Deltron matt klarlakksystem GLOBAL REFINISH SYSTEM Januar 2012 Produktinformasjon GRS Deltron matt klarlakksystem PRODUKTER Deltron matt klarlakk Deltron halvblank klarlakk Deltron HS-herdere Deltron tynnere Deltron lav-voc tynnere

Detaljer

Genotropin Generell informasjon om veksthormon

Genotropin Generell informasjon om veksthormon Bruksanvisning Genotropin Generell informasjon om veksthormon Veksthormon er et protein, helt identisk med det kroppen selv produserer. Et protein kan ikke gis i tablettform og må derfor injiseres. Før

Detaljer

FULL SPORBARHET NATT OG DAG. Harmonix Monitoring Paste er det første trinnet i Integrated Pest Management.

FULL SPORBARHET NATT OG DAG. Harmonix Monitoring Paste er det første trinnet i Integrated Pest Management. FULL SPORBARHET NATT OG DAG Harmonix Monitoring Paste er det første trinnet i Integrated Pest Management. Harmonix Monitoring Paste er det første bærekraftige trinnet i Integrated Pest Management På verdensbasis

Detaljer

Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP (brukervalidert for QIAsymphony DSP DNA Mini-sett)

Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP (brukervalidert for QIAsymphony DSP DNA Mini-sett) August 2015 QIAsymphony SP-protokollark Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP (brukervalidert for QIAsymphony DSP DNA Mini-sett) Dette dokumentet er Tissue_LC_200_V7_DSP og Tissue_HC_200_V7_DSP

Detaljer

Periodisk NLRP 12-Forbundet Feber

Periodisk NLRP 12-Forbundet Feber www.printo.it/pediatric-rheumatology/no/intro Periodisk NLRP 12-Forbundet Feber Versjon av 2016 1. HVA ER PERIODISK NLRP 12-FORBUNDET FEBER 1.1 Hva er det? Sykdommen er arvelig. Det endrede genet ansvarlig

Detaljer

Nedarving autosomal recessiv - en stor fordel i avl La oss på en forenklet måte se litt på hvordan denne defekten nedarves.

Nedarving autosomal recessiv - en stor fordel i avl La oss på en forenklet måte se litt på hvordan denne defekten nedarves. PRA (PROGRESSIV RETINAL ATROFI) Beskrivelse av øyesykdommen PRA Progressiv retinal Atrofi er en arvelig sykdom som finnes hos mange raser. Den arter seg i ulike former og framtrer til ulikt tidspunkt i

Detaljer